医药专业信息及数据库检索第三节药学相关数据库.ppt

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1、第八章 药学相关数据库,第一节 网络版美国化学文摘数据库SciFinder Scholar,一、概述SciFinder Scholar是美国化学文摘（Chemical Abstracts），简称CA 的网络版产品，是世界最大的化学文摘库。也是目前世界上应用最广泛，最为重要的化学、化工及相关学科的检索工具。,（一）收录范围与更新：,收录9000余种期刊文献，以及来自47个国家和3个国际性专利组织的专利说明书、评论、技术报告、专题论文、会议录、讨论会文集等，涉及世界200多个国家和地区60多种文字的文献。收录文献量占全世界化工化学总文献量的98。网络版SciFinder更使用户可以查询到当天的最新

2、记录,SciFinder可检索数据库：CAPLUSSM CA化学文摘索引，创建于1907年，收录摘自世界各地9000多种有影响的期刊杂志文献；每天更新3000多条数据。CAS REGISTRYSM 美国化学会登记号索引，创建于1957年，美国化学会（Chemical Abstracts Socienty CAS）对每种化学物质进行唯一对应的注册登记，给予编号。索引包含3000多万个有机和无机物质，5800多万生物序列。,CASREACT 美国化学会化学反应索引，创建于1907年，收录800多万条反应记录和403,000多条文献记录。CHEMCATS 商业化学物质记录，来自655家供应商的793

3、种目录）CHMLIST 收录来自13个国家和国际性组织24万种管制品化合物的详细清单。MEDLINE（National Library of Medicine美国国立医学图书馆医学文献数据库，收录4300多种期刊，每周更新4次）,（二）SciFinder Scholar的程序安装,1安装程序 复旦大学校园网用户，进入图书馆网页的电子文献中的外文数据库后，选择SciFinder Scholar，首先下载并安装客户端程序，需要安装的程序是：SFS2007.exe，并进行相关配置。SciFinder Scholoar检索出的物质结果中，有很多提供3D视图，要直接查看，需要下载并安装ViewerLit

4、e软件。,2启动程序 运行SciFinder Scholar，通过客户端直接连接SciFinder Scholar的服务器，连接后，系统出现使用协议，接受后，进入主页，检索学术文献和信息查找特定事实或化学物质、浏览特选期刊的内容目录,SciFinder 检索主页,检索学术文献和信息,查找特定事实或化学物质,浏览特选期刊的内容目录,（三）检索途径与功能,1Explore 检索：（1）学术文献检索 提供了Research Topic主题检索、Author Name著者检索、Company Name/Organization机构检索途径（2）化学物质检索 提供了普通物质名称检索、分子式检索、结构式检

5、索、亚结构式检索相似结构式检索。（3）化学反应检索 提供了反应式检索、类反应式检索2Locate通过输入书目信息，如：期刊名称、文献题名关键词、专利号、CA文摘号等，查找特定的文献如期刊或文章3Browse可以浏览特选的期刊(通过系统个性化服务平台注册后，你可以将自己感兴趣的期刊进行选择、上传到服务器你的个人存储箱。以后可定期浏览，或通知系统发送最新内容至你的邮箱，进行定题跟踪。,Explore 检索,（四）检索规则,1主题检索 一般最佳在23个Concepts（关键词），最多不超过5个，支持自然短语检索，最好使用介词而不用Boolean运算符（如AND、OR、NOT）识别常用缩写、单复数、过

6、去式等；支持同意词，近义词检索 不能用！或*（删减字符或通配符）可用括号，括号内为前词的同义词 修饰语不能自行分配，需各自写明,2化学物质检索 化学物质名称最多输入25条；Read File必须是.txt文件；每个条目输入200字符；可以有空格，不区分大小写；如果检索结果不理想，也可在主题检索中再检；支持俗名，商品名检索,3分子式检索区分大小写；输入必须规范，否则会自动要求重输；输入时不同元素之间可用空格隔开，系统也会自动分割；输入盐类，可分为酸碱组分以”.”相连；如：H3 O4 P.3 Na；H3 O4 P.2 Na；H3 O4 P.Na分别代表不同的物质。聚合物则输入单体组成以括号加X，如

7、(C4H6)X；对于复杂的有机物质，可以通过分子式查询，并通过亚结构限定获得。,（五）文献检索结果显示,1题录 内容包括文献的著者、文献题名、来源出处（刊名、卷期页、年份，或专利号等）点击显微镜，可看详细内容2文摘 内容包括除题录外的文摘、索引词（系统提供帮助用户查找到文献的关键词）,去重,分析和优化检索功能按钮,获取相关信息功能按钮,（六）信息分析与优化检索Analyxe and Refine,在检索结果界面中，系统提供了进一步优化检索、分析检索结果、获取相关文献的功能按钮。不同的检索途径检出的结果中有不同的分析和优化功能,1.主题检索分析与优化 从Research Topic 途径检索，得

8、出检索结果后，其分析Analyxe共有11种手段，包括Author Name作者分析：检索结果中发表文献最多的著者排名，帮助确定相关领域核心著者群；CAS Registry Number:检索结果中出现最多的物质排名；CA Section Title CA学科分类：检索结果所涉及的文献最多的分类排名；,Company/Organization机构排名；Database数据库来源显示；Document Type文献类型如综述、论文、专利的文献量排名：帮助分析研究信息的新颖性、成熟性、系统性、实用性等不同文献类型以反映科学的研究过程；Index Term索引词分析：分析检索结果中检索词出现频率排名

9、帮助确定文献主要内容；Journal Name文献量来源期刊排名：帮助确定相关学术期刊群；Language文献语种分布分析：帮助了解信息的地域流向；,PublicationYear文献发表年分析：帮助了解该领域研究的历史发展，热点时代；Supplementary Term辅助索引词分析：帮助分析文献的其他内容,SciFinder Research Topic优化功能从Research Topic 检索途径得出结果后的Refine检索优化功能按钮共有7种优化检索手段。,Research Topic优化功能,Research Topic 主题限定优化：可将文献限定于某一主题；Company Nam

10、e 机构名称限定；Author Name 著者限定；Publication Year 文献发表年份限定；Document Tpye文献类型限定检索；Language 语种限定检索；Database 数据库限定检索,2化学物质检索结果分析与优化 从Explore Substances检索得出的结果，其分析Analyxe功能有6种手段，包括：Real-atom attachments真实原子附属性：帮助分析某一特定原子上的修饰;Variable group可变基团分析：帮助分析结构定义中的定义的某一类基团;R-group compositionR基团分析：帮助分析结构定义中的R基团;Precisi

11、on精确环骨架分析：帮助分析结构中存在的互变异构或者兼性离子；Ring skeletons环骨架分析；Stereo构象分析：帮助分析结构中存在构象问题,其优化限定Refine功能有：Chemical Structure结构再次限定：帮助对结构再次限定;Isotope-Containning Substances同位素限定：帮助获得结构中含有同位素的物质;Metal-Containing Substances金属包含限定：帮助获得结构中含有金属的物质;Commercial Avaliability商业化限定：帮助获得可购买的物质;Property Data性质数据限定：对可提供的物性数据分析；P

12、roperty Avaliability通过物质的理化性质对物质进行限定;Reference Av提供参考分析：帮助获得至少1篇参考信息,3化学反应分析与限定功能 从Explore Reaction 途径检索得出结果共有10种分析手段，包括：催化剂catalyst：了解反应中出现的催化剂;溶剂solvent：了解反应中可能出现的溶剂;反应步数number of steps in reaction：了解反应步数的情况;产率product yield：了解产物的产率。余分析手段同Research Topic途径。,其优化限定功能有4种，包括：Reaction Structure 结构限定：可以进一

13、步限定反应物；产物，催化剂等ProductYield产率限定：可以对反应的产率事先进行限定；Number of Steps 反应步数限定：可以对反应的步数事先进行限定；Reaction Classification反应类型限定：可以限定反应的类型是什么,（七）检索实例,1查找心血管药物Betaloc的系统化学物质名称，分子式等详细信息。在New Task 检索任务主菜单中，选择Locate检索方式，选择Locate by Substance Identifier途径，在检索栏中输入药物商品名称Betaloc。点击OK按钮，,检索结果,CA登记号56392-17-7,成份、分子式、立体化学结构、

14、,CA索引名称（Index Name）、,2查找血小板增多的基因突变相关文献，分析哪些方面研究较突出？检索步骤：选择Explore by Research Topic 检索径，在检索栏中输入自然语句“mutation gene of blood platelet”执行检索,在系统返回结果中选择逻辑关系最近的检索词出现在一个句子中的检索条件语句检索。检索条件语句选择界面在检索结果出现后，进行Analyxe的索引词（Index Term）分析,便可分析出目前研究的突出部分是动物基因变异的研究,检索条件语句匹配选择,Index Term Analyxe 索引词分析,Analyxe分析中的CA分类体系（CA Section Table Analysis），,再重返检索结果界面，进行CA分类体系分析，可得知主要研究集中在Mammailian Pathological Biochemistry 类（哺乳动物病理和生物化学方面）。,Analyxe分析中的CA分类体系（CA Section Table Analysis）,第三次选择检索结果中分析功能按钮，选择主题分类和化学物质组织文献，可以选择感兴趣的类目或相关词来阅读文献。,检索小结：,