发酵工程菌种的来源.ppt
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1、发酵工程 课件 Fermentation Engineering,第二章 菌种的来源,主讲人:夏帆,欢迎,光临,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,2,教学目的:了解工业化菌种的要求以及一些工业化生产菌介绍;了解菌种分离的一般过程;掌握土样采集应注意的问题,菌种的分离方法;掌握优良菌种应具备的基本特性和菌种的选育、种子扩大培养。教学重点、难点:土样采集应注意不同的土壤特点、地理和气候条件,土样的采集方法;生化反应分离法;种子扩大培养。,第二章 菌种的来源(4学时),2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,3,内 容 速 览,2诱变育种,2.2目的微生物的分离,2.1工业化菌种的
2、要求及介绍,2.3菌种选育,1自然选育,菌种的来源,2.4种子扩大培养,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,4,一、工业化菌种的要求,1 工业化菌种的要求及 已工业化产品生产菌介绍,能在廉价原料制成的培养基上生长,且大量高效地合成产物;,遗传性能要相对稳定;,菌种改造的可操作性要强;,抗噬菌体及杂菌污染能力强;,产生菌及其产物的毒性必须考虑(在分类学上最好 与致病菌无关);,发酵条件如温度、pH、溶解氧、泡沫等易控制。,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,5,放线菌(链霉素、四环素、红霉素等),真菌(青霉素、头孢菌素等),一些产芽孢的细菌(多黏菌素、丁胺菌素等),植物或动物
3、来源(蒜素、番茄素、鱼素等),1、抗生素生产有关的微生物,抗生素是次级代谢产物,需要生物体进行复杂的代谢,目前发现的生物来源如下:,二、已工业化产品生产菌介绍,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,6,初级代谢和次级代谢异同?,1 概念不同2 产物不同3 存在范围不同4 对微生物的作用不同5 同微生物生长过程的关系 6 对环境条件的敏感性或遗传稳定性上明显不同7 相关酶的专一性不同8 两者既有区别性又有连续性,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,7,概念不同,在微生物的新陈代谢中,一般将微生物从外界吸收各种营养物质,通过分解代谢和合成代谢,生成维持生命活动的物质和能量的过程,
4、称为初级代谢而次级代谢是相对于初级代谢而提出的一个概念。一般认为,次级代谢是指微生物在一定的生长时期,以初级代谢产物为前体,合成一些对微生物的生命活动无明确功能的物质的过程,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,8,产物不同,初级代谢的产物,即为初级代谢产物。如单糖或单糖衍生物、核苷酸、维生素、氨基酸、脂肪酸等单体以及由它们组成的各种大分子聚合物,如蛋白质、核酸、多糖、脂质等生命必需物质。通过次级代谢合成的产物称为次级代谢产物,大多是分子结构比较复杂的化合物。根据其作用,可将其分为抗生素、激素、生物碱、毒素等类型,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,9,存在范围不同,初级代谢
5、的代谢系统、代谢途径和代谢产物在各类生物中都基本相同,它是一类普遍存在于各类微生物中的一种基本代谢类型。次级代谢只存在于某些微生物中,并且代谢途径和代谢产物因生物不同而不同,就是同种生物也会由于培养条件不同而产生不同的次级代谢产物。,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,10,对微生物的作用不同,通过初级代谢,能使营养物转化为结构物质、具生理活性物质或为生长提供能量,因此初级代谢产物,通常都是机体生存必不可少的物质,只要在这些物质的合成过程的某个环节上发生障碍,轻则引起生长停止,重则导致机体发生突变或死亡,是一种基本代谢类型。次级代谢产物一般对菌体自身的生命活动无明确功能,不参与细胞结
6、构组成,也不是酶活性必需的,不是机体生长与繁殖所必需的物质,即使在次级代谢的某个环节上发生障碍,也不会导致机体生长的停止或死亡,至多只是影响机体合成某种次级代谢产物的能力。但许多次级代谢产物通常对人类和国民经济的发展有重大影响,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,11,2、氨基酸生产有关的微生物,用人工诱变的方法,有意识地改变微生物的代谢途径,最大限度地积累产物,这种发酵形象地称为代谢控制发酵,最早在氨基酸发酵中得到成功应用。,50、60年代以氨基酸发酵为代表的代谢控制发酵,是发酵工业发展历史上的一个转折点。,代谢控制发酵,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,12,可以大量
7、积累,人工诱变的菌株不能合成,反馈抑制,不 能 合 成,人工诱变控制黄色短杆菌的代谢过程生产赖氨酸P459,高丝氨酸脱氢酶,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,13,氨基酸生产菌的要求:,代谢途径比较清楚;代谢途径比较简单。,谷氨酸发酵的菌种:,其它氨基酸生产菌:,棒杆菌属,短杆菌属、节杆菌属或小杆菌属的棒型细菌。,常规菌种一般是以谷氨酸生产菌选育而成;大肠杆菌,枯草芽孢杆菌,工程菌。,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,14,3、酶制剂生产有关的微生物,利用微生物来进行酶制剂生产是19世纪日本人用曲霉通过固体培养生产他卡淀粉酶,而大规模工业化生产则始于20世纪40年代末日
8、本用深层发酵法生产淀粉酶。,淀粉酶:黑曲霉、米曲霉、枯草芽孢杆菌 和地衣芽孢杆菌等;-淀粉酶:米曲霉、巨大芽孢杆菌、腊状芽孢杆菌等;纤维素酶:木霉、青霉;蛋白酶:黑曲霉、米曲霉、枯草芽孢杆菌、灰色链霉菌等。,2023/9/27,15,一、菌种分离的一般过程二、微生物材料的标本采集A、不同的土壤特点B、地理和气候条件 C、微生物的生理特性 D、极端环境条件下采样分离三、标本的预处理四、目的微生物富集的一些基本方法五、菌种分离,2 自然界中目的微生物的分离,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,16,一、菌种分离的一般过程 P14,标本采集,预处理,富集培养,菌种分离(初筛、复筛),发酵性
9、能鉴定,如何使样品中所含微生物的可能性大?,如何在后续的操作中使这种可能性实现?,目的:高效地获取一株高产目的产物的微生物,问题:,菌种保藏,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,17,遵循原则:材料来源越广泛,越有可能获得新的菌种一般通过以下途径获得菌种:向菌种保藏机构索取有关菌株;由自然界采集样品,如土壤、水、动植物体等;从一些发酵制品中分离目的菌株,如从酱油中分离蛋白酶产生菌,从酒醪中分离淀粉酶或糖化酶的产生菌。,二、微生物材料的标本采集,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,18,国内菌种保藏机构27,ACCC 中国农业微生物菌种保藏管理中心 ISF 中国农业科学院土壤
10、肥料研究所SH 上海市农业科学院食用菌研究所 CACC 抗菌素菌种保藏管理中心IA 中国医学科学院抗菌素研究所 SIA 四川抗菌素工业研究所CGMCC 普通微生物菌种保藏管理中心 AS 中国科学院微生物研究所AS-IV 中国科学院武汉病毒研究所 CFCC 林业微生物菌种保藏管理中心CAF 中国林业科学院菌种保藏管理中心 CICC 工业微生物菌种保藏管理中心IFFI 轻工业部食品发酵工业科学研究所 CMCC 医学微生物菌种保藏管理中心ID 中国医学科学院皮肤病研究所 NICPB 卫生部药品生物制品监察所IV 中国医学科学院病毒研究所 CVCC 兽医微生物菌种保藏管理中心CIVBP 中国兽医药品监
11、察所 YM 云南省微生物研究所GIMCC 广东省微生物研究所微生物菌种保藏中心 CCTCC 中国典型培养物保藏中心 CCDM 华中农业大学菌种保藏中心 CMBGCAS 海洋微生物中心HKUCC 香港大学保藏中心 CUHK 香港中文大学保藏中心BCRC 台湾生物资源保藏研究中心,台湾新竹,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,19,国外菌种保藏机构,ATCC(American Type Culture Collection)美国典型菌种保藏中心 NBRC(NITE Biological Resource Center)日本技术评价研究所生物资源中心 NRRL(Agricultural R
12、esearch Service Culture Collection)美国农业研究菌种保藏中心 CBS(Centraalbureauvoor Schimmelcultures)荷兰微生物菌种保藏中心 UKNCC(The United Kingdom National Culture Collection)英国国家菌种保藏中心,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,20,自然界中微生物极其丰富,土壤是微生物最集中的地方,所以土壤样品往往是采集的首选目标。土样采集应注意以下问题:A、不同的土壤特点B、地理和气候条件 C、微生物的生理特性 D、极端环境条件下采样分离,二、微生物材料的标本采集
13、,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,21,A、不同的土壤特点P15,因土壤组成、有机物浓度、pH等条件的不同,微生物的种群分布会非常不同。如菜园和农田常以细菌和放线菌较多(偏碱);果园树根土壤中酵母菌含量较高(偏酸);动植物残骸及腐殖土中霉菌较多;根瘤菌多在豆科植物根系土壤中分离;分解石油的微生物常在油田和石油炼油厂附近的土层中分布最多。自然环境中的天然菌群,可因人类的生产或生活而改变。如在土壤中加去莠津(2-氯-4-乙胺基-6-异丙胺基-1,3,5-三嗪),会导致放线菌群的增加;在杀真菌剂存在下,诺卡氏菌属的菌更容易分离到。,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,22,B
14、、地理和气候条件,南方和北方,一年四季。许多工业微生物菌种,如抗生素产生菌,尤其是霉菌、酵母菌,大多从南方。原因是南方温度高、温暖季节长、雨水多、相对湿度高、植被覆盖面广、土壤有机质丰富。冬季温度低气候干燥;春季温度开始回升但雨水较多;夏季天气炎热温度高;秋季采土样最为理想。采土样的方法:南方,用取样铲,将表层5cm(阳光直射,蒸发量大水分少,而且受紫外线照射)左右的浮土除去,取525cm处的土样1025g,装入事先准备好的塑料袋内扎好。北方土壤干燥,可在1030cm处取样。给塑料袋编号并记录地点、土壤质地、植被名称、时间及其他环境条件。一般样品取回后应马上分离,以免微生物死亡。,2023/9
15、/27,长江大学生科院生物工程系,23,C、微生物的生理特性,筛选高温酶产生菌时,通常到温度较高的南方,或温泉、火山爆发处及北方的堆肥中采集样品;低温酶产生菌时,南北极地区、冰窑、深海;分离耐压菌则从深海底部采样,如Micrococcus aquivivus水活微球菌,耐600个大气压;分离耐高渗透压酵母菌时,通常到甜果、蜜饯或甘蔗渣堆积处采样。花蜜中分离到一株能耐30%高糖的耐高渗透压的酵母菌。,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,24,、极端环境条件下采样分离,极端微生物的采集。高热、高压、低温、强碱、强酸及高渗透压等,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,25,三、标本
16、的预处理 提高菌种分离的效率物理方法:加热(55,6min;100,1h;40 2-6h)、膜过滤法、离心法、空气搅拌法化学方法:含1%几丁质培养基、用CaCO3提高pH值进行培养(链霉菌属)诱饵法:用涂石蜡的棒置于碳源培养基中(诺卡氏菌)、花粉(游动放线菌)、蛇皮(小瓶菌属)、人头发(角质菌属),2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,26,小瓶菌属,放线菌目、游动放线菌科的一属。已记述约10个种。代表种为规则小瓶菌。形态特征:一般无气生菌丝,基内菌丝上层栅栏状菌丝或孢囊柄顶端着生瓶状、简形、铃状或略不规则的孢囊,其中有大量呈平行直线排列的杆状孢囊孢子;孢囊孢子大部具极生鞭毛,能游动;
17、细胞壁化学组分型,即以内消旋二氨基庚二酸和甘氨酸为特征组分;DNA中的G+C克分子含量为72.3。,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,27,富集的基本方法:1、控制营养:如以唯一碳源或氮源作底物;2、控制培养条件:如pH、温度、通气量等;3、抑制不需要的种类。,四、目的微生物富集的一些基本方法,富集的目的:让目的微生物在种群中占优势,使 筛选变得可能。,富集培养是在目的微生物含量较少时,根据微生物的生理特点,设计一种选择性培养基或创造有利生长条件,使目的微生物数量增加,由原来自然条件下的劣势种变成人工环境下的优势种,以利于分离得到所需要的菌株。,2023/9/27,长江大学生科院生
18、物工程系,28,富集培养方法:1、分批式富集培养:指将富集培养物转接到新的同一种培养基中,重新建立选择性压力,如此重复几次后,再取此富集培养物接种至固体培养基上,以获得单菌落。转种是关键。2、恒化式富集培养:通过改变限制性基质浓度,来控制两类不同菌株的比生长速率。,四、目的微生物富集的一些基本方法,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,29,五、菌种分离,从产物角度出发,在培养时以产物的形成有目的的设计培养基;,利用简单、快速的鉴定方法,如抗生素。,从形态的角度,菌落的外观形态,是微生物的一个重要表征。如多糖产生菌在适当的培养基上生长,从具有粘液性的菌落外观上就可以初步识别。,2023
19、/9/27,长江大学生科院生物工程系,30,1、常规分离法:平板划线法、稀释分离法和涂布法,2、生化反应分离法:透明圈法、变色圈法、抑菌圈法、生长圈法。,透明圈法:在平板培养基中加入溶解性较差的底物,使培养基混浊,这样能分解该底物的微生物便会在菌落周围产生透明圈。,圈的大小可初步反映该菌株利用底物的能力,完全可以作为菌种初筛的判断标准。如脂肪酶、淀粉酶、蛋白酶及核酸酶产生菌的分离,产有机酸菌的初筛。,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,31,2023/9/27,长江大学生科院生物工程系,32,A 分区划线法 B 连续划线法,长江大学生科院生物工程系,33,将样品分散到最低浓度,倒平板
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