遗传工程和转基因技术.ppt
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1、DNA重组技术的应用,重组蛋白质的表达系统克隆能编码特定蛋白质的基因或cDNA.开发合适的表达系统,常用的表达系统,大肠杆菌E.coli 枯草芽孢杆菌Bacillus Subtilis酵母培养的昆虫细胞哺乳动物细胞 选择表达系统,根椐所生产的蛋白质的性状确定。,细菌细胞,优越性操作方便细菌繁殖快可获得大量蛋白质且价格低廉缺点多肽成份常不能适当的折叠,常形成不溶性包涵体。而从包涵体中制备的蛋白质常无生物活性。菌体因产生的大量异体蛋白,而对细菌产生毒性副作用,而使细菌培养物中细菌的浓度不高。细菌缺乏转录后修饰的酶,如在蛋白质上加上磷酸根,糖基。而这些修饰作用对蛋白质完成其功能常常是必须的。,酵母细
2、胞,优越性为十分简单的真核细胞,其特性和哺乳动物细胞相似,而其生长和细菌一样快。可完成人类蛋白质的转录后修饰。并可诱导表达蛋白分泌至培养基中。缺点 其有活性的蛋白水解酶类,可降解异体蛋白,使其产量降低。,昆虫细胞,利用昆虫病毒,杆状病毒在昆虫细胞中表达异体蛋白质。优越性1.蛋白能高水平表达,多肽能正确折叠。2.具有转录后修饰作用。缺点昆虫细胞培养价格高于细菌和酵母,哺乳动物细胞,生产哺乳动物蛋白质的最佳表达系统。启动子,载体,转染方法在哺乳动物细胞稳定组入扩增基因,可供产生大量蛋白缺点细胞培养价格高于细菌和酵母和昆虫细胞。,启动子 可使克隆的外源基因高水平表达的最佳启动子,必须具备后面这几个条
3、件1.它必须是一种强启动子,能够使克隆基因的蛋白质产物的表达 量占细胞总蛋白的1030以上。2.这个启动子应能呈现出一种低限的基础转录水平。,3.这种启动子应是诱导型的,能通过简单的方式使用廉价的诱导物而得以诱导。如在大批量的蛋白质制备中,热和化学诱导便是两种广泛使用的方式。IPTG是杂种强启动子tac和trc的一种有效的化学诱导物。但对于人类临床药用蛋白质的大批量制备,IPTG则不是理想的诱导物,因为它有毒性。编码热敏感lac阻遏物的温度敏感突变体lacI基因,为诱导1ac及其派生启动子提供了方便的手段。,在启动子tac的一10和一35元件之间有一段17bp的间隔序列。核糖体结合位点,RBS
4、 由ShineDalgarno,SD序列及其后的一段富含AT碱基的转译间隔区组成,间隔区的最适长度约为8个碱基。在转译起始期间,SD序列与16srRNA的3末端发生作用。三个起始密码子及其在大肠杆菌中的使用频率。三个终止密码子中其后连着U的UAA是大肠杆菌最有效的转译终止密码子。,调节基因R 编码阻遏物,可调节启动子的活性,它既可以存在于表达载体上,也可以是整合在寄主染色体上。转录终止子,TT 可使mRNA和载体分子稳定。抗菌素抗性基因,ter为载体提供了表型选择记号,复制起点,0ri决定着载体的拷贝数。,克隆载体,克隆质粒载体基因克隆的目的不仅是为了获得大量的克隆在载体上的DNA片段,而且还
5、要考虑后续实验如测序,表达,突变的要求。,pGEM-T和pGEM-T Easy载体PCR扩增中常用的DNA聚合酶Taq DNA聚合酶可以不需要模板在PCR产物上加一个A,一些生物公司根据这一特点研究制了T载体。在pGEM-T载体的两边还分别有一个限制性内切酶BstZ I的识别位点,如果在外源DNA片段上没有该酶的识别位点,只用该酶就可以将外源基因完整的切下来,根据酶切片段的大小对重组质粒进行签定。在pGEM-T Easy质粒的插入点两边,增加了EcoR I和Not I酶切位点,使外源DNA片段的鉴定更加容易。,表达质粒载体原核表达质粒载通常须具有一个强的启动子,一个位于启动子和起始密码子ATG
6、之间的核糖体结合序列以及位于外源基因插入序列下游的转录终止序列。原核表达载体常用的启动子,lac启动子 较早使用的启动子,来自大肠杆菌的乳糖操纵子,常用IPTG诱导,启动外源基因的表达。trp启动子 来自大肠杆菌的色氨酸操纵子,表达载体上的启动子常常包含操纵子的启动基因,操纵基因和部分trpE基因,删除了衰减子序列,在-吲哚丙氨酸的诱导下,转录水平比大肠杆菌中的正常启动子提高8到10倍。tac启动子 是一组由lac和trp启动子人工构建的杂合启动子,但仍可以用IPTG诱导,tac是一个非常强的启动子,由tac启动子启动的基因的转录水平比lac和trp启动子高。,PL启动子 来自噬菌体,也是一个
7、非常强的启动子。受噬菌体阻遏基因cI编码的阻遏蛋白的控制,表达载体的宿主菌带有一个cI基因温度敏感突变体,它表达的阻遏蛋白在2830才有活性,能够阻抑启动子的表达;当温度提高到42时,它的表达产物失去活性,启动子能够转录外源基因。这种温度诱导的特性是以PL为表达载体的一大优点。T7启动子 来自于T7噬菌体,有该启动子并在T7 RNA聚合酶驱动下表达外源基因的大肠杆菌质粒称为pET表达载体家族。T7噬菌体RNA聚合酶不仅能够选择性的与T7启动子结合,而且在不降低启动效率的前题下,其沿DNA模板合成mRNA的速度比大肠杆菌RNA聚合酶快5 倍,因此提高了对外源基因的转录水平。,pET表达系统表达外
8、原蛋白必须使用特殊的大肠杆菌受体菌,如BL21和HNS174。这些菌株是噬菌体的溶源衍生菌,其染色体上含有PlacUV5启动子控制下的T7 RNA聚合酶基因。pET表达系统是一个基因表达的级联反应,IPTG首先诱导 PlacUV5启动子表达T7 RNA聚合酶,T7 RNA聚合酶再选择性的结合T7启动子启动外源基因的转录。,pcDNA3.1/His表达载体 pCDNA3.1/His表达载体是Invitrogen公司的产品,载体采用人巨细胞病毒的立即早期启动子,用来在哺乳动物细胞内获得高表达的外源基因及进行基因功能的研究。pCDNA3.1/His载体是一种穿梭质粒表达载体,带有pUC质粒的复制起点
9、和ampr基因,可以在大肠杆菌内扩增和选择重组转化子,同时载有SV40的复制起点和新霉素抗性基因,可以在表达SV40T抗原的细胞内复制并选择重组转化子。,表达载体起始密码子下游有一段编码6个组氨酸的DNA片段及编码一段短肽DLYDDDDK的DNA片段,外源基因克隆在这些基因的上游,构成融合基因。此融合基因能够表达目的蛋白和组氨酸,故通过标记组氨酸可分离纯化目的融合蛋白,组氨酸可以作为检测融合蛋白的标签。在表达载体上设计有蛋白酶的识别和切割位点,用蛋白酶可以切除融合蛋白上非目的蛋白的氨基因酸序列如组氨酸和DLYDDDDK短肽。,组织纤溶酶原激活物克隆表达,tPA 纤溶酶原纤溶酶水解纤维蛋白(可用
10、于血凝块的溶解,治疗血栓梗塞性疾病)tPA基因(信号肽 和tPA CDNA)表达载体重组载体转染哺乳动物细胞用HAT培养基选择出稳定的转染细胞细胞表达低水平的tPAMtx(氨甲蝶呤)筛选细胞表达高水平的tPA细胞在发酵器培养tPA分泌tPA于培养液中。,DNA限制性内切酶消化,DNA限制性内切酶消化是基因分析中的关键步骤,内切酶是最关键的工具酶。限制性内切酶是一类具有严格识别位点,并在识别位点内或附近切割双链DNA 的脱氧核糖核酸酶。酶单位规定为在最适应条件下小时完全消化1DNA的酶量为个单位。影响限制性内切酶活性的因素包括DNA的纯度、缓冲液、温度及酶本身。DNA甲基化,含有蛋白质或高分子量
11、DNA胶体溶液太粘稠均会降低内切酶的消化效率。由于在限制性内切酶消化反应中,甘油浓度超过5会抑制内切酶活性,因此在20l反应体系中,甘油浓度应少于1l。不同的限制性内切酶对缓冲液中盐浓度的要求各不相同。缓冲液一般分为高、中、低盐种。一般使用厂家提供的与酶配套的缓冲液。,在需进行双酶切反应时,可采用以下不同的方法进行。如果两种酶的反应缓冲液相同或相近,可以同时加入两种酶进行酶切,但反应体积应稍大些,以免甘油浓度过高,影响酶的活性。如果相差甚远,则必须如下进行:在第个酶酶解反应完毕后,采用乙醇沉淀,回收已线性化的DNA,再建立第个酶切体系,继续酶解。也可先用低盐浓度的酶进行酶解,等酶解完全后,补加
12、NaCl及相差的化学成分或调节pH然后再加入第种酶继续酶解。如果两个酶的反应条件只是温度上的差别,可以先加一种酶进行酶解,然后加入另一种酶在相应的温度下酶解。,酶解反应 主要应用于质粒的酶切鉴定。典型的反应是20l体积中含0.21gDNA。酶切反应体系如下 质粒DNA 10l 10缓冲液 2l 限制酶 1l 双蒸去离子水 7l 总体积 20l,操作方法 按下列顺序加入试剂(1)在一灭菌的新的Eppendorf管中加入7l双蒸水。(2)加入10缓冲液2l。(3)加限制酶1l(4)最后加入质粒DNA10l。(5)稍离心,混合。(6)37水浴12h。(7)取出后电泳分析鉴定是否酶解。,注意问题1.双
13、蒸水为可变体积,当其它反应成分确定后,用双蒸水将反应体积 补足。2.为保持限制酶的活性,将酶从低温冰箱取出后立即置于预先准备的 冰浴中,操作应迅速,用后立即放回低温水箱中。3.大多数酶多以浓缩液存放,吸取时需严格取量。4.若要取用多种酶,每种酶必须单独使用吸头,避免交叉污染。5.大多数限制酶均加50甘油缓冲液置于-20保存,其活力稳定,但在配制反应混合物时,酶的加入量要准确,小于总体积的1/10,否则甘油会抑制酶解反应。,UNIQ-10质粒提取试剂盒提取质粒DNA 本试剂盒的核心是UNIQ-10柱。柱的底部有一层由Sangon研制开发的惰性大分子材料,它能选择性吸附核酸物质,不吸附蛋白质,多糖
14、和其它物质。DNA与UNIQ-1 0的结合需要一定的离子强度。抽提质粒时,细菌用常规的碱裂解,离心除去基因组D NA。含质粒的上清液加入到UNIQ-1 0拄中,经简单的洗涤步骤除去非特异性结合的杂质。所要抽提的质粒用Elution Buffer,TE或者水洗脱。,质粒 DNA提取,操作步骤1 将过夜培养的12ml细菌12,000rpm离心15秒,彻 底去除上清。注意:对于低拷贝数的质粒,请用25ml细胞,同时按比例 相应提高Solution l,lI和llI的用量。在执行步骤5后,将 上清分批加入到UNlQ-10柱中,重复步骤6,直至处理完所有 样品。2.加入100 l Solution I,
15、用枪头或振荡器充分悬浮细菌。3加入200 l Solution II,立即温和混匀(倾斜45度角,顺一个方向,慢慢旋转离心管),使细菌裂解,室温放 置2分钟。注意:不能剧烈混合,否则会出观基因组DNA污染。4加入350 l SoIution llI 立即上下颠倒510次,使之 充分中和,室温放置2分钟。5.12,000rpm,离心5分钟。,6将步骤5中上清转移到套放于2.0 ml收集管内的 UNIQ-10柱中,8,000rpm室温离心15秒。注意:不要吸取沉淀,否则会出现基因组DNA和蛋白质污染。7.弃收集管中的废液,将UNlQ-10柱放入同一支收集管 中,吸取500 l Wash Solut
16、ion至 UNIQ-1O柱,10,000rpm室温离心30秒。8 重复步骤7。9 弃收集管中的废液,将UNIQ-10柱放入同一支收集管 中,1O,000rpm室温离心30秒以彻底去除Wash SOlutiOn。1 0将UNIQ-10柱放入新的洁净1.5 ml离心管中,加 50l Elution Buffer,室温放置2分钟后,10,000rpm室温 离心1分钟。离心管中的溶液即为所抽提的质粒DNA。注意:如果要提高质粒的浓度,可以用30 l Elution Buffer,37或50下放置2分钟,10,000rpm室温离心1分钟。,DNA体外连接,利用DNA连接酶把目的DNA片段和载体DNA连接
17、在一起,成为一个新的重组分子,这就是基因工程中常说的DNA体外连接。目的DNA片段被限制酶消化后其末端只可能有三种形式 1.带有相同的粘性末端:用同一种酶或同尾酶处理可得这样的末端。由于质粒载体也必须用同样的酶消化,亦得两个相同的粘性末端,因此在连接反应中,外目的基因片段和质粒载体DNA均可能发生自身环化,而且正反两种连接方向都有。为防止载体DNA自身环化,在连接前需除去载体分子5-p,使之最大限度地抑制载体环化现象。,2.带有非互补的粘端 用两种不同的限制酶进行消化可以产生这样的末端。一般情况下,常用质粒载体的多克隆位点总能找到若干个不同的酶单酶切位点,用同样两种酶消化载体后,可将外源目的片
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