常用功能使用教程.ppt
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1、1,Chem3D介绍,提供功能制作结构:立体旋转;读取chemDraw结构;进行结构优化计算进行量化结构;并和数种量子化学软件结合在一起。,chem3D是一个三维分子结构演示软件,2,Chem3D起始界面,3,主界面,Chem3D起始界面,4,工具栏,模型窗口,模型类型,三维视图,ChemDraw切换,图标工具栏,模型数据窗口,扩大(缩小)窗口,消息窗口,状态栏,5,选择,轨迹球,单键,双键,三键,虚键,文本,橡皮,大小调整,6,显示设置,7,视频设置,模型显示设置,立体显示,弹出信息,配体显示,结构显示,原子标记,原子显示,色彩选项,8,显示设置属性,Model Type,线状模型,棒状模型
2、,球棍模型,圆柱键模型,比例模型,9,带状模型,10,结构不同显示方式,View/Setting/Model Dispaly 菜单或F6键:五种,Wire Frame,Sticks,Ball-Sticks,Cylindrical Bonds,Space Filling,11,带状模型常用于生物分子,12,代表用红蓝两种色彩的立体显示,代表用深色显示模型,就是对于模型的部分按观察者的角度不同着色,代表显示两个立体结构完全相同的模型,代表模拟现实的角度观察模型,使模型更接近真实,代表显示模型的时候将后面的部分以阴影形式表示,这样模型的立体感更强。,13,14,选择【单键】工具,在模型窗口向右按动,
3、圆柱键模型,1.利用键工具建立模型,建立3D模型,15,线状模型,16,棒状模型,17,球棍模型,18,比例模型,19,选择【轨迹球】工具,使分子模型在模型窗口沿X、Y轴旋转,X、Y轴旋转指示,20,选择【轨迹球】工具并按“Alt”键,使分子模型在模型窗口沿Z轴旋转,Z轴旋转指示,21,模型结构信息,光标位于原子上,自动显示原子信息,22,工具栏显示原子的符号和标号,23,光标位于键上,自动显示键信息,模型结构信息,24,模型的进一步信息,显示键长变化,显示键角变化,显示二面角,显示所有没有相邻的原子的距离,25,模型的键长数据,26,模型的键长和键角数据,27,乙烯模型中的双键信息,28,键
4、级改动,29,显示氢及孤对电子,30,不显示氢及孤对电子的环己烷,原子名称及序数,31,选择工具,双击原子,按顺序改变原子序号,32,隐藏或显示其它原子,居中移动到色彩调节显示元素符号显示元素编号显示实心球显示点阵表面,调整键长破坏键调整键级就近结合添加质心颠倒调整矩阵,隐藏所选部分隐藏非选部分显示所有原子显示邻近原子显示背面定义基团,33,利用【键】工具建立的结构,键角及键长可能不正常,应【整理结构】,34,环己烷的椅式构象,35,使用【文本】工具输入结构式,2.利用文本工具建立模型,36,按【Enter】自动转化为模型,37,括号表示支链,38,39,整理结构,40,简单优化观察分子变化,
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