生物化学-第一章蛋白质.ppt
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1、第一章 蛋 白 质,7学时,Protein,第一节 蛋白质的生物学意义,体现两点:1、蛋白质是构成原生质的重要组成之一;2、是生物体赖以生存的物质基础,是生物体内一切生理机能的体现者。,一、蛋白质的生物学意义,蛋白质分布广泛、功能多样,1.催化功能-酶(如:淀粉酶)2.结构功能-皮、毛、骨、牙、细胞骨架3.收缩和运载工具-血红蛋白-鞭毛、肌肉蛋白4.免疫作用-免疫球蛋白5.激素作用6.贮藏功能-种子中的谷蛋白7.接受、传递信息的受体作用-受体蛋白 8.遗传信息的控制、细胞膜的通透性,以及高等动物的记忆、识别机构等等,1、元素的组成:C、H、O、N、S等 N的含量一般为16%凯氏定氮法测定蛋白质
2、的含量:蛋白质含量=蛋白氮6.25(6.25=1/16%)2、组成单位氨基酸,第二节 蛋白质的元素组成,第三节 蛋白质的氨基酸组成,一、蛋白质的组成单位氨基酸,1.化学结构R-CH(NH2)-COOH含有氨基的羧酸R代表氨基酸之间差异的部分叫R基,又称为侧链。,酪氨酸分子,A、地球上天然形成的氨基酸有300 种以上,但是 构成蛋白质的氨基酸只有20种,除了脯氨酸外,都是-氨基酸。什么是-氨基酸?-C-C-C-C-COOH-C-C-C-C(NH2)-COOH-氨基酸-C-C-C(NH2)-C-COOH-氨基酸-C-C(NH2)-C-C-COOH-氨基酸,除脯氨酸外,其他均具有如下结构通式。,-氨
3、基酸,可变部分,不变部分,B、除了甘氨酸外,其他均具有不对称碳原子,具有旋光性,比旋光度是氨基酸的重要物理常数之一,是鉴别各种氨基酸的重要依据。C、从蛋白质水解得到的-氨基酸均为 L-型氨基酸,2、分类,各种氨基酸的区别在于侧链R基的不同。20种基本氨基酸按R的极性可分为:(1)非极性氨基酸(2)极性氨基酸(不带电荷氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸),(一)极性氨基酸酸性氨基酸:含两个羧基,带负电荷碱性氨基酸:含两个碱基,带正电荷中性氨基酸:一氨基一羧基氨基酸(二)非极性氨基酸,氨基酸分类(根据R性质)(1)脂肪族氨基酸(2)芳香族氨基酸(3)杂环氨基酸(4)杂环亚氨基酸,丙氨酸 Alanine
4、缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine异亮氨酸 Ileucine脯氨酸 Proline甲硫氨酸 Methionine,非极性氨基酸,丙氨酸 Alanine缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine异亮氨酸 Ileucine脯氨酸 Proline甲硫氨酸 Methionine,非极性氨基酸,丙氨酸 Alanine缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine异亮氨酸 Ileucine脯氨酸 Proline甲硫氨酸 Methionine,非极性氨基酸,丙氨酸 Alanine缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine异亮氨酸 Ileucine脯氨酸 Proline甲硫氨酸 Methionine,非极
5、性氨基酸,丙氨酸 Alanine缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine异亮氨酸 Ileucine脯氨酸 Proline甲硫氨酸 Methionine,非极性氨基酸,丙氨酸 Alanine缬氨酸 Valine亮氨酸 Leucine异亮氨酸 Ileucine脯氨酸 Proline甲硫氨酸 Methionine,非极性氨基酸,苯丙氨酸Phenylalanine色氨酸 Trytophan,非极性氨基酸,苯丙氨酸Phenylalanine色氨酸 Trytophan,非极性氨基酸,特点:难溶于水,具有很强的疏水聚合能力。R基团疏水性强,在蛋白质高级结构中形成疏水键,对稳定高级结构很重要。,精氨酸 Ar
6、gini赖氨酸 Lysine组氨酸 Histidine,碱性氨基酸,碱性氨基酸在pH值7.0时侧链基团带正电荷,精氨酸 Arginine赖氨酸 Lysine组氨酸 Histidine,碱性氨基酸,碱性氨基酸在pH值7.0时侧链基团带正电荷,精氨酸 Arginine赖氨酸 Lysine组氨酸 Histidine,碱性氨基酸,组氨酸在pH值7.0时侧链基团带部分正电荷,天冬氨酸 Aspartate 谷氨酸 Glutamate,酸性氨基酸,酸性氨基酸在pH值7.0时侧链基团带负电荷,天冬氨酸 Aspartate 谷氨酸 Glutamate,酸性氨基酸,酸性氨基酸在pH值7.0时侧链基团带负电荷,丝氨
7、酸 Serine 苏氨酸 Threonine天冬酰胺 Asparagine谷氨酰胺 Glutamine半胱氨酸 Cysteine甘氨酸 Glycine,极性不带电荷氨基酸,比非极性R基氨基酸易溶于水,侧链中含有不解离的极性基。,丝氨酸 Serine 苏氨酸 Threonine天冬酰胺 Asparagine谷氨酰胺 Glutamine半胱氨酸 Cysteine甘氨酸 Glycine,极性不带电荷氨基酸,比非极性R基氨基酸易溶于水,侧链中含有不解离的极性基。,丝氨酸 Serine 苏氨酸 Threonine天冬酰胺 Asparagine谷氨酰胺 Glutamine半胱氨酸 Cysteine甘氨酸
8、Glycine,极性不带电荷氨基酸,比非极性R基氨基酸易溶于水,侧链中含有不解离的极性基。,丝氨酸 Serine 苏氨酸 Threonine天冬酰胺 Asparagine谷氨酰胺 Glutamine半胱氨酸 Cysteine甘氨酸 Glycine,极性不带电荷氨基酸,比非极性R基氨基酸易溶于水,侧链中含有不解离的极性基。,丝氨酸 Serine 苏氨酸 Threonine天冬酰胺 Asparagine谷氨酰胺 Glutamine半胱氨酸 Cysteine甘氨酸 Glycine,极性不带电荷氨基酸,比非极性R基氨基酸易溶于水,侧链中含有不解离的极性基。,丝氨酸 Serine 苏氨酸 Threoni
9、ne天冬酰胺 Asparagine谷氨酰胺 Glutamine半胱氨酸 Cysteine甘氨酸 Glycine,极性不带电荷氨基酸,比非极性R基氨基酸易溶于水,侧链中含有不解离的极性基。,二、氨基酸的理化性质,1、一般物理性质 无色结晶,熔点:均大于200,味道,溶解性:溶解于水,特别是稀酸稀碱溶液,不溶于乙醚、氯仿等有机溶剂。,构成蛋白质的20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但在远紫外区(220nm)均有光吸收。在近紫外区(220-300nm)只有Tyr、Phe和Trp有吸收光的能力。Tyr的max275nm,Phe的max257nm,Trp的max280nm。平均max280nm,氨基酸的
10、光吸收,2、两性解离和等电点,光谱分析证明,氨基酸在结晶形态或在水溶液中,并不是以游离的羧基或氨基形式存在,而是离解成两性离子。在两性离子中,氨基是以质子化(-NH3+)形式存在,羧基是以解离状态(-COO-)存在。,纯晶体状态,C,H,COOH,H,2,N,R,COO-,H3N+,水溶后等电荷状态,总电荷 0,加 酸,总电荷“+”,C,H,COOH,H,3,N,R,COO-,H3N+,水溶后等电荷状态,总电荷 0,加 碱,总电荷“-”,H2N,H2O,氨基酸是个两性电解质,既可进行酸解离也可进行碱解离,氨基酸在水溶液中就可能带+电或-电,以及呈电中性,由溶液的pH值来决定。,正离子 两性离子
11、 负离子+pHpI,氨基酸的等电点,当溶液浓度为某一pH值时,氨基酸分子中所含的-NH3+和-COO-数目正好相等,净电荷为0。这一pH值即为氨基酸的等电点(pI)。在等电点时,氨基酸既不向正极也不向负极移动。,侧链不含解离基团的中性氨基酸,其等电点是它的pK1和pK2的平均值:pI=(pK1+pK2)/2 甘氨酸:(pK1=2.34)一羧基(pK2=9.60)一氨基pI=(pK1+pK2)/2=5.97,对于侧链含有可解离基团的氨基酸,其pI值也决定于两性离子两边的pK值的平均值。酸性氨基酸:pI=(pK1+pK2)/2 谷氨酸(二羧基一氨基)碱性氨基酸:pI=(pK2+pK3)/2 赖氨酸
12、(一羧基二氨基),pK1,pK1,pK2,pK2,pK3,pK3,答案:,中性氨基酸pI一般为6.0提问:为什么偏酸性?-COOH解离程度略大于-NH2提问:酸性氨基酸的pI(更偏酸、更偏碱)?更酸(3.0 左 右)碱性氨基酸pI更碱(7.610.7)(只 有 三 种)提 问:大多数氨基酸在中性(pH=7)时,带 电?,等电点的应用,氨基酸溶液能起缓冲作用-pI区发挥最大的缓冲作用;等电点时,氨基酸的溶解度最小-氨基酸的分离;氨基酸的带电性质-电泳或离子交换法分离混合氨基酸。,3、氨基酸的化学反应,氨基酸的化学反应主要是指它的-氨基和-羧基以及侧链上的功能团所参与的那些反应,因此可以发生的反应
13、很多,以下介绍几种反应。,亚硝酸盐反应烃基化反应酰化反应脱氨基反应西佛碱反应,成盐成酯反应成酰氯反应脱羧基反应叠氮反应,侧链反应,(1)与茚三酮反应,用途:常用于氨基酸的定性或定量分析。,-氨基和羧基共同参与的反应,茚三酮,水合茚三酮,所有的游离氨基酸都有此反应,并产生蓝紫色物质,但脯氨酸与茚三酮反应产生的为黄色物质。因为它们是亚氨基酸,反应不释放NH3,而直接生成黄色物质。应用:比色分析(定量氨基酸)、显色剂、气体分析法,与2,4二硝基氟苯(DNFB)反应,(2)Sanger反应,应用:该反应常用于多肽链或蛋白质的N-端氨基酸的分析。,1953年,Sanger大量使用该反应测定了牛胰岛素的一
14、级结构(51个氨基酸),所以该反应也称Sanger反应。近年来测定N-端氨基酸,广泛使用5-二甲氨基萘磺酰氯。反应生成物5-二甲氨基萘磺酰氨基酸有强烈的荧光。可用荧光光度计快速测定出来。而且灵敏度极高。,(2)Sanger反应,与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应,(3)Edman反应,(3)Edman反应 与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应,在弱碱性条件下,氨基酸中的-氨基与PITC反应,生成相应的PTC-氨基酸,在无水酸中,PTC-氨基酸环化成PTH-氨基酸。,蛋白质+PITC PITC蛋白质末端PTH-氨基酸和比原来少一个氨基酸的多肽链。层析法鉴定,确定 N-端氨基酸种类。剩余的肽链可重复应用
15、该法测定N-端的氨基酸,如此可测出多肽链的氨基酸顺序。,(3)Edman反应,1950年由Edman设计的,首先用来鉴定多肽或蛋白质的N-端氨基酸。后来人们根据该原理设计出“多肽顺序自动分析仪”对氨基酸顺序自动分析,肽:一个氨基酸的-羧基和另一氨基酸的-氨基脱水后形成的化合物叫做肽两个氨基酸形成的肽为二肽,二肽还有-羧基与-氨基,还可以继续与其他氨基酸缩水形成三肽、四肽等等。多个氨基酸形成的肽叫多肽,呈链状故又称多肽链。,第四节 肽(peptide),一、肽和肽链的结构及命名,肽键(酰胺键),二 肽,1.成肽反应,2、肽键,3、氨基酸残基:肽链中的氨基酸由于参加肽链的形成,损失了-NH2上的H
16、和-COOH上的-OH,称为氨基酸残基,-HN-CH-CO-R,4、N端、C端、肽的命名:肽有开链肽和环链肽之分,开链肽的两端分别有游离-NH2和-COOH,带自由氨基的一端为N端,带自由羧基的一端为C端。肽的命名:通常从肽链的N端开始,称为某氨酰某氨酰某氨酸 如:H-Glu-Cys-Gly-OH 谷氨酰半胱氨酰甘氨酸,1、谷胱甘肽(GSH):广泛地存在于动物、微生物的细胞中,是一个重要的三肽,是某些酶的辅酶。,二、重要的天然寡肽,参与体内氧化还原反应保护巯基酶或含Cys的蛋白质中-SH的还原性,2、肽类激素促甲状腺素释放因子(TRH3肽)促黄体生成激素释放抑制因子(LRH10肽)生长激素释放
17、抑制因子(GRIF14肽)加压素(ADH9肽)催产素(9肽),促甲状腺素释放因子(TRH),短杆菌肽S,干扰素、胸腺肽是治疗乙肝、肿瘤的首选药机理:由受损细胞分泌促使其他细胞产生相应的抗病毒蛋白质。,3、脑啡肽,甲硫氨酸型(Met-脑啡肽):HTyrGlyGlyPheMetOH 亮氨酸型(Leu-脑啡肽):HTyrGlyGlyPheLeuOH,脑肽是人在受到突然伤害,脑垂体自然分泌的“鸦片”。有什么生物意义吗?不受疼痛的干扰,迅速自救。,蛋白质是由一条或多条多肽链以特殊方式结合而成的生物大分子。蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是将分子量在6000道尔顿以上的多肽称为蛋白质。,第五节 蛋白质的结
18、构,蛋白质的结构,分四层次探讨,一级结构,二级结构,三级结构,四级结构,一、一级结构(线性结构),蛋白质的一级结构(primary structure)指它的蛋白质分子中各个氨基酸残基的排列顺序。,蛋白质的一级结构(Primary structure)包括:(1)多肽链的氨基酸顺序和数目;(2)多肽链内或链间二硫键disulfide bond的数目和位置。其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。,1、二硫键,由肽链中相应部位上两个半胱氨酸残基脱氢连接而成的,Mw=5734;由A(21个AA,11种),B(30AA,16种)组成,并通过Cys连结两对-S-S-;A链第6和11
19、的Cys通过-S-S-连接成链内小环。,20,19,我国1965年在世界上第一个用化学方法人工合成的蛋白质就是这种牛胰岛素。,二 硫 键,提问:维持蛋白质一级结构的作用力是?键。,答案:肽键、二硫键(都属于共价键),二、蛋白质的空间结构(三维构象,高级结构或立体结构)定义:指蛋白质分子中所有原子在三维空间排列分布和肽链的走向。,一个具有生物活性的蛋白质多肽链在一定条件下往往只有一种或很少的几种构象。为什么?主要是因为肽链结构的高度共振稳定性。,肽平面,多肽链折叠的空间限制,1、肽键CONH带有双键的性质,主链上1/3的键不能自由旋转,2、不是任意二面角(,)所决定的肽链构象都是立体化学所允许的
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- 生物化学 第一章 蛋白质
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