生命史II生命早期演化的历史.ppt
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1、Dr.Baowei Zhang College of Life Science,Anhui University,生命史II生命早期演化的历程,第二部分:生命的启程,从原始细胞到多细胞,目 录,一、光合自养生物的起源二、蓝菌:繁荣与衰落三、从原核细胞到真核细胞四、元古宙晚期的生物进化事件和全球环境变化 五、从单细胞到多细胞化六、多细胞化和后生动、植物的起源 七、显生宙生物进化事件八、动物骨骼的起源与进化 九、维管植物的起源与早期进化十、进化历程与形态进化趋势,一、光合自养生物的起源,光合自养生物的起源光合作用、光合自养生物的出现晚于异养微生物;或光合自养生物起源于异养生物的说法是没有依据的。光
2、合作用与光合自养生物的记录可以追溯到35亿年前,甚至更早。,根据比较分子生物学研究(Fox,1980),许多非光合自养的生物可能起源于光合自养生物;真细菌祖先的表型可能是光合自养的。地质学、古生物学、分子生物学的多方面证据支持如下结论:光合自养、化能自养和异养生物可能同时起源于太古宙早期。,(一)原核细胞的出现原始的原核细胞是最早的生命实体。最早的细胞包括厌气型的光合自养、化能自养和异养等类型的生物。元古宙时代蓝菌一直是生物圈内的优势种。,1.最原始的细胞向细胞的进化,(1)基因组向复杂化和多功能化发展,从而导致蛋白质生物合成的出现。(2)建立起比较完善的膜系统(3)建立起比较完善合成蛋白质的
3、核糖体。,(4)通过建立比较完善的能量代谢系统,而且基因组相对集中,形成类核,就进化为原始的细菌类。(5)光合作用系统的建立,就进化为原始的光合细菌,成为现代蓝菌的祖先。,原始细胞的模式原核细胞与真核细胞有共同的起源,即它们有共同的祖先,且原核细胞比真核细胞在生物进化史上先出现。即便如此,原核细胞仍然很复杂和精密。,推测:最原始的细胞的结构原始的基因/基因组+膜系统(?),证据1:化石与沉积岩早太古代的沉积岩(变质、轻变质)在世界上只发现于两处:南非,斯瓦兹兰超群,3133亿年。澳大利亚,皮尔巴拉超群,35亿。在地层中都找到了微生物化石和叠层石。叠层石是蓝菌和其他微生物生命活动的产物,一般被视
4、为光合作用和光合微生物存在的可靠证据。,证据2:地球化学证据对于光合作用的地球化学记录也证实了光合自养生物的历史极其古老。碳元素主要以两种形式存在:1 氧化碳,即碳酸盐碳;2 还原碳,即有机碳。沉积岩中还原碳几乎都是生物成因的有机碳。,对1000多个不同时代的沉积岩样品的分析数据显示,从最古老的岩石(格陵兰的依苏阿 Isua,38亿年前)到最新的沉积岩,有机碳含量值近乎恒定,即在0.4到0.6之间变动。如果承认岩石中的有机碳来源于生物的初级生产(前显生宙主要是原核生物),那么生物固定碳可能有38亿年的历史。,新的问题:地球化学的和古生物的记录还不能区分:非释氧的光合作用(光合系统I)释氧的光合
5、作用(光合系统II)。,虽然光合自养微生物早已出现了,但地球大气圈中的自由氧的积累是极缓慢的。整个太古宙和元古宙早期的大气都是缺氧的,到20亿年前大气圈氧的分压才达到1 PAL(目前大气圈氧分压的1)。多数学者都认为:现今大气圈自由氧的含量乃是漫长的生命史上生物光合作用的累积结果。所以:光合作用的起源大大早于大气圈的氧化。,但是如何解释下列问题:(1)光合系统II、释氧的光合作用起源晚;(2)早期地球表面的大量的还原性物质消耗了光合作用释放的自由氧。推测:太古宙时代的原始蓝细菌很可能像光合细菌一样只具有光合系统 I,在进化过程中获得了光合系统 II。,二、蓝菌:繁荣与衰落,元古宙的地质特色之一
6、是大规模的叠层石碳酸盐沉积。叠层石是由底栖的光合自养的微生物群落(主要是蓝菌)的生物沉积构造。在元古宙10多亿年时期,蓝菌一直是生物圈主要的生物类群,也是全球生态系统主要的初级生产者。,漫长的蓝菌时代造成了地球环境改变:(1)大气圈的成分改变自由氧的缓慢积累。(2)海水的物理化学性质改变 钙、镁离子浓度降低,pH值改变。(3)地球表面平均温度可能逐渐下降 大气CO2含量下降引起全球温度下降。,元古宙早期浮游生物还未大量出现,蓝菌主要占据浅海底生境,形成叠层石或微生物席生态系统。元古宙中、晚期,臭氧层形成之后,海水表层逐渐成为浮游生物的生境,真核单细胞的浮游植物与底栖的蓝菌并存。元古宙末期,大约
7、6、7亿年前,后生动物与后生植物适应辐射时,叠层石骤然衰落,蓝菌时代结束。,总结:蓝菌繁盛时代造成的环境改变是蓝菌衰落的主要原因,直接后果是生态系统的重建,后生动、植物和真核浮游生物进入新的生态系统。,三、从原核细胞到真核细胞,(一)真细菌、古细菌及早期生物三分支进化(二)真核细胞的出现(三)真核细胞起源的途径,(二)真细菌、古细菌及早期生物三分支进化,分子系统学研究揭示整个生物界进化可以分为三条主线,分表为古细菌、真细菌和真核生物。30多亿年前,它们都起源于一个“原祖”的原始细胞。,(1)古细菌,古细菌是生长在一些特殊或者极端环境中的细菌,如甲烷细菌、嗜盐菌、热原质体、硫氧化菌等等。古细菌在
8、进化上具有重要的意义,因为今天古细菌的生存环境正是地球早期的典型环境。,古细菌的发现1977年,C.R.Woese 等人在用原核生物的16S rRNA进行分子进化研究,发现一类能利用 CO2 和 H2 产生甲烷的厌氧细菌(产甲烷菌)的 rRNA序列与一般细菌的十分不同。甲烷菌序列与一般细菌的差异程度很大,比它与真核生物的 rRNA 序列的差异还要大!,甲烷菌 Methanococcus,所以,研究揭示出原核生物并非亲缘关系密切的一大类群;这些产甲烷的细菌代表一般的细菌和真核生物之外的的另一个生物类群 称为 Archaebacteria(古细菌/原细菌)。一般的细菌(包括蓝菌)则被称为 Euba
9、cteria(真细菌)。,进一步的研究确证了古细菌与真细菌之间的重大差异,同时发现古细菌的一系列分子生物学和细胞生物学特征与真核生物有不少相似之处。一些的研究表明:真核细胞可能起源于古细菌。,古细菌是与真核生物有更密切亲缘关系的原核生物,但真核生物的直接祖先应该是远古的古细菌,而非远古的真细菌。而线粒体和叶绿体则是与真细菌有较密切的进化关系。,(2)细菌界分歧:巨 VS 细,超微细菌:纳米细菌(Nanobacteria,Nb)是近年来才被发现的超微细菌。其体积极其微小,其最小直径仅50 nm,这大大低于理论上细菌体积的下限。在被发现的初期,纳米细菌的真实性就受到许多学者的质疑,由此引发了一场关
10、于微生物最小体积的争论。随着研究的深入,纳米细菌的生物学特性不断地被揭示,已经成为当前研究的一个热点问题。纳米细菌在医学界被认为与肾结石、胆囊结石、动脉粥样硬化等病理性钙化疾病的发生有关系。,世界最大细菌:由德国生物学家舒尔斯(Heide Schulz)在纳米比亚海岸发现了。这细菌呈球形细胞,阔度普遍有。它们的,住在纳米比亚海岸的沉淀物数量很多,因含有微小的硫磺颗粒,发出闪烁的白色。所以被命名为Thiomargarita namibiensis。它们生长在缺氧但养份丰富的沉淀物中,它的整个细胞就是一个液胞,富含硝酸盐,把硫化物氧化,其边缘则储存着硫磺。,Thiomargarita namibi
11、ensis,(二)真核细胞的出现,在整个生命史的大部分时间里,原核生物是地球生物圈的唯一的(主要)成员。单细胞真核生物化石出现于1920亿年前,较可靠的化石出现于元古宙晚期(810亿年)。从原核细胞向真核细胞的进化是最重要的细胞进化事件。,主张真核生物起源于细胞内共生的观点可以追溯到100多年前。1883年A.F.W.Schimper发现植物叶绿体可以自主繁殖、分裂,从而认为植物的质体来源于“寄生”的蓝绿藻(即蓝菌)。,(三)真核细胞起源的途径,1.细胞核的产生 2.细胞器的演化内共生假说渐进直接进化的假说 3.真核细胞起源于原核细胞的证据,1.细胞核的产生,从原始的原核细胞进化为真核细胞,最
12、关键的一步是细胞核的形成细胞核的起源最关键的一点是核膜的起源。有关核膜起源有一下几种观点:(1),(2),(3),(1)内褶假说细胞膜内褶把原始的类核包围而产生。(2)不同的起源说核膜的内膜与外膜有不同的起源,内膜源于细胞膜,而外膜则源于内质网膜。(3)内质网膜起源说核膜起源于由细胞膜形成的原始内质网膜。,2.细胞器的起源与内共生假说,(1)内共生(Endosymbiotic theory)内共生是指一种较大的细胞把另一种较小的细胞“吞吃”到其内,但并不把小细胞消化掉,而是建立起一种互惠的共生关系。其中大细胞利用小细胞的某种功能,从中得益,小细胞则利用大细胞提供的环境与食物,得以更好地生存。,
13、内共生学说示意图,(2)内共生起源假说,许多种单细胞的绿藻、甲藻和硅藻可以共生于高等植物、真菌、其他藻类以及脊椎动物和无脊椎动物的细胞中。蓝菌可以共生在真菌、变形虫、鞭毛虫以及已失去叶绿体的绿藻的细胞中,蓝菌可以进行光合作用,为宿主提供一定的养分。,设想一种较大的单细胞生物“吞吃”了另一种较小的单细胞生物,两者首先建立起内共生的关系(内吞)。在进化的过程中,被“吞吃”的小细胞逐步高度特化,不能再在细胞外长期生存,从而就成为了细胞内的一种具有专门功能的细胞器官(特化)。,细胞器的内共生起源学说就是根据自然界中比较普遍地存在着细胞内共生这一现象,认为一些细胞器也是通过细胞内共生的过程而起源的。很早
14、就发现叶绿体可以通过分裂来进行增殖,因此早在19世纪末20世纪初,就有人提出了叶绿体是起源于胞内共生的蓝菌的设想。,在发现线粒体这种细胞器时,就有人指出它们在大小和形状上与细菌很相似。在此基础上,20世纪20年代前后有人提出线粒体是来自胞内共生的细菌;后来发现线粒体也可以像细菌那样通过分裂而增殖,这给线粒体具内共生起源的提法增添了依据。,仅凭线粒体与细菌之间、叶绿体与蓝菌之间的一些表面上的相似性,就认为线粒体和叶绿体是的内共生起源,这未免缺乏足够的说服力。一直到20世纪60年代,内共生起源学说都没有得到多大的发展。Lynn Margulis(1938-2011)对内共生学说的发展作出了很大的贡
15、献。,Lynn Margulis,1999 National Medal Of Science Laureates,Dr.Lynn Margulis and Dorian Sagan,Carl Sagan,Carl and Wife Lynn Alexander(later Lynn Margulis)on Their Wedding Day(June 16th,1957),Carl and Son,Dorion,Carl and Linda Salzman at Their Wedding(April 6,1968),Carl Sagan and His(Third)Wife,Ann Dru
16、yan;Carl and Ann Married on June 1,1981,英国新达尔文主义生物学家理查德道金斯曾经如此评论马古利斯与她对内共生学说的研究:“我非常钦佩琳马古利斯在内共生学说上所表现的十足勇气与韧性,并带领这个理论从异端走入正统。我认为关于真核生物和早期原核生物之间产生共生的构想,是20世纪演化生物学上最伟大的成就之一,而我因此对她感到钦佩”。,Lynn Magulis 的部分著作:获得性基因组:关于物种起源的理论历代冰河志:了解全球气候变迁五大生物界:地球生命各大门图说 细胞演化中的共生:太古时期及古代的微生物共同体 性是什么?倾斜的真相:论盖亚、共生与演化 性的历史 演
17、化之舞:细菌主演的地球生命史 性的起源:三十亿年来的遗传重组 早期生命,(3)细胞器的起源,真核细胞的直接祖先是一种巨大且有吞噬能力的单细胞生物,它们靠吞噬糖类并把其分解来获得生存所需的能量。,线粒体的起源,线粒体的祖先则是一种需氧的细菌,它们能更好地利用糖类,能把其分解得更彻底以产生更多的能量。在生命演化的过程中,真核细胞的祖先吞噬了这种细菌并建立了内共生关系。,真核细胞的祖先能为细胞内的细菌提供较好的环境,并供给未完全分解的糖类,而细菌由于可轻易得到这些物质,因此能产生更多的能量,并供给宿主。这种细胞内共生对于双方都是有好处的,因而双方在进化中就可以建立一种逐步稳固的关系。,在细胞内共生的
18、细菌由于所处的环境与其独立生存时不同,因此很多原来的结构、功能、包括基因组中的很多基因等都变得不必要,并在细胞进化的过程中被“丢掉”。内共生的细菌变得越来越特化,最后演化为一种专门进行能量代谢的细胞器 线粒体。,叶绿体的起源,叶绿体起源于被吞噬进细胞内的蓝菌,它们与宿主细胞建立起内共生关系。通过类似于线粒体在进化中形成的过程特化为叶绿体。,(4)支持内共生的事实依据及反对意见,线粒体、叶绿体的产生过程。现代真核细胞中的线粒体或叶绿体只能由原有的线粒体或叶绿体通过分裂、断裂或出芽等产生,而不能从细胞的任何其他部分重新形成;失去线粒体或叶绿体的真核细胞不能再产生这些细胞器。,把线粒体从一种真核细胞
19、中分离出来后再引入到另外一种真核细胞中,这些异源的线粒体能可以生存很长的时间。叶绿体在异种细胞中的生存能力更大,如一些海螺消化细胞可以生活着源自所食的海藻叶绿体。线粒体和叶绿体都有一定的独立生存能力。叶绿体甚至可在细胞外人工培养;培养的叶绿体可进行一定次数的分裂,在相当长的时间内保持光合作用的能力。,现代的真核细胞中,可以找到介于胞内共生蓝菌与叶绿体之间的生物结构。如在一种真核藻类的细胞内,只有跟蓝菌特别相似的蓝小体,但其DNA和叶绿体的基因组近似。显微形态结构、化学成分、蛋白质来源等方面可知,线粒体和叶绿体的两层膜有不同的来源。内膜与原核生物的细胞膜相似,而外膜则与真核细胞内的膜系统相似。,
20、线粒体、叶绿体有各自的基因组,它们与细胞核的基因组有较大的差异,但与细菌的基因组比较相似。这两种细胞器的DNA复制与RNA转录所需的酶都与细菌中的相似。细胞器中蛋白质合成体系,包括核糖体(rRNA、蛋白质)、mRNA、tRNA、相关的酶、对蛋白质合成抑制物的反应,都与一般细菌中的相似。,新陈代谢途径以及参与代谢的酶,线粒体和叶绿体也分别与细菌和蓝菌的相似,而与真核生物细胞质中的有较大的差别。分子进化的研究表明,线粒体的 rRNA序列与一般细菌的比较相似,而与细胞核中的 rRNA 序列则有较大差别。对其他生物大分子(包括蛋白质)的序列分析也得出相似的结论。,分析肯定了线粒体的祖先与现代的一个类群
21、紫细菌的某些种类非常相似。叶绿体 rRNA 序列与蓝菌中的 rRNA 序列的相似程度很高,而与叶绿体所在的细胞质中的相应序列却相差较大。分子进化的研究确定了叶绿体起源于现代蓝菌某一类的远古祖先。,上述事实对线粒体和叶绿体的内共生起源学说是十分有力的支持。,内共生假说的反对意见:整个真核细胞可能都是起源于某一种细菌,只不过特化为线粒体或叶绿体的部分在进化过程中特别保守,这样在真核细胞的其他部分都发展进化了以后,线粒体和叶绿体还保留着细菌的种种特性。在对真核细胞的直接祖先没有足够的认识之前,并不能排除这种说法。,3.真核细胞起源于原核细胞的证据,原核细胞到真核细胞是渐进的、直接的进化过程的论据:原
22、核细胞与真核细胞之间存在着一些中间过渡类型:原绿藻有细胞核,但色素组成等与绿藻相似;蓝菌是原核细胞,但光合作用与真核植物相似;红藻是真核细胞,在色素组成上接近蓝菌。,从代谢的生理、生化特征的比较看,真核细胞的需氧呼吸代谢系统可能是通过原核生物发酵途径的改造而建立的。有一些光合作用的原核生物具有复杂的胞内膜结构。,通过分子进化研究,现在已知真核细胞的直接祖先与细菌十分不同,细菌却与线粒体和叶绿体有很多相似之处。现在已没有理由设想含有线粒体(或同时含有线粒体和叶绿体)的整个真核细胞都是起源于同一种远古的原核生物。内共生学说现在已经得到普遍的公认。,四、元古宙晚期的生物进化事件和全球环境变化,元古宙
23、晚期,即新元古代(Neoproterozoic,105.4亿年前),发生了一系列重要的生物进化事件和全球性的环境变化。蓝菌的衰落,生物的多细胞化,单细胞生命的优势地位逐渐被多细胞生物所替代。,在地质史上新元古代是以强烈的地质构造活动为主要特征的,板块活动活跃,中元古代形成的超级大陆(冈瓦纳大陆)处于崩解过程中。研究方式:(1)碳酸盐岩石中的锶同位素组成(87Sr86Sr)(2)碳同位素(13C12C)的分析资料,87Sr86Sr海水中的锶有两个来源:1 来自陆地表面的风化侵蚀的“陆源”的锶有较高的(87Sr86Sr)值,2 海底热泉和火山的“幔源”的锶具有低的(87Sr86Sr)值结果:8.5
24、8亿年龄的碳酸盐岩的(87Sr86Sr)值很低,比显生宙任何时代都低。这说明该时期地壳活动活跃。,13C12C光合作用优先吸收轻碳(12C)形成有机碳,表层海水的可溶性无机碳则富集了重碳(13C)。在沉积的碳酸盐岩中的两个相,即碳酸盐碳(可酸溶,无机碳)和有机碳(酸不溶的有机物),其碳同位素组成(13C)的绝对值反映了碳的流向。如果:碳酸盐相的13C愈高,表明光合作用活跃,轻碳被移出多,被注入有机碳,相有机物埋葬率高;反之亦然。,在8.56亿年前期间,碳酸盐岩石的碳酸盐相的13C值较高,但在7.2亿年前和6亿年前分别出现了两个13C低值期,低值时间对应于两个冰期。新元古代环境的特点之一是全球多
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