生物化学第一章蛋白质化学.ppt
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1、第一章 蛋白质化学 周口师范学院生命科学系(2008.09),主要内容,一.蛋白质及其生物学意义,二.蛋白质的组成与分类,三.蛋白质的基本单位-氨基酸,四.肽,五.蛋白质的结构,六.蛋白质分子结构与功能的关系,七.蛋白质的性质分析,蛋白质(protein,1838年提出,最重要的/最原始的/最根本的)(是由许多不同的-氨基酸按一定的序列通过酰胺键(肽键)缩合而成的,具有复杂结构和重要生物学功能的高分子有机物质,是生命体系中最重要的成分.典型的蛋白质分子含数百至数千个Aa残基,分子量数千至数百万。,一.蛋白质及其生物学意义,蛋白质存在于所有的生物细胞中,是构成生物体最基本的结构物质和功能物质。蛋
2、白质是生命活动的物质基础,它参与了几乎所有的生命活动过程。,一.蛋白质及其生物学意义,1.作为生物催化剂:在体内催化各种物质代谢反应的酶几乎都是蛋白质。2.调节代谢反应:一些激素是蛋白质或肽,如胰岛素、生长素。3.运输载体:如红细胞中运输O2、CO2要靠Hb(Hemoglobin血红蛋白)、运输脂类物质的是载脂蛋白、运铁蛋白等转运蛋白或叫载体蛋白。4.参与机体的运动:如心跳、胃肠蠕动等,依靠与肌肉收缩有关的蛋白质来实现,如肌球蛋白、肌动蛋白。5.参与机体的防御:机体抵抗外来侵害的防御机能,靠抗体,抗体也称免疫球蛋白,是蛋白质。6.接受传递信息:如口腔中的味觉蛋白、视网膜中的视觉蛋白。7.调节或
3、控制细胞的生长、分化、遗传信息的表达。8.其它:如鸡蛋清蛋白、牛奶中的酪蛋白是营养和储存蛋白;胶原蛋白、纤维蛋白等属于结构蛋白。还有甜味蛋白、毒素蛋白等都具有特异的生物学功能。,一.蛋白质及其生物学意义,C、H、O、N,大多含有 S.有的还含有P、Fe、I、Cu、Mo、Zn(碳 50-55%、氢、氧 19-24、氮 16%、硫 0-3、)其他 微 量,1.元素组成,各元素的百分比对于大多数蛋白质都较相似,其中 N约占16%。这可用于测定蛋白质的含量凯氏定氮法。蛋白含量含氮量/16含氮量X6.25,二.蛋白质的组成与分类,2.蛋白质的氨基酸组成,蛋白质的基本结构单元是氨基酸(amino acid
4、)多个氨基酸首尾连结形成长而不分支的多聚物多肽链多肽链再折叠卷曲,形成蛋白质,3.蛋白质的分类,a-氨基酸,C,三.蛋白质的基本单位-氨基酸(amino acid),组成蛋白质的氨基酸都为L型(除Gly外),D型 与 L型,1.氨基酸的构型与分类,1.1 氨基酸的构型,1.2 蛋白质中常见氨基酸的结构,甘氨酸 Glycine,脂肪族氨基酸,氨基乙酸,氨基酸的结构,脂肪族氨基酸,甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine,-氨基丙酸,氨基酸的结构,甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine缬氨酸 Valine,脂肪族氨基酸,-氨基异戊酸,氨基酸的结构,甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Al
5、anine缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine,脂肪族氨基酸,-氨基异己酸,氨基酸的结构,甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine异亮氨酸 Ileucine,脂肪族氨基酸,-氨基-甲基戊酸,氨基酸的结构,甘氨酸Glycine 丙氨酸Alanine缬氨酸Valine亮氨酸Leucine异亮氨酸 Ileucine脯氨酸 Proline,亚氨基酸,-吡咯烷基-羧酸,氨基酸的结构,甘氨酸Glycine 丙氨酸Alanine缬氨酸Valine亮氨酸Leucine异亮氨酸 Ileucine脯氨酸Proline甲硫氨酸 Methionine,含硫氨基酸,
6、-氨基-甲硫基丁酸,氨基酸的结构,甘氨酸Glycine 丙氨酸Alanine缬氨酸Valine亮氨酸Leucine异亮氨酸Ileucine脯氨酸Proline甲硫氨酸 Methionine半胱氨酸 Cysteine,含硫氨基酸,-氨基-巯基丙酸,氨基酸的结构,芳香族氨基酸,苯丙氨酸Phenylalanine,-氨基-苯基丙酸,氨基酸的结构,芳香族氨基酸,苯丙氨酸Phenylalanine酪氨酸Tyrosine,-氨基-对羟苯基丙酸,氨基酸的结构,芳香族氨基酸,苯丙氨酸Phenylalanine酪氨酸Tyrosine色氨酸 TryptophanTrp,-氨基-吲哚基丙酸,氨基酸的结构,碱性氨基酸
7、,精氨酸 Arginine,-氨基-胍基戊酸,氨基酸的结构,碱性氨基酸,精氨酸 Arginine赖氨酸 Lysine,,-二氨基己酸,氨基酸的结构,碱性氨基酸,精氨酸 Arginine赖氨酸 Lysine组氨酸 Histidine,-氨基-咪唑基丙酸,氨基酸的结构,天冬氨酸 Aspartate,酸性氨基酸,-氨基丁二酸,氨基酸的结构,天冬氨酸 Aspartate 谷氨酸 Glutamate,酸性氨基酸,-氨基戊二酸,氨基酸的结构,丝氨酸 Serine,含羟基氨基酸,-氨基-羟基丙酸,氨基酸的结构,丝氨酸 Serine 苏氨酸 Threonine,含羟基氨基酸,-氨基-羟基丁酸,氨基酸的结构,天
8、冬酰胺 Asparagine,含酰胺氨基酸,氨基酸的结构,天冬酰胺 Asparagine谷酰胺 Glutamine,含酰胺氨基酸,1.3 氨基酸的分类,(一)根据来源分:内源氨基酸和外源氨基酸(二)根据分子组成:脂肪族、芳香族、杂环氨基酸等(三)根据R的极性分:极性和非极性氨基酸根据(四)从营养学角度分:必需氨基酸和非必需氨 基酸(五)是否组成蛋白质来分:蛋白质中常见 氨基酸、蛋白质中稀有氨基酸和非蛋白氨基酸,根据R的化学结构(1)脂肪族氨基酸:1)疏水性:Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Met、Cys;2)极性:Arg、Lys、Asp、Glu、Asn、Gln、Ser、Thr(2)芳香
9、族氨基酸:Phe、Tyr(3)杂环氨基酸:Trp、His(4)杂环亚氨基酸:Pro,根据R的极性(1)极性氨基酸:1)不带电:Ser、Thr、Asn、Gln、Tyr、Cys;2)带正电:His、Lys、Arg;3)带负电:Asp、Glu(2)非极性氨基酸:Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Met、Pro、Trp,人类自身能合成,人类自身不能合成或不能足量合成,必须依赖食物供给。,Ile Leu Lys Met Phe Thr Trp Val Arg His,Ala Asn Asp Cys Glu Gln Gly Pro Ser Tyr,Ile Met Val Leu Trp Ph
10、e Thr Lys 一 家 写 两 三 本 书 来,根据营养功能的不同,在少数蛋白质中分离出一些不常见的氨基酸,通常称为不常见蛋白质氨基酸。这些氨基酸都是由相应的基本氨基酸衍生而来的。,蛋白质中的稀有氨基酸,广泛存在于各种细胞和组织中,呈游离或结合态,但并不存在蛋白质中的一类氨基酸,大部分也是蛋白质氨基酸的衍生物。H2N-CH2-CH2-COOH H2N-CH2-CH2-CH2-COOH,(-丙氨酸),(-氨基丁酸),非蛋白质氨基酸,a.作为细菌细胞壁中肽聚糖的组分:D-Glu D-Alab.作为一些重要代谢物的前体或中间体:-丙氨酸(VB3)、鸟氨酸(Orn)、胍氨酸(Cit)(尿素)c.作
11、为神经传导的化学物质:-氨基丁酸d.有些氨基酸只作为一种N素的转运和贮藏载体(刀豆氨酸)e.调节生长作用f.杀虫防御作用 绝大部分非蛋白氨基酸的功能不清楚。,非蛋白质氨基酸存在的意义,氨基酸同时含有氨基和羧基:氨基具有碱性(质子受体),羧基具有酸性(质子供体),2.1 氨基酸的两性和等电点,2.氨基酸的理化性质,氨基酸的两性性质,NH3+-C-H,-,COO-,R,NH2-C-H,-,-,COOH,R,两性解离,两性离子:同一分子上带有正、负两种电荷Aa在水溶液或晶体状态下都以两性离子形式存在,-,氨基酸的解离曲线,以中性氨基酸为例,当溶液的pH由低到高时:,滴定曲线,等电点(isoelect
12、ric point),使氨基酸净电荷为零时溶液的pH值,用 pI 表示,此时,COOH及NH2解离度相等。正离子负离子,净电荷为零,在电场中既不向阳极 也不向阴极移动。,pI 是氨基酸的特征性常数,等电点(isoelectric point),20种氨基酸的pI,等电点的计算(以 Gly为例),pI=1/2(pK1+pK2)=1/2(2.34+9.60),pI=1/2(pK2+pK3),溶液 pH 值增大,等电点的计算(以 Lys为例),等电点的计算(以 GLu的解离为例),除Gly(R=H)之外,其余蛋白质氨基酸都有手性(不对称)碳原子,都具有旋光性。,旋光性质,2.2 氨基酸的光学性质,T
13、rp、Tyr、Phe 含芳香环共轭双键系统,最大吸收峰分别在 279nm、278nm、259nm。,紫外吸收,利用紫外分光光度法可快速、简便地测定蛋白质含量。,茚三酮反应,2.3 氨基酸的化学反应,在酸性条件下,氨基酸与茚三酮共热,生成紫色化合物(Pro呈黄色),茚三酮反应,茚三酮反应常用于aa的定性和定量分析,Sanger 反应,在弱碱溶液中,氨基酸的-氨基与2,4-二硝基氟苯(DNFB)反应,生成黄色的二硝基苯氨基酸(DNP-Aa)。,此反应最初被Sanger 用于测定肽链 N-末端氨基酸,Edman反应,可用层析法鉴定出aa的种类,与亚硝酸反应 放出氮气,氮气的一半来自氨基氮,一半来自亚
14、硝酸,在通常情况下测定生成的氮气的体积量可计算氨基酸的量,此反应可用于测定蛋白质的水解程度。,四、肽(peptide),一个氨基酸的-羧基和另一个氨基酸的-氨基脱水缩合而成的化合物。氨基酸之间脱水后形成的键称肽键(酰胺键)。,当两个氨基酸通过肽键相互连接形成二肽,在一端仍然有游离的氨基和另一端有游离的羧基,每一端连接更多的氨基酸。氨基酸能以肽键相互连接形成长的、不带支链的寡肽(25个氨基酸残基以下)和多肽(多于25个氨基酸残基)。多肽仍然有游离的-氨基和-羧基。,肽与肽键,一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基之间失水形成的酰胺键称为肽键,所形成的化合物称为肽。,由两个氨基酸组成的肽称为二肽,由
15、多个氨基酸组成的肽则称为多肽。组成多肽的氨基酸单元称为氨基酸残基。,肽平面,肽链写法,游离-氨基在左,游离-羧基在右,氨基酸之间用“-”表示肽键。H2N-丝氨酸-亮氨酸-苯丙氨酸-COOH,Ser-Leu-Phe,(S-L-F),肽的重要理化性质,a.肽晶体的熔点都很高。b.肽的酸碱性质主要来自游离末端-NH2和游离末端-COOH以及侧链上可解离的基团。c.每一种肽都有其相应的等电点.d.肽也能发生茚三酮反应、Sanger反应、DNS反应和Edman反应;还可发生双缩脲反应。,在生物体中,多肽最重要的存在形式是作为蛋白质的亚单位。也有许多分子量比较小的多肽以游离状态存在。这类多肽通常都具有特殊
16、的生理功能,常称为活性肽(active peptide)。如:脑啡肽;激素类多肽;抗生素类多肽;谷胱甘肽;蛇毒多肽等。,几种重要的多肽,L-Leu-D-Phe-L-Pro-L-Val L-Orn L-Orn L-Val-L-Pro-D-Phe-L-Leu 短杆菌肽S(环十肽)由细菌分泌的多肽,有时也都含有D-氨基酸和一些非蛋白氨基酸。如鸟氨酸(Ornithine,缩写为 Orn)。,五、蛋白质的结构,蛋白质是氨基酸以肽键相互连接的线性序列。在蛋白质中,多肽链折叠形成特殊的形状(构象)(conformation)。在结构中,这种构象是原子的三维排列,由氨基酸序列决定。蛋白质有四种结构层次:一级结
17、构(primary)二级结构(secondary)三级结构(tertiary)四级结构(quaternary),Primary secondary tertiary quaternary,1.蛋白质的一级结构(化学结构),一级结构就是蛋白质分子中氨基酸残基的排列顺序,即氨基酸的线性序列。在基因编码的蛋白质中,这种序列是由mRNA中的核苷酸序列决定的。一级结构中包含的共价键(covalent bonds)主要指肽键(peptide bond)和二硫键(disulfide bond),定义 1969年,国际纯化学与应用化学委员会(IUPAC)规定:蛋白质的一级结构指蛋白质多肽连中AA的排列顺序,包
18、括二硫键的位置。其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。,胰岛素的一级结构,2 蛋白质的二级结构,二级结构的概念:多肽链在一级结构的基础上,按照一定的方式有规律的旋转或折叠形成的空间构象。其实质是多肽链在空间的排列方式。-螺旋、-折叠、-转角、自由回转,-螺旋(-helix),-螺旋在许多蛋白中存在,如-角蛋白、血红蛋白、肌红蛋白等,主要由-螺旋结构组成。,每3.6个氨基酸残基上升一圈,相当于0.54nm。多个肽键平面通过-碳原子旋转,主链绕一条固定轴形成右手螺旋。相邻两圈螺旋之间借肽键中CO和N-H形成许多链内氢健,即每一个氨基酸残基中的NH和前面相隔三个残基的CO之间形
19、成氢键,这是稳定-螺旋的主要键。肽链中氨基酸侧链R,分布在螺旋外侧,其形状、大小及电荷影响-螺旋的形成。,-螺旋的结构要点,酸性或碱性氨基酸集中的区域,由于同电荷相斥,不利于-螺旋形成;较大的R(如苯丙氨酸、色氨酸、异亮氨酸)集中的区域,也妨碍螺旋形成;脯氨酸因其-碳原子位于五元环上,不易扭转,加之它是亚氨基酸,不易形成氢键,故不易形成上述-螺旋;甘氨酸的R基为H,空间占位很小,也会影响该处螺旋的稳定。,影响-螺旋稳定的因素,-折叠结构(-pleated sheet),是一种肽链相当伸展的结构。肽链(段)按层排列,依靠相邻肽链(段)上的羰基和氨基形成的氢键维持结构的稳定性。肽键的平面性使多肽折
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- 生物化学 第一章 蛋白质 化学
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