化学物质与酶的相互作用.ppt
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1、第七章,化学物质与酶的相互作用,Interaction between chemicals and enzymes,主要内容,化学物质对酶的抑制作用Inhibition of enzymes by chemicals化学物质对酶的激活作用Activation of enzymes by chemicals酶对化学物质的催化作用Enzymatic catalysis of chemical substances,教学要求,熟练掌握抑制作用的类型,动力学特性以及抑制剂研究的意义;掌握酶激活作用的类型、动力学特性;掌握酶对化学物质的催化作用;掌握酶制剂的类型、催化反应的介质以及酶催化的有机合成反应类
2、型。,化学物质与酶的相互作用,自然界中发现的酶已达3000多种,而且这个数目随着基因工程和蛋白质工程方面研究的发展而大大增加。酶可以直接作为药物用于医药工业,如溶菌酶可治疗各类炎症(咽喉炎、口腔溃疡、慢性鼻炎、带状疤疹及各种刀伤引起的发炎等),天冬酞胺酶治疗癌症,治疗血栓的尿激酶等。酶也广泛应用于食品工业、化学工业、医药工业、环保工业等,在临床检验、生物分析等领域也广泛使用。,本章主要知识点,化学物质(无机物质、有机物质和高分子物质)与酶的相互作用包括化学物质对酶的抑制作用、激活作用酶对化学物质的催化作用。,第一节,化学物质对酶的抑制作用,Inhibition of enzymes by ch
3、emicals,化学物质对酶的抑制作用,酶的抑制作用:凡能降低酶促反应速度的作用。通过酶抑制作用的研究,不仅对了解酶的专性,酶活性部位的物理和化学结构,酶的动力学性质以及酶的作用机制等;对了解药物和毒物作用于机体的方式及机理等也有重要意义;对代谢途径中酶的调节也能提供信息。酶的抑制剂(inhibitor):能使酶活性受抑制的物质。抑制剂能抑制酶促反应,主要是抑制剂能使酶的必需基因或活性部位的性质和结构发生改变,从而导致酶活性降低或丧失。,抑制剂的分类,按抑制剂作用的方式不同,酶的抑制作用两种类型 类型:不可逆抑制剂 可逆抑制剂 应用:研制杀虫剂、药物 研究酶的作用机理,确定代谢途径,半数有效浓
4、度,为了评价化合物对酶的抑制活性,用半数有效浓度IC50。测定IC50方法:将底物与酶的浓度保持恒定,改变抑制剂的浓度,求出使酶活性降低50%所需的抑制剂浓度。,一、可逆抑制作用,按可逆抑制剂对酶底结合的影响不同,可分为许多类型,它们的反应历程可用一通式表示:,速度方程通式,根据此反应历程,根据快速平衡学说或恒态学说推导,得到其总速度方程通式如下,在不同的抑制作用中,仅在于EI的解离常数Ki和EIS的解离常数Ki两个数值的不同,一般可分为4种类型:竞争性抑制、非竞争性抑制、反竞争性抑制和混合性抑制作用。,将该方程作双倒数处理,可得,可逆抑制作用的类型和特点,1、竞争性抑制作用,竞争性抑制作用(
5、Competitive inhibition)中I只与自由酶结合,因而阻止S与酶结合。而S又不能与EI结合,I也不能与ES结合,所以EIS不存在;EI亦不能分解成产物。反应历程:,竞争性抑制作用的特点,个竞争性抑制剂只增加酶底结合的表观米氏常数Km(Kmapp),即抑制剂I浓度增加,Kmapp就增加;而Vmax则保持不变。在竞争性抑制剂存在下,要达到最大反应速度Vmax,必须加入更高的底物浓度。如S100Km时,Vmaxi可达Vmax。竞争性抑制剂对酶促反应的抑制程度,决定于I,S,Km和Ki的大小。I一定,增加S,减少抑制程度;S一定,增加I,增加抑制程度,Ki值较低时,任何给定I和S,抑制
6、程度都较大;Km值越低,在一定S、I下,抑制程度越小。,竞争性抑制作用的双倒数图,在不同的固定I下,改变S并测定相应S下,如图所示,图中:有竞争性抑制剂存在,不管I如何,其双倒数图的纵截距不变,仍为1/Vmax,而横截距则随I的增加其负值增加,如I 达饱和浓度,则可使初始速度降为零,Vmax unchanged,Km increases,竞争性抑制作用Ki的求解,从双倒数图计算出表观米氏常数Kmapp,然后代入Kmapp=Km(1+I/Ki)可计算出Ki。从双倒数图求得各I浓度下的Kmapp值对相应I再作图,从再制图的纵截距可直接测得Km,从其横截距可直接测得Ki。从不同固定I下所作一簇直线的
7、斜率1/S对相应I再制图,其纵截距为Km/Vmax,斜率为Km/VmaxKi,横截距即为-Ki。Dixon作图法求Ki,Dixon作图法求Ki,将竞争性抑制剂存在下的双倒数重排成1/v随I而变化的方程,竞争性抑制剂的IC50值,取决于实验所用的酶和底物浓度,当酶的浓度固定时,IC50值与Ki、Km和底物浓度S呈如下关系:根据该方程式,当底物浓度大于Km值时,IC50值高于Ki值,尤其当底物浓度较高时,Ki值偏低更加明显。,竞争性抑制剂的结构特征,底物类似物过渡态类似物其他化合物,利用酶底物类似物作为竞争性抑制研究一些三维结构不清楚的酶活性中心结构;根据底物结构设计临床药物。,底物类似物,实例1
8、,-葡糖苷酶抑制剂如阿卡波糖(acarbose)、伏格列波糖(voglibose)和米格列醇(Miglitol)的结构与酶的低聚糖类底物和葡萄糖糖苷类相似。可与活性部位发生竞争性结合,抑制肠道内双糖分解,从而降低餐后的高血糖。,黄嘌呤氧化酶可催化次黄嘌呤氧化成黄嘌呤,进而被氧化成尿酸,黄嘌呤氧化酶抑制剂别嘌呤醇治疗痛风病就是通过抑制黄嘌呤氧化酶,降低尿酸的生物合成。,实例2,返回,过渡态类似物,酶催化化学反应效率高的原因在于酶能与高能态的过渡态相结合,从而大大降低了化学反应的活化能。如果对催化某一特定生物化学反应的酶的三维结构尚不清楚,可以根据其生化反应的过程,设计合成具有特定结构、疏水性匹配
9、、电子和空间因素与过渡态类似的稳定化合物,作为该酶特异的抑制剂,这无疑为药物合理分子设计提供了另一强有力的手段。,AChE的羟基与酯酶的酯解部位形成共价键,其四价氮上的强正电荷与酯酶的阴离子部位呈静电联接。酶的乙酰化很快导致酯键断裂和胆碱的消除,乙酰化酶随即与水反应而使酶再生并放出乙酸。氨基甲酸酯杀虫剂是乙酰胆碱酯酶水解过渡态的稳定类似物,能与乙酰胆碱酯酶结合部位紧密结合而抑制乙酰胆碱酯酶。,乙酰胆碱酯酶(AChE),实例,苯甲酰丙氨醛是胰凝乳蛋白酶的过渡态抑制剂;其结构类似底物苯甲酰苯丙氨酰化合物与酶形成的共价中间物中的底物酰基部分,比底物中的肽键羰基更易受到酶活性中心羟基的亲核进攻,但不能
10、形成酰化酶共价中间物。,返回,其它化合物,有些化合物的平面结构与底物并不相似,但立体构象十分相近,也可以成为竞争性抑制剂。,非甾体抗炎药,非甾体抗炎药是一类具有不同结构类型的化合物,由于选择性地抑制环氧合酶的活性,用作抗炎止痛药。环氧合酶抑制剂消炎痛和底物花生四烯酸的三维结构,整个分子的立体构象中,羧基和双键的配置有某种相似性,因而竞争性地与环氧合酶结合。,作为环氧合酶(COX2,炎症细胞产生的酶)的特异性抑制剂,难以进入开口较小的COX1活性中心的通道,故而不能对其产生抑制作用,但仍能进入口径稍大,后段略有柔性的COX2通道,而能对COX2产生抑制作用。,塞来克西(Celebrex),某些竞
11、争性抑制剂的化学结构与底物的结构没有任何关系,其抑制作用的原理是抑制剂与一些酶活性中心的金属离子络合,妨碍了底物的进入,从而起到抑制酶活性的目的。LOX的活性中心含有一个非血红素铁原子,通过Fe2+与Fe3+的循环实现其催化功能。该酶的抑制剂(CGS-23885,A-76745)就是通过铁的螯合而与底物竞争性地与酶活性中心结合。,5-脂氧合酶(LOX),2、非竞争性抑制作用,典型的非竞争性抑制剂不影响酶-底物结合;底物也不影响酶-I的结合;S和I都可可逆独立地结合于酶的不同部位上;并且ESI为端点复合物。,非竞争性抑制作用的双倒数方程,非竞争性抑制作用Ki 的求解,从I0和I为某一固定浓度所作
12、1/对1/S双倒数图的纵截距可直接测得1/Vmax和(1/Vmax)(1+I/Ki),从而计算出Ki。从不同固定I所作双倒数图的斜率1/S对I再制图可求得Ki。从不同固定I所作双曲数图的纵截距对I再制图,从其横截距可直接到得Ki。,Dixon作图法求Ki,非竞争性抑制剂的IC50值,非竞争性抑制剂的IC50值与底物浓度的关系如下:根据该式,当底物浓度较高时,IC50值接近于Ki值;当底物浓度较低时,IC50值明显低于Ki值。,非竞争性抑制剂的结构特征,由于非竞争性抑制剂并非结合于酶活性中心的底物结合位点,而是活性中心附近的某些区域或基团,不影响酶与底物的亲和力。而非竞争性抑制剂的作用部位不是十
13、分清楚,所以,不能根据酶的底物及酶活性中心的结构设计非竞争性抑制剂。目前所发现的一些酶的非竞争性抑制剂大多数都是随机筛选得到的化合物。,Genistein对于-葡萄糖苷酶的抑制作用就是非竞争性抑制作用。他克林(tacrine)是治疗老年痴呆症的乙酰胆碱酯酶的非竞争性抑制剂。,染料木素(genistein),3、反竞争性抑制作用,反竞争性抑制剂I不能与自由酶结合,而只能与ES可逆结合生成不能分解成产物的EIS。这一点与竞争性抑制相反,Ki值为,EIS只能解离成ES+I,而不能解离成EI+S。,反竞争性抑制程度取决于I、S、Ki和Km等。它的抑制程度随底物浓度的增加而增加。反竞争性抑制剂使酶的Km
14、值降低,即KmappKm。从这点看,反竞争性抑制剂不是一个抑制剂,而像是一个激活剂。它之所以造成对酶促反应的抑制作用,完全是由于它使Vmax降低而引起。所以如果S很小,反应主要为一级反应,则抑制剂对Vmax的影响几乎完全被对Km的相反影响所抵消。这时几乎看不到抑制作用。,反竞争性抑制作用的特点,反竞争性抑制作用的双倒数方程,反竞争性抑制剂的结构特征,反竞争性抑制在单底物酶催化反应中比较少见胎盘碱性磷酸酯酶以葡萄糖-6-磷酸或-萘酚磷酸酯为底物时,L-苯丙氨酸为反竞争性抑制剂;顺铂对乙酰胆碱酯酶的抑制作用也是属于反竞争类型。,在双底物反应中,反竞争性抑制比较多见,如乒乓机制的酶促反应时,因为I可
15、以与EB复合物结合,对一个底物(A)表现竞争性抑制的化合物(I)对另一个底物(B)呈现反竞争性抑制。抗坏血酸对兔肌乳酸脱氢酶的抑制作用,抗坏血酸相对于NADH表现为乳酸脱氢酶的反竞争抑制,相对于丙酮酸为乳酸脱氢酶的竞争性抑制剂。,抗坏血酸,HIV-1 protease,4、混合性抑制作用,混合性抑制作用中S和E或EI都能够结合,I也可和E或ES结合,但亲和力都不相等,表明S和I对酶的结合互有影响,Ki和Ki两者既不等于无穷大,又互不相等,Ksi和Ks也不相等。有关可逆抑制作用的通式就是混合性抑制作用的公式。,当用双倒数方程作图时,有抑制剂和无抑制剂的直线既不平行,又不相交于纵轴或横轴,而是相交
16、于横轴负侧的上方(第二象限)或下方(第三象限),双倒数方程作图,5、四种类型可逆抑制的比较,不同类型的可逆抑制作用可以利用双倒数作图法来区别根据图中有无抑制剂时的直线是否相交于1/S轴,还是1/V轴就可以区别。,Vmax decreases,Km increases.,二、不可逆抑制作用,这类抑制作用的抑制剂与酶分子上的某基团以牢固的共价健结合使酶失活。不能用透析、超滤等物理方法除去抑制剂而使酶复活。不可逆抑制作用的特点是随时间的延长会逐渐地增加抑制,最后达到完全抑制。,不可逆抑制作用的类型和特点,抑制剂是作用于酶分子中的一类或几类基团,这些基团中包含了必需基团,因而引起酶的失活。类型有,1、
17、非专一性不可逆抑制作用,这类抑制剂选择性很强,它只能专一性地与酶活性中心的某些基团不可逆结合,引起酶的活性丧失。实例:有机磷杀虫剂,2、专一性不可逆抑制剂,这类抑制剂呈现其活性是在酶的催化过程实现的。这类抑制剂的结构与底物有很大相似性,与酶分子有较高的亲和力,它本身无化学活性或者没有化学活性基团,但在酶的催化作用下,产生了化学活性的亲电性基团,从而与酶的活性部位处的 亲核性基团发生不可逆的 结合反应,使酶失活。,3、酶自杀性底物的抑制作用,Ks型:一种抑制剂只作用于酶分子中一种氨基酸侧链基团,该氨基酸残基属于酶的必需基团。如:有机汞:专一作用于巯基;有机磷农药:专一作用于丝氨酸羟基,如乐果、敌
18、百虫Kcat型:抑制剂为底物的类似物,但其结构中潜藏着一种化学活性基团,在酶的作用下,潜在的化学活性基团被激活,与酶的活性中心发生共价结合,不能再分解,酶因此失活。,自杀性底物,自杀性底物具有以下的结构特征和性能,(1)同正常底物的化学结构具有相似性;(2)可以同酶结合成复合物,有较大的亲和力;(3)在通常状态下,有低反应性能或化学惰性的基团或结构片断;(4)在酶的催化阶段,可将惰性基团转化为反应性能强的中间体;(5)与酶的活性部位发生化学反应,特别是共价键合,使酶不可逆失活。,酶自杀性底物的功能基团类型,基于它与正常底物的结构相似性、这是酶与该抑制剂结合成复合物并经催化反应暴露出活性基团的前
19、提。所暴露出的反应活性基团大多是亲电基团。,酶的自杀性底物的特异性,醛、酮、亚胺或酯等与酶分子的亲核基团发生迈克尔加成反应 生成的负碳型中间体被负电性的羰基共振稳定化,使邻位碳发生消去反应或去质子化,生成邻位不饱和键。,不饱和羰基,4、指向活性部位抑制剂,指向活性部位抑制剂的作用特征是,抑制剂分子中含有化学活泼的功能基,它与酶的活性部位处的基团或原子发生共价结合,使酶失活。这类抑制剂的结构类似于酶的底物,可被酶的活性部位识别。可用于酶活性中心的结构研究,也称为亲和标记试剂。指向活性部位的不可逆抑制剂的化学活性基团多为亲电试剂,与其发生反应的酶活性部位的基团则是亲核性基团,形成共价键。,第二节,
20、化学物质对酶的激活作用,Activation of enzymes by chemicals,化学物质对酶的激活作用,有些化学物质的作用与抑制剂的作用相反,对酶起着激活作用,加强酶作用的效果。在某些情况下,只有在激活剂的存在下,酶催化反应才能进行,或者说只有在激活剂的存在下催化反应速度才能测得出来。激活剂:凡是能提高酶活性的物质;激活剂一般是无机离子活简单的有机化合物,而高分子物质较少。,一、激活剂的类型,激活剂的类型除了在生物体内起激活作用的蛋白质分子(如酶原激活)以外,按照分子的大小可以分为三种类型。即:无机离子、有机分子和高分子物质。,1、具有巯基的还原剂,半胱氨酸、2-巯基乙醇和还原型
21、谷胱甘肽等都含有巯基,可以使酶分子中被氧化的-SH基还原,从而提高酶的催化活力。如半胱氨酸、2-巯基乙醇和还原型谷胱甘肽等对腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶、木瓜蛋白酶、蜡样芽胞杆菌蛋白酶、D-甘油醛-3-磷酸脱氢酶等均具有激活作用。半胱氨酸(20mM)、2-巯基乙醇(10mM)和谷胱甘肽(10mM)分别使未活化的腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶的活性提高1.3、3.5和2.8倍。,巯基的配位作用,这些含有巯基的化合物还可以作为金属酶活性中心的轴向配体从而激活酶的催化作用,如巯基苯甲酸、巯基乙酸、半胱氨酸对细胞色素 P450、过氧化氢酶的激活作用。过氧化氢酶被巯基乙酸激活后,其km值减小、kcat/km增
22、大,即巯基乙酸能够提高过氧化氢酶对底物的亲和力及底物专一性。巯基乙酸同样能够引起过氧化氢酶的可见光谱的蓝移及酶分子的色氨酸残基的荧光强度减小,从而使过氧化氢酶活性中心铁卟啉周围环境发生变化,以达到提高酶活力之目的。,2、多羟基化合物,多羟基化合物如甘油、乙二醇、糖类物质等不但可以作为酶的稳定剂使用,而且它们对许多酶具有激活作用。对腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶起激活作用的物质除了半胱氨酸、2-巯基乙醇和还原型谷胱甘肽等以外,3-磷酸甘油是其最有效的激活剂。乙二醇在0.33mol/L的浓度范围内对-葡萄糖醛酸苷酶具有激活作用,其激活机理可能是由于乙二醇与底物的水解产物-葡萄糖醛酸形成苷式结合,降低了
23、产物抑制效应,从而提高了酶促反应,使酶的活性升高。,3、变性剂,某些变性剂如脲、盐酸胍等可以完全破坏酶蛋白的空间构象,使酶失去活性。但是当变性剂的浓度较低时,酶蛋白仅仅发生了部分变性。由于酶活性中心附近的多肽链的柔性,部分变性使活性中心的空间构象发生的改变,有利于底物的结合以及产物的离去,从而使酶的催化活性提高。,实例,在5C、20C、30C,鸡肝二氢叶酸还原酶随着盐酸胍的浓度增加而增高,经历一个激活过程后,再开始失活。2mol/L的脲可使二氢叶酸还原酶活力提高3.6倍,而且酶活力可以稳定12小时。4mol/L的脲可使二氢叶酸还原酶的催化活力提高大约5倍,但激活后的酶很快失去活力。,曲线1和2
24、是在脲加入后立即检测,曲线3和4是在脲加入12小时后检测,4、有机溶剂,在某些情况下,低浓度的有机溶剂和表面活性剂可以有助于底物的溶解,同时也可以使酶分子部分变性,从而提高酶分子的催化活性。图中是甲醇、乙醇、丙醇和丁醇对青霉素V酰化酶的诱导激活过程,醇分子是以有机分子形式起作用。,表面活性剂,如Tween 80处理Bacillus megaterium酯酶,可使酶催化对硝基苯酚己酯的Km值降低,而Kcat/Km值提高14倍。非离子表面活性剂浓度在0.1%0.8%时,吐温80、聚乙二醇等作为纤维素酶的激活剂,可使纤维素酶活力提高20%-50%。而阴离子表面活性剂浓度在0.1%0.8%时,如十二烷
25、基磺酸钠也可作为纤维素酶的激活剂。,5、小分子有机化合物,在有机胺类化合物(二乙胺、二异丙胺、三乙胺、吡啶等)的存在下,磷酸三酯酶的催化活性随着有机胺的浓度改变而变化;当有机胺浓度较低时,磷酸三酯酶的催化活性明显提高,显示出有机胺化合物对磷酸三酯酶的激活作用,但当有机胺的浓度增大时(0.1mol/L),则表现出较强的抑制作用。,6、高分子化合物,高分子化合物如聚乙烯亚胺、聚精氨酸、聚赖氨酸等聚电解质,在低浓度的溶液中可以与酶蛋白分子表面的相反电荷相互作用,多点的静电引力结合可能使酶活性中心附近的空间构象发生变化,从而提高酶的催化活力。如聚乙烯亚胺,聚丁基亚胺分别使乳酸脱氢酶活力提高3.0和 5
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