《酶学与酶工程》PPT课件.ppt
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1、第一章 酶学与酶工程,第一节 酶工程概述,1、酶学发展历史,新陈代谢是生命活动的基础,是生命活动最重要的特征。约公元前21世纪夏禹时代,人们就会酿酒。公元前12世纪周代已能制作饴糖和用豆类做酱。,1810年Jaseph Gaylussac发现酵母可将糖转化为酒精。1833年Payen和Persoz从麦芽得到淀粉酶制剂(diastase),其意思是“分离”。首先发现了酶。1878年,Kuhne才给酶一个统一的名词,叫Enzyme,希腊文意思是“在酵母中”。,1903年,Herlri提出了酶与底物作用的中间复合物学说。1913年Michaelis和Mentern导出了米氏方程,酶由定性到定量,奠定
2、了酶学发展的里程碑。,1926年美国科学家Sumner从刀豆提取出了脲酶并获得结晶,证明脲酶具有蛋白质性质。奠定了现代酶学、蛋白质化学的基础。萨姆纳,J.B.美国生物化学家 1946年诺贝尔化学奖,1958年,Koshland提出了“诱导契合”理论,以解释酶的催化理论和专一性。,1965年Phillips首次用X射线晶体衍射技术阐明了鸡蛋清溶菌酶的三维结构。,80年代初Cech和Altman分别发现了核酶(ribozyme),开辟了酶学研究的新领域,1989年共同获得诺贝尔化学奖。切赫(1947)奥尔特曼S.Altman(1939-),1986年Schultz与Lerner等人研制成功抗体酶(
3、abzyme),这一研究成果对酶学研究具有重要的理论意义和广泛的应用前景。它集生物学、免疫学、化学于一身,采用单克隆、多克隆、基因工程、蛋白质工程等高新技术,开创了催化剂研究和生产的崭新领域。,Boyer和walker阐明了ATP合酶(ATP synthase)合成与分解ATP的分子机制,于1997年获得诺贝尔化学奖。ATP合酶的结构(引自Lodish等1999),现已鉴定出4000多种酶,数百种酶已得到结晶。这些问题的提出和解决,都与酶学知识和理论的掌握有直接的关系。,2、酶工程简介,(1)酶工程的产生(2)酶工程的历史(3)酶工程研究内容,(1)酶工程的产生,生物工程学(biotechno
4、logy)也叫生物技术或生物工艺学,是20世纪70年代初在分子生物学和细胞生物学基础上发展起来的一个新兴技术领域。酶工程(enzyme engineering)是生物工程的主要内容之一。是酶学和工程学相互渗透结合、发展而成的一门新的技术科学。是酶学、微生物学的基本原理与化学工程有机结合而产生的边缘科学技术。,(2)酶工程的历史,1894年,日本科学家首次从米曲霉中提炼出淀粉酶,治疗消化不良,开创人类有目的地生产和应用酶制剂的先例。1908年,德国科学家罗门等利用胰酶(胰蛋白酶、胰淀粉酶和胰脂肪酶的混合物),用于皮革的鞣制。1917年,法国人用枯草杆菌产生的淀粉酶作纺织工业上的退浆剂。1949年
5、,日本采用深层培养法生产-淀粉酶获得成功,使酶制剂生产应用进入工业化阶段。1959年,葡萄糖淀粉酶催化淀粉生产葡萄糖新工艺研究成功,大大地促进了酶在工业上应用的前景。,1953年,德国科学家首先将聚氨基苯乙烯树脂重氮化,然后将淀粉酶等与这种载体结合,制成了固定化淀粉酶。1971年,第一次国际酶工程学术会议在美国召开,会议的主题就是固定化酶的研制和应用。,20世纪70年代大规模开展了固定化细胞、辅酶共固定、增殖细胞固定、动植物细胞固定等研究。建立多种类型的酶反应器,酶工程蓬勃发展。近20年来,酶分子修饰技术、酶的化学合成以及酶的人工合成等方面的研究,也在积极地开展中,从而使酶工程更加显示出广阔而
6、诱人的前景。当然酶工程的研究不是孤立的,而是与各个学科相互关联、相互渗透、相互促进的。,(3)酶工程的内容,酶工程主要指酶制剂在工业上的大规模应用及其相应的研究,由以下部分组成:酶的生产;酶的分离纯化;酶的固定化;酶分子的改造和修饰 酶抑制剂的研究 生物反应器。,化学酶工程和生物酶工程,化学酶工程指自然酶、化学修饰酶、固定化酶及化学人工酶的研究和应用 生物酶工程是酶学和以基因重组技术为主的现代分子生物学技术相结合的产物,主要包括3个方面:用基因工程技术大量生产酶(克隆酶)修饰酶基因产生遗传修饰酶(突变酶)设计新的酶基因合成自然界没有的新酶,全世界著名的酶制剂企业有:丹麦Novozymes公司、
7、美国杰能科国际公司(Genencor)。我国酶制剂工业诞生于1965年。现有100多家生产厂,最大的是无锡酶制剂厂。万吨以上企业有10家。品种有20多种,应用在食品、饲料、制革、洗涤剂、纺织、酿造、造纸、医药等许多行业。,使用的酶制剂类型:,一类是水解酶类 淀粉酶、纤维素酶、蛋白酶、脂肪酶、果胶酶、乳糖酶等,占有市场销售额的75%以上。约有60%以上的酶制剂已用基因改良菌株生产,公司使用的菌种有80%是基因重组菌株。,二类是非水解酶 主要是分析试剂用酶、医药工业用酶、淀粉加工用酶、乳制品工业用酶,第二节 酶的分类、组成、结构特 点和作用机制,一、酶的分类(一)酶的命名法1、习惯命名法(1)依据
8、底物来命名(绝大多数酶):蛋白酶、淀粉酶;(2)依据催化反应的性质命名:水解酶、转氨酶;(3)结合底物和催化反应的性质命名:琥珀酸脱氢酶;(4)有时加上酶的来源:胃蛋白酶、牛胰凝乳蛋白酶。,(二)国际系统命名基本原则:明确标明酶的底物及催化反应的性质(底物为水时可略去不写)。,举例:谷丙转氨酶的系统名称:丙氨酸:-酮戊二酸 氨基转移酶,丙氨酸:-酮戊二酸氨基转移酶,(三)国际系统分类法及编号(EC编号)(1)按反应性质分六大类,用1、2、3、4、5、6表示:氧、转、水、裂、异、合;,1:氧化还原酶 2:转移酶 3:水解酶 4:裂合酶 5:异构酶 6:合成酶(连接酶),(2)根据底物中被作用的基
9、团或键的特点,将每一大类分为若干个亚类,编号用1、2、3等;(3)每个亚类又可分为若干个亚一亚类,用编号1、2、3表示。,乙醇脱氢酶 EC1.1.1.1,第一个数字表示大类:氧化还原酶类第二个数字表示反应基团:醇基第三个数字表示电子受体:NAD+第四个数字表示此酶底物:乙醇。,前面三个编号表明这个酶的特性:反应性质、底物性质(键的类型)及电子或基团的受体,第四个编号用于区分不同的底物。,酶的编号由4个数字组成,中间以“”隔开。第一个数字表示大类,第二个数字表示亚类,第三个表示亚-亚类,第四个数字表示在亚-亚类中的编号。,二、酶的组成和结构特点(一)酶的化学本质 酶除了少数有催化活性的RNA分子
10、外,几乎所有的酶都是蛋白质。具有蛋白质的典型性质。同时具有自身的特性。,(二)酶的化学组成单纯酶类(simple enzyme):仅由蛋白质组成,不含其它物质,如脲酶、溶菌酶、淀粉酶、脂肪酶、核糖核酸酶等。缀合酶类(conjugated enzyme):全酶=脱辅酶+辅因子,二者存在酶才有催化作用;如超氧化物歧化酶(Cu2、Zn2)、乳酸脱氢酶(NAD+),辅酶:与酶蛋白结合较松,可透析除去。如NAD+,NADP+辅基:共价键,与酶蛋白结合较紧,透析不可除去。如细胞色素氧化酶的铁卟啉,金属离子:Fe2+、Zn2+、Cu+、Cu2+、Mn3+、Mg2+、K+、Na+、Co2+等。有机化合物:NA
11、D+,NADP+,FAD,生物素,卟啉等,酶的辅因子主要有金属离子和有机化合物,并且根据与脱辅酶结合的松紧程度不同可分为两类,即辅酶和辅基。,1.单体酶一般是由一条肽链组成,大多是催化水解反应的酶。,牛胰RNase 124a.a 单链 鸡卵清溶菌酶 129a.a 单链,2.寡聚酶 由两个或两个以上亚基组成的酶,亚基可以相同或不同,一般是偶数,亚基间以非共价键结合。亚基一般无活性,必须相互结合才有活性。,如乳酸脱氢酶等。,3.多酶复合体由几个酶靠非共价键结合而成,其中每一个酶催化一个反应,所有反应依次进行,构成一个代谢途径或代谢途径的一部分。大肠杆菌丙酮酸脱氢酶复合体由三种酶组成:,丙酮酸脱氢酶
12、(E1)二氢硫辛酸转乙酰基酶(E2)二氢硫辛酸脱氢酶(E3),(二)酶的结构特点1.有四级空间结构形式,寡聚酶必须具有正确的四级结构才有活性。2、具有活性的酶都是球蛋白,即被广泛折叠、结构紧密的多肽链,其氨基酸亲水基团在外表,而疏水基团向内。,三、酶的作用机制,(一)结合部位 Binding site酶分子中与底物结合的部位或区域一般称为结合部位。,(二)催化部位 catalytic site,酶分子中促使底物发生化学变化的部位称为催化部位。,酶的活性中心的概念 通常将酶的结合部位和催化部位总称为酶的活性部位或活性中心。结合部位决定酶的专一性,催化部位决定酶所催化反应的性质。,酶的活性中心包括
13、底物结合部位(决定酶的专一性)、催化部位(直接参与催化反应,形成产物),酶的作用机制,酶结合底物分子,形成酶-底物复合物。酶活性部位的活性残基与底物分子结合,转变为过渡态,然后生成产物,释放到溶液中。游离的酶与另一分子底物结合后,开始它的又一次循环。(一)两种模型,1、锁和钥匙模型(lock-and-key model)1894年Emil Fischer,德国科学家。师从凯库勒。他发现了苯肼,对糖类、嘌呤类有机化合物的研究取得了突出的成就,因而荣获1902年的诺贝尔化学奖。,认为整个酶分子的天然构象是具有刚性结构的,酶表面具有特定的形状。酶与底物的结合如同一把钥匙对应一把锁一样。,2、诱导契合
14、模型(induced-fit model)1958年由Koshland 提出。认为酶表面并没有一种与底物互补的固定形状,而只是由于底物的诱导才形成了互补形状。,随后的X衍射分析实验结果支持这一假说,比较满意地说明了酶的专一性。(1)酶有其原来的形状,不一定一开始就是底物的模板。(2)底物能诱导酶蛋白分子形状发生一定的变化。(3)酶分子发生变化后就能与底物互补楔合。(4)在酶反应过程中,活性中心构象的变化是可逆的诱导契合学说认为:酶的活性部位在结构上是柔性的而非刚性的也就是说不固定的,即具可逆性和弹性。,(二)酶的作用机制,1、酸碱催化酶分子的一些功能基团起瞬时质子供体或质子受体的作用。分为狭义
15、的酸碱催化和广义的酸碱催化。狭义的酸碱催化剂即是H+与OH-广义的酸碱是指能供给质子(H+)与接受质子的物质。可作为广义酸碱的功能基团:氨基、羧基、巯基、酚羟基、咪唑基。,影响酸碱催化反应速度的两个因素:酸或碱的强度。组氨酸咪唑基的解离常数为6,在pH6附近(中性溶液)有一半以质子供体(酸)形式存在,另一半以质子受体(碱)形式存在。给出质子或结合质子的速度。其中,咪唑基给出质子和结合质子的速度十分迅速,是酶的催化反应中最有效、最活泼的一个功能基团。,2、共价催化酶的某些亲核基团,能迅速与底物形成共价中间复合物,降低反应的活化能,使反应加速。酶亲核基团:Ser-OH,Cys-SH,His-咪唑基
16、等 底物亲电中心:磷酰基(-P=O),酰基(-C=O),糖基(Glc-C-),3、邻近效应及定向效应,邻近效应 底物的反应基团与酶的催化基团越靠近,其反应速度越快。定向效应 催化基团与底物的反应基团之间的正确取位,从而提高酶催化反应速度的效应。,4、变形或张力 当特异底物与酶结合时,酶蛋白发生一定构象变化,与底物发生诱导契合。酶使底物分子中的敏感键发生变形或张力。,底物形变,利于形成ES复合物。进一步转换成过渡态结构,大大降低活化能。,5、酶的活性中心为疏水区域,酶的活性中心常为酶分子的凹穴。此处常为非极性或疏水性的氨基酸残基。介电常数低,并排出极性高的水分子。这使得底物分子的反应键和酶的催化
17、基团之间易发生反应,有助于加速酶催化反应。,6、多元催化和协同效应,多个基元催化反应配合在一起共同起作用。上面介绍了实现酶反应高效率的几个因素,但是并不能指出那一种因素可以影响所有酶的全部催化活性。更可能的情况是:不同的酶,起主要影响的因素可能是不同的,各自都有其特点,可以受一种或几种因素的影响。,第三节 酶作为催化剂的显著特点,酶与化学催化剂比较具有显著的特性。最重要的有三方面:一、高催化效率 二、强专一性 三、酶活性可以调控,一、高催化效率,催化能力,酶加快反应速度可高达108-1020倍。,酶促反应速度相当高,而酶催化的最适条件几乎都为温和的温度和非极端pH。以NH3为例:固氮酶:25、
18、中性pH。工业:700900K、1090MPa,(一)酶专一性类型1、结构专一性,(1)绝对专一性 酶对底物的要求非常严格,只能对某一种底物的某一种反应起催化作用。脲酶只能催化尿素水解,而对尿素的各种衍生物或尿素的其它反应不起作用。,(2)相对专一性:对底物专一性降低,可作用一类结构相近的底物。,二、酶的专一性,基团专一性除了对键有要求,还对于键的一端的基团要求严格。例如:-D-葡萄糖苷酶不但要求-糖苷键,并且要求-糖苷键的一端必须有葡萄糖残基,而对键的另一端R基团则要求不严,因此它可催化含有-葡萄糖苷的蔗糖或麦芽糖水解,但不能使含有-葡萄糖苷的纤维二糖水解。,键专一性:作用于一定的键,但对键
19、两端的基团并无严格要求。这类酶对底物结构的要求低。酯酶催化酯键的水解,而对底物R-C中的R及R基团都没有严格的要求,即能催化水解甘油酯类、简单脂类,也能催化丙酰、乙酰胆碱等。,2.立体异构专一性 有些酶不仅对底物化学结构有要求,而且对底物分 子的立体构型也有要求,称作立体异构专一性。立体异 构专一性又分两类:(1)旋光异构专一性 当底物具有旋光性时,酶只能作用于其中的一种。它是酶反应中相当普遍的现象。例如:L-氨基酸氧化酶只能 催化L-氨基酸氧化,而对D-氨基酸无作用。,(2)几何(顺反)异构专一性 酶对底物的几何构型有严格的要求称之为几何异构专一性。例如:延胡索酸酶只能催化反丁烯二酸(即延胡
20、索酸),而不能催化顺丁烯二酸的水合作用。,三、调节性,酶活性的调节控制主要有下列7种方式 1.酶浓度的调节 两种方式:诱导或抑制酶的合成;调节酶的降解 例如:-半乳糖苷酶的合成。,2.激素调节 例:乳糖合成酶 乳糖合成酶由催化亚基和调节亚基组成,可以催化乳糖合成反应:EUDP-半乳糖+葡萄糖 乳糖+UDP,调节亚基合成是受激素控制的。,3.共价修饰调节 在一种酶分子上,共价地引入或去掉一个基团从而改变酶的活性 例:磷酸化酶的磷酸化和去磷酸化 4.限制性蛋白水解作用与酶活力调控 高特异性的共价修饰调节系统 例:酶原激活、血液凝固、补体激活,5.抑制剂的调节 例:胰脏的胰蛋白酶 抑肽酶,磷酸变位酶
21、 2,3-二磷酸甘油酸6.反馈调节 许多小分子物质的合成是由一连串的反应组成的。催化此物质生成的第一步反应的酶,往往可以被它的终端产物所抑制,这种对自我合成的抑制叫反馈抑制。例:异亮氨酸抑制第一个酶一苏氨酸脱氨酶 7.金属离子和其他小分子化合物的调节,第四节 影响酶活性的因素,一、酶速度,酶催化反应的速率通常称作酶速度(velocity)。酶速度通常以酶促反应的初速度为准(底物消耗5%)。因为底物浓度降低、酶部分失活、产物抑制和逆反应等因素,会使反应速度随反应时间的延长而下降。,几个概念,酶的活力单位:表示酶活力大小所用的两个国际单位1IU:在最适反应条件下,每分钟催化1mol底物转化为产物所
22、需的酶量,称一个IU。1 Kat:在最适反应条件下,每秒钟催化1mol底物转化为产物所需的酶量,称Kat单位 1 Kat60 106 IU;1 IU 1/60 Kat16.7n Kat最适条件:最适温度(25或37),最适pH、最适缓冲液离子强度、最适底物浓度。底物浓度要求:(1)通常很大,使酶饱和;(2)底物消耗5%。,酶活力(或总活力):样品中酶的总单位比活力:是每毫克蛋白质中酶单位的数量(U/mg)。比活力=活力U/mg蛋白=总活力U/总蛋白mg,影响酶活力的因素1、底物浓度酶速度对底物浓度(S)的依赖关系的正常模式是:在低的底物浓度下,S增加1倍,将导致起始速度(Vo)也增加1倍。在较
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