生物化学ppt第一章核酸的结构与功能.ppt

《生物化学ppt第一章核酸的结构与功能.ppt》由会员分享，可在线阅读，更多相关《生物化学ppt第一章核酸的结构与功能.ppt（55页珍藏版）》请在三一办公上搜索。

1、第一章核酸的结构与功能,第一节 核酸是遗传物质的载体第二节 核酸的基本化学组成第三节 DNA的结构第四节 RNA的结构与功能第五节 核酸的性质,核酸是一类重要的生物大分子，担负着生命信息的储存与传递。核酸是现代生物化学、分子生物学的重要研究领域，是基因工程操作的核心分子。,核酸概述,第一节 核酸是遗传物质的载体,一、核酸的研究发现史1868年，F.Miescher从细胞核中分离得到一种酸性物质，即现在被称为核酸的物质。,1944年，Avery的转换转化实验,or,and,可分离,1952年，Hexshey、Chase T2噬菌体（捣碎器实验）1953年，Watson、Crick DNA双螺旋模

2、型核酶（Ribozyme）,98核中（染色体中）真核 线粒体（mDNA）核外 叶绿体（ctDNA）DNA 拟核或类核 原核 核外：质粒（plasmid）病毒：DNA病毒,二、核酸的种类和分布,核酸分为两大类：脱氧核糖核酸 Deoxyribonucleic Acid（DNA）核糖核酸 Ribonucleic Acid（RNA）,RNA主要存在于细胞质中,tRNA rRNA mRNA 其它 RNA病毒：SARS,三、分子生物学的中心法则,第二节 核酸的基本化学组成,核酸,核苷酸,核苷,磷酸,碱基,戊糖,元素组成：C H O N P,核酸完全水解产生嘌呤和嘧啶等碱性物质、戊糖（核糖或脱氧核糖）和磷酸

3、的混合物。每个核苷分子含一分子碱基和一分子戊糖，一分子核苷酸部分水解后除产生核苷外，还有一分子磷酸。核酸的各种水解产物可用层析或电泳等方法分离鉴定。,组成核酸的戊糖有两种。DNA所含的糖为-D-2-脱氧核糖；RNA所含的糖则为-D-核糖。,一、戊糖,二、碱基,1.嘌呤（Purine）,2.嘧啶（Pyrimidine）,核酸中也存在一些不常见的稀有碱基。稀有碱基的种类很多，大部分是上述碱基的甲基化产物。,三、核苷（nucleoside）,核苷 戊糖+碱基 糖与碱基之间的C-N键，称为C-N糖苷键,假尿苷（）次黄苷（肌苷）I黄嘌呤核苷 X二氢尿嘧啶核苷 DHU2-O-甲基腺苷Am 取代核苷的表示方

4、式5-甲基鸟苷 m5G,Adenosine Guanosine Cytidine Uridine,四、核苷酸（nucleotide）核苷酸 核苷+磷酸 戊糖+碱基+磷酸,五、核苷酸衍生物,1.继续磷酸化,2.环化磷酸化,cAMP,cGMP,3.肌苷酸及鸟苷酸(强力味精),4.辅酶 NAD(辅酶I，烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)、NADP(辅酶II，烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸)、FMN（黄素单核苷酸）、FAD（黄素腺嘌呤二核苷酸）、CoASH（辅酶A）,IMP GMP,六、多聚核苷酸（核酸）,多聚核苷酸是通过一个核苷酸的C3-OH 与另一分子核苷酸的5-磷酸基形成3,5-磷酸二酯键相连而成的链状聚合物。,

5、5-磷酸端（常用5-P表示）；3-羟基端（常用3-OH表示）多聚核苷酸链具有方向性，当表示一个多聚核苷酸链时，必须注明它的方向是53或是35。,多聚核苷酸的表示方式,DNA RNA,5PdAPdCPdGPdTOH 3 5PAPCPGPUOH 或5ACGTGCGT 3 5ACGUAUGU 3 ACGTGCGT ACGUAUGU,第三节 DNA的结构,一、DNA的一级结构脱氧核糖核酸的排列顺序可以用碱基排列顺序表示连接键：3，5-磷酸二酯键磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架碱基形成侧链多核苷酸链均有5-末端和3-末端 DNA的碱基顺序本身就是遗传信息存储的分子形式。生物界物种的多样性即寓于DNA分子中

6、四种核苷酸千变万化的不同排列组合之中。,核酸的序列测定,双脱氧链终止法（Sanger酶法）2.Gilbert化学降解法,2.基因与基因组,基因（gene）：一段有功能的DNA片段，生物细胞中DNA分子的最小功能单位（交换单位）。,基因组（genome）：某生物体（完整单倍体）所含全部遗传物质的总和。包括：核基因组（拟核/核DNA）及核外（质粒/质体DNA）,各种细胞、病毒和细菌质粒中基因组的大小,3.原核生物基因组特点 重复序列少，多位编码区 多为操纵子形式组织 有重叠基因存在,真核生物基因组特点 以染色体存在 重复序列多,基因组计划人类基因组计划（Human Genome Project，H

7、GP）酵母基因组计划（YGP）大肠杆菌（E.Coli）,二、DNA的二级结构 DNA的双螺旋模型,1953年，J.Watson和F.Crick 在前人研究工作的基础上，根据DNA结晶的X-衍射图谱和分子模型，提出了著名的DNA双螺旋结构模型，并对模型的生物学意义作出了科学的解释和预测。在DNA分子中，嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。,DNA双螺旋模型要点,B型结构 两条链反向平行，右手螺旋 碱基在内（AT，GC）碱基平面垂直于螺旋轴 戊糖在外，双螺旋每转一周 为10碱基对（bp）A型结构 碱基平面倾斜20，螺旋变粗变短，螺距23nm。Z型结构 左手螺旋，只有小沟,双螺旋DNA的结构参数,双

8、螺旋稳定的力 氢键 碱基堆积力（疏水相互作用及范德华力）离子键等 则:DNA变性剂（热、pH、脲/酰胺、有机溶剂）,三链DNA：Hoogsten方式配对,DNA的三链结构可能与基因表达调控有关。第三股链的存在可能阻碍了一些调控蛋白或RNA聚合酶与DNA的结合。,二、DNA的三级结构,DNA双螺旋的进一步扭曲构成三级结构，负超螺旋 原核 双链环状DNA（dcDNA）病毒 单链环状DNA（scDNA）单链线性DNA（ssDNA）,DNA的存在形式,真核 双链线性DNA（dsDNA）,第四节 RNA的结构与功能,一、结构特点碱基组成 A、G、C、U（AU/GC）稀有碱基较多，稳定性较差，易水解多为单

9、链结构，少数局部形成螺旋分子较小分类mRNA（hnRNA 核不均一RNA）tRNA rRNA（snRNA/asRNA）少数RNA病毒,二、tRNA,占RNA总量的15一种氨基酸对应最少一种RNA,分子量25000左右，大约由7090个核苷酸组成，沉降系数为4S左右。分子中含有较多的修饰成分。3-末端都具有CpCpAOH的结构。,tRNA的三级结构,三、rRNA,占RNA总量的80,四、mRNA和hnRNA,占细胞总RNA的35,真核细胞mRNA的3-末端有一段长达200个核苷酸左右的聚腺苷酸(polyA)，称为“尾结构”，5-末端有一个甲基化的鸟苷酸，称为”帽结构“。,五、snRNA（smal

10、l nucleic RNA 小核RNA）scRNA（small cytoplasmic RNA）asRNA（antisense RNA）,帽子结构和3PolyA都有抗核酸外切酶降解的作用。另外5帽子结构可能与蛋白质合成的正确起始作用及协助核糖体与mRNA相结合有关。,第五节 核酸的性质,二、核酸的紫外吸收特性,在核酸分子中，由于嘌呤碱和嘧啶碱具有共轭双键体系，因而具有独特的紫外线吸收光谱，一般在260nm左右有最大吸收峰，可以作为核酸及其组份定性和定量测定的依据。以A260/A280进行定性、定量DNA和RNA溶液中加入溴化乙锭（EB），在紫外下发出荧光核酸的光吸收值常比其各核苷酸成分的光吸收

11、值之和少30一40。这是在有规律的双螺旋结构中碱基紧密地堆积在一起造成的。这种现象叫做DNA的减色效应。,三、核酸的变性、复性与分子杂交,1.变性稳定核酸双螺旋次级键断裂，空间结构破坏，变成单链结构的过程。核酸的一级结构(碱基顺序)保持不变。变性表征 生物活性部分丧失、粘度下降、浮力密度升高、紫外吸收增加（增色效应：260nm紫 外吸收值升高）变性因素 pH（11.3或5.0）变性剂（脲、甲酰胺、甲醛）低离子强度 加热,DNA的变性过程是突变性的，它在很窄的温度区间内完成。因此，通常将紫外吸收的量达最大量一半时的温度称熔解温度，用Tm表示。一般DNA的Tm值在70-85C之间。DNA的Tm值与

12、分子中的G和C的含量有关。G和C的含量高，Tm值高。因而测定Tm值，可反映DNA分子中G,C含量，可通过经验公式计算：（G+C)%=(Tm-69.3)2.44,2.热变性和Tm,3.核酸的复性,变性核酸的互补链在适当的条件下，重新缔合成为双螺旋结构的过程称为复性。DNA复性后，一系列性质将得到恢复，但是生物活性一般只能得到部分的恢复，具有减色效应。将热变性的DNA骤然冷却至低温时，DNA不可能复性。变性的DNA缓慢冷却时可复性，因此又称为“退火”。退火温度Tm25复性影响因素 片段浓度/片段大小/片段复杂性（重复序列数目）/溶液离子强度,4.分子杂交,DNA单链与在某些区域有互补序列的异源DN

13、A单链或RNA链形成双螺旋结构的过程。这样形成的新分子称为杂交DNA分子。核酸的杂交在分子生物学和遗传学的研究中具有重要意义。Southern 杂交（Southern bolting）Northern 杂交（Northern bolting）Western 杂交（Western bolting）,本 章 小 结,核酸是遗传物质载体的证明和研究历史核酸的化学结构：戊糖、碱基（A、T、G、C、U），核苷、核苷酸及其衍生物的结构特点（原子编号）DNA的结构：一级结构（核酸序列及其表示、基因及基因组、序列测定）、二级结构（Watson Crick双螺旋模型、ZDNA）、结构维持的化学键RNA结构与功能：碱基组成特点、RNA的种类结构及功能核酸的性质：酸碱性、变性与复性、分子杂交,习 题1、比较DNA、RNA在化学组成上、分子结构上、生物学功能上的特点。2、DNA双螺旋结构模型的要点有哪些？此模型如何能恰当地解释DNA的生物学功能？3、RNA有哪些主要类型？比较其结构与功能。4、从两种不同细菌提取得DNA样品，其腺嘌呤核苷酸分别占其碱基总数的32%和17%，计算这两种不同来源DNA四种核苷酸的相对百分组成。两种细菌中有一种是从温泉（64）中分离出来的，该细菌DNA具有何碱基组成？为什么？5、解释下列名词：增色效应与减色效应 DNA的变性与复性 Tm,