方差分析(ANOVA)使用.ppt

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1、方差分析（ANOVA）,例子：某研究者在某单位工作人员中进行了体重指数（BMI）抽样调查，随机抽取不同年龄组男性受试者各16名，测量了被调查者的身高和体重值，由此按照BMI=体重/身高2公式计算了体重指数，请问，不同年龄组的体重指数有无差异。,一、方差分析的基本思想,5,思想来源：观察值总变异可以分解为组间变异和组内变异,6,总变异(Total variation):全部测量值Xij与总均数 间的差异 组间变异(between group variation):各组的均数 与总均数 间的差异组内变异（within group variation)：每组的每个测量值 与该组均数 的差异,可用离均

2、差平方和反映变异的大小,1.总变异:所有测量值之间总的变异程度，SS总,2组间变异：各组均数与总均数的离均差平方和，SS组间,SS组间反映了各组均数 的变异程度组间变异随机误差+处理因素效应,3组内变异：用各组内各测量值Xij与其所在组的均数差值的平方和来表示，SS组内,SS组内反映随机误差的影响（个体差异和测量误差）。,均方差，均方(mean square，MS),VS,VS,组间均方与组内均方比值越小，样本越可能来源于同一个总体，比值越大，样本越可能不是来源于一个总体,二、F 值与F分布,，,如果各组样本的总体均数相等（H0成立），即各处理组的样本来自相同总体，无处理因素的作用，则组间变异

3、同组内变异一样，只反映随机误差作用的大小。组间均方与组内均方的比值称为F统计量 F值接近于1，就没有理由拒绝H0；反之，F值越大，拒绝H0的理由越充分。数理统计的理论证明，当H0成立时，F统计量服从F分布。,F 分布曲线,回忆t分布和t检验,17,18,F 界值表,二、完全随机设计方差分析(单因素方差分析),关于因素与水平,因素也称为处理因素（factor）每一处理因素至少有两个水平(level)（也称“处理组”）。,完全随机设计：将实验对象随机分配到不同处理组的单因素设计方法。针对一个处理因素，通过比较该因素不同水平组均值，推断该处理因素不同水平组的均值是否存在统计学差异。,例 在评价某药物

4、耐受性及安全性的I期临床试验中，对符合纳入标准的30名健康自愿者随机分为3组每组10名，各组注射剂量分别为0.5U、1U、2U，观察48小时部分凝血活酶时间（s）试问不同剂量的部分凝血活酶时间有无不同？,方差分析步骤：（1）提出检验假设，确定检验水准 H0:1=2=3 H1:1，2，3不全相同 a=0.05,（2）计算检验统计量F 值,（3）确定P值，做出推断结论 F0.05(2，26)=2.52，FF0.05(2，26)，P0.05，拒绝 H0。三种不同剂量48小时部分凝血活酶时间 不全相同。,例子：某研究者在某单位工作人员中进行了体重指数（BMI）抽样调查，随机抽取不同年龄组男性受试者各1

5、6名，测量了被调查者的身高和体重值，由此按照BMI=体重/身高2公式计算了体重指数，请问，不同年龄组的体重指数有无差异。,方差分析适合于任何多组独立均衡可比的数据,基本步骤,（1）建立假设，确定检验水准,H0：三个总体均数相等，即三组工作人员的体重指数总体均数相等H1：三个总体均数不等或不全相等a=0.05,（2）计算检验统计量F值,（3）确定p值，作出统计推断,P2,45=3.20-3.218.87，本次F值处于F界值之外，说明组间均方组内均方比值属于小概率事件，因此拒绝H0，接受H1，三个总体均数不等或不全相等,方差分析的关键条件,第一、各组服从正态分布！第二、各组符合方差齐性！第三、独立

6、性,方差齐性检验Bartlett检验法Levene F 检验最大方差与最小方差之比3，初步认为方差齐同。,问题：不符合条件怎么办？,第一招：数据转换 方差齐性转换；正态性转换,第二招：特别分析方法 非参数检验,三、多个样本均数的两两比较,方差分析能说明什么问题？,能否用T检验呢,当有k个均数需作两两比较时，比较的次数共有c=k!/(2!(k-2)!)=k(k-1)/2设每次检验所用类错误的概率水准为，累积类错误的概率为，则在对同一实验资料进行c次检验时，在样本彼此独立的条件下，根据概率乘法原理，其累积类错误概率与c有下列关系：1(1)c 例如，设0.05，c=3(即k=3)，其累积类错误的概率

7、为1(1-0.05)3=1-(0.95)3=0.143,多重比较的方法：SNK检验（q 检验）：探索性研究，进行两两比较。LSD-t 检验：证实性检验，可认为LSD法是最灵敏的Turkey 检验方法，探索性研究，要求样本量相同。Duncan 检验方法，探索性研究Dunnet 检验方法，证实性检验，常用于多个试验组与一个对照组间的比较。,例1 在肾缺血再灌注过程的研究中，将36只雄性大鼠随机等分成三组，分别为正常对照组、肾缺血60分组和肾缺血60分再灌注组，测得各个体的NO数据见数据文件no.sav，试问各组的NO平均水平是否相同？,单因素方差分析,分析：对于单因素方差分析，其资料在SPSS中的

8、数据结构应当由两列数据构成，其中一列是观察指标的变量值，另一列是用以表示分组变量。实际上，几乎所有的统计分析软件，包括SAS，STATA等，都要求方差分析采用这种数据输入形式，这一点也暗示了方差分析与线性模型间千丝万缕的联系。,单因素方差分析,预分析（重要）：检验其应用条件,单因素方差分析,选择data 中的split file，出现如下对话框：,单因素方差分析,单因素方差分析,单因素方差分析,这里仅取其中一组结果，表明该资料符合分组正态性的条件。,单因素方差分析,注意分组检验正态性后，要先回到data菜单下的split file，如下操作取消拆分后才能进行后续的方差分析：,单因素方差分析,单

9、因素方差分析,选入分组变量,选入因变量,给出各组间样本均数的折线图,指定进行方差齐性检验,单因素方差分析,结果分析,单因素方差分析,（1）方差齐性检验,Levene方法检验统计量为3.216，其P值为0.053，可认为样本所来自的总体满足方差齐性的要求。,单因素方差分析,结果分析,（2）方差分析表,第1列为变异来源，第2、3、4列分别为离均差平方和、自由度、均方，检验统计量F值为5.564，P0.008，组间均数差别统计学意义，可认为各组的NO不同。,变异来源,单因素方差分析,结果分析,（3）各组样本均数折线图,Means plots 选项给出，更直观。注意：当分组变量体现出顺序的趋势时，绘制

10、这种折线图可以提示我们选择正确的趋势分析模型。,通过以上分析得到了拒绝H0的结论，但实际上单因素方差分析并不这样简单。在解决实际问题时，往往仍需要回答多个均数间到底是哪些存在差异。虽然结论提示不同组别个体的NO量不同，但研究者并不知道到底是三者之间均有差别，还是某一组与其他两组有差别。这就应当通过两两比较（多重比较）进行考察。,均数两两比较方法,直接校正检验水准（相对粗糙）专用的两两比较方法：计划好的多重比较（Planned Comparisons）非计划的多重比较（PostHoc Comparisons）,均数两两比较方法,Contrasts按钮,Post Hoc按钮,点击单因素方差分析主对

11、话框中的Post Hoc按钮，总共有14种两两比较的方法，如下：,均数两两比较方法,LSD法：最灵敏，会犯假阳性错误；Sidak法：比LSD法保守；Bonferroni法：比Sidak法更为保守一些；Scheffe法：多用于进行比较的两组间样本含量不等时；Dunnet法：常用于多个试验组与一个对照组的比较；S-N-K法：寻找同质亚组的方法；Turkey法：最迟钝，要求各组样本含量相同；Duncan法：与Sidak法类似。,均数两两比较方法,仍以例1为例，LSD法的输出格式：,均数两两比较方法,结果分析,仍以例1为例，SNK法的输出格式：,结果分析,均数两两比较方法,该方法的目的是寻找同质子集，

12、故各组在表格的纵向上，均数按大小排序，然后根据多重比较的结果将所有的组分为若干个子集，子集间有差别，子集内均数无差别。,当各组样本含量不同，选择Scheffe法，得结果：,均数两两比较方法,结果分析,假设在调查的设计阶段，就计划好了第二组和第一组，以及第三组和第一组的比较，可以使用主对话框中的contrast 按钮实现。,在coefficients后面的框中输入1，-1，0，每次输入后点击add，就可以比较第一组和第二组的NO；再点击next按钮，继续输入下一个组合，即0，-1，1。,均数两两比较方法,均数两两比较方法,结果分析,可见，第一个组合无统计学意义，而第二个组合有显著性差异。,四、多

13、因素方差分析,多因素方差分析,一个因素（水平间独立）单因素方差分析,两个因素（水平间独立或相关）多(两)因素方差分析一个个体多个测量值重复测量资料的方差分析目的：用这类资料的样本信息来推断各处理组间多个总体均数的差别有无统计学意义。,（一）随机区组方差分析（水平间独立两因素）,随机区组设计：先将受试对象按条件相同或相近分成m个区组（或配伍组），每个区组有k个受试对象，再将其随机地分配到k个处理组中，称之为随机区组设计，属于两因素方差分析。,总变异分解 SS总=SS组间+SS组内（完全随机）SS总=SS组间+（SS区组+SS组内）（随机区组）,在存在着区组的情况下，随机区组设计的方差分析效率要高

14、于单因素方差分析,计算公式,总变异：，自由度N-1。处理组变异：，自由度k-1区组变异：，自由度ni-1组内：SS总-SS处理-SS区组，自由度N-k-ni-1,举例 为探讨Rgl对镉诱导大鼠睾丸损伤的保护作用，某研究者将同一窝别的3只大鼠随机地分到T1、T2、T3三组，进行不同处理,共观察了10个窝别大鼠的睾丸MT含量（g/g）。试问不同处理对大鼠MT含量有无影响？,方差分析,=3.55，P0.05，三组大鼠 MT含量的总体均值不全相同。,随机区组设计方差分析前提条件：数据服从正态分布数据要求具有独立性数据要求具有方差齐性,举例,对三组病人进行降血压药物治疗，一组病人为安慰剂，一组病人为常规药物，另外一组为新研制药物。分别在服药5、10、20天测量血糖这种例子看似随机区组设计实则不然，数据之间存在相关性需采用重复测量方差分析,小结,完全随机设计t检验：单因素两样本分析完全随机设计方差分析：单因素多样本分析随机区组设计方差分析：两因素多样本分析,