化学手册网络数据库Beil.ppt

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1、Crossfire Beilstein/Gmelin 化学手册网络数据库,中科院文献情报中心信息服务部 姚丹丹2005,内容提要,背景资料客户端软件安装CrossFire Beilstein/Gmelin 基本检索,背景资料Leopold Gmelin,17881853 German chemist 1822 discoverer of potassium ferricyanide 18171819 wrote the Handbuch der Chemie first edition,4th ed.1843-1855)1848-1850 translated into English for

2、 the Cavendish Society by H.Watts.,背景资料Friedrich Beilstein,1838-1906 Russian chemist1881 First Edition of Beilsteins Handbook of Organic Chemistry(1,500 compounds,2,200 pages)1988 Beilstein database online at STN1993 First release of the CrossFire software for the Beilstein database1994 The Beilstei

3、n Database available under CrossFire as in-house version with ca.6,000,000 organic compounds(ca.7,5 m in 1999),背景 资料Crossfire Beilstein/Gmelin,由Beilstein和Gmelin两个数据库组成。分别由德国Beilstein Institute和Gmelin Institute进行。前者收集有机化合物的资料，后者收集有机金属与无机化合物的资料。是传统贝尔斯坦有机化学手册(Beilstein Handbuch der Organische Chemie)及盖

4、墨林无机与有机金属化学手册(Gmelin Handbook of Inorganic and Organometallic Chemistry)的电子化。,背景资料Crossfire Beilstein/Gmelin,The worlds largest electronics collection of organic reactions and chemical facts,The only comprehensive,electronically searchable source of structures,properties,and citations in inorganic a

5、nd organometallic chemistry,背景资料Crossfire Beilstein/Gmelin,物质信息：化合物化学性质化合物物理性质化合物化合物结构信息化合物生物活性信息化合物参考文献信息,反应信息：化学反应信息制备物质的详细资料反应途径,引用文献信息：参考文献根据1980年-的重要有机化学文献索引整理的摘要,900 万种化合物50万个/年增,1000万个有机化学反应,Crossfire Beilstein1771-,200万篇参考文献80万篇摘要,背景资料Crossfire Beilstein/Gmelin,175 Journals 1771 年,背景资料Crossf

6、ire Beilstein/Gmelin,化学结构数据 化学反应（制备）物理性质化学性质 参考文献,200万种无机和有机 金属化合物 14000种玻璃和陶瓷 3200种矿物 55000种合金 110万篇文献 15万篇摘要 160万个反应,Crossfire Gmelin1772-,地质学/矿物学/冶金学信息资源 材料科学/电子学/催化学信息资源,背景资料Crossfire Beilstein/Gmelin,62 Journals 1772 年,背景资料Elsevier-MDL,Crossfire等化学信息管理、药物研究开发等软件供应商 探索生命科学、材料科学、化学工业信息学的领导者 国际性公司

7、，总部社在美国加州San Leandro,在全球设有分公司,背景资料创腾科技有限公司,MDL Crossfire中国地区总代理面向国内材料/生命科学领域用户提供分子模拟、化学/生物/材料信息学、高性能计算全面解决方案的专业计算机公司提供Crossfire的技术咨询,内容提要,背景资料客户端软件安装CrossFire Beilstein/Gmelin 基本检索方法,客户端程序安装,网络检索CrossFire Beilstein/Gmelin 需要安装客户端程序,CrossFire Commander 6.0,CrossFire Commander 7.0,新版本客户端具有更清晰的使用界面和页面H

8、ELP提示,客户端软件安装步骤（适用中科院用户）,升级程序的下载地址为：,进入地址后，将Crossfire.rar下载并解压缩后，双InstallShell.exe，按提示安装，建议使用默认配置。,CrossFire Commander 6.0需要卸载,客户端软件安装安装信息（适用中科院用户）,权限控制方式为外部IP+内部私有IP+口令以中科院文献情报中心为例：,客户端软件安装安装信息,MDL ISIS Draw,是Crossfire平台上的特定产品，在这个平台上使用起来有时会比ISIS Draw方便，但不能脱离此平台使用。,安装中需要选择画图软件,是使用最广泛的一种，除了在Crossfire

9、，还可以在MDL公司的其他各种产品中使用。,MDL Draw,ISIS Draw的换代产品，操作起来更简单，相对于ISIS Draw有很多改进，会逐渐取代ISIS Draw，目前对于非MDL用户不是免费的。,MDL Crossfire Structure Editor,内容提要,背景资料客户端软件安装CrossFire Beilstein/Gmelin 基本检索方法,CrossFire Beilstein检索 CrossFire Commander 7.0界面结构,数据表格检索,结构检索,关键词检索,CrossFire Beilstein检索 CrossFire Commander 7.0 界

10、面结构,5个功能按钮,CrossFire Beilstein检索 CrossFire Commander 7.0的界面结构,菜单与功能快捷键,CrossFire Beilstein检索选择数据库,选择数据库,CrossFire Beilstein检索选择化学结构画图工具,确认选用的画图工具与安装的画图工具一致,CrossFire Beilstein检索关键词检索,在“Search All Text”中输入关键词,Truncate:截词选择,例：检索PVC的相关物质信息,CrossFire Beilstein检索关键词检索,兰色的“Bar”提示关键词出现的频次,选择检索内容：Substances

11、 Reactions Citations,CrossFire Beilstein检索关键词检索,View 检索结果,命中记录Hits的数量,CrossFire Beilstein检索关键词检索,双击某个Hit,浏览详细内容红色标志显示有生物活性的化合物,CrossFire Beilstein检索关键词检索,可访问的数据内容可访问的数据数量链接相关数据内容,点击快捷键show显示化合物结构窗口,CrossFire Beilstein检索数据和事实的超链接,链接Reaction 详细数据,CrossFire Beilstein检索访问参考文献,超链接获取参考文献记录超链接获取MDL-LitLink

12、文献提供服务,CrossFire Beilstein检索访问参考文献,超链接参考文献详细内容 部分参考文献提供经过整理的摘要,CrossFire Beilstein检索访问参考文献,超链接获取MDL-LitLink文献提供服务注册服务,CrossFire Beilstein检索结果显示方式,选取检索结果记录的显示方式,CrossFire Beilstein检索结果显示方式,利用快捷键选取显示的数据内容“Hit Only”只显示与检索条件匹配的数据,直接查询相关记录，不用重新提问,CrossFire Beilstein检索相关记录检索,CrossFire Beilstein检索检索历史,显示特定

13、日期的检索内容,选取并复制检索内容到“Query”,CrossFire Beilstein检索保存/打开提问式,点击“Save Query”保存提问式点击“Open Quey”单击文件名预览保存提问式点击“Open Quey”双击文件名copy检索提问,CrossFire Beilstein检索提问集,“Querties”显示“Today”“Yesterdays”,“Previous”的检索提问“Queries”,直接“Copy”检索提问,CrossFire Beilstein检索数据表格检索,数据表格索引区包括6种索引,查询内容填充区,CrossFire Beilstein数据结构,Cros

14、sFire Beilstein检索数据表格检索,单击数据索引名称浏览索引详细内容选择数据域名称,CrossFire Beilstein检索数据表格检索,点击“Select for search”，查询内容自动添入“Search Field”对索引内容的描述与检索样例可以locate索引内容在“tree”中的位置,CrossFire Beilstein检索数据表格检索,输入查询数据的名称点击“Find”双击显示的数据域名称，该名称自动填充到数据表格检索区,CrossFire Beilstein检索数据表格检索,例：检索CAS no.122-01-0化合物的相关信息,输入数据域，填充检索内容“Li

15、st”提供相应内容的选择与自动填充，如果相应内容，则检索无结果,CrossFire Beilstein检索数据表格检索,“List”提供相应内容的选择、自动填充和预检。,CrossFire Beilstein检索数据表格检索,检索结果显示,CrossFire Beilstein检索数据表格检索,输入查询词 点击“Find”,在“Tree”中以背景颜色显示结果 双击查询结果，数据域名自动进入“Field Name”,“Enlarge”可以独立显示数据检索表格,例：查询在760毫米汞柱下沸点 120 c,不含氯元素的溶剂，同时查询其“Density”“Viscosity”信息,CrossFire

16、Beilstein检索数据表格检索,“Enlarge”填充完毕的数据表格,CrossFire Beilstein检索数据表格检索,检索结果中符合定义条件的数据一背景颜色显示,CrossFire Beilstein检索预定义检索表格,利用“Predefined Search forms”简化检索条件的填充和予检索如果予检为零，则检索结构为零。9种预定义检索表格,CrossFire Beilstein检索预定义检索表格,填充需检索内容利用List预检索 定义的检索内容将自动进入“Search Field”,“Substance Indentification Data”Predefined Sea

17、rch forms,CrossFire Beilstein检索预定义检索表格,输入检索内容，利用“List”进行预检索,例 查询化合物信息：CAS=610-96-6,Molecular Formula=C8H7ClO2,CrossFire Beilstein检索预定义检索表格,预检索显示可以检索到相关数据,CrossFire Beilstein检索预定义检索表格,填充检索条件提交检索,CrossFire Beilstein检索预定义检索表格,检索数据记录显示,CrossFire Beilstein检索二次检索,“Hitsets”对各命中集以列表显示,在“Hitsets”中选择不同的命中集组合进

18、行二次检索,CrossFire Beilstein检索结构检索,用“Draw Structure”打开画图工具或在“Structure/Reaction search”中双击打开画图工具,CrossFire Beilstein检索结构检索,如果无法打开画图工具，请确认是否正确的选择了画图工具在菜单“Option”中点击“Select Structure Editor”,CrossFire Beilstein检索结构检索选项,立体化学检索条件选项区,结构检索半反应检索,子结构检索选项取代基位置,其他检索条件选项,CrossFire Beilstein检索精确结构检索,旋转、删除、画笔,原子、键、

19、环,化合物精确结构,CrossFire Beilstein检索精确结构检索,化合物结构自动进入结构将化合物结构Copy到“Query builder”,CrossFire Beilstein检索精确结构检索,将化合物结构Copy到“Query builder”后开始检索,CrossFire Beilstein检索精确结构检索结果显示,选择“View all”查看该化合物全部信息,CrossFire Beilstein检索子结构检索,画出子结构在“Generics”中选取 Beilstein 定义的广义基团定义取代基的位置,CrossFire Beilstein检索子结构检索,进行子结构检索,C

20、rossFire Beilstein检索子结构检索结果显示,显示红色的部分为检索的子结构,CrossFire Beilstein检索保存/打开结构提问,用“Save Query”保存提问结构用“Open Query”复制提问结构,CrossFire Beilstein检索反应检索,例：检索亚胺生成唑烷的反应途径,利用结构检索建立检索条件,CrossFire Beilstein检索反应检索,选取反应模式 绘制结构 分别选中化合物分子结构,点击“Reactant”,”Product”,CrossFire Beilstein检索反应检索,命中176 Reactions,CrossFire Beils

21、tein检索联合检索,利用结构/预定义表格建立联合检索条件,例：检索亚胺生成唑烷的反应，产率 80%,CrossFire Beilstein检索联合检索,命中21 Reactions,CrossFire Beilstein检索联合检索,结构和数据的联合检索,检索对氯苯甲酰氯的合成方法及NMR数据,CrossFire Beilstein检索联合检索,结构和数据联合检索结果,CrossFire Beilstein检索联合检索,选择“substance as Product only”,CrossFire Beilstein检索联合检索,超链接化合物的合成反应,反应数据,CrossFire Beil

22、stein检索联合检索,超链接反应物的信息,超链接反应物的合成反应,CrossFire Beilstein检索联合检索,CrossFire Beilstein检索联合检索,超链接反应物的信息,CrossFire Beilstein检索联合检索,超链接至起始反应物,CrossFire Beilstein检索联合检索,选择“Show Hitset History”查看历史记录,CrossFire Beilstein检索联合检索,历史记录了反应的反合成路线,CrossFire Beilstein检索联合检索,对氯苯甲酰氯的NMR数据以高亮背景显示,CrossFire Beilstein检索联合检索,

23、输入化合物关键词选择需要检索的内容 可以限定选项的具体数值,例：查询 PE 的“MeltingPoint”,”Density”信息,关键词和数据的联合检索,CrossFire Beilstein检索联合检索,选择“View Hit”，检索结果只显示符合查询条件的数据内容 符合查询条件的内容以背景颜色显示,CrossFire Beilstein检索检索结果导出,选择以不同的格式导出全部检索记录,CrossFire Beilstein检索检索结果导出,选择“Compound ID to Excell as Table”的导出格式,CrossFire Beilstein检索检索结果导出,在Repor

24、t中打开导出的检索结果,CrossFire Beilstein检索检索结果报告生成,选中检索记录内容用“Copy to Report”,以不同格式导出,CrossFire Beilstein检索检索结果报告生成,在Report中打开部分导出的检索记录,CrossFire Beilstein检索定制跟踪服务,建立检索条件后点击“Crear Alert”,CrossFire Beilstein检索定制跟踪服务,填写电子邮件地址等信息,CrossFire Beilstein检索结构式的自动标准命名,点击“AutoNom”给出化学结构在“Option”中选择命名时参考的环系点击“Generate Na

25、me”,产生自动结构命名,CrossFire Gmelin 检索 选择数据库,选择数据库,CrossFire Gmelin 检索 数据域,数据域Search Field,CrossFire Gmelin 检索 数据域,CrossFire Gmelin 检索预定义表格,预定义的检索表格Predefined Search Form,CrossFire Gmelin 检索,在Search Field Name中查询合金的数据域名称,例1：查询Cr的重量百分比在15-31%的镍铬合金数据，检索结果含有热膨胀的相关数据,CrossFire Gmelin 检索,在Search Field Name中查询热

26、膨胀数据域名称,CrossFire Gmelin 检索,以“Hit Only”显示与检索条件匹配的数据,CrossFire Gmelin 检索,Draw structure利用结构进行反应检索,例 2：查询Cp2ZrCl2(茂金属催化剂）的合成信息及催化作用信息、相关文献（结构已知）,CrossFire Gmelin 检索,检索结果,CrossFire Gmelin 检索,Reaction Details化合物(Products)信息的超链接Ref 提供数据依据与更详细的反应描述,CrossFire Gmelin 检索,催化信息的超链接,CrossFire Gmelin 检索,催化信息参考文献

27、的超链接 早期文献仅提供文献源的相关信息近期文献提供经过重新整理的摘要,CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索,同时选择Beilstein/Gmelin数据库,CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索 选择数据库,仅提供共有数据域的检索,同时选择Beilstein/Gmelin,CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索 选择数据库,共同的数据域,CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索,选择2个数据库同时进行“PVC”关键词检索后显示该词在不同数据库出现的频次,CrossFire Beilstein/Gmelin

28、联合检索,在各数据库中“Substances”检索的命中数量,CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索,各数据库中命中结果的显示,CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索,Beilstein 的数据内容,CrossFire Beilstein/Gmelin联合检索,Gmelin 的数据内容,Brochure,CrossFire Beilstein/Gmelin检索使用帮助,CrossFire Beilstein/Gmelin检索使用帮助,Eductional,CrossFire Beilstein/Gmelin检索使用帮助,Help,CrossFire Beilstein/Gmelin检索使用帮助,F1-页面帮助,谢谢！,