基因突变及其机制.ppt
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1、第三章 基因变异与重组第一节 突变类型和基因符号 第二节 基因突变的规律 第三节 自发突变的机制第四节 诱变剂及其作用机理第五节 突变生成过程,第一节 突变类型及基因符号,定义1:突变是指生物表型突然发生的可遗传的变化。,定义2:突变是指生物生长过程中,由于内因或外因的作用导致染色体DNA结构或数量发生的改变。,突变体:带有突变基因的细胞或个体,突变型:突变体的基因型或表型称为突变型,和其相对的原存在状态称为野生型。,诱发突变的频率要远远高于自发突变频率.,一、突变类型,(一)、按突变发生原因分类,自发突变(spontaneous mutagenesis):未经任何人为的处理而自然地发生的突变
2、,称为自发突变。,诱发突变(induced mutagenesis):由人们有意识地利用物理或化学手段引起的突变称为诱发突变。,突变可以发生在染色体水平或基因水平,发生在染色体水平的突变称为染色体畸变,发生在基因水平的突变称为基因突变。,(二)、按变化范围分突变类型,1)整倍体(euploidy):含有完整的染色体组单倍体:haploid二倍体:diploid三倍体:triploid四倍体:tetraploid,1 染色体畸变(chromosome aberration),染色体数目的变化或染色体结构发生较大片段的异常改变。,(1)染色体数目的变化,单体(二倍减一,monosomic dipl
3、oid):2n-1缺体(二倍减二,nullisomic dilpoid):2n-2三体(二倍加一,trisomic diploid):2n+1四体(二倍加二,tetrasomic diploid):2n+2双二倍加一(double trisomic):2n+1+1部分二倍体(merodiploid):细菌等原核生物中由一整条染色体和外来的一个染色体片 段所构成的不完整二倍,2)非整倍体aneuploidy:含有不完整状态的染色体组,一般是指二倍体中成对染色体成员 的增加或减少。,涉及到DNA分子上较大范围的变化,往往会涉及到多个基因。,(2)染色体结构的变化,染色体结构的改变,多数是染色体或染
4、色单体遭到巨大损伤产生断裂,而断裂 的数目、位置、断裂端连接方式等造成 不同的突变.,包括染色体缺失、重复、倒位和易位等,d-相互易位,a-缺失,b-重复,c-倒位,缺失deficiency:是染色体片段的丢失。细胞学效应:缺失环遗传学效应:这种突变往往是不可逆的损伤,其结果会造成遗传平衡的失衡。,重复repetition:是染色体片段的二次出现。细胞学效应:重复环遗传学效应:这种突变有可能获得具有优良遗传性状的突变体。,倒位inversion:是指染色体的片段发生了180的位置颠倒细胞学效应:倒位环遗传学效应:造成染色体部分节段的位置顺序颠倒,极性相反。,易位translocation:是指
5、一个染色体的一个片段连接到另一个非同源染色体上。相互易位reciprocal translocation:两个非同源染色体间相互交换一部分。相互易位的细胞学效应:十字型图象,点突变point mutation:单碱基对的置换突变发生在一个基因范围内。多位点突变:突变超出一个基因范围。,(2)基因突变(gene mutation),基因突变是指一个基因内部遗传结构或DNA序列的任何改变,包括一对或少数几 对核苷酸的缺失、插入或置换,分为碱基置换和移码突变。,根据染色体局部座位内的变化范围,(2)颠换transversion:DNA链中一个嘌呤(嘧啶)被一个嘧啶(嘌呤)所置换。,1、碱基置换bas
6、e pair substitution,DNA链上一个碱基对为另一碱基对所取代叫碱基置换,(1)转换transition:DNA链中一个嘌呤(嘧啶)被另一个嘌呤(嘧啶)所置换。,一般只引起一个基因的表达出现错误。,2、移码突变frameshift mutation,在DNA序列中由于一对或少数几对核苷酸的插入或缺失,而使其后全部遗传密码的阅读框架发生移动,进而引起转录和转译错误的突变叫移码突变。,同义突变(synonymy mutation)和沉默突变(silent mutation)。,(三)按突变是否引起遗传编码特性的改变分类,一类是引起遗传性状改变:,错义突变(missense muta
7、tion),无义突变(nonsense mutation)和移码突变,一类不改变遗传性状的突变,移码突变frameshift mutation:在DNA序列中由于一对或少数几对核苷酸的插入或缺失,而使其后全部遗传密码的阅读框架发生移动,进而引起转录和转译错误的突变。,错义突变missense mutation:突变后的密码子代表另一种氨基酸。个别碱基的 改变导致多肽链上某个氨基酸为另一种 氨基酸所取代。例:GGC突变为AGC,编码的氨基酸由甘氨酸变成色氨酸。,无义突变nonsense mutation:突变后的密码子代表终止密码。例:AAG(亮氨酸)突变为UAG(终止密码子)。,沉默突变:表型
8、不发生改变的基因突变。包括同义突变和氨基酸序列发生改变而不影响蛋白质功能的错义突变。,同义突变:突变后的密码子编码的仍是同一种氨基酸。碱基序列发生改变而氨基酸 序列未发生改变的隐蔽突变。例:ATT突变为ATC,两者都编码异亮氨酸。,同义突变的发生是由于遗传密码的简并性。,同义突变不会导致编码特性的改变,但往往会引起限制酶切割位点的变化,造成 DNA限制片段长度的多态性,Tyr酪氨酸 UAG:琥珀型(Amber,Am)UAA:赭石型(Ochre,Och)UGA:乳石型(Opal,Opal),野生型wild type:表现该物种正常表型的生物。突变型mutant:由于突变导致其正常的表型发生了改变
9、的生物。,(四)、按突变的表型变化效应分类,1.形态突变型morphological mutant:引起细胞个体形态和菌落形态发生改变的突变型。是一种可见突变。,2.生化突变型:引起特定生化功能的丧失而无形态学效应的突变型。包括营养缺陷型、抗性突变型、糖代谢突变型等。,营养缺陷型auxotrophic mutant:由于代谢过程的缺陷而不能合成某种与合成初级代谢物有关的 基因产物的缺陷型。抗性突变型resistant mutant:由于基因突变而产生的对某种化学药物、致死物理因子或噬菌体 具有抗性的变异菌株a)抗药物突变型:对原本敏感的药物具有一定的耐性。b)抗噬菌体突变型:对原本敏感的噬菌体
10、产生抗性。,3.致死突变型lethal mutant:由于基因突变造成个体死亡的突变型。杂合状态的显性致死和纯合状态的隐性致死都导致个体的死亡,4.条件致死突变型condition lethal mutant:在某一条件下具有致死效应,而在另一条件下没有致死效应的突变型。如:温度敏感突 变型temperature-sensitive mutant,6.产量突变型metabolite quantitative mutant:所产生的代谢产物的产量明显有别于原始菌株的突变株称产量突变型,5.调节突变型regulatory mutant:丧失对某一基因或操纵子表达能力调节的突变型。,突变类型,按突变
11、发生原因分,自发突变诱发突变,按变化范围分,染色体畸变,数目的变化:整倍体/非整倍体,结构的变化:缺失、重复、倒位和易位等,基因突变,碱基置换:转换/颠换,移码突变,点突变/多位点突变,按是否引起表型的改变分,引起遗传性状改变:错义突变/无义突变/移码突变,不改变遗传性状的突变:同义突变/沉默突变,按突变的表型变化效应分,形态突变型生化突变型:营养缺陷型/抗性:抗药物/噬菌体致死突变型条件致死突变型调节突变型产量突变型,二 基因符号,基因命名原则1966年M.Demerec等提出,TIG遗传命名指南提出基因的名称由该基因突变后的表现型效应来命名,每一基因座位(locus)用三个斜体小写英文字母
12、表示,它们来自说明这一基因特性的一个或一组英文单词的前三个字母;如lac(lactose),his(histidine);rps(ribosomal protein small subunit),rim(ribosomal modification)产生同一突变型表型的不同基因,在三个小写字母后用不同的一个大写斜体字母来表示;如trpA,trpB同一基因的不同突变位点(mutation site)在基因符号后用阿拉伯数字表示。如trpA23突变型的基因符号用基因座符号加上加/减号(“+/-”)或其 他符号(“r/s”)来表示。如leu+,his-;strr基因表型和产物用相应基因型的正写字母表
13、示,其中第一个字母大写。如lacZ-LacZ-,突变的特征,第二节 基因突变的规律,自发性,随机性,稀有性,独立性,可诱变性,可遗传性,可逆性,(一)突变的特征,说明:E.coli 对噬菌体的抗性是在接触噬菌体之前的细胞分裂过程中自发产生的。,波动实验,1943,Luria&Delbrck设计,突变的自发性,1952,Lederberge夫妇设计,影印培养实验,直接证明抗药微生物的产生是自发产生的,与链霉素的使用无关;链霉素只是起到筛选作用。,基因突变的发生从时间、个体、位点和所产生的表型变化等方面都带有比较明显的随机性。,突变的随机性,突变总是以一定的频率在群体中发生,5-甲基胞嘧啶(MeC
14、)的存在发生DNA上短的连续重复序列处突变热点也还与诱变剂有关,突变热点(hot spots of mutation),DNA分子上各个部分有着不同的突变频率,某些位点的突变频率大大高于平均 值,这些位点称为突变热点,形成突变热点的最主要的原因,突变的稀有性,抗药性突变以一定的突变率发生在个别细胞中。正常情况下,突变发生的频率往往很低。,突变率(mutation rate):指在一个世代或其他规定单位时间,在特定环境条件下,一个细胞产生某一性状突变的概率。也可指某一群体在某一世代(即分裂一次)产生的突变菌株数目。,基因自发突变概率在10-9-10-6,转座突变在10-4,无义错义突变概率在10
15、-8,细胞分裂非同步性教正:突变率=ln2m=0.69m,突变率(m)的计算,固体平板法测突变率:m=(M2-M1)/(N2-N1),液体培养法测突变率:m=2(M2/N2-M1/N1)/(g2-g1),液体稀释法测突变率:P0=e-mN,细菌数N突变数M分裂次数g突变率m突变试管与总试管数比值P0,分裂次数 0 1 2 3 4细菌总数 N 2N 4N 8N 16N原有突变型数M=mN 2mN 4mN 8mN 16mN新增加突变型数 mN 2mN 4mN 8mN突变型/野生型(1/2)m m(3/2)m 2m,液体培养中细菌数和突变型数的关系,分裂g次后的比数是(1/2)gm,液体培养法测突变
16、率:m=2(M2/N2-M1/N1)/(g2-g1),例:在20个试管中有11个试管不含任何突变型细菌,每一试管的平均细菌数N测得是5.6108,P0=e-mNP0=11/20=0.55m=-ln P0/N=0.6/(5.6 108)=1.2 10-8,两类增变基因:一类是DNA聚合酶的各个基因一类是dam基因和mut基因,增变基因(mutator gene),当生物体内有些基因突变时,整个基因组的突变频率明显上升。这些基因称为增变基因,增变基因的突变导致突变频率的大幅提升,在大肠杆菌中,到目前为止已发现有5种DNA聚合酶,分别为DNA聚合酶、和,都与DNA链的延长有关。DNA复制中起主导作用
17、的是DNA pol,1聚合作用:235外切酶活性校对作用:353外切酶活性切除修复作用,拓展阅读:DNA聚合酶,突变的独立性,一个基因的突变不受其它基因突变的影响,两个不同基因同时发生突变的频率为两个基因各自的突变率的乘积。,交叉抗性,产生原因:作用2种或以上结构类似的抗生素或作用机制近似抗生素,从而表现为交叉抗性。,拓展阅读:抗生素的抗性机理,自发突变的频率可以通过某些理化因素的处理而大为提高。高幅度为101105倍 基因突变的可诱发性是诱变育种的基础,突变的可诱导性,突变基因和野生型基因一样是一个相对稳定的结构,通过复制传递给子代DNA 突变基因所表现的遗传性状也是一个稳定的性状,突变的可
18、遗传性,突变的可逆性,真正的原位回复突变,可使突变基因回复到野生型基因完全相同的DNA序列,第二点的回复突变(抑制突变suppressor mutation)第二点的回复突变并没有改变突变的DNA碱基序列,只是其突变效应被抑制了.大多数回复突变都是第二点突变抑制了第一次突变造成的表现型(表型抑制),基因内抑制:抑制突变发生在正向突变基因内;基因间抑制:抑制突变发生在其他基因之中;,抑制突变的类型,根据作用位置分:,直接抑制突变:通过恢复或部分突变基因蛋白质的功能;间接抑制突变:通过改变其他蛋白质的性质或表达水平而补偿原来突变造成的缺陷,从而使野生表型得以恢复。,根据作用方式分:,鉴定:重组实验
19、。由于抑制突变发生位置很近,鉴定困难,DNA序列分析或蛋白质序列分析。,基因内抑制突变,基因内抑制突变:,错义突变可通过基因内的另一处突变使蛋白质功能得到恢复。,移框突变的基因内抑制突变:,可通过基因内第二点基因插入或基因缺失使蛋白质功能得到恢复。,Ser Glu Thr Met Phe ThrAGG GAG ACU AUG UUU ACG,野生型:,G,Ser Glu Asp Tyr Val TyrAGC GAG GAC UAU GUU UAC G,突变型:,Ser Gly Thr Met Phe ThrAGC GGG ACU AUG UUU ACG,去除A,Ser Glu Asp X Ph
20、e ThrAGG GAG GAC UAG UUU ACG,去除U,需要琥珀抑制tRNA,正向突变的无义突变、错义突变和移框突变可被另一基因上的突变所抑制,分别称为无义抑制突变,错义抑制突变和移框抑制突变。这些突变均发生在tRNA或与tRNA功能有关的基因上,这些基因又叫抑制基因。,基因间抑制突变,UAG抑制tRNA:琥珀型(amber)抑制突变UAA抑制tRNA:赭石型(Ochre)抑制突变UGA抑制tRNA:乳石型(Opal)抑制突变,(1)基因间无义抑制突变,温度敏感抑制突变:许多amber突变抑制tRNA表现出温度敏感性,即30能产生对amber突变表型抑制,而在42则不能产生这种效应。
21、,(2)基因间错义抑制突变:tRNA的反密码子的改变,例如:GGA(Gly)AGA(Arg)如果甘氨酸tRNA反密码子也由UCCUCU,则仍能在相应处安插一个Gly,如果安插的不是Gly,而是其他氨基酸,只要能使蛋白质功能部分恢复,都表现出错义抑制效应。,(3)基因间移框抑制突变:,tRNA反密码子上增加或减少一个碱基。,第三节 自发突变的机制,转座因子(Transposable element TE),细胞基因组中能够从一个位置转移到另一个位置的一段DNA序列。,几乎所以生物都有转座因子存在,转座因子类型,按照结构和遗传性质分三类插入序列(insertion,IS)比较短,转座酶基因TnP、
22、颠倒重复序列(IR)转座子(transposon,Tn)分子量较大,转座酶基因、标志基因(抗生素或金属抗性基因,产细菌毒素基因,某些糖发酵基因)复杂转座子、复合转座子转座噬菌体(Mu噬菌体,mutator phage)没有特定的整合位置生物诱变剂,DNA分子的运动,1)环出效应,2)碱基的互变异构作用,T和G可以酮式或烯醇式两种互变异构状态,而C 和A可以以氨基式和亚氨基式两种状态存在,5mC同样易于自发脱氨基转变为胸腺嘧啶T,子代DNA发生GCAT的突变,自发脱氨氧化作用,胞嘧啶C氧化脱氨基自发地变成尿嘧啶U 而形成错配的碱基对,DNA的复制差错,源于DNA聚合酶产生的错误DNA分子运动而造
23、成碱基配对错误修复系统的各种缺陷所导致的结果,第四节、诱变剂及其作用机理,凡能诱发生物基因突变,并且突变频率远远超过自发突变率的物理因子或化学物质,称为诱变剂。它们包括物理诱变剂、化学诱变剂、生物诱变剂三大类。一、物理诱变剂二、化学诱变剂三、生物诱变剂,一、物理诱变剂,物理辐射可分为电离辐射和非电离辐射,电离辐射是一切能引起物质电离的辐射总称;带电粒子有粒子、粒子、质子,不带电粒子有中子、X射线、射线。非电离辐射是指能量比较低,并不能使物质原子或分子产生电离.紫外线、红外线、激光、微波都属于非电离辐射。,(一)电离辐射,电离辐射:当量子能量达到120eV 以上时,对物体有电离作用,能导致机体的
24、严重损伤,这类辐射称为电离辐射 常用于微生物诱发突变的电离辐射有快中子、X射线和射线等。,电离辐射的作用机制还不能做出圆满解释。存在两种假说,即所谓的直接物理作用假说与间接化学作用(辐射裂解水分子产生自由基而起作用)假说。,电离辐射主要引起DNA上的基因突变和染色体的畸变;,1、电离辐射的作用机制,2、电离辐射的剂量,快中子的剂量通常以拉德(rad)表示,在诱变育种中快中子照射的致死率达到50%-85%比较合适,采用的诱变剂量大约在15-30krad(千拉德)。不同种类菌种最适当剂量范围是不同的。,1rad=100erg/g=0.01J/kg=0.01Gy。,X射线和射线的剂量通常以伦琴(R)
25、来表示,由于X射线和射线穿透能力很强,对细胞致死作用比紫外线和一般的化学诱变剂表现更为强烈,因此,它们不适宜像紫外线那样进行反复多次照射。一般常用的剂量掌握在杀菌率90-99.9为宜,切忌用高剂量进行处理。,1cm3干燥空气征0,1.013105Pa(760mmHx气压下)产生2.08x109离子时所需的能量。,直接对平皿上生长的菌落进行照射,或者用直径6-10mm的打孔器把菌落连琼脂一同取出,置于灭菌平皿内进行照射;也可制成菌悬液,取1-2mL置于试管内并浸入冰水中,从上或侧面或下向进行短时间照射。试管内的菌悬液不宜过多,否则液层太厚,氧气供给不足,诱变效应和重复性都将比较差。处理完毕后,把
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