《生皮蛋白质化学》PPT课件.ppt
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1、本章包含如下内容1 氨基酸(分类、性质)2 多肽3 蛋白质(构象、性质)4 生皮蛋白质化学(胶原、角蛋白等),1 蛋白质的化学组成,C、H、O、N,大多含有 S有的还含有P、Fe、I、Cu、Mo、Zn,1.元素组成,各元素的百分比对于大多数蛋白质都较相似,其中N约占16%。这可用于测定蛋白质的含量凯氏定氮法。,2 蛋白质的基本结构单位 氨基酸(amino acid),组成蛋白质的氨基酸都为a-氨基酸(除Pro外),C,酸,氨,不同的 aa 在于 R基团 的不同,组成蛋白质的氨基酸都为L型(除Gly外),D型 与 L型,组成蛋白质的氨基酸共有20 种,I 非极性氨基酸,I 非极性氨基酸,I 非极
2、性氨基酸,组成蛋白质的氨基酸共有20 种,不同的 aa 在于 R基团 的不同,II 非解离的极性氨基酸,II 非解离的极性氨基酸,III 酸性氨基酸,IV 碱性氨基酸,1.由R基团的性质,Phe、Tyr、Trp,Pro、His,Ala、Val、Leu,二.氨基酸的分类,二.氨基酸的分类,2.由aa的营养需求,人类自身能合成,人类自身不能合成或不能足量合成,必须依赖食物供给。,Lys Val Leu Ile Met Phe Thr Trp,Gly Ala Ser Tyr Cys Pro Asn Asp Glu Gln,Arg His,三 不常见的氨基酸4-羟脯氨酸(4-hydroxyprolin
3、e)和5-羟赖氨酸(5-hydroxy1ysine),存在于结缔组织的纤维状蛋白质中。胱氨酸(Cystine,Cys)是由两个半胱氨酸氧化后生成,毛、发、角、蹄中含量丰富。-N-甲基赖氨酸(-N-methyllysine)存在于肌球蛋白,一种行使收缩功能的肌肉蛋白质。-羧基谷氨酸(-carboxyglutamic acid),在凝血酶原中发现,它也存在于某些具有血液凝固功能的其他蛋白质中。,5羟赖氨酸 N甲基赖氨酸 羧基谷氨酸 4羟脯氨酸,胱氨酸,锁链素(dasmosine)和异锁链素(isodesmosine),它是赖氨酸的衍生物,中央的吡啶环结构是由4个赖氨酸分子的侧链组成的,此氨基酸只存
4、在于弹性蛋白中。,以游离或结合态存在于细胞或组织中,大部分是常见氨基酸的衍生物或异构型。如存在于细菌细胞壁肽聚糖内的D-谷氨酸和D-丙氨酸、花生中的g-亚甲基谷氨酸、甘蔗中的b-氨基丁酸,刀豆中的刀豆氨酸等。,非蛋白质氨基酸,非蛋白质氨基酸,鸟氨酸(Orn),瓜氨酸,四 氨基酸的性质1 等电点PI2 光学活性3 化学性质【氨基、羧基、共同参与、侧链R基】,1.两性性质和等电点,四 氨基酸的理化性质,氨基酸同时含有氨基和羧基:氨基具有碱性,羧基具有酸性,甘氨酸的解离曲线,滴定曲线,1.两性性质和等电点,等电点(isoelectric point),使氨基酸净电荷为零时溶液的pH值,用 pI 表示
5、,此时,aa 以两性离子形式存在,也有少量的数目基本相同的正、负离子存在,还有极少量的中性分子,pI 是氨基酸的特征常数,1.两性性质和等电点,等电点(isoelectric point),20种氨基酸的pI,等电点的计算,例 Gly 的pI 计算,pI=1/2(pK1+pK2),等电点的计算,例 Lys 的pI 计算,pI=1/2(pK2+pK3),溶液 pH 值增大,等电点的计算,例 Glu 的解离,pI=1/2(pK1+pK2),等电点的计算,aa 等电点的计算公式,pI=1/2(pKn+pKn+1),(其中n为可解离的正电荷基团数目),Conclusion,pH pI 带负电,移向正极
6、,pH pI 带正电,移向负极,pH=pI 不带电,不移动,2.光学性质,除Gly之外,其余蛋白质氨基酸都有手性碳原子,都具有旋光性。,旋光性质,Trp、Tyr、Phe 含芳香环共轭双键系统,最大吸收峰分别在 279nm、278nm、259nm。,紫外吸收,3.重要的化学性质,茚三酮反应,反应分2步:,茚三酮反应常用于aa的定性和定量分析,在酸性条件下,氨基酸与茚三酮共热,生成紫色化合物,Pro的茚三酮反应呈黄色,Sanger反应,在弱碱溶液中,氨基酸的-氨基与2,4-二硝基氟苯(DNFB)反应,生成黄色的二硝基苯氨基酸(DNP-AA),此反应最初被Sanger 用于测定肽链 N-端氨基酸,E
7、dman反应,Edman反应,Edman反应,此反应即是目前“蛋白质顺序测定”的设计原理,3 肽(peptide),一.肽的定义,一个氨基酸的羧基与另一个氨基酸的氨基脱去一分子水而形成酰胺键,这个键称为肽键(peptide bond),产生的化合物叫做肽(peptide)。,二个氨基酸形成的肽称作二肽,三个氨基酸形成的肽称作三肽;余类推。寡肽(oligopeptide):aa 10 个,二.肽的结构,肽键结构特点1)肽键具有部分双键性质,不能自由旋转;2)肽平面是刚性平面结构(六个原子处在同一平面内);3)在肽平面内,羰基上的氧与亚胺基上的氢反式排布。,无分枝的长链,由“N-C-C”单元的周期
8、性连接,构成多肽链的主链;氨基酸残基的R基团连接在主链的Ca上,形成多肽链的侧链。,具有方向性。两个末端分别为N端(氨基端)和C端(羧基端)。,1、中文表示法:从肽链的N端开始,对氨基酸残基逐一命名,残基称氨酰,三.肽的表示法,2、三字母表示法:aa1-aa2-aa3-aa4-aa1.aa2.aa3.aa4.,3、单字母表示法:ABCD,四.肽的酸碱性质,其等电点是在所有可解离的基团的净电荷为0时的状态。,肽链的一端含有一个游离的-氨基,另一端含有一个游离的-羧基,加上部分氨基酸可解离的R基团,因而与氨基酸一样具有两性解质的性质。,五.重要肽,还原性谷胱甘肽(reduced glutathio
9、ne)是存在于动植物细胞中的一种非常重要的三肽。它是由谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸组成。GSH,谷氨酰半胱氨酰甘氨酸,GSH由谷氨酸,半胱氨酸和甘氨酸通过两步依赖ATP的反应而生成。第一步反应由谷氨酸和半胱氨酸在-谷氨酰半胱氨酸合成酶(-EC合成酶;-ECS,EC 6.3.2.2)催化下形成-谷氨酰半胱氨酸(-EC),第二步是由GSH合成酶(GS,EC 6.3.2.3)将-EC和谷氨酸连接形成 GSH,4 蛋白质一 蛋白质的构象1 蛋白质的一级结构(primary structure)蛋白质分子的一级结构是指多肽链中氨基酸的组成、连接方式和排列顺序。不同的蛋白质,一级结构不同。蛋白质的一级结构是由
10、基因上的遗传密码的排列顺序决定的。一级结构最为重要,它包含着决定蛋白质空间结构的基本因素,也是蛋白质生物功能的多样性和种属特异性的结构基础。,牛胰岛素的一级结构示意图(牛胰岛素由两条肽链共51个氨基酸残基组成)A链含有11种共21个氨基酸残基,N-端为甘氨酸,C-端为天冬酰胺,A链本身的6位和11位上的二个半胱氨酸通过二硫键相连成环;B链含16种共30个氨基酸残基,其N-端为苯丙氨酸,C-端为丙氨酸。,2 蛋白质的空间结构主要包括蛋白质的二级结构、三级结构和四级结构。维持蛋白质分子构象的作用力有:氢键、盐键、疏水键、范德华力和二硫键等。,a氢键;b盐键;c疏水键;d二硫键,(1)蛋白质的二级结
11、构蛋白质的二级结构是指多肽链的主链骨架中若干肽段在空间的伸展方式。维系主链构象稳定的最主要因素是主链的羰基和亚氨基之间所形成的氢键;蛋白质的二级结构最重要的是-螺旋和-折叠,还有-转角和无规卷曲等。,1)-螺旋结构(Helix),在-螺旋结构中,多肽链中各肽键平面通过-碳原子的旋转,围绕中心轴形成一种紧密螺旋盘曲构象。蛋白质分子中广泛存在-螺旋。,如果一系列相邻肽单位的成对二面角都采用相同或相似的值,导致多肽链的主链骨架绕定轴一圈圈螺旋上升,形成象弹簧一样的螺旋结构。,结构特点如下:肽链呈螺旋上升,每相隔3.6个氨基酸残基上升1圈,每个氨基酸残基绕轴旋转100,沿轴向升高0.15nm,故螺距约
12、为0.54nm;,螺旋间靠氢键维系,氢键是由同一条主链上一个氨基酸残基中的C=O氧与后面第四个氨基酸残基中的N-H氢形成,方向与螺旋轴大致平行,由于每个肽键中的C=O和N-H都参与形成链内氢键、故保持了-螺旋的最大稳定性。,2)-折叠结构(Sheet)一般由两条以上的肽链或一条肽链内的若干肽段共同参与形成,它们平行排列,并在两条肽链或一条肽链内的两个肽段之间以氢键维系而成。,按照通过氢键结合起来的相邻肽链的端基方向,折叠分为平行折叠和反平行折叠两种。在平行折叠中,相邻肽链的N端都在同一端;在反平行折叠中,每一条肽链都与其相邻肽链的端基方向相反,即首尾交替排列。折叠大量存在于丝心蛋白和角蛋白中。
13、,3)胶原螺旋(Collagen Helix)胶原螺旋是胶原蛋白质特有的构象形式。胶原属于纤维蛋白,是动物结缔组织中的主要蛋白质。平均分子量将近30万,1056个AA构成;氨基酸构成:13 Gly,11 Ala,12 Pro和9Hyp;肽段呈现明显的三肽周期性结构,Gly为三肽中的固定组成,Pro、Hyp是肽中对构象有决定意义的组成。最常见的几种三肽序列:GlyXPro、GlyProY、GlyXHyp,胶原为三股胶原螺旋构象,即由三条呈左手螺旋的肽链形成的右手复合螺旋。其中,单条肽链的左手螺旋是一种较伸展的螺旋构象,螺距为0.9nm,每圈含3个氨基酸残基,每个氨基酸在螺旋轴线上的投影约为0.3
14、nm,明显的大于螺旋的螺距0.54nm和每个氨基酸投影0.15nm。右手大螺旋的螺距2.86nm,每圈含10个氨基酸残基。肽链之间形成的氢键维持构象稳定。,(2)蛋白质的三级结构,蛋白质的三级结构是指蛋白质(主要指球状蛋白)分子在二级结构的基础上依靠非共价键力进一步卷曲、折叠而构成的一种不规则的、特定的、更复杂的空间结构。球状蛋白质分子内有几类二级结构单元。,肌红蛋白存在于哺乳动物(鲸、海狗和海豚)肌肉中,是一种较小的球状蛋白,它是由一条含153个氨基酸残基组成的多肽链。主链中75绕曲成8段比较直的-螺旋。,3 蛋白质的性质1)蛋白质的酸碱性(PI),2)蛋白质的沉淀(precipitatio
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