【教学课件】第二章蛋白质.ppt
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1、第二章 蛋白质,授课目的:本章主要阐述蛋白质的主要功能、性质以及蛋白质的分离纯化,并在此基础上简要地阐明蛋白质结构与其性质及功能的关系。授课时数:8学时,第一节 蛋白质概述,第二节 氨基酸蛋白质的构件分子,第三节 肽,第四节 蛋白质的结构与功能的关系,第五节 蛋白质的理化性质,第六节 蛋白质的分离、纯化,授课时序:,第一节 蛋白质概述,一、蛋白质的生物学功能二、蛋白质的分类三、蛋白质的水解四、蛋白质的组成成分,一、蛋白质的生物学功能,1.生物体的组成成分2.酶3.运输4.运动5.抗体6.干扰素7.遗传信息的控制8.细胞膜的通透性9.高等动物的记忆、识别机构,构成生物机体的结构蛋白如肌动蛋白、肌
2、球蛋白,具有催化功能的蛋白质,免疫球蛋白,二、蛋白质的分类,依据蛋白质的外形分类:按照蛋白质的外形可分为球状蛋白质和纤维状蛋白质。球状蛋白质:globular protein外形接近球形或椭圆形,溶解性较好,能形成结晶,大多数蛋白质属于这一类。纤维状蛋白质:fibrous protein分子类似纤维或细棒。它又可分为可溶性纤维状蛋白质和不溶性纤维状蛋白质。,(2)依据蛋白质的组成分类,按照蛋白质的组成,可以分为:简单蛋白(simple protein)结合蛋白(conjugated protein)。,简单蛋白,又称为单纯蛋白质;这类蛋白质只含由-氨酸组成的肽链,不含其它成分。1.清蛋白和球蛋
3、白:albumin and globulin广泛存在于动物组织中。清蛋白易溶于水,球蛋白微溶于水,易溶于稀酸中。2.谷蛋白(glutelin)和醇溶谷蛋白(prolamin):植物蛋白,不溶于水,易溶于稀酸、稀碱中,后者可溶于7080乙醇中。3.精蛋白和组蛋白:碱性蛋白质,存在与细胞核中。4.硬蛋白:存在于各种软骨、腱、毛、发、丝等组织中,分为角蛋白、胶原蛋白、弹性蛋白和丝蛋白。,结合蛋白质,由简单蛋白与其它非蛋白成分结合而成,色蛋白:由简单蛋白与色素物质结合而成。如血红蛋白、叶绿蛋白和细胞色素等。糖蛋白:由简单蛋白与糖类物质组成。如细胞膜中的糖蛋白等。脂蛋白:由简单蛋白与脂类结合而成。如血清
4、-,-脂蛋白等。核蛋白:由简单蛋白与核酸结合而成。如细胞核中的核糖核蛋白等。,完全水解得到各种氨基酸的混合物,部分水解通常得到多肽片段。最后得到各种氨基酸的混合物。所以,氨基酸是蛋白质的基本结构单元。大多数的蛋白质都是由20种氨基酸组成。这20种氨基酸被称为基本氨基酸。,三、蛋白质的水解,1.酸水解常用6 mol/L的盐酸或4 mol/L的硫酸在105-110条件下进行水解,反应时间约20小时。此法的优点是不容易引起水解产物的消旋化。缺点是色氨酸被沸酸完全破坏;含有羟基的氨基酸如丝氨酸或苏氨酸有一小部分被分解;门冬酰胺和谷氨酰胺侧链的酰胺基被水解成了羧基。,胃蛋白酶Pepsin:R1和R2R1
5、=苯丙氨酸Phe,色氨酸Trp,酪氨酸Tyr;亮氨酸Leu以及其它疏水性氨基酸水解速度较快。,一般用5 mol/L氢氧化钠煮沸10-20小时。由于水解过程中许多氨基酸都受到不同程度的破坏,产率不高。部分的水解产物发生消旋化。该法的优点是色氨酸在水解中不受破坏。,2.碱水解,目前用于蛋白质肽链断裂的蛋白水解酶(proteolytic enzyme)或称蛋白酶(proteinase)已有十多种。应用酶水解多肽不会破坏氨基酸,也不会发生消旋化。水解的产物为较小的肽段。,3.酶水解,蛋白质和多肽的肽键与一般的酰胺键一样可以被酸碱或蛋白酶催化水解,酸或碱能够将多肽完全水解,酶水解一般是部分水解.多肽是由
6、氨基酸以酰胺键形式连接而成的线性大分子。它在生物体内可以单独存在,但是更多的则是作为蛋白质的组成部分。蛋白质是由一个或多个多肽链通过共价键(主要是二硫键)或非共价力结合而成。应用化学或物理方法,可以将蛋白质拆分成多肽组分。,胰蛋白酶Trypsin:R1=赖氨酸Lys和精氨酸Arg侧链(专一性较强,水解速度快)。,或胰凝乳蛋白酶(Chymotrypsin):R1=苯丙氨酸Phe,色氨酸Trp,酪氨酸Tyr;亮氨酸Leu,蛋氨酸Met和组氨酸His水解稍慢。,糜蛋白酶,四、蛋白质的组成成分,蛋白质是由许多不同的-氨基酸按一定的序列通过酰胺键(肽键)缩合而成的,具有较稳定的构象并具有一定生物功能的大
7、分子。,蛋白质是一类含氮有机化合物,除含有碳、氢、氧外,还有氮和少量的硫。某些蛋白质还含有其他一些元素,主要是磷、铁、碘、碘、锌和铜等。这些元素在蛋白质中的组成百分比约为:,三 蛋白质的元素组成,碳 50 氢 7 氧 23 氮 16%硫 03 其他 微 量,N的含量平均为16%凯氏(Kjadehl)定氮法的理论基础。,氮占生物组织中所有含氮物质的绝大部分。因此,可以将生物组织的含氮量近似地看作蛋白质的含氮量。由于大多数蛋白质的含氮量接近于16%,所以,可以根据生物样品中的含氮量来计算蛋白质的大概含量:蛋白质含量(克%)=每克生物样品中含氮的克数 6.25,(二)蛋白质的氨基酸组成,氨基酸 是蛋
8、白质的基本组成单位。从细菌到人类,所有蛋白质都由20种标准氨基酸(20 standard amino acids)组成。形成复杂的氨基酸长链,中间靠肽键连接,形成多肽或蛋白质。,第二节 氨基酸蛋白质的构件分子,一、蛋白质的基本组成单位氨基酸 氨基酸是具有氨基(-NH3+)或亚氨基和羧基(-COOH)的有机分子。氨基酸种类多,但构成蛋白质具有遗传密码的氨基酸只有20种,且都是L-型的-型氨基酸,其通式为:,C如是不对称C(除Gly),则:具有两种立体异构体 D-型和L-型2.具有旋光性 左旋(-)或右旋(+),氨基酸的构型是以距羧基最近的手性C原子为标准(除Gly外),而糖的构型是以距羧基最远的
9、手性C原子为标准。,氨基酸分子中既含有NH2,有含有COOH,所以氨基酸与强酸强碱都能成盐,实际上氨基酸本身就能形成内盐。,二 氨基酸的分类,根据R的化学结构(1)脂肪族氨基酸:1)疏水性:Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Met、Cys;2)极性:Arg、Lys、Asp、Glu、Asn、Gln、Ser、Thr(2)芳香族氨基酸:Phe、Tyr(3)杂环氨基酸:Trp、His(4)杂环亚氨基酸:Pro,2.根据R的极性(1)极性氨基酸:1)不带电:Ser、Thr、Asn、Gln、Tyr、Cys;2)带正电:His、Lys、Arg;3)带负电:Asp、Glu(2)非极性氨基酸:Gly、Al
10、a、Val、Leu、Ile、Phe、Met、Pro、Trp,三 氨基酸的重要理化性质,(一)一般物理性质 溶解度:水中溶解度差别较大,不溶于有机溶剂。光吸收性:可见光区无光吸收,紫外光区Phe、Thy、Trp有光吸收。旋光性:AA的物理常数,与结构、PH值有关。味感:不同味道(与构型有关).,(二)两性解离和等电点 氨基酸在水溶液中或在晶体状态时都以离子形式存在,在同一个氨基酸分子上带有能放出质子的NH3+正离子和能接受质子的COO-负离子,为两性电解质。,调节氨基酸溶液的pH,使氨基酸分子上的NH3+基和COO-基的解离程度完全相等时,即所带净电荷为零,此时氨基酸所处溶液的pH值称为该氨基酸
11、的等电点(pI)。,等电点的含义,1.定义:当氨基酸在其某一PH值时,氨基酸所带正电荷和负电荷相等,即净电荷为零,此时的PH值成为氨基酸的等电点,用PI表示。氨基酸在等电点时主要以偶极离子形式存在。2.氨基酸等电点的特点:净电荷数等于零,在电场中不移动;此时氨基酸的溶解度最小。,氨基酸等电点的确定:,1、酸碱滴定,2、根据pK值(该基团在此pH一半解离)计算:等电点等于两性离子两侧pK值的算术平均数。,Gly的滴定曲线,Gly解离作用,(三)化学性质,(1)与茚三酮的反应:Pro产生黄色物质,其它为蓝紫色。在570nm(蓝紫色)或440nm(黄色)定量测定(几g)。,(2)与甲醛的反应:氨基酸
12、的甲醛滴定法,OH-,中和滴定,(3)与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应,弱碱性,DNP-氨基酸,取代DNFB测定蛋白质N端氨基酸,灵敏度高,(4)与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应,pH8.3,无水HF,重复测定多肽链N端氨基酸排列顺序,设计出“多肽顺序自动分析仪”,(5)成盐反应,(6)酰基化和烃基化反应,(7)成酯反应,HCl气,当羧基变成乙酯后,羧基的化学性质就被掩蔽了,而氨基的化学性质就突出地显示出来。,(8)酰氯化反应,使氨基酸的羧基活化,易于另一氨基酸的氨基结合,在合成肽的工作上常用。,(9)成酰胺反应,H2NCHRCOOC2H5+HNH2,体外,无水,有机体内:,Asp(Gl
13、u)+NH4+,Asn(Gln),Asn(Gln)合成酶,ATP,(10)脱羧反应,H2NCHRCOOH,脱羧酶,(11)迭氮反应,H2N-CHR-COOH,NH2NH2,(-CH3OH),HNO2,第三节 肽,一、肽 一个氨基酸的-羧基和另一个氨基酸的-氨基脱水缩合而成的化合物。氨基酸之间脱水后形成的键称肽键(酰胺键)。,.,肽键肽键的特点是氮原子上的孤对电子与羰基具有明显的共轭作用。组成肽键的原子处于同一平面。,肽键中的C-N键具有部分双键性质,不能自由旋转。在大多数情况下,以反式结构存在。,当两个氨基酸通过肽键相互连接形成二肽,在一端仍然有游离的氨基和另一端有游离的羧基,每一端连接更多的
14、氨基酸。氨基酸能以肽键相互连接形成长的、不带支链的寡肽(25个氨基酸残基以下)和多肽(多于25个氨基酸残基)。多肽仍然有游离的-氨基和-羧基。少于10AA成为寡肽,多于10AA成为多肽或聚肽。分子量大于10000d称为蛋白质,小于10000d称为多肽。,在生物体中,多肽最重要的存在形式是作为蛋白质的亚单位。但是,也有许多分子量比较小的多肽以游离状态存在。这类多肽通常都具有特殊的生理功能,常称为活性肽。如:脑啡肽;激素类多肽;抗生素类多肽;谷胱甘肽;蛇毒多肽等。,(一)谷光甘肽(GSH),2GSH,GSSG,(二)催产素和升压素,均为9肽,第3位和第9位氨基酸不同。催产素使子宫和乳腺平滑肌收缩,
15、具有催产和促使乳腺排乳作用。升压素促进血管平滑肌收缩,升高血压,减少排尿。,(三)促肾上腺皮质激素(ACTH),39肽,活性部位为第410位的7肽片段:Met-Glu-His-Phe-Arg-Trp-Gly。,(四)脑肽,脑啡肽具有强烈的镇痛作用(强于吗啡),不上瘾。,Met-脑啡肽 Tyr-Gly-Gly-Phe-MetLeu-脑啡肽 Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu,-内啡肽(31肽)具有较强的吗啡样活性与镇痛作用。,(五)胰高血糖素,由胰岛-细胞分泌(-细胞分泌胰岛素),29肽。胰高血糖素调节 维持血糖浓度。,第四节 蛋白质的结构与功能的关系,蛋白质是由一条或多条多肽(polype
16、ptide)链以特殊方式结合而成的生物大分子。蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是将分子量在6000道尔顿以上的多肽称为蛋白质。蛋白质分子量变化范围很大,从大约6000到1000000道尔顿甚至更大。,蛋白质是氨基酸以肽键相互连接的线性序列。在蛋白质中,多肽链折叠形成特殊的形状(构象)(conformation)。在结构中,这种构象是原子的三维排列,由氨基酸序列决定。蛋白质有四种结构层次:一级结构primary),二级结构(secondary),三级结构(tertiary)和四级结构(quaternary)(不总是有)。,一、稳定蛋白质的作用力,共价键,次级键,化学键,肽键,一级结构,氢键,二硫
17、键,二、三、四级结构,疏水键,盐键,范德华力,三、四级结构,蛋白质分子中的共价键与次级键,二硫键,一、共价键,蛋白质分子中的共价键有肽键和二硫键。是生物大分子分子之间最强的作用力,化学物质(药物、毒物等)可以与生物大分子(受体蛋白或核酸)构成共价键,共价键除非被体内的特异性酶催化断裂以外,很难恢复原形,是不可逆过程,对酶来讲就是不可逆抑制作用。,二、非共价键,生物体系中分子识别的过程不仅涉及到化学键的形成,而且具有选择性的识别。共价键存在于一个分子或多个分子的原子之间,决定分子的基本结构,是分子识别的一种方式。而非共价键(又称为次级键或分子间力)决定生物大分子和分子复合物的高级结构,在分子识别
18、中起着关键的作用。,1.静电作用,静电作用是指荷电基团、偶极以及诱导偶极之间的各种静电吸引力。酶、核酸、生物膜、蛋白质等生物大分子的表面都具有可电离的基团和偶极基团存在,很容易与含有极性基团的底物或抑制剂等生成离子键和其它静电作用。,(1)离子键,生物大分子表面的带电基团可以与药物或底物分子的带电基团形成离子键。这种键可以解离。,(2)离子偶极作用,药物分子和受体分子中O、S、N和C原子的电负性均不相等,这些原子形成的键由于电负性差值可以产生偶极现象。这种偶极部分与永久电荷可以形成静电作用.离子-偶极相互作用一般比离子键小得多,键能与距离的平方差成反比,由于偶极矩是个向量,电荷与偶极的取向会影
19、响药物-受体的作用强度。如普鲁卡因及其衍生物的局部麻醉作用与酯羰基的偶极性质有关。,(3)偶极-偶极相互作用,两个原子的电负性不同,产生价键电子的极化作用,成为持久的偶极两个偶极间的作用。偶极偶极相互作用的大小,取决于偶极的大小、它们之间的距离和相互位置。这种相互作用在水溶液中普遍存在。它的作用强度比离子偶极作用小,但比偶极诱导偶极作用大。这种作用对药物受体相互作用的特异性和立体选择性非常重要,2.氢键,氢键的形成 氢键是由两个负电性原子对氢原子的静电引力所形成,是一种特殊形式的偶极偶极键。它是质子给予体X-H和质子接受体Y之间的一种特殊类型的相互作用。氢键的大小和方向 氢键的键能比共价键弱,
20、比范德华力强,在生物体系中为8.433.4kj/mol(2-8kcal/mol)。键长为0.250.31nm,比共价键短。氢键的方向用键角表示,是指XH与HY之间的夹角,一般为180250。,3 范德华力,这是一种普遍存在的作用力,是一个原子的原子核吸引另一个原子外围电子所产生的作用力。它是一种比较弱的、非特异性的作用力。这种作用力非常依赖原子间的距离,当相互靠近到大约0.40.6nm(46A)时,这种力就表现出较大的集合性质。范德华力包括引力和排斥力,其中作用势能与1/R6成正比的三种作用力(静电力、诱导力和色散力)通称为范德华引力。,4疏水作用,疏水作用是指极性基团间的静电力和氢键使极性基
21、团倾向于聚集在一起,因而排斥疏水基团,使疏水基团相互聚集所产生的能量效应和熵效应。蛋白质和酶的表面通常具有极性链或区域,这是由构成它们的氨基酸侧链上的烷基链或苯环在空间上相互接近时形成的。高分子的蛋白质可形成分子内疏水链、疏水腔或疏水缝隙,可以稳定生物大分子的高级结构。,一 蛋白质的一级结构,就是蛋白质分子中氨基酸残基的排列顺序,即氨基酸的线性序列。在基因编码的蛋白质中,这种序列是由mRNA中的核苷酸序列决定的。一级结构中包含的共价键(covalent bonds)主要指肽键(peptide bond)和二硫键(disulfide bond),一级结构确定的原则:将大化小,逐段分析,制成两套肽
22、片段,找出重叠位点,排出肽的前后位置,最后确定蛋白质的完整序列。,目前往往采用从待测蛋白质的基因序列反推出蛋白质的一级结构。,一级结构测定的顺序:,(1)测定蛋白质分子中多肽链的数目(2)拆分蛋白质分子的多肽链。(3)断开多肽链内的二硫桥。(4)分析每一多肽链的氨基酸组成。(5)鉴定多肽链的N一末端和C一末端残基。(6)裂解多肽链成较小的片段用两种或几种不同 的断裂方法。(7)测定各肽段的氨基酸序列。(8)重建完整多肽链的一级结构。(9)确定半胱氨酸残基间形成的S-S交联桥的位置。,二、蛋白质的高级结构 蛋白质分子中所有原子在三维空间的排列分布和肽链的走向。,由于羰基碳-氧双键的靠拢,允许存在
23、共振结构(resonance structure),碳与氮之间的肽键有部分双键性质,由CO-NH构成的肽单元呈现相对的刚性和平面化,肽键中的4个原子和它相邻的两个-碳原子多处于同一个平面上。,氨基的H与羰基的O几乎总是呈反式(trans)而不是顺式(cis)。,蛋白质构象稳定的原因:1)酰胺平面;2)R的影响。,1.蛋白质的二级结构,指蛋白质多肽链本身的折叠和盘绕方式,(1)-螺旋(-helix),结构要点:1)螺旋的每圈有3.6个氨基酸,螺旋间距离为0.54nm,每个残基沿轴旋转100。,2)每个肽键的羰基氧与远在第四个氨基酸氨基上的氢形成氢键(hydrogen bond),氢键的走向平行于
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