生化蛋白质.ppt
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1、蛋白质化学,第 2章,Structure and Function of Protein,下午5时58分,2,Protein 来自希腊字母,意思是“头等重要的,原始的”蛋白质 来源于对蛋清(清蛋白)的研究,分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的45,某些组织含量更高,例如脾、肺及横纹肌等高达80。,下午5时58分,3,下午5时58分,4,下午5时58分,5,下午5时58分,6,1833年 Payen和Persoz分离出淀粉酶。1864年 Hoppe-Seyler从血液分离出血红蛋白,并将其制成结晶。19世纪末 Fis
2、cher证明蛋白质是由氨基酸组成的,并将氨基酸合成了多种短肽。1938年 德国化学家Gerardus J.Mulder引用“Protein”一词来描述蛋白质。,大事记:,下午5时58分,7,1951年 Pauling采用X(射)线晶体衍射发现了蛋白质的二级结构-螺旋(-helix)。1953年 Frederick Sanger完成胰岛素一级序列测定。1962年 John Kendrew 和 Max Perutz确定了血红蛋白的四级结构。1965年 我国完成结晶牛胰岛素的人工合成。20世纪90年代以后 蛋白质组学,下午5时58分,8,生命的起源必然是通过化学途经实现的,只要把蛋白质的化学成份弄清
3、楚以后,化学就能着手制造出活的蛋白质来,如果化学有一天能用人工的方法制造蛋白质,那么这样的蛋白质就一定会显示出生命现象。反杜林论 恩格斯,下午5时58分,9,什么是蛋白质?,蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物。,下午5时58分,10,组成蛋白质的元素,有些蛋白质还含有少量的P、Fe、Cu、Mn、Zn、Se、I等。,C 50 55%H 6 7%O 19 24%N 13 19%S 0 4%,主要元素组成,下午5时58分,11,各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16。,由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要
4、测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:,100克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数 6.25100,1/16%,蛋白质元素组成的特点,凯氏定氮法:,下午5时58分,12,2.1蛋白质的分类,2.1.1 根据蛋白质形状,膜蛋白质,下午5时58分,13,下午5时58分,14,下午5时58分,15,下午5时58分,16,下午5时58分,17,下午5时58分,18,下午5时58分,19,下午5时58分,20,2.1.2 根据蛋白质组成成分,下午5时58分,21,1.简单蛋白:又称为单纯蛋白质;这类蛋白质只含由-氨基 酸组成的肽链,不含其它成分。(1)清蛋白和球蛋白
5、:广泛存在于动物组织中,易溶于水,球蛋白微溶于水,易溶于稀酸中。(2)谷蛋白和醇溶谷蛋白:植物蛋白,不溶于水,易溶于稀酸、稀碱中,后者可溶于7080乙醇中。(3)精蛋白和组蛋白:碱性蛋白质,存在与细胞核中。(4)硬蛋白:存在于各种软骨、腱、毛、发、丝等组织中,分为角蛋白、胶原蛋白、弹性蛋白和丝蛋白。,下午5时58分,22,2.结合蛋白:由简单蛋白与其它非蛋白成分结合而成(1)色蛋白:由简单蛋白与色素物质结合而成。如血红蛋白、叶绿蛋白和细胞 色素等。(2)糖蛋白:由简单蛋白与糖类物质组成。如细胞膜中的糖蛋白等。(3)脂蛋白:由简单蛋白与脂类结合而成。如血清-、-脂蛋白等。(4)核蛋白:由简单蛋白
6、与核酸结合而成。如细胞核中的核糖核蛋白等。(5)磷蛋白:由简单蛋白质和磷酸组成。如胃蛋白酶、酪蛋白、角蛋白、弹性蛋白、丝心蛋白等。,下午5时58分,23,2.1.3 根据功能分类,1.酶 如蛋白酶2.调节蛋白 如激素3.贮存蛋白质 如卵清蛋白4.转运蛋白 如血红蛋白5.运动蛋白 如肌球蛋白、肌动蛋白6.防御蛋白和毒蛋白,下午5时58分,24,7.受体蛋白8.支架蛋白9.结构蛋白10异常蛋白,下午5时58分,25,1)酶的生物催化作用,蛋白质具有重要的生物学功能,下午5时58分,26,2)调控作用,参与基因调控:组蛋白、非组蛋白等参与代谢调控:如激素或生长因子等,下午5时58分,27,3)运动与
7、支持,机体的结构蛋白:头发、骨骼、牙齿、肌肉等,下午5时58分,28,4)参与运输贮存的作用,血红蛋白 运输氧铜蓝蛋白 运输铜铁蛋白 贮存铁,下午5时58分,29,5)免疫保护作用,抗原抗体反应凝血机制,下午5时58分,30,6)参与细胞间信息传递,信号传导中的受体、信息分子等,7)氧化供能,下午5时58分,31,2.2 蛋白质的组成单位氨基酸,下午5时58分,32,氨基酸 组成蛋白质的基本单位,存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的基本氨基酸仅有20种,即含有氨基又有羧基的化合物,下午5时58分,33,分子中同时含有羧基和氨基,且与羧基相邻的-碳原子上都有一个氨基,因而称为-氨
8、基酸。除甘氨酸外,其它所有氨基酸分子中的-碳原子都为不对称碳原子,A.氨基酸都具有旋光性;B.每一种氨基酸都具有D-型和L-型两种立体异构体。目前已知的天然蛋白质中氨基酸都为L-型。,下午5时58分,34,R,下午5时58分,35,既有氨基,又有羧基的小分子有机物称为氨基酸。氨基酸就是氨基连接在羧酸的碳原子上。,下午5时58分,36,基本氨基酸中,除脯氨酸和甘氨酸外其余均属于L-氨基酸。,例外:,Pro 亚氨基酸,Gly 没有手性,下午5时58分,37,以甘油醛为参照,AA分为D型和L型,有旋光性手性碳原子,下午5时58分,38,下午5时58分,39,下午5时58分,40,下午5时58分,41
9、,下午5时58分,42,下午5时58分,43,2.2.2 氨基酸的分类,分类依据:R侧链基团的结构及理 化性质的不同,下午5时58分,44,按侧链的极性:极性AA、非极性AA按侧链的结构:脂肪族AA、芳香族AA 杂环AA、杂环亚AA按侧链的酸碱性:酸性AA、碱性AA中性AA,下午5时58分,45,按侧链的极性、酸碱性,非极性疏水性氨基酸极性中性氨基酸极性带电荷氨基酸,酸性氨基酸,碱性氨基酸,中性氨基酸,下午5时58分,46,非极性疏水性氨基酸极性中性氨基酸酸性氨基酸碱性氨基酸,下午5时58分,47,甘氨酸 glycine Gly G 5.97,丙氨酸 alanine Ala A 6.00,缬氨
10、酸 valine Val V 5.96,亮氨酸 leucine Leu L 5.98,异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02,苯丙氨酸 phenylalanine Phe F 5.48,脯氨酸 proline Pro P 6.30,非极性疏水性氨基酸,下午5时58分,48,下午5时58分,49,色氨酸 tryptophan Try W 5.89,丝氨酸 serine Ser S 5.68,酪氨酸 tyrosine Try Y 5.66,半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07,蛋氨酸 methionine Met M 5.74,天冬酰胺 asparagine Asn N
11、5.41,谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65,苏氨酸 threonine Thr T 5.60,2.极性中性氨基酸,下午5时58分,50,侧链基团在中性溶液中解离后带负电荷。,3.酸性氨基酸 Glu,Asp,天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97,谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22,下午5时58分,51,4.碱性氨基酸 His,Arg,Lys,侧链基团在中性溶液中解离后带正电荷。,组氨酸 His(H)7.59,赖氨酸Lys(K)9.74,精氨酸 Arg(R)10.76,下午5时58分,52,另外:,1、蛋白质中的很多氨基酸是经过加工修
12、饰的修饰氨基酸 如:脯氨酸 羟基化 成 羟脯氨酸 赖氨酸 羟基化 成 羟赖氨酸2、半胱氨酸Cys常以胱氨酸的形式存在,下午5时58分,53,半胱氨酸,胱氨酸,下午5时58分,54,下午5时58分,55,下午5时58分,56,下午5时58分,57,人体所需的八种必需氨基酸 赖氨酸(Lys)缬氨酸(Val)蛋氨酸(Met)色氨酸(Trp)亮氨酸(Leu)异亮氨酸(Ile)苏氨酸(Thr)苯丙氨酸(Phe)婴儿时期所需:精氨酸(Arg)、组氨酸(His)早产儿所需:色氨酸(Trp)、半胱氨酸(Cys),下午5时58分,58,必需氨基酸 生命活动所必需的,但人体自身不能合成,必须从食物中摄取的氨基酸。
13、半必需氨基酸 在人体内合成速度很低,特别是新生儿或患病期,但又需要给予补充的氨基酸。非必需氨基酸 人体自身能够合成的氨基酸。,下午5时58分,59,2.2.3 氨基酸的理化性质,.两性解离及等电点,氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处溶液的酸碱度。,下午5时58分,60,等电点(isoelectric point,pI)在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。,下午5时58分,61,氨基酸等电点的特点:净电荷数等于零,在电场中不移动;此时氨基酸的溶解度最小。,下午5时58分,62,氨基酸等电点的确定:,酸
14、碱滴定 根据pK值计算:等电点等于两性离子两侧pK值的算术平均数。,下午5时58分,63,下午5时58分,64,方,方,下午5时58分,65,下午5时58分,66,Gly+Gly Gly-,OH+,OH+,H+,H+,pI=(pK1+pK2)/2=(2.34+9.6)/2=5.97,下午5时58分,67,下午5时58分,68,Asp+Asp Asp-Asp=,H+,H+,H+,OH+,OH+,OH+,K1,K2,K3,两性离子zwitterion,pI=(pK1+pK2)/2=(1.88+3.65)/2=2.77,下午5时58分,69,H+,H+,H+,OH+,OH+,OH+,K1,K2,K3
15、,两性离子,pI=(pK2+pK3)/2=(8.95+10.53)/2=9.74,Lys+Lys+Lys Lys-,下午5时58分,70,中性氨基酸:pIpH6.0(5.06.3)碱性氨基酸(二氨基一羧基):pIpH7.5(7.610.9)酸性氨基酸(一氨基二羧基):pI pH3.0(2.83.2),下午5时58分,71,计算一定pH氨基酸溶液中各离子比例,pH=pKa+lg,质子受体,质子供体,下午5时58分,72,紫外吸收,色氨酸和酪氨酸的最大吸收峰在 280 nm 附近。,下午5时58分,73,紫外分分光度法:大多数蛋白质含有这两种氨基酸残基,所以测定蛋白质溶液280nm的光吸收值是分析
16、溶液中蛋白质含量的快速简便的方法。,芳香族氨基酸的紫外吸收,下午5时58分,74,氨基酸的化学性质 茚三酮反应:氨基酸可与茚三酮缩合产生蓝紫色化合物,最大吸收峰在570nm。该反应可作为蛋白质定性、定量分析的基础。-氨基、-羧基共同参与的反应。,下午5时58分,75,下午5时58分,76,与甲醛的反应,OH-,中和滴定,下午5时58分,77,与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应,弱碱性,下午5时58分,78,取代DNFB测定蛋白质N端氨基酸,灵敏度高,下午5时58分,79,与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应,pH8.3,无水HF,重复测定多肽链N端氨基酸排列顺序,设计出“多肽顺序自动分析仪”,
17、下午5时58分,80,与亚硝酸反应,在标准条件下测定生成的氮气体积,即可计算出氨基酸的量,也可用于蛋白质水解程度的测定注意:生成的氮气(N2)只有一半来自氨基酸,下午5时58分,81,与荧光胺反应:根据荧光强度测定氨基酸含量(ng级)。激发波长x=390nm,发射波长m=475nm。,下午5时58分,82,与5,5-双硫基-双(2-硝基苯甲酸)反应:,下午5时58分,83,硫代硝基苯甲酸,测定Cys-SH含量(pH8.0412nm的摩尔消光系数=13600 L.mol-1.cm-1),下午5时58分,84,2.3、肽,2.3.1 肽(peptide)的结构,肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合
18、物。,下午5时58分,85,+,甘氨酰甘氨酸,肽键,下午5时58分,86,肽键(peptide bond):是由一个氨基酸的-羧基与另一个氨基酸的-氨基脱水缩合而形成的化学键,本质为酰胺键。氨基酸残基(residue):肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为氨基酸残基。,下午5时58分,87,下午5时58分,88,下午5时58分,89,下午5时58分,90,*两分子氨基酸缩合形成二肽,三分子氨基酸缩合则形成三肽,*由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相连形成的肽称多肽(polypeptide)。,*多肽链(polypeptide chain
19、)是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。,下午5时58分,91,下午5时58分,92,N 末端:多肽链中有自由氨基的一端C 末端:多肽链中有自由羧基的一端,多肽链有方向性:,N端,C端,下午5时58分,93,N末端,C末端,牛核糖核酸酶,下午5时58分,94,下午5时58分,95,2.3.2 几种生物活性肽,谷胱甘肽(glutathione,GSH),下午5时58分,96,GSH过氧化物酶,GSH还原酶,NADPH+H+,NADP+,GSH 有抗氧化剂的作用,可还原细胞内产生的过氧化氢,下午5时58分,97,谷胱甘肽的生理功用:解毒作用:参与氧化还原反应:保护巯基酶的活性:抗氧化剂作用,
20、维持红细胞膜的稳定:,下午5时58分,98,体内许多激素属寡肽或多肽,神经肽(neuropeptide),2.多肽类激素及神经肽,下午5时58分,99,促进子宫、乳腺平滑肌收缩,加速遗忘。,收缩血管减少排尿巩固记忆,加压素(升血压),催产素,下午5时58分,100,脑啡肽(enkephalin,ENK)与-内啡肽、强啡肽等合称内源性阿片肽.内源性阿片肽是体内具有阿片样活性的一类物质,分布广泛,通过作用于不同部位的各种类型的阿片受体,发挥复杂多样的生理作用.,下午5时58分,101,脑啡肽:一种能产生吗啡样作用的天然化学物质。它是发现最早(1975年)的内啡肽,属于五肽。休斯(Hughes,G.
21、)从动物脑内分离出两种类似的五肽:一种为甲硫氨酸脑啡肽(MEnkephalin);另一种为亮氨酸脑啡肽(LEnkephalin)。发现它们局限于脑内的神经末梢,含脑啡肽的神经元都是小的中间神经元。其作用和吗啡 一样能与阿片受体呈立体专一性结合,下午5时58分,102,下午5时58分,103,下午5时58分,104,2.4 蛋白质的结构The Molecular Structure of Protein,下午5时58分,105,蛋白质是由许多氨基酸单位通过肽键连接起来的,具有特定分子结构的高分子化合物。构象是由于有机分子中单键的旋转所形成的。蛋白质的构象通常由非共价键(次级键)来维系,下午5时5
22、8分,106,蛋白质的分子结构包括(人为划分)一级结构(primary structure)二级结构(secondary structure)三级结构(tertiary structure)四级结构(quaternary structure),下午5时58分,107,定义:蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。(包括蛋白质分子中所有的二硫键的位置),2.4.1、蛋白质的一级结构,主要的维系键:肽键,有些蛋白质还包括二硫键。,一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。但不是决定蛋白质空间构象的唯一因素,下午5时58分,108,CN键不能自由旋转酰胺平面包括6个原子,下午5时58分,1
23、09,Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Ala-Ser-Val-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn,1 5 6 10 11 15 21,Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Leu-Tyr-Leu-Val-Cys-Gly,1 5 7 10 15 20,-Glu-Arg-Gly-Phe-Phe-Tyr-Thr-Pro-Lys-Ala,21 25 30,B链,A链,S,S,牛胰岛素的一级(化学)结构,蛋白质的一结构包括:氨基酸组成、氨基酸的排列顺序、氨
24、基酸的连接方式,下午5时58分,110,下午5时58分,111,2.4.2 蛋白质的空间结构,蛋白质的构象蛋白质分子中所有原子在三维空间的分布和肽链的走向,下午5时58分,112,疏水作用、离子键、氢键和 Van der Waals力等。,稳定蛋白质空间结构的作用力,下午5时58分,113,下午5时58分,114,、蛋白质的二级结构,主要的维系键:氢键,下午5时58分,115,由于C=O双键中的电子云与N原子上的未共用电子对发生“电子共振”,使肽键具有部分双键的性质,不能自由旋转。,蛋白质立体结构原则,下午5时58分,116,肽键平面由于肽键具有部分双键的性质,使参与肽键构成的六个原子被束缚在
25、同一平面上,这一平面称为肽键平面或肽单元。,肽单元,下午5时58分,117,由于-碳原子与其他原子之间均形成单键,因此两相邻的肽键平面可以作相对旋转,下午5时58分,118,蛋白质二级结构的主要形式,-螺旋(-helix)-折叠(-pleated sheet)-转角(-turn)无规卷曲(random coil),下午5时58分,119,下午5时58分,120,下午5时58分,121,-螺旋:,-螺旋是多肽链的主链原子沿一中心轴盘绕所形成的有规律的螺旋构象,结构特征:为一右手螺旋,侧链伸向螺旋外侧 螺旋每圈包含3.6个氨基酸残基,螺距 0.54nm;螺旋以氢键维系(氨基酸的N-H和相邻第四个氨
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