琼脂糖凝胶电泳-完整整理版.ppt

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1、分子生物学实验技术专题,分子生物学实验技术专题,电泳技术简介,什么是电泳技术？电泳法，是指带电荷的供试品（蛋白质、核苷酸等）在惰性支持介质（如纸、醋酸纤维素、琼脂糖凝胶、聚丙烯酰胺凝胶等）中，于电场的作用下，向其对应的电极方向按各自的速度进行泳动，使组分分离成狭窄的区带，用适宜的检测方法记录其电泳区带图谱或计算其百分含量的方法。,电泳技术的分类,电泳法可分为自由电泳（无支持体）及区带电泳（有支持体）两大类。自由电泳包括 Tise-leas式微量电泳、显微电泳、等电聚焦电泳、等速电泳及密度梯度电泳。区带电泳则包括滤纸电泳（常压及高压）、薄层电泳（薄膜及薄板）、醋酸纤维薄膜电泳、非凝胶性支持体区带

2、电泳（支持体有：淀粉，纤维素粉，玻璃粉，硅胶等)、凝胶支持体区带电泳（琼脂、琼脂糖、淀粉胶、聚丙烯酰胺凝胶）等。,凝胶电泳技术,琼脂糖凝胶电泳,聚丙烯酰胺凝胶电泳,琼脂糖凝胶电泳：实验原理,琼脂糖是由琼脂分离制备的链状多糖。其结构单元是 D-半乳糖和3.6-脱水-L-半乳糖。许多琼脂糖链依氢键及其它力的作用使其互相盘绕形成绳状琼脂糖束，构成大网孔型凝胶。其本身不带有电荷。因此该凝胶适合于免疫复合物、核酸与核蛋白的分离、鉴定及纯化。,琼脂糖凝胶电泳：实验原理,DNA分子在碱性缓冲液中带负电荷，在外加电场作用下向正极泳动。DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时，有电荷效应与分子筛效应。不同DNA的分子量大

3、小及构型不同，电泳时的泳动率就不同，从而分出不同的区带。DNA 分子的迁移速度与相对分子质量的对数值成反比关系。凝胶电泳不仅可分离不同相对分子质量的DNA，也可以分离相对分子质量相同，但构型不同的DNA 分子。,琼脂糖与琼脂的区别,琼脂是由琼脂糖（agarose）和琼脂果胶（agaropectin）组成的。琼脂糖的结构单元是 D-半乳糖和3.6-脱水-L-半乳糖；琼脂果胶是由许多更小的分子组成的异质混合物。它们的结构相似，但琼脂果胶带硫酸根和羧基组分，凝胶能力差。在琼脂糖制备过程中需要把琼脂果胶尽量去除，否则琼脂糖有可能存在极微量硫酸根和丙酮酸取代电离基团，就会造成电内渗，电内渗对质点的移动产

4、生影响。质量较好的琼脂糖硫酸根含量比较低，通常在0.2%以下，电内渗比较小，通常在0.13%以下。简言之，琼脂糖是从琼脂中精细提取的，有自身独特的性质，所以琼脂糖要比琼脂贵得多。,琼脂糖凝胶电泳特点,琼脂糖凝胶的配置,1.根据电泳需要，配置合适浓度的电泳及制胶缓冲液。一般为 1 TAE或0.5TBE。注意：用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须是相同的。2.根据制胶量及凝胶浓度，在加有一定量的电泳缓冲液的三角锥瓶中，加入准确称量的琼脂糖粉。注意：总液体量不宜超过三角锥瓶的50%容量。3.在微波炉中加热溶解琼脂糖注意：必须保证琼脂糖充分完全溶解，否则，会造成电泳图像模糊不清。加热时如胶液剧烈沸腾

5、发泡，停止加热。微波炉中加热时间不宜过长。,琼脂糖凝胶的配置,3.使溶液冷却至60左右，如需要可在此时加入溴化乙锭(EB)溶液使其终浓度为0.5ug/ml，并充分混匀不提倡使用。注意：溴化乙锭是一种致癌物质。使用含有溴化乙锭的溶液时，请戴用手套。溴化乙锭在可见光下会分解。5.将琼脂糖溶液倒入制胶模中，然后在适当位置处插上梳子。凝胶厚度一般在35 mm 之间。注意：不要产生气泡，溶液温度太高(60)，会使得水分过分蒸发，改变凝胶离子浓度，影响电泳效果。6.在室温下使胶凝固（大约30 分钟），然后放置于电泳槽中进行电泳。注意：凝胶不立即使用时，用保鲜膜将凝胶包好在4下保存，或者放在制胶的缓冲液中，

6、一般可保存25 天。,琼脂糖凝胶缓冲液,有几种缓冲液适用于天然双链DNA的电泳Tris-乙酸盐和EDTA缓冲液（pH8.0,TAE，也称为E缓冲液）Tris-硼酸盐缓冲液(TBE)Tris-磷酸盐缓冲液(TPE),琼脂糖凝胶缓冲液,琼脂糖凝胶缓冲液,琼脂糖凝胶缓冲液,TBE可以使用10次左右，而TAE用23次就要更换。电泳缓冲液多次使用后，离子强度降低，pH值上升，缓冲性能下降，可能使DNA条带模糊或不规则DNA带迁移。电泳缓冲液刚好没过凝胶1mm为好，太多则电流加大，凝胶发热。,琼脂糖凝胶载样缓冲液,载样缓冲液是上样时与样品一起加入泳道的。载样缓冲液有三个作用：增加样品密度以保证DNA沉入加

7、样孔内；使样品带有颜色便于上样操作；其中的染料在电场中以可以预测的泳动速率向阳极迁移。上样缓冲液有几种，但基本都包括溴酚蓝和二甲苯氰FF。,琼脂糖凝胶载样缓冲液,溴酚蓝在琼脂糖凝胶中迁移速率是二甲苯氰FF的2.2倍，这一特性与琼脂糖凝胶的浓度无关；在0.5TBE琼脂糖凝胶电泳中溴酚蓝的速率约与长约300bp的线性双链DNA相同，而二甲苯氰FF约与长4kb的DNA相同。在0.5%-1.4%浓度的琼脂糖凝胶中基本不会变化。,琼脂糖凝胶载样缓冲液,影响电泳迁移率的因素,影响电泳迁移率的因素,影响电泳迁移率的因素,琼脂糖凝胶的浓度,影响电泳迁移率的因素,影响电泳迁移率的因素,影响电泳迁移率的因素,琼脂糖凝胶的浓度,影响电泳迁移率的因素,影响电泳迁移率的因素,DNA电泳常见问题分析,DNA电泳常见问题分析,DNA电泳常见问题分析,