第一讲医学文献检索 ppt课件.ppt
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1、图书馆2013年下半年读者培训安排,西区咨询电话:82655067,图书馆电子资源系列培训一,东区咨询电话:82668103,图书馆信息咨询部 张小曼2013.10.11,医学文献检索与利用,图书馆电子资源培训一,查找文献在科研工作中的时间比重,据美国科学基金会统计,一个科研人员花费在查找和消化科技资料上的时间需占全部科研时间的51%,计划思考占8%,实验研究占32%,书面总结占9%。由上述统计数字可以看出,科研人员花费在科技出版物上的时间为全部科研时间的60%。-美国科学基金会 NSF(National Science Foundation),检索误区,1.文献检索即是能看到全文 研究人员时
2、间有限“首先必需认识到,科研工作者都十分宝贵自己的时间,除极少数和自己工作关系十分密切的论文以外,绝大多数读者都不会阅读全文。”著名生物化学家 邹承鲁院士“我的科学之路”2.主题检索-主题词选取 如:Neoplasms(肿瘤);Tumors(瘤);Cancers;Carcinoma(癌);-多主题课题 少数的主题词无法反映全文的内容3.计算机检索技巧 逻辑算符的运用,高级学术搜索技巧。例如:1.作者:flowers(人名弗劳尔,也是花的意思)会返回由名为“Flowers”的人撰写的文章 2.在标题:mars 得到的结果只包括文件名中的搜索字3.“-”操作符排除所有包括搜索字词的结果,Flowe
3、rs 作:Flowers;,目 录,世界权威生物医学文献检索系统,国内生物医学文献检索数据库,SinoMed 检索(CBM Web 检索),PubMed检索与利用,世界四大生物医学文献检索工具,美国医学索引(IM)Medline Pubmed荷兰医学文摘(EM)EMBASE美国生物学文摘(BA)BIOSIS Preview美国化学文摘(CA)SciFinder web,世界权威生物医学文献网络检索系统,1.PubMed:是国际权威的生物医学数据库,是生物医学领域相关文献的主要检索数据库。2.SciFinder web:是在客户端版SciFinder Scholar的基础上开发的基于web浏览器
4、的网络检索平台,二者访问的内容和功能都是一样的,只是访问的方式不同:SciFinder Scholar需要用户下载并安装客户端软件进行使用;SciFinder Web在网页浏览器上运行,无需下载软件,读者在使用web版之前必须先进行注册,完成后即可进行检索。3.BIOSIS Previews:由美国生物科学信息服务社(BIOSIS)出版,是世界上最大的关于生命科学的文摘索引数据库。该库包括生物学文摘(Biological Abstracts(R)所收录期刊以及(Biological Abstracts/RRM(R)所收录的会议、报告、评论、图书、专论等多种文献。4.EMBASE医学文摘(Exc
5、erpta Medica Database,EMBASE/EM)是当今世界上唯一用英文出版的大型医学文摘,是世界上最有影响的二次文献之一;因在荷兰出版,通常称做荷兰医学文摘,涵盖了更多欧洲和远东地区的文献。,世界四大著名检索系统,科学引文索引(SCI)科技会议录索引(ISTP)工程索引(EI)科学评论索引(ISR),世界著名的四大检索系统,SCI(Science Citation Index)即科学引文索引,是自然科学领域基础理论学科方面的重要的期刊文摘索引数据库。它创建于1961年。ISTP(Index to Scientific&Technical Proceedings)即科学技术会议录
6、索引,创刊于1978年,由美国科学情报研究所编制,主要收录国际上著名的科技会议文献。Ei(Engineering Index)即工程索引,创刊于1884年,由Elsevier Engineering Information Inc.编辑出版。主要收录工程技术领域的论文(主要为科技期刊和会议录论文)ISR(Index to Scientific Reviews)即科技评论索引,创刊于1974年,由美国科学情报研究所编辑出版,收录世界各国2700余种科技期刊及300余种专著丛刊中有价值的评述论文。,世界著名四大医学周刊,Lancet 柳叶刀 http:/(IF):2012年 39.060 Brit
7、ish Medical Journal(BMJ)英国医学杂志 http:/(IF):2012年 17.215 New England Journal of Medicine(N Engl J Med)http:/www.nejm.org 新英格兰医学杂志(IF):51.658 Journal of the American Medical Association(JAMA)http:/www.jamia.org 美国医学会杂志(IF):2012年 29.978,我校可检的生物医学数据库,检索类数据库系统 国 内:中国生物医学文献数据库CBM)中国科学引文数据库核心库(CSCD)读秀学术搜索(h
8、ttp:/CALIS e读(edu china)国 外:PubMed、Medline、Web of Science、Biosis Preview、Scifinder Scholar,期刊全文数据库 国 内:维普中文科技期刊数据库 http:/中国学术期刊全文数据库 http:/数字化期刊(万方数据)http:/国 外:Elsevier(ScienceDirectOnLine,SDOL)OVID(LWW,OUP,EBMReviews)、SpringerLink、WileyInterScience、EBSCO(ASP)、Karger Online Journals等 OA期刊,中国生物医学文献数据
9、库(CBM Web 检索)SinoMed 检索,中国生物医学文献数据库(CBM),中国医学科学院医学信息研究所开发研制的综合性医学文献数据库。中国生物医学文献数据库收录 1978 年以来 1800 多种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录。学科覆盖范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的各个领域。中国生物医学文献数据库注重数据的规范化处理和知识管理,全部题录均根据美国国立医学图书馆最新版医学主题词表、中国中医研究院中医药信息研究所中国中医药学主题词表,以及中国图书馆分类法 医学专业分类表进行主题标引和分类标引。词表辅助检索功能:检索系统具有多种词表辅助检
10、索功能,建有主题词表、中英文主题词轮排表、分类表、期刊表、索引词表、作者表等多种词表,且有丰富的注释信息。检索入口多:除 30 多个检索入口外,更提供特色的主题词检索、分类检索、第一著者检索、文献类型、资助项目和参考文献等检索方式。尤其是主题和副主题词检索功能将有效提高查准和查全率。,SinoMed概况介绍,中国生物医学文献服务系统(SinoMed)是在中国生物医学文献数据库(CBMdisc)的基础上开发研制的新一代专业文献信息服务系统。其涵盖资源丰富,能全面、快速反映国内外生物医学领域研究的新进展;功能强大,是集检索、开放获取、个性化定题服务、全文传递服务于一体的生物医学中外文整合文献服务系
11、统。,涵盖资源,中国生物医学文献数据库(CBM)、中国医学科普文献数据库、协和医大博硕学位论文库、西文生物医学文献数据库(WBM)、日文生物医学文献数据库、俄文生物医学文献数据库、英文会议文摘数据库英文文集汇编文摘数据库。,我校订购资源,中国生物医学文献数据库(CBM):收录1978以来1800多种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录600余万篇,全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工处理。年增文献50余万篇,双周更新。中国医学科普文献数据库:收录1985年以来国内出版的医学科普期刊近百种,重点突显养生保健、心理健康、生殖健康、运动健身、医学美容、婚姻家庭、食品营养等与医学健康
12、有关的内容。双周更新。协和医大博硕学位论文库:收录1985年以来北京协和医学院培养的博士、硕士研究生学位论文,学科范围涉及医学、药学各专业领域及其他相关专业,内容前沿、丰富,可在线浏览全文。每季更新。,系统特色,涵盖资源丰富,中西兼有:用户可根据自身需要随意搭配;数据加工深度、规范:主题标引和分类标引等规范化加工处理使得文献内容的揭示更加全面、准确;检索功能强大,方便易用:智能检索、多内容限定检索、主题词表辅助检索、主题与副主题扩展检索、分类表辅助检索、定题检索、作者机构限定、多知识点链接检索、检出结果统计分析等功能,使检索过程更快、更高效,使检索结果更细化、更精确。,跨库检索,例题1:请在S
13、inoMed中检索有关葛根素治疗心绞痛的中文文献资源。,方法一,方法二,方法三,检索结果,单库检索:中国生物医学文献数据库(CBM),CBM中的基本检索,检索西安交通大学药学系贺浪冲老师老师自2000年以来作为第一作者发表的文献,精确检索,表示检索词与命中检索字符串完全等同,适用于关键词、主题词、特征词、分类号、作者、第一作者、刊名、期字段。模糊检索,亦称包含检索,即输入的检索词包含在命中文献的检索字符串中如无特殊说明,SinoMed系统中默认进行的是模糊检索。,检索2004年到2005年以来癫痫的文献,要求限于带摘要的综述,并且文献涉及到的实验对象为儿童(612岁),智能检索,CBM在“缺省
14、字段”支持智能检索功能,即能够自动实现检索词、检索词对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索。注意:智能检索不支持逻辑组配检索,CBM中的主题检索,主题检索的功能:将非主题词引见到主题词形式提供主题词的定义和注释显示主题词之间的族性关系(上位词、下位词、同位词),主题检索,使用主题检索查找有关登革热药物治疗的文献(包括中药和西药),检索过程截图,主题词的加权检索:主题词“加权”表示主题词的重要程度,反映文章论述的主要内容。加权主题词用“*”表示 加权检索表示仅对加星号(*)主题词(主要概念主题词)检索,非加权检索表示对加星号主题词和非加星号主题词(非主要概念主题词)均进行检索。,扩展检索指对当
15、前主题词及其所有下位主题词进行检索,非扩展检索则仅限于当前主题词的检索。,扩展检索,CBM中的分类检索,可通过分类号和分类名进行检索,也可通过分类导航逐级浏览。优点:族性检索例题5:检索有关舌癌遗传学方面的文献,CBM中的期刊检索,可通过选择刊名、出版地、出版单位、期刊主题词或者ISSN等检索入口直接查找期刊。也可通过“分类导航”或“首字母导航”逐级查找浏览期刊。例题6:查找南方医科大学学报2006年第6期中有关肝移植的文献有多少?,CBM中的作者检索,举例:检索我校黄辰老师作为第一作者发表的文献。,CBM中的检索历史,*最多允许保存100条检索表达式。*可从中选择一个或多个检索表达式并用逻辑
16、运 算符AND、OR、NOT组成更恰当的检索策略。*根据需求选择一个或多个有意义的检索表达式 保存成特定的“检索策略”。在“我的空间”中可定期调用该检索策略,及时获取最新信息。*无意义的检索表达式选中后点击“删除检索史”可进行删除。*系统退出后,检索历史清除。,检索结果的处理,1.检索结果分析:分析上题中我校黄辰老师以第一作者发表的文章,刊载在哪个期刊上的最多?哪一年发表的文章最多?,2.检索结果下载,个性化服务:我的空间,我的检索策略我的数据库,我的检索策略,用于定期跟踪某一课题的最新文献。,我的数据库,用于在检索过程中随时保存检索结果,供再次查阅或索取原文。可通过“标题”、“作者”、“标签
17、”三个字段在数据库中查找有关文献。用户根据需要可添加“标签”或“备注信息”。“我的数据库”最多保存500条记录,每页显示50条记录。,PubMed检索与利用,目 录,PubMed概况PubMed界面PubMed检索特点PubMed检索功能检索途径与方法检索结果的处理,PubMed简介,PubMed是美国国家医学图书馆(NLM,National Library Of Medicine)下属的国家生物技术信息中心(NCBI,National Center For Biotechnology Information)开发的、基于WWW的医学数据库查询系统,是目前国际上公认的检索生物医学文献最具权威、
18、利用率最高、影响最广的数据库,也是我国卫生部认定的科技查新必须检索的国际医学文献数据库。,数据库演变,美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)是目前国际上重要的生物医学文献信息服务中心。美国医学索引(Index Medicus,IM)创刊于1879年,由美国国立医学图书馆编辑出版,是当前世界上最常用的综合性生物医学文摘检索期刊。MEDLINE数据库:1963年起NLM采用计算机技术建立了医学文献分析和检索系统(MEDLARS),1971年发展为联机检索,简称MEDLINE。MEDLINE文献来源:美国医学索引(Index Medicus,IM)、(
19、印刷版)牙科文献索引(Index to Dental Literature)国际护理索引(International Nursing Index)1997年6月26日NLM宣布MEDLINE数据库在Internet上免费检索PubMed检索系统:主要提供MEDLINE和PRE-MEDLINE检索。除此之外,PubMed还 Publisher supplied citations(出版商直接向PubMed递送的电子记录中不被Medline收录的部分)。,MEDLINE(医学文献数据库),是美国国立医学图书馆(NLM)编辑出版的国际综合生物医学信息书目数据库,是当今世界上最具权威性的生物医学文献数
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