蛋白质结构与功能-终.ppt
《蛋白质结构与功能-终.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《蛋白质结构与功能-终.ppt(187页珍藏版)》请在三一办公上搜索。
1、第二章,蛋白质的结构与功能,概述蛋白质的基本组成单位蛋白质的结构蛋白质结构与功能的关系蛋白质的重要性质、分离纯化与鉴定,本章重点与难点重点:掌握组成蛋白质的氨基酸的结构特点、分类、三个字母代号及重要理化性质;掌握蛋白质1-4级结构特点、作用力;了解蛋白质结构与功能的关系;了解蛋白质的重要理化性质难点:氨基酸结构特点、酸碱性质、等电点;蛋白质各级结构的概念和特点、结构与功能的关系;蛋白质重要理化性质的应用。,蛋白质的生物学意义和元素组成蛋白质的分类蛋白质在生产和生活中的应用,2.1 概述,蛋白质的生物学意义,蛋白质作为生命现象的物质基础之一,构成一切细胞和组织结构的最重要的组成成分,参与生物体内
2、许多方面的重要功能。,蛋白质的重要作用,(一)酶的催化作用(二)转运和贮存功能(三)运动功能(四)结构支持作用(五)免疫作用(六)生物膜功能,(七)接受和传递信息(八)代谢调节功能(九)控制生长和分化(十)感染和毒性作用(十一)其他作用,蛋白质的元素组成,元素组成:所有蛋白质都含有 C、H、O、N 四种元素,大多数蛋白质还含有少量的 S,有些蛋白质还含有一些其它元素,如 P、Fe、Cu、Mo、I等。,各种蛋白质的含氮量都很接近,都在16%左右,因此可通过测定生物样品中的含氮量计算出样品中蛋白质的含量,1克氮就相当于6.25克蛋白质。,由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测定生物样品中的含
3、氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:,100克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数 6.25100,凯氏定氮法原理,蛋白质的分类,1根据蛋白质的化学组成 2根据蛋白质的溶解性和组成3根据蛋白质分子形状4根据蛋白质生物功能,简单蛋白质和结合蛋白质,分类表,球状蛋白质和纤维状蛋白质,活性蛋白质和非活性蛋白质,蛋白质在生产和生活中的应用,在食品和饲料领域的应用 基本营养要素在医药领域的应用 生物多肽类药物在轻化工等其他领域的应用 催化剂、生产原材料等,2.2 蛋白质的基本组成单位,氨基酸的分类,氨基酸的性质,氨基酸的结构,氨基酸的结构与分类,-蛋白质的基本结构单位。,组成蛋白质的
4、氨基酸结构通式特点:L-型-氨基酸;-碳原子是不对称碳原子。,氨基酸的结构特点:,1、所有的氨基酸的共同特点是分子中同时具有1个羧基(COOH)和1个氨基(NH2),不同氨基酸之间的差异在于侧链的R基团结构不同。同一分子上既有酸性羧基,又有碱性氨基。故为两性化合物。,2、除R=H的甘氨酸外,a碳原子均为不对称碳原子,因而是光学活性物质,有D-型和L型两种异构体,构成蛋白质的氨基酸除Gly外均为L-型异构体。D型氨基酸没有营养价值,仅存在缬氨霉素、短杆菌肽等极少数寡肽之中,没有在蛋白质中发现。,构型与构象含义有根本的区别构型(configuration):是指在立体异构体中所有取代原子或基团在空
5、间的取向。如几何异构体中的顺式和反式,光学异构体中的D-型和L型。构型的转变必须经历共价键的断裂。构象(conformation):指分子中的原子或取代基团由于共价单键旋转所可能形成的不同的立体异构体。在这种立体结构中,原子或基团的空间位置改变,不涉及共价键的断裂。,氨基酸的分类,以氨基酸是否参加蛋白质的组成为依据,将氨基酸分为两大类:组成蛋白质的氨基酸 编码氨基酸(有密码子)非编码氨基酸(无密码子)非蛋白质氨基酸,根据氨基酸R基侧链的极性,可将氨基酸分为:,疏水性氨基酸(非极性氨基酸),亲水性氨基酸(极性氨基酸),编码蛋白质的氨基酸分类,不带电荷的极性氨基酸,带正电荷的碱性氨基酸,带负电荷的
6、酸性氨基酸,Asp Glu,Lys ArgHis,Ser Thr TyrAsn Gln CysGly,Ala Val IleLeu Pro Met phe Trp,根据生物体的需要,可将氨基酸分为:,必需氨基酸,半必需氨基酸,非必需氨基酸,其余氨基酸,Arg His,Lys、Val IleLeu phe Met TrpThr,编码蛋白质的氨基酸分类,编码蛋白质氨基酸的结构、代号,中性氨基酸,非编码氨基酸,属于氨基酸的衍生物,也称为修饰氨基酸。如:胱氨酸、羟赖氨酸、羟脯氨酸、L-甲状腺素等,非编码氨基酸(胱氨酸),羟脯氨酸与羟赖氨酸,非蛋白质氨基酸,不是蛋白质的组成成分以游离或结合的形式存在于生
7、物界大都是常见氨基酸的衍生物还有些是-,-,-,和D-型氨基酸一些是代谢中间产物,如瓜氨酸、鸟氨酸;-氨基丁酸等,2.2.2氨基酸的理化性质,两性解离与等电点,光学性质与吸收光谱,化学反应,一般理化性质,氨基酸为无色晶体或粉末状,不同氨基酸其晶体形状不相同。氨基酸熔点高,一般在200300C。氨基酸一般溶于水(除Cys,Tyr外),易溶稀酸稀碱,绝大多数氨基酸不溶于有机溶剂。各种氨基酸有不同的味感。氨基酸的比旋光度。,两性解离与等电点,氨基酸在水溶液中或在晶体状态时主要以两性离子的形式存在。,具有酸碱性质,是两性电解质。,等电点(isoelectric point,pI)在溶液的某一pH条件下
8、,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。,pH=pI,pHpI,pHpI,氨基酸的兼性离子,阳离子,阴离子,等电点的计算:,中性氨基酸:以Gly为例,酸性氨基酸,以Asp为例:,侧链不含离解基团的中性氨基酸:pI=(pK1+pK2)/2 对于侧链含有可解离基团的氨基酸,其pI值为两性离子两边的pK值的算术平均值。酸性氨基酸:pI=(pK1+pKR-COO-)/2 碱性氨基酸:pI=(pK2+pKR-NH2)/2,当溶液的pHpI,氨基酸带净负电荷,在电场中将向正极移动;当溶液的pHpI,氨基酸带净正电荷,在电场中将向负极移动;
9、当溶液的pHpI,氨基酸带净电荷为零,在电场中不移动。在一定pH范围内,溶液的pH离pI愈远,氨基酸所携带的净电荷愈大。,结论:,光学性质与吸收光谱,芳香族氨基酸在pH8时紫外吸收光谱,芳香族氨基酸有紫外吸收特性,所以280nm处吸收的测定,是定量蛋白质浓度最常用的方法。,紫外吸收性受溶液pH的影响,氨基酸的化学反应,(1)茚三酮反应,茚三酮在弱酸中与-氨基酸共热,引起氨基酸的氧化脱氨,脱羧反应,最后,茚三酮与反应产物氨和还原茚三酮反应,生成蓝紫色物质。由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比关系,因此可作为氨基酸定量分析方法。两个亚氨基酸脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应形成黄色化合物,(2)甲醛反应
10、-甲醛滴定法,不仅用于测定氨基酸含量,也常用来测定蛋白质水解程度。,氨基酸以两性离子形式存在,直接用酸碱滴定法很难测定其含量。,若加入中性甲醛,与氨基酸的-氨基结合,生成羟甲基衍生物,释放出H,就可以用酚酞做指示剂,用碱滴定释放出来的H。每释放出一个H,就相当于有一个氨基氮,通过氨基氮量计算氨基酸的量。-工业上常用的测定氨基氮的原理和方法。,(3)桑格(Sanger)反应2.4一二硝基氟苯(DNFB)DNP-氨基酸,黄色,层析法鉴定,被Sanger用来测定多肽的NH2末端氨基酸,(4)与荧光胺反应,氨基酸可与荧光胺反应,产生荧光产物,可用荧光分光光度计测定氨基酸含量。,(4)丹磺酰氯(DNS-
11、Cl,5-二甲基氨基萘-1-磺酰氯)反应常用于多肽链-NH2末端氨基酸的标记和微量氨基酸的定量测定。,(5)异硫氰酸苯酯反应(Edman反应)在弱碱性条件下,氨基酸中的-氨基还可以与异硫氰酸苯酯(PITC)反应,产生相应的苯氨基硫甲酰氨基酸(PTC-氨基酸)。在无水酸中,PTC-氨基酸即环化为苯硫乙内酰脲(PTH),后者在酸中极稳定。这个反应首先被Edman用于鉴定多肽或蛋白质的N-末端氨基酸。,+,PITC,苯硫乙内酰脲(PTH-AA),苯氨基硫甲酰氨基酸(PTC-氨基酸),(Edman反应),(6)与亚硝酸反应,含游离-氨基的氨基酸能与亚硝酸起反应,定量地放出氮气,氨基酸被氧化成羟酸。测定
12、N2 的体积,即可算出氨基酸的含量。Van Slyke 氨基氮测定法就是根据此反应原理。,含亚氨酸的脯氨酸则不能与亚硝酸反应。,1纸层析法,2薄层层析法,3离子交换柱层析法,4高效液相层析法,5纸电泳,氨基酸的分离与分析,制备氨基酸有4种途径:,从蛋白质水解液中分离提取;,应用发酵法生产;,应用酶的催化反应生成氨基酸;,有机合成法。,适宜于中小规模的生产,可大规模生产,氨基酸的生产(制备),蛋白质的基本组成,对生物体具有其他特殊的生理作用,参与许多代谢作用,不少已用来治疗疾病。,用于食品强化剂、调味剂、着色剂、甜味剂和增味剂,用于饲料添加剂,调节皮肤pH值和保护皮肤的功能,氨基酸的应用状况,2
13、.3 肽,肽的基本概念,肽命名、书写阅读与分类,天然活性肽,肽类的应用和发展前景,肽的基本概念,肽是由氨基酸构成的聚合物。氨基酸之间通过一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸氨基脱水缩合形成酰胺键(肽键)连接而成。,肽键:-CO-NH-,肽的命名、书写阅读与分类,由两个氨基酸组成的肽叫二肽,三个称三肽,20个以内又称为寡肽。20个以上称多肽。一般的肽都有一个游离的氨基(N端)和一个游离的羧基(C端)。阅读和书写方向是从N端到C端。多肽化合物的名称,通常按照肽内氨基酸残基的排列顺序,以残基名称(如某某氨酰)从N端依次阅读到C端,并以C端残基全名结束肽的名称。绝大多数肽为线性结构,少数肽为环状结构。,命名
14、举例,氨基末端,羧基末端,下列五肽命名为丙氨酰谷氨酰亮氨酰缬氨酰组氨酸:,注意:,在开链肽的N端和C端可以有游离的氨基和羧基,而有的开链肽的N端或C端的游离的氨基或羧基被别的基团结合(如烷基化、酰化等)或N端残基自身环化。,例如促甲状腺素释放激素的N端残基是谷氨酸,此残基易于自身环化成焦谷氨酰基(氨基与谷氨酸的羧基脱水缩和而成)。,举 例,谷胱甘肽(GSH),它的分子中有一个特殊的肽键,是由谷氨酸的羧基与半胱氨酸的氨基缩合而成。由于GSH中含有一个活泼的巯基很容易氧化,二分子GSH脱氢以二硫键相连成氧化型的谷胱甘肽(GSSG)。,谷胱甘肽的生理功用:解毒作用:与毒物或药物结合,消除其毒性作用;
15、参与氧化还原反应:作为重要的还原剂,参与体内多种氧化还原反应;保护巯基酶的活性:使巯基酶的活性基团-SH维持还原状态;维持红细胞膜结构的稳定:消除氧化剂对红细胞膜结构的破坏作用。,活性肽-激素类,活性肽-抗生素类,活性肽-在体内的重要作用,生物的生长、发育、细胞分化、大脑活动、肿瘤病变、免疫防御、生殖控制、抗衰老、生物钟规律及分子进化等均涉及到活性肽。生物活性肽是机体内传递信息、调节代谢和协调器官活动的重要化学信使。,2.4 蛋白质分子的结构,蛋白质的一级结构 肽键 一级结构测序蛋白质的三维结构 蛋白质的二级结构 超二级结构与结构域 蛋白质的三级结构与作用力 蛋白质的四级结构,蛋白质的结构层次
16、,一级结构,空间结构,二级结构三级结构四级结构,超二级结构结构域,蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是将分子量在6000道尔顿以上的多肽称为蛋白质。,1、蛋白质的一级结构,定义-蛋白质的一级结构指蛋白质中多肽链的数目;多肽连中氨基酸的排列顺序;包括二硫键的数目与位置。,氨基酸彼此之间通过肽键连接,形成一条多肽链。,肽键中的C-N键具有部分双键性质,不能自由旋转。在大多数情况下,以反式结构存在。,N=C 0.127nm键长=0.132nmN-C 0.148nm,肽键,1.由于C=O双键中的电子云与N原子上的未共用电子对发生“电子共振”,使肽键具有部分双键的性质,不能自由旋转。2.与肽键相连的六个原
17、子构成刚性平面结构,称为肽单元或肽键平面。由于-碳原子与其他原子之间均形成单键,因此两相邻的肽键平面可以作相对旋转。,肽平面或酰胺平面:,酰胺平面与-碳原子之间形成的二面角(和),蛋白质分子的一级结构测定方法,一.测定蛋白质分子量及肽链数目,二.蛋白质中肽链的拆离,三.氨基酸组成分析、氨基酸末端分析,四.肽链的部分降解及肽片断的分离,五.肽段氨基酸顺序测定及肽段重叠,六.二硫键与酰胺基的定位,1测定蛋白质分子量及肽链数目a、样品必须是均一的,纯度应在97%以上;b、测定蛋白质的分子质量(电泳、层析、离心等),其误差允许在10%左右。c、通过测定末端氨基酸残基的摩尔数与蛋白质相对分子量之间的关系
18、,即可确定多肽链的数目。,蛋白质中肽链的拆离,几条多肽链通过二硫键交联在一起。可在8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍存在下,用过量的-巯基乙醇(还原法)处理,使二硫键还原为巯基,然后用烷基化试剂(ICH2COOH)保护生成的巯基,以防止它重新被氧化。,二硫键的断裂,氨基酸组成分析、氨基酸末端分析,常用6 mol/L的盐酸或4 mol/L的硫酸,110真空水解10-24小时左右可使蛋白质完全水解。优点:不引起消旋作用,得到的是L-氨基酸。缺点:色氨酸完全被破坏;羟基氨基酸(丝氨酸或苏氨酸)有一小部分被分解;天门冬酰胺和谷氨酰胺酰胺基被水解成了羧基。,酸水解,一般用5 mol/L氢氧化钠煮沸10
19、-20小时。优点:可使蛋白质完全水解,色氨酸在水解中不受破坏。缺点:由于水解过程中许多氨基酸都受到不同程度的破坏,产率不高。部分的水解产物发生消旋化,其产物是D-型和L-型氨基酸的混合物。,碱水解,N-末端分析,二硝基氟苯法(FDNB法),二甲基氨基萘磺酰氯法(DNS-Cl法),异硫氰酸笨酯法(Edman法),C-末端分析,肼解法,还原法,还原法,羧肽酶法,肼解法 是目前最好的方法 用色谱法鉴定 多肽与肼在无水条件下加热,C-端氨基酸即从肽链上解离出来,其余的氨基酸则变成肼化物。肼化物能够与苯甲醛缩合成不溶于水的物质而与C-端氨基酸分离。注:末端若为半胱氨酸或胱氨酸就不能用此法,必须烷基化后再
20、肼解。,羧肽酶的方法 是目前最有效也是最常用的方法。羧肽酶是一类肽链外切酶,它专一地从肽链的C端依次切下一个氨基酸残基,释放出游离的氨基酸。,肽链的部分降解及肽片断的分离,酶解法:胰蛋白酶胰凝乳蛋白酶 胃蛋白酶 嗜热菌蛋白酶等,化学法:溴化氰法羟胺法,R1=Lys和Arg侧链(专一性较强,水解速度快)。R2=Pro 水解受抑。,胰蛋白酶,R1=Phe,Trp,Tyr时水解快;R2=Pro 水解受抑。,胰凝乳蛋白酶,化学法:可获得较大的肽段溴化氰水解法:它能选择性地切割由甲硫氨酸的羧基所形成的肽键。羟胺(NH2OH):专一性断裂-Asn-Gly-之间的肽键。也能部分裂解-Asn-Leu-之间的肽
21、键以及-Asn-Ala-之间的肽键。,Edman降解法,DNS-Edman方法,DABITC/PITC双耦合法,成功用于微量序列分析,顺序分析的最主要的方法,肽段氨基酸顺序测定及肽段重叠,使测定灵敏度,进一步提高,所得资料:氨基末端残基 H 羧基末端残基 S 第一套肽段 第二套肽段 OUS SEO PS WTOU EOVE VERL RLA APS HOWT HO,片段重叠法重建完整多肽链一级结构,借助重叠法确定肽段次序,末端残基 H S末端肽段 HOWT APS第一套肽段 HOWT OUS EOVE RLA PS第二套肽段 HO WTOU SEO VERL APS 推断全顺序 H O W T
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 蛋白质 结构 功能

链接地址:https://www.31ppt.com/p-6394272.html