PubMed2013教程如何使用好PubMed.ppt

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1、认识PubMed 让它融入您的科研,学科馆员：周成效,认识PubMed让它融入您的科研,主要内容,一、认识PubMed二、PubMed 检索入门三、PubMed高级检索四、PubMed医学主题词表检索五、PubMed其他功能六、PubMed个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,Web of Science,您的选择？,Google Scholar,PubMed,Scopus,Scirus,一、认识PubMed,认识PubMed让它融入您的科研,/,一、认识PubMed,PubMed与NCBI数据库的关系图,一、认识PubMed,认识PubMed让它融入您的科研,认识PubMed让它融入

2、您的科研,标引质量高,更新速度快,信息量大,使用方便,选择PubMed的n个理由,一、认识PubMed,认识PubMed让它融入您的科研,Medline,OldMedline,In Process Citations,Record supplied by publisher,一、认识PubMed,认识PubMed让它融入您的科研,一、认识PubMed,认识PubMed让它融入您的科研,检索提问区,文献匹配,临床咨询,特定主题咨询,期刊检索,主题检索,高级检索,一、认识PubMed,认识PubMed让它融入您的科研,2.1 单著者检索,键入著者姓氏全称和名字的首字母全写或缩写 如:Alving

3、c Fauci as koltilil s Geneau Wong julia s Ryan,james2.1.2 利用高级检索中的“Author”检索,选下拉选项定位,二、PubMed检索入门,认识PubMed让它融入您的科研,直接输入您所要检索的关键词或主题词,英文单词或短语（大写或小写均可）,词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。如:sleep walking cause,2.2 著者与主题联合检索,2.2.1 直接输入作者姓名与主题词,不用AND 如:dodick dw migraine,2.3 单主题检索,二、PubMed检索入门,认识PubMed让它融入您的科研

4、,2.4 期刊检索,2.4.1 输入期刊名，ISSN，Medline jounal title abbreviation 如:molecular biology of the cell cellta 1087-01562.4.2 用single citation matcher中的期刊名称检索2.4.3 用journal database检索,二、PubMed检索入门,认识PubMed让它融入您的科研,2.5 日期或日期范围检索2.5.1 日期的录入格式为YYYY/MM/DD,2.6 检索期刊子集（辑）检索词AND jsubset 数据库首字母。可供检索的期刊子库有3种，分别使用进行限定。Ab

5、ridged Index Medicus(有120种重要核心医学期刊)Dental Nursing 如：neoplasms AND jsubseta,二、PubMed检索入门,认识PubMed让它融入您的科研,2.7 检索带文摘的记录,2.7.1 检索词AND has abstract,要注意的是在1975年前出版的文章，其MEDLINE记录中没有文摘 如:liver cancer AND has abstract,二、PubMed检索入门,认识PubMed让它融入您的科研,2.8.1 布尔逻辑运算符(AND,OR,NOT)如：Oncology AND(treatment OR researc

6、h)截词符(*)如:bacter*词组检索(“”)如:“Single cell”通配符(?)如:“en?oblast”,2.8 组配/截词/短语检索,二、PubMed检索入门,认识PubMed让它融入您的科研,2.9 PubMed检索字段标识,二、PubMed检索入门,认识PubMed让它融入您的科研,2.10 PubMed检索结果显示及处理,二、PubMed检索入门,认识PubMed让它融入您的科研,二、PubMed检索入门,认识PubMed让它融入您的科研,2.11 PubMed基本检索举例,Clinical cancer research 2009diabete AND jsubsetn

7、“embryonic stem cell*”swine flu*OR swine influ*OR H1N1 OR SIV,二、PubMed检索入门,认识PubMed让它融入您的科研,1明确所要检索的内容。先分析这一问题中的关键词语，主要由维生素C，和普通感冒构成。即VITAMIN C和COMMON COLD。2分析所要检索的两个相关词语的关系。根据我们的日常生活经验，可以将两个关键词之间的关系定义为“AND”,在检索框内键入“VITAMIN C”AND COMMON COLD,2.12 PubMed基本检索演示,检索课题一 维生素C对于普通感冒的防治作用,二、PubMed检索入门,认识Pub

8、Med让它融入您的科研,检索课题二 检索2000-2005年以后有关Crohn病药物治疗研究的文献,Crohn DiseasemhAND drug therapy sh AND 2000：2005 edat,二、PubMed检索入门,2.12 PubMed基本检索演示,认识PubMed让它融入您的科研,君欲善其事必先利其器,三、PubMed高级检索,认识PubMed让它融入您的科研,检索事半功倍,检索框,三、PubMed高级检索,认识PubMed让它融入您的科研,明确你所要检索的关键概念及词语，即关键字考虑到关键字的类似说法，即有可能出现的同义词,检索要诀,通过限定等，精炼你的检索范围通过布尔

9、（BOOLEAN）运算来提高你的效率多向有经验的人求教,PubMed,三、PubMed高级检索,认识PubMed让它融入您的科研,3.1 Filter在这里可以进行以下设定：将搜索范围设定在一个特定的域。将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型,如综述 设定只搜索包含摘要的文献。设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库（如Abridged Index Medicus 或AIDS相关的条目）。需要注意的是：限制了出版物类型、年龄、人或动物、性别中的任何一项，检索将只

10、在Medline中进行检索（因为这些特征限制只有Medline中才有）。,三、PubMed高级检索,认识PubMed让它融入您的科研,人或动物实验选择,性别选择,语种选择,期刊分类选择：核心临床医学牙科期刊护理期刊 Medline期刊,年龄选择,出版物类型选择,认识PubMed让它融入您的科研,认识PubMed让它融入您的科研,看到最近100次的查询结果。如果两次查询内容相同，PubMed会将头一次的去除。当点击 Clear History可以将History中的所有内容清除,3.2 History,三、PubMed高级检索,认识PubMed让它融入您的科研,3.3 Clipboard贴板可以

11、帮助你保存或查看在一个或多个查询中选择的条目。可以打印、保存、订购剪贴板中的内容。条目复选框选中，单击“send to clipboard”就可以将其加入剪贴板中。剪贴板中最大的储存数是500条。剪贴板中的内容在8小时内没有任何操作，将会自动消失。,三、PubMed高级检索,认识PubMed让它融入您的科研,3.4 Details 即在提问框中键入的检索词被PubMed自动地转换成了哪些词，并使用了什么样的检索规则和检索语法。,三、PubMed高级检索,认识PubMed让它融入您的科研,Result区显示检索结果的记录总数，点击这个数字，可回到检索结果显示屏,Translation区显示检索词

12、转换的详细情况,Database区显示检索的数据库,User Query 区显示用户键入的检索词或检索式,对检索策略进行编辑,三、PubMed高级检索,认识PubMed让它融入您的科研,文献太多，如何保证查全和查准？,四、PubMed医学主题词表检索,何为MeSH？MeSH是Medical Subject Headings的缩略词，即医学主题词，是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。论述文献中心的主题词称主要主题词论述主题某一方面的内容的词称为副主题词,Mesh词表帮助您！,4.1 MeSH Database的运用,认识PubMed让它融入您的科研,四、PubMed医学主题词表检索,认识Pu

13、bMed让它融入您的科研,词义解释,四、PubMed医学主题词表检索,认识PubMed让它融入您的科研,副主题词,四、PubMed医学主题词表检索,认识PubMed让它融入您的科研,四、PubMed医学主题词表检索,四、PubMed医学主题词表检索,主题词的逻辑匹配检索,四、PubMed医学主题词表检索,认识PubMed让它融入您的科研,检出结果限定在主要主题词可提高查准率,限制扩展检索，只需检索单个主题词,四、PubMed医学主题词表检索,认识PubMed让它融入您的科研,在 MeSH Database 中查找关键词?如何联合检索两个 MeSH Terms?,如何在 MeSH Databas

14、e 中利用副主题检索?,4.2 MeSH检索实例演示,四、PubMed医学主题词表检索,认识PubMed让它融入您的科研,4.2 MeSH检索实例演示,四、PubMed医学主题词表检索,认识PubMed让它融入您的科研,五、PubMed其他功能,实现单篇文章的一对一检索,实现多篇文章的一次性检索,一次最多可检索PubMed中100条文献纪录,获得文献的PMID,认识PubMed让它融入您的科研,选择相应类别,选择检索范围,检索结果更加贴近临床的需要,五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研,限定于各类不同的医学临床主题进行检索,五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融

15、入您的科研,实现PubMed与核酸和蛋白质序列数据库、基因组数据库、分类学数据、图书等数据库之间的多向链接,多向查询,五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研,与PubMed建立联系的网站，如某篇文献所对应期刊的出版商，文献全文、相关数据库及网站等。,五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研,五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研,eUtils(Entrez Programming Utilities)通过eUtils 这个程序设计模块,可以通过我们自己设计的应用程序平台,获取NCBI 数据库的数据,从而实现这些数据资源的深度开发使用。实

16、现自动化的大批量的从Entrez数据库下载数据。并且提供了几种常用的语言以供选择，像Perl,Python,Java,和 C+等。,五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研,免费期刊的获取,PubMed提供了免费全文期刊网址 Pubmed Central/向作者索要作者主页,五、PubMed其他功能,认识PubMed让它融入您的科研,六、PubMed的个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,保存检索式(生成URL或HTML实现共享),检索结果的分类过滤,特定功能的参数设置,六、PubMed的个性化服务,书目管理设置,认识PubMed让它融入您的科研,经由2000多位专家

17、学者的评价推荐，提供目前世界上最重要的生物学论文资讯及研究趋势。特色是收录每篇具有科学价值的文献，而考虑这些文献在哪在些期刊里发表,PubMed里检索出最核心的文献Faculty of 1000与pubmed的完美结合,六、PubMed的个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,PubMed快速检索功能的实现,NCBI Search Toolkit,安装NCBI Search Toolkit划词右击直接进行pubmed检索,六、PubMed的个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,PubMed其实还有更加丰富多彩的内容等着你去挖掘,查阅各种健康疾病相关的主题，医药信息。还有一部非常完

18、善的在线医学词典。此外，你还可以浏览到很多有用的健康新闻。,六、PubMed的个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,GoPubMed是德国Transinsight公司和德国德累斯顿大学合作，利用生物信息学相关知识开发的一个可以对PubMed检索结果进行探索、分析的工具。,六、PubMed的个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,四个“W”,分析功能,六、PubMed的个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,时间分析,国家分析,六、PubMed的个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,城市分析,刊物分析,六、PubMed的个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,作

19、者分析,主题分析,六、PubMed的个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,研究态势,地区分布图,六、PubMed的个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,研究人员关系网,线条越多，线形越多，地位越重要,六、PubMed的个性化服务,认识PubMed让它融入您的科研,Add Your Title,舌根肿瘤的病理学,阿司匹林治疗心肌梗死,实战二,实战三,实战一,附：PubMed检索实战操作,Asthma drug therapy,Tonguetongue basebase of the tongueneoplasms pathology,Aspirintherapeutic use myocardial infarctiondrug therapy,认识PubMed让它融入您的科研,课件类别：学科资源制 作 人：周成效联系方式：制作日期：2013-4-19,请批评指正！,谢 谢!,