《遗传学控制》PPT课件.ppt
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1、第三章 遗传学质量控制,实验动物质量控制:遗传质量控制微生物质量控制营养质量控制环境质量控制,动物实验要求:实验结果正确、可靠、有规律、重复性好,从而精确判断实验结果,得出正确结论。要达到这个目的,就必须要求实验动物有一致的反应性。必须对实验动物进行遗传控制,寻求群体在遗传上的稳定性,以求获得较好的实验再现性和群体代表性。,实验动物遗传质量控制,实验动物的遗传背景与反应特性是影响实验结果的重要因素,不同遗传背景与反应性的实验动物,对同一刺激有时可引出不同质和量的反应。并不是所有用于科研的动物都是实验动物。实验动物:从遗传学角度讲,实验动物应是具有明确遗传背景并受严格遗传控制,属于遗传限定性动物
2、。,实验动物的分类方法,一切动物的分类都离不开传统的生物学分类法则。每一种实验动物都可以在传统分类法中找到自己的位置。以大家鼠为例,它属于:脊椎动物门哺乳动物纲啮齿目鼠科大家鼠属大家鼠种,犰狳,沙鼠,鼬,种、品种和品系的概念,实验动物品种(stock)、品系(strain)的定义超出了一般动物分类学的概念。1、种(species):是生物学分类的最基本单位。有生殖隔离的动物则是异种动物。而实验动物则把同一动物中具有不同遗传特性的动物分为不同的品种和品系。因此,品种和品系是实验动物分类的基本单位。实验动物品种、品系是经人工培育,遗传限定,并且用于各项实验研究的动物,在同一物种中不同的品种和品系并
3、不存在种间隔离的天然屏障。,2、品种(stock):是种以下的进一步分类。品种一般系指具有一些容易识别和人们所需要的性状,而且可以基本稳定遗传的动物群体。如青紫蓝兔、Wistar大鼠、KM小鼠等。,3、品系(strain):在实验动物学中把基因高度纯合的动物称作品系动物。如,C57BL/6是近交系动物中的一个品系,属低癌、高补体活性的动物。习惯上把近交系动物称为品系,封闭群动物称为品种。,种、品种和品系,三、作为品种、品系的条件1.相似的外貌特征:同一品种或品系具有相同的外貌特征:如毛色、形态大小外观等,但不同品系、品种的动物也有外貌相似的。,品种、品系的条件,2.独特的生物学特性:独特的生物
4、学特性是一个品种、品系存在的基础。就白化小鼠而言多达几十个品系,但每个品系、品种的生物学特性都有或多或少的差别。例如A系经产鼠中高发乳腺肿瘤(80%),A系老年鼠多有肾脏病变,AKR系自发淋巴细胞白血病(60%-90%)。,品种、品系的条件,3.稳定的遗传性能:作为一个品系,不仅要有相似的外貌特征,独特的生物学特性,更重要的是要有稳定的遗传性能,即在品系、品种自群繁殖时,能将其特性稳定地传给后代。换言之,就是一个品系、品种必须具有一定的育种价值。,4.共同的遗传来源和一定的遗传结构 任何品种、品系都可追溯到其共同的祖先,并由此分支经选育而成,其遗传结构也应是独特的。例如,KM小鼠Glo-l位点
5、为a基因,为单一型,而NIH小鼠在该基因呈多态分布,a、b型基因频率分别为67和33。如果将上述两个品种建立基因概貌就发现它们在基因概貌上的差异,而品种内这种差异是有限的。,近交系小鼠的起源与谱系之一,第一节 遗传学分类,一、实验动物按遗传学控制分类根据遗传特点、基因纯合程度可分为:近交系动物(Inbred strains)杂交F1代动物(F1-Hybrid)封闭群动物(Closed-colony)野生动物:未经遗传控制而进行自然交配的动物,故不属于遗传分类体系。,新进展,染色体置换系 Consomicstrainsorchromosomesubstitution strains定义:为把某一
6、染色体全部导入到近交系中,反复进行回交而育成的近交系。与同类系相同,将 F1 作为第1个世代,至少要 10个回交。,新进展,核转移系 Conplasticstrains 定义:将某个品系的核基因组移到别的品系细胞质而培育的品系。混合系 Mixedinbredstrains 定义:由两个亲本品系(其中一个是重组基因的 ES 细胞株)混合制作的近交系。互交系 Advancedintercrosslines 定义:是两个近交系间繁殖到 F2,采取避免兄妹交配的互交所得到的多个近交系。由于其较高的相近基因位点间的重组率而被应用于突变基因的精细定位分析。,第二节 近交系动物,一、基本概念1.近交(inb
7、reeding):遗传上血缘关系较近的雌雄个体之间的交配称为近亲交配。属于基因型分离交配,实验动物育种多采用兄妹交配的方法近交。,2.近交方式:全同胞交配亲子交配半同胞、叔侄、祖孙等交配类型。,3.近交程度:近交系数 coefficient of inbreeding 根据近亲交配的世代数,将基因的纯化程度用百分比来表示。Fn=1-(1-F)n。n表示近交代数,F是每进一代的近交系数上升率。血缘系数coefficient of relationship 群体中个体之间的基因组成的相似程度用数值来表示。,理论上,随着全同胞交配或亲子交配世代数的增加,近交系数上升,到20代时,近交系数可达98.6
8、,杂合基因仅剩1.4。,同卵孪生子之间的基因组成完全相同时,血缘系数为100,子代从双亲中获得基因各一半,亲子之间的血缘系数为50。随着近交代数增加,血缘系数相应不断升高,到第20代时血缘系数可以达到99.6%。,4.近交系动物:经至少连续20代以上的全同胞兄妹交配培育而成,品系内所有个体都可追溯到起源于第20代或以后代数的一对共同祖先,该品系称为近交系。,近交系动物培育方法,培育目标:定向、不定向两种 种鼠的选择 1从野生鼠中选择 2从起源于没有经过的近亲繁殖的远交群 中选择 3从杂交群中选择,近交系动物培育方法:,近交系的培育过程:F0 x F1 x F2 x F3 x F20 x,20代
9、21代22代23代,近交系动物的培育,近交系动物培育成功的标志:1 品系内个体间异体植皮获得成功(100天)2 各个基因位点都是纯合子 3 确定品系的遗传概貌:4 给品系命名:,5.亚系(substrain):近交系的亚系:是指一个近交系内各个分支的动物群之间,己经发现或十分可能存在遗传差异。是指育成的近交系在培育过程中,由于杂合子基因的分离,基因突变的产生以及抽样误差导致部分遗传组成改变而形成遗传差异的近交系动物群。,亚系分化存在以下3种情况:同一近交系在兄妹交配40代以前分离(即分支 发生于F20到F40之间),很可能由于残余杂合性而导致形成亚系。同一近交系长年处于分离状态(100代以上)
10、可能由于突变形成亚系。已发现一个分支与其它分支存在有遗传差异 产生这种差异的原因可能是残留杂合、突变或遗传污染(genetic contamination)(即一个近交系与非本品系动物之间杂交引起遗传改变)。,6.支系(subline):当饲养环境改变,或对动物进行某些人为的技术性处理时,可能对近交系动物的某些生物学特征产生影响,这些特征可能是遗传性的,也可能是非遗传性的,形成了不同的支系。如:引种到另一个实验室、代乳、受精卵或胚胎移植、卵巢移植、冷冻保存和人工哺乳等。这些处理在某些实验中会影响实验结果,因此有必要对同一品系或亚系进行区分,这些经过处理的动物可视为这些近交系或亚系的支系。,二、
11、近交系动物的特征1 基因位点的纯合性(homozygosity):近交系动物培育成后,其任何一个基因位点上的纯合概率高达98.6以上,导致动物群体不再携带未知的隐性基因,品系将会保留和表现所有的遗传性状。品系内个体之间交配不会出现性状分离。,2 遗传组成的同源性(Isogenicity):一个近交系内,所有动物都可追溯到其原始的一对共同的祖先。所有位点的基因都是纯合的,并且只来源于共同祖先的一个拷贝。遗传同源性将导致近交系有以下三个重要特性:(1)品系内个体间可接受组织移植(2)从品系内单个个体的监测中可得知品系整体的基因类型(3)从一个群体内可以很容易分离出许多遗传上相同的亚群体,近交系动物
12、的特征,3 表型一致性(Uniformity):由于遗传上的同源性,近交品系内个体在表型上极为相同,尤其是那些高度由遗传决定的生物学特征。如毛色、组织型等,甚至行为类型也一样。近交系表型上的一致性使得使用较少量的动物,即可以达到统计学的精确程度。,近交系动物的特征,4 遗传组成独特性(Individuality):近交系培育后,每个品系从物种的整个基因库只获得极少部分基因,这些基因的组合构成了品系的遗传组成。因此,每个品系在遗传组成上是独一无二的,具有独特的表型特征。,近交系动物的特征,5 长期遗传稳定性(Long term genetic stability):近交系动物可保持长期遗传稳定性
13、。如:C57BL,DBA.BALB/c 近交系虽然在遗传上并不是绝对稳定不变,但是其遗传组成不受选择、近交的影响,能导致遗传上发生变化的因素易受人为控制,而且出现的概率很低。,近交系动物的特征,6 遗传特征的可辨性(Identification):近交系一旦培育成功,动物群体内几乎将不存在遗传多态性,即每个位点只有一种基因类型,而不会存在其它的等位基因。选择一定的遗传检测方法,可将外貌相似的不同品系分辨出来。,近交系动物的特征,7 国际分布广泛:近交系动物个体具备品系的全能性,任何个体均可携带该品系全部基因库,引种非常方便,仅需1至5对动物,便于不同 国家、不同地区建立完全相同的标准近交系,进
14、行科学研究。可重复或验证已取得的数据。,近交系动物的特征,8 背景资料完整性:近交系动物由于在培育和保种的过程中都有详细记录,加之这些动物分布广泛,经常使用,已有相当数量的文献记载着各个品系的生物学特性,另外对任何近交系每一项研究又增加了该品系的研究应用履历档案,这些基本数据对于设计新的实验和解释实验结果提供了有价值的参考信息。,近交系动物的缺点,1 引起近交衰退(Inbreeding Depression)由于近交衰退,近交系一般具有较低的生育力和生活力。这一特征给品系的维持、保种和繁殖生产带来极大的不利,所以近交系生产量较低,很容易断种,而且这一特征也使动物不能接受剧烈的实验处理。有害的隐
15、性基因的暴露:多基因平衡的破坏:,近交系动物的缺点,2 生产饲养成本高:近交系由于其繁殖力低,需要严格的饲养管理,对饲养环境和饲料营养要求较高,所以相对来说其生产和实验的成本较高。3 对外界因素的敏感性,三近交系动物的分类和应用:普通近交系重组近交系同源近交系:同源突变近交系 同源导入近交系 分离近交系,普通近交系应用:节省样本量。组织细胞或肿瘤移植,个体间相容性一致。隐性纯合基因的暴露,获得先天性畸形及先天 性疾病的动物模型,如糖尿病、高血压等。某些品系自发或诱发肿瘤,成为肿瘤病因学,肿瘤药理学模型。多个近交系同时使用,分析不同的遗传组成对某项实验结果的影响,或观察实验结果是否具有普遍意义。
16、,2.重组近交系(recombinant inbreed strain,RI)由两个无血缘关系的近交系杂交后,得到F1代,分组分别经连续20代以上的全同胞兄妹交配而培育成的近交系列组动物。为重组近交系提供亲代的两个近交系称为祖系。该品系动物既具有其双亲品系的特性,又具有重组后一组内和每个重组近交系的特征,应用:重组近交系对祖系间有差异的性状和基因进行遗传分析是非常有用的实验材料。分离分析连锁分析功能分析,3.同源近交系:(1)同源突变近交系 coisogenic inbred strain 两个近交系除了一个指明位点等位基因不同外,其它遗传基因全部相同的品系。是某个近交系在某基因位点上发生突变
17、而分离出的近交系亚系,与原近交系的差异只是发生突变的基因位点上带有不同的基因,而其它位点上的基因完全相同。,(2)同源导入近交系 congenic inbred strain 通过基因导入的方法将一个目的基因导入某个近交系的基因组内,由此形成的一个近交系与原来的近交系只是在一个很小的染色体片段上基因不同。,配系(partner strain):接受目的基因的品系,必须是近交系。乘客基因(passenger gene):在基因导入过程中,因与差异基因紧密连锁一起导入近交系基因组的基因。供系(donor strain):提供目的基因的品系,可以是任何一种基因类型的动物。,(3)分离近交系 segr
18、egating inbred strain 在培育近交系的过程中,采用一定的交配方法,迫使个别基因位点上的基因处于杂合状态,则分离出该基因位点上带有不同等位基因的两个近交系亚系。,同源近交系的应用:在同一遗传背景下比较某基因位点上不 同等位基因的遗传效应。在不同遗传背景中研究同一基因与遗传 背景及其它基因的关系。消除杂合遗传背景对某些突变基因表达 的影响,以获得更为稳定的实验动物模型对复杂的多基因性状进行遗传分析。,四、近交系动物的保种繁殖1、近交系保种近交系保种严格按全同胞方式进行交配。育成的近交系不得与其他品系杂交。近交系有特异的遗传特性,保种过程随时 分离或淘汰遗传变异的个体。近交繁殖力
19、低,选择繁殖力高的,淘汰繁 殖力低的家系。对个体进行详细记录和建立系谱。,2、近交系动物生产:基础群:严格按照全同胞方式交配(3-5对)扩大群:全同胞方式交配生产群:随机交配,繁殖代数不超过3代。红绿灯繁殖体系:白标签表示第 1代,绿标签表示第2代,黄标签表示第3代,红标签表示第4代,红标签后不得留种再做繁殖用。,红绿灯生产体系,常用的近交系动物,常用的近交系动物:C57BL/6,常用的近交系动物,第三节 封闭群动物,群体的概念:所谓群体是指生物的一个种、一个亚种、一个品系、品种或其它类群的所有成员之和。在生物的进化历史中,单个生物个体的存在与否是无意义的,生物只有以群体的方式生存,这个物种才
20、能存在与发展。,基因频率和基因型频率 基因频率(gene frequency):就是在一个群体中某一种基因的数量与占据同一基因座的全部等位基因总数的比例,取值范围在0到1之间,通常写成小数的形式。基因型频率(genotype frequency):就是在二倍体的生物群体中,某一个基因座的特定基因型(如AA、Aa和aa)在其全部基因型中所占的比例,取值范围在0到1之间,通常也写成小数的形式。,封闭群动物,在一个群体内部,个体之间遗传变异一般起因于等位基因的差异,而群体间的遗传变异则取决于其基因频率的差异。因此,基因频率决定了群体的遗传特性。,封闭群动物,Hardy-Weinberg定律:在一个无
21、限大的随机交配的群体内,如果没有突变,选择和迁移等外来因素的干扰,则该群体每一世代基因频率和基因型频率保持不变。,一、封闭群(closed colony)一个群体既不以近交形式进行交配,也不引入任何外来血缘,在封闭条件下交配繁殖,从而保持了群体的一般遗传特征,又具有杂合性,我们称之为封闭群。ICLAS规定,以非近亲交配方式进行繁殖生产的一个种群,在不从外部引入新的血缘条件下,至少连续繁殖4代以上称为封闭群。,二、封闭群动物的特点及应用1、封闭群动物避免了近亲交配,具有较强的繁殖力和生活力,表现为每胎产子多,胎间隔较短,仔鼠死亡率低,生长快,成熟早,寿命长,对疾病的抵抗力强。在饲养繁殖过程中无需
22、详细记录谱系,成本低,易生产,可大量生产,充足供应。广泛应用于实验,一般实验及学生的教学。,封闭群动物,2、封闭群动物(远交种)的遗传组成具有很高的杂合性,类似于人类群体遗传异质性的遗传组成,用于人类遗传学研究、药物筛选、毒物试验,生物制品和化学药品的鉴定等方面。3、由于封闭群动物的遗传组成具有很高的杂合性,所以在遗传学研究中可作为选择实验的基础群体,用于对一些性状遗传力的研究。,毕格犬,4、封闭群动物的突变种携带的突变基因通常可导致动物某些方面的异常,成为生理学、胚胎学和医学研究的模型。如高血压大鼠。5、由于其可携带大量的隐性有害基因,可用于估计群体对自发或诱发突变的遗传负荷能力。,SHR,
23、封闭群动物,常用的封闭群动物,wistar、SD大鼠,毕格犬,青蓝紫兔,KM、NIH、ICR小鼠,三、封闭群动物的维持原则:尽量保持封闭群动物的基因异质性及多态性,避免近交系数随繁殖代数增加而上升过快。近交系数增量:F1/2NN:群体个数,国际实验动物委员会规定封闭群每代近交系数增加量不得超过1,由F1/2N得到每代动物数量不能少于25对。引种时,小型啮齿类封闭群动物数不得少于25对。,四、封闭群动物的繁育体系 采用随机交配的繁育体系,要求这个繁育体系能保持严格的家系记录并最大限度地避免动物近交。每代近交系数上升不超过1%。方法:1.按随机数表配对法 2.分组交配法 3.循环配对法,封闭群动物
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