《药物设计原理》PPT课件.ppt
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1、2023/7/31,第三章,药物设计的原理与方法,The principle and methods of new Drug design,拼合原理,局部修饰,生物电子等排原理,前药原理,软药原理,2023/7/31,先导化合物只提供一种新作用的结构类型,往往作用较弱、药代性质不合理或具有不良作用而不能用于临床,需要对先导化合物结构进行改造或修饰,以优化出具有良好药效、合理的药代和最低的毒付作用的新化学实体先导物的优化方法在前章已作了部分介绍,多数都是经验性的总结,本章所讲内容依然可以认为是先导物的优化,2023/7/31,利用化学的方法、设计并合成先导物的结构类似物(analogs)、同源物
2、(congenes)、同系物(homologs)或衍生物(deravatives),通过化学操作和生物学评价,发现决定药理作用的药效团、药效片断或基本结构,得到在药效、毒性、特异性、作用时间等方面优于先导物,同时还应具有易服用、化学稳定、方便易得等优点具体的方法除了第二章所讲到的以外,还有利用拼合原理、局部修饰、生物电子等排、药物的潜伏化(前药原理)、软药等方法。下面分别作以介绍,2023/7/31,3-1.拼合原理(Hypridization principle),一、基本原理1、拼合原理的定义:将两种药物的结构拼合在一个分子中,或将两者的药效基团通过共价键兼容于一个分子中,使形成的药物或兼
3、具两者的性质,强化药理作用,减少各自相应的毒副作用,或是两者取长补短,发挥各自的药理活性,协同完成治疗作用。有时将其称为挛药(Twin Drug),药物设计的原理及方法,2023/7/31,4-1.拼合原理(Hypridization principle),2、拼合操作利用不同的链接基(linker)连接,以调整两个药效团间的空间距离,两个分子不经连结基团而直接连接;经重叠某些结构而键合。连接方式 三种头-头;尾-尾;头-尾 类型在体内分裂成原来的两种药物,分别其作用,可以认为是前药,改善药学和药代动力学性质在体内不分解以整个分子起作用,呈现不同的药理效用,药物设计的原理及方法,2023/7/
4、31,分子重复(molecular replication)是指两个或多个相同的分子或片断经共价键结合形成的分子许多天然活性产物就是结构重复性分子,如双香豆素(Dicumarol)、黄青霉素(Xanthocilin)等。合成药包括血管扩张剂山梨烟酯(Sorbinicate)等。,2023/7/31,另一种药物的重复是有亚烷基链连接的,如7个亚甲基连接两个他克林分子,其抑制胆碱酯酶的活性比他克林强1000倍,2023/7/31,Veraguensin可作为血小板活化因子抑制剂IC50=1.1mol/L,进一步改造后活性增加,Veraguensin,2023/7/31,3-1.拼合原理(Hypri
5、dization principle),可以与两个不同的受体作用、或与一个受体的两个不同的结合位点作用、或与两个不同的酶作用以及与一个酶和一个受体作用等的双重作用药物是拼合原理的重要应用。两种药物拼合在一起形成的新分子,一般在体外无生物活性,进入体内后,经相关酶的酶促分解后才能发挥相应的药理作用。,药物设计的原理及方法,2023/7/31,二、Examaple of Hypridization principle,1、扑炎痛(Benorilate)阿司匹林和对乙酰氨基酚(扑热息痛)都是解热止痛药 阿司匹林分子中的羧基,对胃粘膜有刺激性,长期服用易引起溃疡 对乙酰氨基酚长期服用,以导致肾脏毒性
6、将前者的羧基与后者的酚羟基脱水酯化,口服对胃无刺激,在体内经酯酶分解后,又重新分解为原来的药物,共同发挥解热镇痛作用,用药剂量小,毒副作用大大降低。,2023/7/31,Hypridization principle,.,阿司匹林,扑热息痛,2023/7/31,氨苄西林:半合成-内酰胺类广谱抗生素,具有耐酸性适用于口服而广泛用于临床。金黄色葡萄球菌等产生的青霉素酶或-内酰胺酶,能使-内酰胺换开裂而丧失抗菌活性。舒巴坦:-内酰胺酶抑制剂,对革兰氏阳性或阴性菌有作用 二者通过次甲基拼合成双酯,由于舒巴坦分子中的砜基的氧原子与碳6原子上的-构型的氢形成氢键,增加了-内酰胺环上羰基碳原子的正电性。提高
7、了与酶负电中心的结合力,使氨苄西林的结构免遭破坏,从而保证了其抗菌性的发挥。同时该双酯的口服吸收好,提高了生物利用度;,2、氨苄西林与舒巴坦的拼合,2023/7/31,Hypridization principle,.,2023/7/31,3、-内酰胺类头胞菌素与喹诺酮类药物的拼合,-内酰胺类头胞菌素作用为阻挠细菌合成其细胞壁(其作用是保护不受外来异物的侵入)喹诺酮类药物则干扰细菌核酸的功能将头胞噻肟(Cefotaxime)(-内酰胺类)和罗氟沙星(Fluroxacine)(喹诺酮类)通过酯键连结为一个分子,由于头胞类干扰细菌胞壁的合成,将喹诺酮类药物携进细菌细胞内,水解后释放出罗氟沙星易于和
8、细菌的核酸作用,其对肠杆菌属及其它革兰氏阴性菌和阳性菌有强烈的抑制作用。,2023/7/31,-内酰胺类头胞菌素与喹诺酮类药物的拼合,上述设计是基于下述原因考虑的喹诺酮类药物疗效确切,研究深入,没有耐药性问题两大类抗菌药的抗菌谱有一定的互补性,头胞类对革兰氏阳性菌作用较强,喹诺酮类对包括铜绿假单胞菌在内的革兰氏阴性菌和-内酰胺耐药株作用较强喹诺酮的溶解度小,中枢神经系统毒副作用,光毒性和关节损害,可通过与-内酰胺类形成前药得以弥补喹诺酮类和-内酰胺类的靶酶分别是DNA促旋酶和转肽酶,不同的作用机制有利于降低细菌对双重作用抗生素的耐药性,2023/7/31,4、抗菌药的拼合,头胞噻肟,罗氟沙星,
9、2023/7/31,5、同时抑制两个受体,TxA2受体拮抗剂具有潜在的抗哮喘作用,组胺H1受体及抗剂具有抗过敏作用。同时抑制两个受体,可具有更好的抗哮喘作用,2023/7/31,6、同时抑制两个酶的拼合物,环氧合酶(COX)和5-酯氧酶(5-LO)可分别催化前列腺素和白三烯的生物合成,导致炎症产生,同时抑制两种酶,不仅可增强抗炎作用,安全性也可提高达布非隆(Darbuferone)具有此作用,为水溶性无致溃疡作用的口服抗炎药,达布非隆,2023/7/31,7、同时对受体和酶具有作用的拼合体,下列化合物同时对于TxA2受体和TxA2合成酶具有抑制作用既可抑制催化生成TxA2的酶系,又对已经生成的
10、TxA2激活受体的作用加以阻断,具有较好的抗哮喘作用,2023/7/31,具有利尿、降血压双重功能的降压药,2023/7/31,降压作用显著,2023/7/31,8、药物潜伏化drug latentiation,二氢吡啶类类易透过血脑凭证,可将药物携至脑内,青霉素、头孢类难以进入中枢神经系统,不能用于脑部疾病的治疗,二者结合起来即可,2023/7/31,药物潜伏化也可设计为将原药进行改造,使其在体内转化为原药,属于前药类别。拼合原理在其他地方也有很多应用其他如雷尼替丁与柠檬酸铋钾的拼合、头孢塞肟与氟罗沙星的拼合等。,2023/7/31,存在问题,拼合设计困难很大,成功率较低有效药物的拼合生成无
11、活性的产物,药物对受体不能识别和结合作用平和的两部分的活性强度的匹配,对两个受体分别呈激动或拮抗作用的拼合物难以在作用强度上适配二者在剂量上的适配、药代动力学的要求是否相同,2023/7/31,3-2 局部修饰(Local Manipulation),结构改造使用的最多的就是对先导化合物的局部修饰或变换,包括分子量大小的改变、柔性-刚性的互换、饱和碳原子数的改变、链状化合物的闭环以及环的开裂、双键或不对称中心的引入、具有空间障碍的大体积基团的除去或改变、功能基的引入或去掉、基团位置或方向的改变、分子的电荷分布或状态的改变等,2023/7/31,一、同系物变换,先导物中烷基链的延长或缩短,得到相
12、应的同系物,在杂原子或芳香环上引入甲基对生物活性的影响更大,这是由于氢键的形成、位阻的增加、电性的改变、构想以及代谢样式的改变,使药效学和药代动力学明显改变。不同的先导物碳链的改变对活性的影响不同,无固定规则奇数和偶数碳原子对活性有交替的影响有时低数碳链和高数碳链的作用模式正好相反,2023/7/31,2023/7/31,二、开环与关环,先导物含有环系时,将环打开就可得到链状类似物,也可将环缩小和扩环。开环类似物可在体内经氧化或失水等代谢反应而环和为原环状物,这种开环相当于前药氯胍(proguanil)体外物活性,在体内被环化后具有活性,且半衰期延长,氯胍(无活性),环氯胍(有活性),2023
13、/7/31,多数开环类似物在体内不会被环合,而是以环状物的构象类似物的形式起作用,如雌二醇的德类似物阿仑雌酚、己烯雌酚等开环的分子有时会降低活性,如钾离子通道开放剂色满卡林(Cromakalin)开环后活性降低60%;-受体激动剂可乐定开环后活性下降30倍,Cromakalin,开环物,Clonidine,Seco-Clonidine,2023/7/31,开链结构环合也是一个重要的修饰方法,成环后减少并限制了分子的构象,可用其推断药物的活性构象,但是也可能带来立体异构现象从Norfloxacin到Ofloxacin,活性大大增加,Norfloxacin,Ofloxacin,2023/7/31,
14、由于分子的柔性,可能会产生多种药理活性,成环后分子的多样性减少,作用特异性增加,副作用相对减少中枢神经递质r-氨基丁酸(GABA)是介导抑制中枢神经系统的重要内源性物质,分子中含有4个可旋转的键,可产生多种构象,对其进行构象限制,包括成环,可得到强效GABA激动剂,GABA,Trans-4-氨基巴豆酸,isoguvacine,THIP,2023/7/31,三、多重键的引入,引入双键可改变分子的立体化学性质、分子构型和构象都与饱和化合物有极大的差别,导致生物活性发生变化具体做法:在饱和链上引入双键;形成叉烯物(vinylogues)在分子链中引入乙烯基,因其导电子性,电荷分布未发生重要变化,但分
15、子长度和立体性质发生改变,易发生代谢降解,毒性有所增加,2023/7/31,四、大基团的引入、除去及置换,大基团的引入会导致分子与酶或受体的相互作用受阻,造成生物活性的改变。如青霉素、头孢类分子中引入大体积基团,阻断-内酰胺酶对-内酰胺环的进攻而得到耐-内酰胺酶,抗菌作用强的新抗生素向内源性活性物质分子中引入大体积基团,使分子和受体作用变化,甚至有激动剂变为拮抗剂,2023/7/31,去甲肾上腺素(-肾上腺激动剂,摩西塞利 血管扩张剂(-肾上腺拮抗剂),乙酰胆碱,抗胆碱药,异丙肾上腺素(-肾上腺激动剂,普萘洛尔(-肾上腺拮抗剂),2023/7/31,五、基团电性的改变,基团的改变主要从诱导效应
16、和共轭效应两方面引起分子电性的变化,引起分子物理化学性质的变化,并对其生物活性产生影响电子接受体和电子供体,2023/7/31,共轭效应,2023/7/31,一、基础:、电子等排原理1、Erlenmeyer 等的电子等排体概念 定义:外层电子数相等的原子、离子或分子都成为电子等排体,电子等排体的外周电子层结构在形状、大小、极化度等方面近似,并且化合物应是同晶形的或可共晶的,一对电子等排体分子应适合于同一晶格。电子等排体的结构、性质和作用相近,3-3.生物电子等排(bioisosterism),药物设计的原理及方法,2023/7/31,外层电子数相同的原子或原子团,4 5 6 7 8 N+P S
17、 Cl ClH P+As Se Br BrH S+Sb Te I I As+PH SH SH2 Sb+PH2 PH3,2023/7/31,考虑到电子等排概念在分子药理学上的广泛应用,Friedman把有关原子、原子团和分子的理化性质与生物活性联系起来,提出生物电子等排的概念:凡是具有相似的物理化学性质,又能产生相似的生物活性的基团或分子称为“生物等电子体”。利用生物电子等排原理得到的新化合物,其药效不一定比原药有显著增加,但是在体内的作用选择性,毒性和代谢稳定性等方面可望有明显改善.,2、生物电子等排体,2023/7/31,3、Bio-isosterism principle,生物电子等排不仅
18、应具有相同总数的外层点子,还应在分子大小、形状(键角、杂化度),构象、电子分布、(极化度、有都效应、共轭效应、电荷、偶极距等)、脂水分布系数、pK、化学反应性(代谢相似性)、氢键形成能力等方面存在相似性。不要求全部参数相似,仅某些重要参数相近,并与生物活性存在相关性。疏水性等排体(脂水分布系数相近)、等电性等排体(相近的电性效应参数)、立体性等排体等,2023/7/31,1、类型 经典生物电子等排体和非经典生物电子等排体 经典生物电子等排体的取代基形状、大小、外层电子构型大致相同,组成基团的原子数、键价、不饱和程度以及芳香性等方面极其相似。非经典生物电子等排体的取代基原子数可以不同,也不遵循经
19、典的生物电子等排体的主体和典型的规则,形状和大小变化亦较大,由于保留了pKa值、静电势能、最高占据分子轨道(HOMO)和最低空轨道(LEMO)等性能,因而仍显示生物活性。,、生物电子等排的类型及特点,2023/7/31,等疏水性等排体:具有相近脂水分布系数(如p)的生物电子等排体。等电性等排体:具有相近电性效应参数(如sm)者。等立体性等排体:具有相近立体效应参数(如Es)者等电性-等疏水性-等立体性生物电子等排体:诸种性质相似者等构象性电子等排体:构象与生物活性之间存在重要相关关系,具有相近构象的电子等排体或基本结构。,2023/7/31,COOH、SO2NHR、SO3H、PO(OH)NH2
20、、PO(OH)OEt、CONHCN、,羰基:,羧基:,生物电子等排体的类型,羟基:,OH、NHCOR、NHSO2R、CH2OH、NHCONH2、NHCN、CH(CN)2,2023/7/31,邻苯二酚,卤素,F、Cl、Br、I、CF3、CN、N(CN)2、C(CN)3,硫醚,生物电子等排体的类型,2023/7/31,生物电子等排体的类型,-N=,-(CH2)3-、-C5H5-,硫脲,甲亚胺,吡啶,空间近似基,2023/7/31,经典生物电子等排体为Erlenmeyer所限定的范围,包括一价的、二价的、三价的、四价的和环内等价的等五种类型经典的电子等排一价电子 二价电子 三价电子 四价电子 环内
21、F、OR、-O-S-N=-P=C=N+=-CH=CH-NH2、CH2-Se-Te-Sb、-As=P+=、=As+=Cl、SH、PH-CH=Sb+=-S-O-NH-Br、I,二、经典的电子等排体,2023/7/31,1、一价电子等排体 利用一价电子等排体进行药物设计,所得的化合物的生物活性没有规律性,活性可能增加,也可能减弱,有时甚至得到生理作用相拮抗的化合物。但是同一主族元素的互相置换,生物活性不会发生质的变化,如F、Cl、Br、I相互置换活性往往相似,2023/7/31,苯海拉明(抗过敏药)分子中苯环上的氢原子(R)被卤素取代,抗过敏作用随着卤素原子的相对原子量增加而增加。在烃类化合物中引入
22、卤素,可增加全身麻醉作用,且作用随卤素的增加,如麻醉强度CHCl3 CH2Cl2CH3ClCH4.,2023/7/31,在化合物中引入Cl、Br、I等代替氢原子均可增加其脂溶性,而氟原子在芳香族化合物中可增加脂溶性,在脂肪族化合物中则降低脂溶性。F、Cl,-OH、-NH2、CH3是经典的一价电子等排体,它们之间可以互换。,2023/7/31,研究磺胺类药物时发现的口服降血糖药氨磺丁脲(Carbutamide)的芳氨基用甲基取代得到甲苯磺丁脲(Tolbutamide),降血糖活性明显增加。用卤素(Cl)取代其中的甲基,并将丁基改为丙基,得到的氯磺丙脲(Chlorpropamide),半衰期延长,
23、毒副作用大为减小。,R=NH2 氨磺丁脲(Carbutamide)R=CH3 甲苯磺丁脲(Tolbutamide),氯磺丙脲(Chlorpropamide),2023/7/31,因为酶促反应的特异性,药物分子结构的微小变化,将导致活性的消失或拮抗,一价电子等排基团的互换所导致的生物活性的变化没有规律性,。肌苷(Inosine)参与体内能量代谢和蛋白质合成,可用于治疗各种原因所致的白细胞或血小板减少,6位羟基用巯基替代得到巯嘌呤(Mercaptopurine),药效学改变,具有强的抗癌作用,R=OH InosineR=SH Mercaptopurine,Attention:,2023/7/31,
24、2、二价电子等排-O-、-S-、-NH-、-CH2-是最常见的二价电子等排体,它们的疏水性相差较大,在化合物结构中相互替代,生物活性将会发生变化。另外它们的立体相似性借助于健角的相似性,键角均在108112之间。基团-O-S-NH-CH2-键角 108 3 112 2 111 3 111.5 3,2023/7/31,普鲁卡因(Procaine)和普鲁卡因胺(Procainamide)结构相近,但前者局麻作用明显强于后者。酯类局麻药分子羰基碳原子上电子云密度最低,为活性中心,与受体产生偶极吸引.前者分子中羰基偶极特性明显,后者由于芳胺的共轭效应被酰胺抵消,羰基的偶极减小,最终导致药效学发生变化,
25、普鲁卡因胺是抗心率失常药,2023/7/31,局麻药与受体相互作用示意图,2023/7/31,组胺H1受体拮抗剂苯海拉明,先用-NH-代替-O-,后来又将一个苯基取代氨基中的氢原子,得到有效的抗组胺药苯苄胺(安提根 Antergen).另外,用-CH2CH2-取代氯丙嗪杂环中的-S-,得到有价值的抗忧郁药丙米嗪(Imipriamine)和阿米替林(Amitriptyline),环中的-CH2-在分别用-O-、-S-、-NH-代替,得到系列抗精神病药物,其中多塞平(Doxepin)已用于临床。,2023/7/31,Example,苯海拉明(x=O),苯苄胺,氯丙嗪,丙咪嗪,多塞平,2023/7/
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