生物光子学2-光子学与光谱学基础.ppt
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1、主讲人:刘立新西安电子科技大学,生物光子学,第 2 章,光子学与光谱学基础,光在界面上的反射和折射:分别遵从反射定律和Snell定律;当光从光密(折射率大)介质入射到光疏(折射率小)介质的界面时,发生光的部分反射和折射现象;当入射角大于临界角时,光线会停止进入光疏介质,而全部反射回光密介质,即发生全反射。光纤若光疏介质是溶液,由于波动效应,有一部分光的能量会穿过界面渗透到溶液中,是一种非均匀波,叫做消逝波,也称隐失波或倏逝波。其在第二介质中的有效进入深度约为一个波长。全内反射荧光显微术,内容回顾,3,光的本质波粒二象性;光是一种能在真空和介质中以波动形式传播的,由振动的电波和磁波组成的电磁波,
2、同时也是一种叫做光子的能量包;凡是与光的传播有关的各种现象,如衍射、干涉和偏振,必须用波动说来解释,凡是与光和物质相互作用有关的各种现象,如物质的光吸收与发射、光电效应和光散射(康普顿效应),都必须用光子说来解释;波动性参量(波长、频率、相位、速度)粒子性参量(能量、动量),内容回顾,4,光波的干涉和衍射 光的相干性:时间相干性、空间相干性产生干涉条件:只有两列光波的频率相同,位相差恒定,振动方向一致的相干光源,才能产生光的干涉。当光遇到尖锐的障碍物、通过小孔和狭缝,或聚焦于尺寸与光波长相近的斑点时,光弯折和扩散等衍射现象就会发生。相长干涉产生亮纹,相消干涉产生暗纹。,内容回顾,5,光子的吸收
3、、发射和散射;光与分子的相互作用过程:吸收、自发辐射、受激辐射、拉曼散射;光子的吸收和发射过程用爱因斯坦(Einstein)模型描述。,物质的“波粒二象性”,内容回顾,6,分子的能级结构:电子和振动能级(量子化)在生物光子学中有重要的作用激发态的跃迁过程:有机分子的各种辐射和非辐射过程常用Jablonski能级图描述;,内容回顾,7,单重态:S0,S1,S2三重态:T1IC:内转化ISC:系间窜跃荧光磷光,光谱,电子在两个能级间的跃迁与振动耦合,分子振动,同时包含电子能级和振动能级改变的电子振动跃迁,吸收,从低能态向受激态的跃迁,发射,从高能态到低能态的跃迁,磷光自旋不守恒,荧光自旋守恒,拉曼
4、散射散射一个可见光频域的光子从而导致振动能态的改变,红外吸收吸收一个红外或远红外光子从而从一个低能态跃迁到高能态,生物光子学中用到的各种光谱,8,内容回顾,光谱仪:棱镜、光栅、FT-IR光谱仪,2.1 光在界面上的反射和折射2.2 光的本质波粒二象性2.3 光子的吸收、发射和散射2.4 光波的干涉和衍射 2.5 分子能级结构与光谱 2.6 激光与非线性光学,本 章 内 容,9,3、电子能级吸收光谱电子能级吸收用于对样品的定量分析,如紫外-可见光谱仪测量电子能级的线性吸收;线性吸收由Beer-Lambert定律定义,即一束初始强度为I0频率为v的入射光按指数衰减,即输出强度I为:系数(v)和k(
5、v)的单位为Lmol-1cm-1;(v)比k(v)更常用,称为频率v处的消光系数;b以cm为单位,是光学路径长度,定义为光通过吸收介质的路径的长度;,2.5 分子能级结构与光谱,10,线性吸收过程,2.5 分子能级结构与光谱,11,线性吸收由Beer-Lambert定律定义,即一束初始强度为I0频率为v的入射光按指数衰减,即初始强度I为:,另外一些描述吸收衰减的参量:,2.5 分子能级结构与光谱,12,T和OD考虑了光通过介质时由于吸收和散射而造成的总的强度损失;如果吸收占主导地位,则OD=A。,电子能级吸收光谱典型的吸收光谱表示为T相对于v或的曲线,或A相对于v的曲线;v定义为吸收谱带最大吸
6、收值一半处的宽带。,2.5 分子能级结构与光谱,13,吸收光谱的两种表示,电子能级吸收光谱吸收光谱能够识别发色团;吸收频率可能与发色团的环境有关;如果已知发色团在频率v处的摩尔消光系数(v),则可以得到此发色团的浓度;生物介质中可能含有多种已知摩尔消光系数的吸收性发色团,通过测量在一系列频率上的吸收率A,可以得到各种不同发色团的浓度。,2.5 分子能级结构与光谱,14,乙醚中叶绿素a的吸收光谱,2.5 分子能级结构与光谱,15,如图,在650nm处的吸收与叶绿素的绿色对应。因为,红光的吸收产生绿色的透射或散射光(补色)。,HPPH(光动力疗法中的一种药物)的吸收光谱,2.5 分子能级结构与光谱
7、,16,4、电子能级发射光谱研究从一个受激电子能态向一个较低电子能态(一般是基态)跃迁而产生的光发射;室温下生物分子即有荧光现象;从一个三重受激态到单重态的磷光则在室温下很少观察到;单光子吸收产生了红移的荧光谱带;这种在吸收谱带的峰值与发射谱带的峰值之间的偏移称为Stokes红移,吸收和发射光子之间的能量差对应于非辐射过程的能量损失;Stokes红移可能由环境效应造成,也可能是由于发射光子的受激态的结合结构的改变造成的。,2.5 分子能级结构与光谱,17,荧光素的吸收和发射光谱,2.5 分子能级结构与光谱,18,荧光成像是生物光子学中主要的光学生物成像技术。荧光光谱学包括如下特性的研究:荧光光
8、谱技术荧光激发光谱荧光寿命荧光量子产额荧光偏振,2.5 分子能级结构与光谱,19,荧光光谱技术(发射光谱)光源:在单光子激发荧光中常用方便而强大的光源是激光器,并使用一个宽带滤波器只让高于发射光谱频率的光通过;这种情况下所得的荧光叫做激光诱导荧光(LIF);探测:作为频率函数的荧光强度所成的荧光光谱在一个包含有一个分光器件的荧光光谱仪中得到;分光器件:光栅、棱镜。,2.5 分子能级结构与光谱,20,荧光激发光谱(吸收光谱)激发光谱给出关于激发分子到一个产生最大荧光的能态的信息;激发光谱中的极大值对应于产生极大荧光的吸收的光子频率。,2.5 分子能级结构与光谱,21,荧光寿命表示荧光强度的衰减,
9、是指分子受到光脉冲激发后返回基态之前在激发态平均停留的时间,通常小于100ns,它主要依赖于被测荧光团所处的微环境变化。,荧光寿命,2.5 分子能级结构与光谱,22,一个简单的荧光衰减是单指数的,即,I(t)是样品受到光脉冲激发后t时刻测量得到的强度,I0是t=0时的强度,k为衰减速率常数,kr:辐射衰减常数knr:非辐射衰减常数:荧光寿命,通过实验测量并进行单指数拟合,得到总的荧光寿命。,荧光寿命的两种测量方法:时域测量:也叫脉冲法,它是用高重复频率超短光脉冲激发样品,处于激发态的荧光分子在退激发到基态的过程中发射荧光释放能量,然后测量荧光强度衰减。频域测量:也叫相位调制法,它是用强度按正弦
10、规律调制的激光激发样品,荧光强度也是按正弦调制的,且二者调制频率相同,通过测量荧光相对于激发光的相位差及解调系数来计算荧光寿命值。,荧光寿命,2.5 分子能级结构与光谱,23,荧光的量子产额荧光的量子产额是发射光子数与吸收光子数比率的一种量度。在没有非辐射衰减时,量子产额等于1,即激发态只以辐射(荧光)过程衰减;定义式:荧光的量子产额是测量分子聚合物中荧光团周围环境的最好手段。,2.5 分子能级结构与光谱,24,荧光的偏振荧光偏振定义为:另一种定义荧光偏振的量叫荧光发射的各向异性r,定义为:I/和I分别为极化方向与激发光的极化方向平行和垂直的荧光强度。,2.5 分子能级结构与光谱,25,5、振
11、动能级光谱振动能级光谱给出振动频率信息;振动频率可提供有关化学键、键角、化学集团的详细特征描述,可以用来识别分子。振动能级光谱包括:红外光谱(吸收):吸收一个红外或远红外光子会产生振动跃迁;拉曼光谱(散射):通过拉曼散射产生振动跃迁。红外光谱和拉曼光谱是提供振动跃迁和振动能带信息的互补技术。,nphoton=nvibration,nI ns=nvibration,2.5 分子能级结构与光谱,26,振动能级光谱拉曼散射:入射和散射光子的能量差为分子振动能级差;Stokes拉曼散射:散射光子的频率低于入射光子(vv),分子从低振动能级跃迁到高振动能级;反Stokes拉曼散射:散射光子的频率高于入射
12、光子(vv),分子从较高振动能级跃迁到较低振动能级;,2.5 分子能级结构与光谱,27,振动能级光谱拉曼光谱的缺点:拉曼散射的效率很低:一般来说,在105个光子中,只有一个光子可以产生散射。(因此使用激光作为光源)拉曼光谱比IR光谱的灵敏度低,因而在固态、液态或者不含水的有机分子研究中,经常使用IR光谱来获得关于结构的详细信息;如果被测样品中具有自体荧光,则荧光信号强度要比Raman散射信号大许多数量级,因而背景荧光会淹没Raman谱带。,2.5 分子能级结构与光谱,28,振动能级光谱拉曼光谱的优点(相比于IR光谱):生物样品经常存在于水中;水对IR的吸收率很大,而拉曼散射很小,因此拉曼光谱对
13、于探测水溶液中的生物样品十分重要;做拉曼散射前,被测样品无需特殊处理,可直接利用被测样品的自然形态(液态、固态、胶状);由于可见光波段的激光可以聚焦到微米量级大小,因此可以获得微米颗粒(比如一个细胞大小)的拉曼光谱;利用与待测分子最大吸收峰相近的激光,通过共振增强拉曼散射,可以选择性地探测特定的化学片段或亚细胞组分。,2.5 分子能级结构与光谱,29,振动能级光谱拉曼光谱的发展:紫外共振Raman光谱(230250nm的紫外激发);表面增强Raman光谱术(SERS):把分子沉淀在精微粗糙的金属、金属胶状物或金属纳米颗粒的表面,从而增强这种分子的Raman跃迁的强度;这种增强可达几个数量级,金
14、和银是增强效果最大的金属。,2.5 分子能级结构与光谱,30,一些化学键的典型振动频率,2.5 分子能级结构与光谱,31,振动光谱在生物材料的结构特征识别和相互作用机理的探索上有广泛的应用。,固态的天然胰岛素和变性胰岛素的拉曼光谱,2.5 分子能级结构与光谱,32,水化蛋白质膜的典型红外光谱,2.5 分子能级结构与光谱,33,6、荧光相关光谱FCS=Fluorescence Correlation SpectroscopyFCS测量由一个只含少量分子的微体积在两个不同时刻发出的荧光强度的相关函数;典型FCS的采样体积是10-15L,而传统荧光光谱的采样体积一般是0.11.0mL或者更大;FCS
15、测量的荧光强度起伏与发生在所探测的微体积内的动态过程相关联;FCS提供由分子扩散和蛋白质-配位基结合等动态过程造成的荧光强度变化信息。,2.5 分子能级结构与光谱,34,A 由小分子扩散运动引起的荧光强度起伏,B 由扩散性较差的生物多聚物的扩散运动引起的荧光强度起伏,荧光相关光谱,2.5 分子能级结构与光谱,35,由分子扩散引起的荧光强度起伏与分子的大小有关。小分子扩散快,荧光强度起伏也快(图A);相反,大分子扩散慢,荧光强度起伏缓慢(图B)。,模拟得到的自由配位基和相应的结合配位基的FCS自相关函数。中间曲线代表混合物的FCS自相关函数。,自相关函数(定量描述荧光强度起伏),2.5 分子能级
16、结构与光谱,36,如图给出了一个典型的自相关函数G()关于时间间隔的曲线。其中自由配位基扩散速度较快,结合配位基扩散速度较慢。,2.1 光在界面上的反射和折射2.2 光的本质波粒二象性2.3 光子的吸收、发射和散射2.4 光波的干涉和衍射 2.5 分子能级结构与光谱 2.6 激光与非线性光学,本 章 内 容,37,1、激光(Laser)激光=受激辐射光放大 Light amplification by stimulated emission of radiation激光的历史可以追溯到1917年,爱因斯坦在其经典著作关于辐射的量子理论中第一次提出受激辐射的概念,论证了受激辐射、自发辐射和光吸收
17、之间的关系;1958年,Schallow和Townes提出在可见光以及红外光波段实现激发谐振的可能;1960年,Maiman发明第一台激光器,这是一台红宝石激光器,在694.4 nm波长处获得了400mJ的相干脉冲光。,2.6 激光与非线性光学,38,激光的特性激光具有与普通光源很不相同的特性,每一种特性都在生物医学领域具有重要的应用价值:单色性好(单波长)方向性好(空间发散小)相干性好能量集中激光的这些特性不是彼此独立的,它们相互之间有联系;实际上,正是由于激光的受激辐射本质决定了它是一个相干光源,因此其单色性和方向性好,能量集中。,2.6 激光与非线性光学,39,激光的原理:受激辐射:处于
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- 生物 光子 光谱 基础
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