微生物的遗传变异与育种第一节遗传物质的物质基础.ppt
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1、,第十章 微生物的遗传变异与育种 第一节 遗传物质的物质基础,遗传(heredity):亲代生物传递给子代一套实现与其相同形状的遗传信息。特点:具稳定性。遗传型(genotype):又称基因型,指某一生物个体所含有的全部基因的总和 是一种内在可能性或潜力。,变异(variation):生物体在外因或内因的作用下,遗传物质的结构或数量发生改变而导致表型改变。变异的特点:a。群体一般为10-610-10;b.形状变化的幅度大;c.变化后形成的新性状是稳定遗传的。,表型(phenotype):指生物体所具有的一切外表特征和内在特性的总和;是具一定遗传型的生物在一定条件下所表现出的具体性状。遗传型+环
2、境条件 表型。,饰变(modification):指不涉及遗传物质结构改变而只发生在转录、转译水平上的表型变化。特点:a.几乎整个群体中的每一个个体都发生同样的变化;b.性状变化的幅度小;c.因遗传物质不变,故饰变是不遗传的。引起饰变的因素消失后,表型即可恢复。,一、3 个经典实验,(一)经典转化实验(二)噬菌体感染实验(三)植物病毒重建实验,(一)经典转化实验,1928年 F.Griffith 肺炎链球菌 使小鼠患败血症死亡 S型菌株-菌株形成荚膜、菌落表面光滑、致病 R型菌株-菌株不形成荚膜、菌落表面粗糙、不致病,平板培养实验,热死S菌不生长活 R 菌长出RII菌热死S菌+活R菌长出大量R
3、菌和10-菌,活R菌+S菌无细胞抽提液 长出大量R菌和少量S菌,1944年,活R菌+加S菌DNA 加S菌DNA及DNA酶以外的酶 加S菌的DNA和DNA酶 加S菌的RNA 加S菌的蛋白质 加S菌的荚膜多糖,长出S菌,只长R菌,10分钟后 用捣碎器 使空壳脱离,吸附,离心,沉淀细胞进一步培养后,可产生大量完整的子代噬菌体,(二)噬菌体感染实验,含32P-DNA的一组:放射性85%在沉淀中,(三)植物病毒的重建实验,二、遗传物质在细胞内的存在部位和方式,(一)核酸存在的七个水平及质粒 细胞水平:存在于细胞核或核质体,单核或多核 细胞核水平:原与真核生物的细胞核结构不同,核外DNA 染色体水平:倍性
4、(真核)和染色体数 核酸水平:在原核中同染色体水平、存在部分二倍体 DNA或RNA,复合或裸露,双链或单链 基因水平:具自主复制能力的遗传功能单位,长度与信息量,转录翻译 密码子水平:信息单位,起始和终止,核苷酸水平:突变或交换单位,四种碱基,DNA 的三种存在形式,第二节 基因突变和诱变育种,一、基因突变,一、基因突变,突变:指生物体的表型发生的可遗传的变化。狭义突变:基因突变点突变 广义突变:基因突变和染色体畸变 突变的几率:10-6-10-9 野生菌株-突变-突变株,(一)基因突变类型(表型分类),营养缺陷型(株)抗性突变型(株)条件致死突变(株),形态突变型(株)抗原突变型(株)产量突
5、变型(株),营养缺陷型因突变而丧失合成某种物质的能力,因此必须在培养基中添加某种物质才能生长的突变类型。抗性突变型因突变而产生了对某种化学药物或致死物理因子的抗性的突变株。,条件致死突变型突变后在某种条件下可正常生长繁殖,而在另一条件下却无法生长繁殖的突变型 抗原突变型因突变而引起的抗原结构发生改变,(二)突变率,每一细胞在每一世代中发生某一性状突变的几率。突变率为108是指该细胞在一亿次细胞分裂中,会发生一次突变。突变率也可以用每一单位群体在每一世代中产生突变株(mutant,即突变型)的数目来表示。突变率=突变细胞数/分裂前群体细胞数,突变是独立的。某一基因发生突变不会影响其它基因的突变率
6、。,(三)基因突变的特点,以细菌的抗药性为例。不对应性:突变的性状与突变原因之间无直接的对应关系。自发性:突变可以在没有人为诱变因素处理下自发地产生。稀有性:突变率低且稳定。,(三)基因突变的特点,独立性:各种突变独立发生,不会互相影响。可诱发性:诱变剂可提高突变率。稳定性:变异性状稳定可遗传。,(三)基因突变的特点,可逆性:从原始的野生型基因到变异株的突变称为正向突变,从突变株回到野生型的过程则称为回复突变,(四)基因突变的自发性和不对应性,变量试验又称波动试验或彷徨试验。1943年,S.E.Luria 和M.Delbrck 根据统计学原理,设计了的实验。大肠杆菌 大肠杆菌的T1噬菌体(烈性
7、噬菌体)观察统计抗噬菌体的抗性菌株数量,2、涂布实验,原理与变量试验相同,方法更为简便,且可计算突变率。,(五)基因突变剂机制,自发突变 诱发突变,1、染色体数目的变化,n-2n-3n-4n 整倍变化 n-n+1、n-1,2n-2n+1、2n-1、2n-2 非整倍变化 原核生物只有一条染色体,但可成为部分二倍体。,2、染色体结构的变化,染色体结构的变化也称为染色体畸变,包括:缺失、重复、倒位、易位、转座。一般认为这是由于染色体单体发生断裂后,错误性愈合而造成的。可造成隐性基因的表达、显形基因的拷贝数增多、某一性状的缺失、基因间连锁程度的变化、不同染色体基因的连锁等变化。,重复、缺失、倒位、易位
8、,转座因子(可移动基因、跳跃基因),插入序列 IS 转座子 Tn 转座噬菌体 Mn 转座频率:10-510-7 转座因子-复制-非同源重组 正向重复序列-转座酶基因-反向重复序列,3、基因突变(点突变)的诱变机制,诱变剂(mutagen):凡能提高突变率的任何理化因子,就称为诱变剂 种类:诱变剂的种类很多 代表性的诱变剂的作用机制。,(1)碱基置换(substitution),一对碱基被另一对碱基所置换。转换(transition),即DNA链中的一个嘌呤被另一个嘌呤或是一个嘧啶被另一个嘧啶所置换;颠换(transversion),即一个嘌呤被一个嘧啶,或是一个嘧啶被一个嘌呤所置换。,碱基的置
9、换(实线代表转换;虚线代表颠换),碱基置换后会出现下列几种情况,(1)错义突变 一种氨基酸,变成另一种氨基酸;(2)无义突变 氨基酸的碱基置换后变成 UAG(琥珀突变)、UAA(赫石突变)UGA(乳石突变)等终止密码子;,配对原则,嘌呤-嘧啶 6位上是氨基的嘌呤-4位上是酮基的嘧啶 6位上是酮基的嘌呤-4位上是氨基的嘧啶,*烷化剂(alkylating agent),带有一个或多个活性烷基,诱变作用是其与DNA中的碱基或磷酸作用。常见的烷化剂有硫酸二乙酯(EDS)、甲基磺酸乙酯(EMS)、N-甲基-N-硝基-N-亚硝基胍(NTG)、亚硝基甲基脲(NMU)、氮芥、乙烯亚胺和环氧乙酸等。,B 间接
10、引起置换的诱变剂,这类诱变剂主要是一些碱基类似物 这些化合物有5-溴尿嘧啶(5-BU),5-氟尿嘧啶(5-FU)、8-氮鸟嘌呤(8-NG)和2-氨基嘌呤(2-AP)等。它们与正常碱基的结构类似,在DNA复制时,它们可以被错误地掺入DNA,引起诱变效应,所以说它们引起碱基置换的作用是间接的。,(2)移码突变,移码突变是指由一种诱变剂引起DNA分子中的一个或少数几个核苷酸的插入或缺失,从而使该部位后面的全部遗传密码发生转录和翻译错误的一类突变。,移码突变诱变剂,吖啶类染料(原黄素、吖啶黄、吖啶橙等)和一系列称为ICR类的化合物(美国的肿瘤研究所合成而得名),都是移码突变的有效诱变剂,4、自发突变的
11、机理,大多数自发突变本质上也是诱发的,只不过它不是人为的,而是自然环境或细胞内环境诱发的。细胞外因素、细胞内因素 DNA分子内部因素,(1)细胞外的诱发因素,自然环境或人工条件下的物理和化学因素 自然环境中,宇宙间的短波辐射、宇宙线和紫外线等,多因素低剂量长期辐射的综合效应,将会引起生物的自发突变。自然环境中存在低剂量的金属离子、高分子化合物、生物碱药物、染料等都能成为引起生物突变的化学因素,(2)细胞内的诱发因素,细胞的代谢活动会产生一些诱变物质,如过氧化氢、咖啡碱和重氮丝氨酸等,它们是引起自发突变的内源诱变剂。许多微生物的陈旧培养物中易出现自发突变株,可能就是这类原因。,(3)DNA分子内
12、部因素,DNA分子中的碱基存在着互变异构效应。A、T、G、C四种碱基,存在酮基结构(T,G)或氨基结构(A,C),酮式与烯醇式存在互变异构,氨基式与亚氨基式存在互变状态,(3)DNA分子内部因素,一般生理条件下,碱基互变平衡反应倾向于酮式或氨基式,DNA两条互补链之间总是以A:T和CG碱基配对。但T偶尔也会以稀有的烯醇式形式出现,这样在DNA复制到达这一位置的瞬间,新合成链中T对应的不再是A,而是G;,(3)DNA分子内部因素,同理,若碱基C以稀有的亚氨基形式出现,在DNA复制到达这一位置的瞬间,则它对应的不是G 据统计,碱基对发生自发突变的几率约为10 8 10 9。,环出效应,环状突出效应
13、。有人提出,在DNA的复制过程中,如果其中某一单链上偶然产生一个小环,则会因其上的基因越过复制而发生遗传缺失,(六)紫外线对DNA的损伤及其修复,嘧啶对紫外线的敏感性要比嘌呤强得多。嘧啶的光化产物主要是二聚体和水合物。其中了解较清楚的是胸腺嘧啶二聚体的形成和消除。紫外线的主要作用是使同链DNA的相邻嘧啶间形成共价结合的胸腺嘧啶二聚体。,1、光复活作用(photoreactivation),经紫外线照射后的微生物立即暴露于可见光下时,可明显降低其死亡率的现象,称为光复活作用。对照:8106个/ml E.coli U.V.100个/ml 试验:8106个/ml E.coli U.V.360490n
14、m 2106个/ml E.coli 可见光,30分,1、光复活作用(photoreactivation),经紫外线照射后形成的带有胸腺嘧啶二聚体的DNA分子,在黑暗下会被一种光激活酶即光裂合酶(photolyase)结合,当形成的复合物暴露在可见光(300500nm)下时,此酶会因获得光能而发生解离,从而使二聚体重新分解成单体。光激活酶也从复合物中释放出来。每一E.coli细胞中约含有25个光激活酶分子。,1、光复活作用(photoreactivation),由于一般的微生物中都存在着光复活作用,所以进行紫外线诱变育种时,只能在红光下照射及处理照射后的菌液。,2、暗修复作用(dark repa
15、ir),又称切除修复(excision repair)。是活细胞内一种用于修复被紫外线等诱变剂(包括烷化剂、X射线和射线等)损伤后的DNA的机制。这种修复作用与光无关。,有四种酶参与 内切核酸酶:切开 外切核酸酶:扩大 DNA聚合酶:复制 通过连接酶:连接 完成了修复作用。,3、紫外诱变方法:,设备:紫外灯、磁力搅拌器、暗室等,紫外灯:波长为253、7nm,功率是15W 处理时的照射距离:20cm 30cm 样品:要直接暴露在紫外灯下,厚度不能超过3mm 照射时,要用磁力搅拌器搅拌。处理剂量:常用照射时间或死亡率作为相对剂量,在实际应用中,用死亡率表示照射剂量更可靠。通常先绘制照射时间与死亡率
16、的关系曲线,然后选择合适的剂量。生产上经常采用的剂量:死亡率为70%80%左右。,二、突变与育种,(一)自发突变与育种 1、生产中育种 10-6突变率-寻找正向突变菌株 2、定向培育优良菌种 牛型结核杆菌-13年-230代-卡介苗(减毒活菌疫苗),(二)诱变育种,诱变+筛选 诱变是随机的;筛选是定向的 目前发酵工业生产菌株都是经过突变改造过的。,1、诱变育种的基本规律,2、诱变育种中的几个原则诱变剂的选择,1 诱变剂作用的普遍性:选择那些在其它菌种选育中诱变效果好的诱变剂。如:UV,亚硝基胍(NTG),快中子等。2诱变剂的特异性:经验之谈。如,四环素族抗生素用亚硝酸、羟胺,青霉素用氮芥、乙烯亚
17、胺、亚硝基胍,3*菌株的差异:(即使是同一菌)A:遗传性不稳定的菌株-用缓和诱变剂 B:遗传性稳定的菌株-首用强,后用缓。*考虑诱变机制:UV 嘧啶,亚硝酸 嘌呤,因此复合用为好,2、诱变育种中的几个原则诱变基本过程,选择合适的出发菌株 制备待处理的菌悬液 诱变处理 筛选 保藏和扩大试验,出发菌株的选择,出发菌株用来育种处理的起始菌株出发菌株应具备 对诱变剂的敏感性高;具有特定生产性状的能力或潜力;出发菌株的来源 自然界直接分离到的野生型菌株:历经生产考验的菌株:已经历多次育种处理的菌株:,(4).制备单细胞或单孢子悬液要求 菌体处于对数生长期,细胞分散且为单细胞,方法:玻璃珠打散10-15m
18、in;加.3%吐温80 用无菌脱脂棉过滤。制备:物理诱变剂生理盐水 化学诱变剂缓冲液 浓度:细菌、放线菌 108个/ml 霉菌、酵母菌 106个/ml,(5)诱变剂剂量的选择,用90-99%杀菌剂量 用5085%的杀菌剂量,此时正突变率高,特别是出发菌株已是高产菌株。,(6)诱变剂的处理方法,诱变剂使用方式 单一处理 复合处理:诱变处理条件:温度(生长温度)PH(缓冲剂)处理时间 诱变作用的终止:用解毒剂、用水稀释,(7)突变株的筛选,筛选条件:基因型+环境 表型 表型迟延 充分表达 分离性迟延现象 生理性迟延现象,(7)突变株的筛选,合适的筛选方法:,平皿快速检测法 变色圈法 透明圈法 生长
19、圈法 抑菌圈法 梯度平板法 摇瓶培养法,第一轮:一个出发菌株 选出200个菌株 选出50株 选出5株,诱变处理,初筛,(每瓶一株),复筛,(每瓶四株),第二轮:5个出发菌株 选出50株 选出5株,40株 40株 40株 40株 40株,诱变处理,初筛,复筛,(每瓶一株),(每瓶四株),3、三类突变株的筛选,产量突变株筛选 抗药性突变株的筛选(梯度平板法)营养缺陷型(auxotroph)的筛选,产量突变株筛选,琼脂块培养法(春日霉素)孢子悬液-诱变-适当培养(表型迟延)-涂布平板-打孔取菌落-琼脂块培养-4-5天 测定琼脂块所含的抗生素的抑菌圈-效价高菌,抗药性突变株的筛选(梯度平板法),抗药性
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