生物信息的传递-从MRNA到蛋白质.ppt
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1、第四章 生物信息的传递(下)从mRNA到蛋白质,第四章 生物信息的传递(下)从mRNA到蛋白质,1、遗传密码2、tRNA3、核糖体4、蛋白质合成的生物学机制5、蛋白质运转机制,蛋白质是生物信息通路上的终产物,一个活细胞在任何发育阶段都需要数千种不同的蛋白质。因此,活细胞内时刻进行着各种蛋白质的合成、修饰、运转和降解反应。翻译是指将mRNA链上的核苷酸从一个特定的起始位点开始,按每3个核苷酸代表一个氨基酸的原则,依次合成一条多肽链的过程。,2023/9/18,3,在翻译过程中:核糖体是蛋白质合成的场所。mRNA是蛋白质合成的模板。转移RNA(transfer RNA,tRNA)是模板与氨基酸之间
2、的接合体。在合成的各个阶段有许多蛋白质、酶和其他生物大分子参与。,4,翻译过程的特点:蛋白质合成是一个需能反应,要有各种高能化合物的参与。细胞用来进行合成代谢的总能量的90%消耗在蛋白质合成过程中。在真核生物细胞核内合成的mRNA,要运送到细胞质,才能翻译生成蛋白质。蛋白质合成速度很高。大肠杆菌只需要5s就能合成一条由100个氨基酸组成的多肽。,2023/9/18,5,蛋白质的生物合成步骤:,(1)翻译的起始:核糖体与mRNA结合并与氨酰-tRNA生成起始复合物。(2)肽链的延伸:由于核糖体沿mRNA5端向3端移动,开始了从N端向C端的多肽合成,这是蛋白质合成过程中速度最快的阶段。(3)肽链的
3、终止及释放:核糖体从mRNA上解离,准备新一轮合成反应。,第1节 遗传密码,贮存在DNA上的遗传信息通过mRNA传递到蛋白质上。mRNA与蛋白质之间的联系是通过遗传密码的破译来实现的。The genetic code is the correspondence between the sequence of the four bases in nucleic acids and the sequence of the 20 amino acids in proteins.mRNA上每3个核苷酸翻译成蛋白质多肽链上的一个氨基酸,这3个核苷酸称为密码,也叫三联子密码。Triplets:43=64,
4、amino acids:20(degenerate)翻译时从起始密码子AUG开始,沿着mRNA5 3的方向连续阅读密码子,直至终止密码子为止,生成一条具有特定序列的多肽链蛋白质。,2023/9/18,7,遗传密码表,1.三联子密码及其破译 构想:1954年,物理学家George Gamov 首先对遗传密码进行了探讨:41=4、42=16:编码的 aa 数目小于20种aa,显然不可能。43=64:在四种核苷酸条件下,64能满足于20种aa编码的最小数。44=256:虽能保证20种 aa 编码,但不符合生物体在亿万年进化过程中形成并遵循的经济原则。证明:在模板mRNA中插入或删除一个碱基,会改变该
5、密码子以后全部氨基酸序列。若同时对模板进行插入和删除试验,插入和删除的碱基数一样,后续密码子序列就不会变化,翻译得到的后续的蛋白质序列就保持不变。如果同时删去3个核苷酸,翻译产生少一个氨基酸的蛋白质,序列不发生变化。,密码破译方法:在体外无细胞蛋白质合成体系中加入人工合成的均聚物、随机共聚物和特定序列的共聚物为模板;aa-tRNA与确定的三核苷酸序列结合(核糖体结合技术)。,2023/9/18,10,(1)Marshall Nirenberg(1961),共聚物为模板,密码子的破译(1968.nobel prize),共聚物实验,(2)M.Nirenberg 1399),In vitro,tR
6、NAaaRibosomeNitrocellulose filter,UCU(trinucleotide),核糖体结合实验,把已结合到核糖体上的aa-tRNA与未结合的aa-tRNA分开。,每次只有一种被C14标记,(3)Stop codon 的证实,61个codons被破译,(仅剩UAA,UAG,UGA?),Brenner(1961)获得T4 phage 头部蛋白基因的琥珀突变(amber)证明:突变体头部蛋白较野生型的变短 推测:头部蛋白基因发生了终止突变,使蛋白质合成中断。,Garen(1965)获得,E.coli 碱性磷酸酯酶基因(phoA)Amber突变株的大 量回复突变株 分析;回复
7、突变株中对应“回复”的氨基酸,Stop codon 的证实,发生终止突变的原氨基酸 Trp(UGG),Ser:UCG,UCC,UCA,UCU,AGU,AGCLeu:UUG,UUA,CUU,CUC,CUA,CUGTyr:UAU,UACLys:AGG,AAAGln:CAG,CAAGlu:GAG,GAA,证明:终止突变密码为 UAG(amber 琥珀突变),UAA(ocher 赭色突变)UGA(opal 蛋白石突变),?!,回复突变的氨基酸和密码,2.遗传密码的性质密码的连续性。起始密码子决定所有后续密码子的位置。,2023/9/18,16,密码的简并性。由一种以上密码子编码同一个氨基酸的现象称为简
8、并(degeneracy),对应于同一种氨基酸的几个密码子称为同义密码子(synonymous coden)。,2023/9/18,17,同义密码子第一、二第位核苷酸往往是相同的,而第三位核苷酸的改变不一定影响所编码的氨基酸。一般说来,编码某一氨基酸的密码子越多,该氨基酸在蛋白质中出现的频率也越高(精氨酸例外)。,2023/9/18,18,密码的普遍性与特殊性。密码子表是具有普遍性的,适用于一切生物,但也有些特殊情况。,2023/9/18,19,密码子与反密码子的相互作用。在密码子与反密码子的配对中,前两对严格遵守碱基配对原则,第三对碱基有一定的自由度,可以摆动,因而使某些tRNA可以识别1个
9、以上的密码子-摆动假说(wobble hypothesis)。,R,ORFs,从mRNA 5端起始密码子AUG到3端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读框架(open reading frame,ORF)。An ORF is a suspected coding region.,第2节 tRNA,tRNA在蛋白质合成中处于关键地位。,2023/9/18,21,tRNA不仅为每个三联密码子翻译成氨基酸提供了接合体,还为准确无误地将所需氨基酸运送到核糖体上提供运送载体,它又被称为第二遗传密码。特点:存在经过特殊修饰的碱基,3端都以CCA-OH结束,这
10、是其氨基酸结合位点。,2023/9/18,22,1.tRNA的结构(1)二级结构由于小片段碱基互补配对,形成三叶草形的二级结构。三叶草形tRNA分子上有4条根据它们的结构或已知功能命名的手臂:受体臂:链两端碱基序列互补形成的杆状结构;3端有未配对的34个碱基;3端的CCA,最后一个碱基2羟基可被氨酰化。TC臂:其中表示拟尿嘧啶,是tRNA分子所拥有的不常见核苷酸。反密码子臂:位于套索中央,有三联反密码子。D臂:含有二氢尿嘧啶。,2023/9/18,23,2023/9/18,24,tRNA 二级结构,2023/9/18,25,最常见tRNA有76个碱基。所有tRNA含7495个核苷酸。tRNA长
11、度的不同主要是由其中的两条手臂引起。在D臂中存在多至3个可变核苷酸位点。tRNA分子中最大的变化发生多余臂上。一类是只含有一条仅为35个核苷酸的多余臂的tRNA,占所有tRNA的75%;一类是有较大多余臂的tRNA,包括杆状结构上的5个核苷酸和套索结构上的311个核苷酸。,2023/9/18,26,(2)三级结构tRNA三级结构都呈L形折叠式tRNA的三级结构与氨酰-tRNA合成酶对tRNA的识别有关。,2.tRNA的功能翻译阶段遗传信息从mRNA转移到结构极不相同的蛋白质分子,信息是以能被翻译成单个氨基酸的三联体密码子形式存在的,这里起作用的是tRNA的解码机制。氨基酸在合成蛋白质之前先通过
12、AAtRNA合成酶活化,在消耗ATP的情况下结合到tRNA上,生成有活性的AAtRNA,由AA tRNA上的反密码子与mRNA上的密码子相互识别并配对,将AA带到mRNA-核糖体复合物上,插入到正在合成的多肽链的适当位置上。,2023/9/18,27,3.tRNA的种类起始tRNA和延伸tRNA。一类能特异地识别mRNA模板上起始密码子的tRNA叫起始tRNA(原核生物起始tRNA携带甲酰甲硫氨酸)。其他tRNA统称为延伸tRNA。同工tRNA。几个代表相同氨基酸的tRNA称为同工tRNA。校正tRNA。分两类:无义突变的校正tRNA和错义突变的校正tRNA。均通过改变其反密码子区校正突变而依
13、然合成原氨基酸。,2023/9/18,28,2023/9/18,29,无义突变和错义突变的校正,4.氨酰-tRNA合成氨酰-tRNA合成酶是一类催化氨基酸与tRNA结合的特异性酶。其反应包括两步:氨基酸活化生成酶-氨酰腺苷酸复合物。AA+ATP+酶(E)EAAAMP+PPi氨酰基转移到tRNA3末端腺苷残基的2或3羟基上 EAAAMP+tRNA AAtRNA+E+AMP,2023/9/18,30,蛋白质合成的真实性主要决定于tRNA能否把正确的氨基酸放到新生多肽链的正确位置上,而这一步主要决定于AAtRNA合成酶是否使氨基酸与对应的tRNA相结合。AA-tRNA合成酶既要能识别tRNA,又要能
14、识别氨基酸,它对两者都具有高度的专一性。,2023/9/18,31,第3节 核糖体,生物细胞内,核糖体像一个能沿mRNA模板移动的工厂,执行着蛋白质合成的功能。,2023/9/18,32,核糖体是由几十种蛋白质和几种核糖体组成的亚细胞颗粒。一个细菌细胞内约有20000个核糖体,而真核细胞内可达106个。,核糖体是一个致密的核糖核蛋白颗粒,可以解离为大小两个亚基,大亚基约为小亚基相对分子质量的二倍。每个亚基都含有一个分子质量较大的rRNA和许多蛋白质分子。这些大分子rRNA能在特定位点与蛋白质结合,从而完成核糖体不同亚基的组装。原核生物核糖体由约2/3的RNA及1/3的蛋白质组成。真核生物核糖体
15、中RNA占3/5,蛋白质占2/5。,2023/9/18,33,1.核糖体的结构原核生物、真核生物细胞质及细胞器中的核糖体存在着很大差异。如下图:,2023/9/18,34,2023/9/18,35,大肠杆菌核糖体小亚基由21种蛋白质组成,分别用S1S21表示,大亚基由36种蛋白质组成,分别用L1L36表示。真核生物细胞核糖体蛋白质中,大亚基含有49种蛋白质,小亚基有33种蛋白质,它们的相对分子质量在81034.0104之间。,2023/9/18,36,在高倍电镜下得到的原核生物70S核糖体大、小亚基相结合的模型,核糖体分子可容纳两个tRNA和约40bp长的mRNA。,2023/9/18,37,
16、核糖体有三个tRNA结合位点,位于大小亚基交界面,其中,A位点(氨酰基位点,与新掺入的氨酰tRNA结合);P位点(肽酰基位点,与延伸中的酰肽tRNA结合);E位点(肽酰转移后即释放tRNA位点)。tRNA的移动顺序是:A位点-P位点-E位点。,2023/9/18,40,2.核糖体的功能核糖体存在于每个细胞中进行蛋白质的合成。尽管在不同生物体内其大小有别,但组织结构基本相同,而且执行的功能完全相同。核糖体包括5个以上活性中心,即:mRNA结合部位;接受AA-tRNA部位(A位);结合肽基tRNA的部位(P位);肽基转移部位;形成肽键的部位(转肽酶中心)。此外,还有负责肽链延伸的各种延伸因子的结合
17、位点。,2023/9/18,41,核糖体小亚基负责对模板mRNA进行序列特异性识别,如起始部分的识别、密码子与反密码子的相互作用等,mRNA的结合位点也在小亚基上。,大亚基负责携带AA-tRNA、肽键的形成、AA-tRNA与肽链的结合、A位、P位、转肽酶中心等在大亚基上。,2023/9/18,42,核糖体在体内及体外都可解离为亚基或结合成70S/80S的颗粒。在翻译的起始阶段需要游离的亚基,随后才结合成70S/80S颗粒,开始翻译进程。肽链释放后,核糖体脱离mRNA解聚成亚基,直接参与另一轮蛋白质的合成。,第四节 蛋白质合成机制,蛋白质合成是一个需能反应。真核生物中可能有近300种生物大分子参
18、与蛋白质的生物合成,这些组分约占细胞干重的35%。细胞用来进行合成代谢总能量的90%消耗在蛋白质合成过程中。蛋白质的生物合成包括:氨基酸活化肽链的起始、延伸、终止新合成多肽链的折叠和加工,2023/9/18,43,1.氨基酸活化氨基酸是生物合成蛋白质的原料,氨基酸在氨酰-tRNA合成酶的作用下生成活化氨基酸AA-tRNA才能被准确地运送到核糖体中,参与多肽链的起始或延伸。氨基酸活化反应包括两步:氨基酸活化生成酶-氨酰腺苷酸复合物。AA+ATP+酶(E)EAAAMP+PPi氨酰基转移到tRNA3末端腺苷残基的2或3羟基上EAAAMP+tRNA AAtRNA+E+AMP,2023/9/18,44,
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