《PUBMED使用方法》PPT课件.ppt

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1、PUBMED,樊嵘,上海交通大学医学院医学文献检索教研室,医学院主页地址 图书馆主页地址,上海交通大学医学院医学文献检索教研室,课题查新,校外访问图书馆资源,申请了校园网统一账号(JAccount)可使用内部代理功能。校外访问限定在校内访问的资源，请在浏览器中设定使用代理服务器：地址：端口：8000或80访问时按提示输入JAccount账号和口令即可。,上海交通大学医学院医学文献检索教研室,医学文献检索四大经典文摘工具,IMMEDLINE（光盘版、网络版PUBMED、OVID等）EM EMbase光盘版EMBASE.COMBA BA光盘版BIOSIS PREVIEW（OVID、ISI）CA C

2、A光盘版Scifinder Scholar,2023/7/8,6,Pubmed概况,由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的，是全球最著名的免费医学专业题录型数据库网上检索系统。从1997年6月起，PubMed在网上免费向用户开放。它具有收录范围广泛、更新速度快、检索系统完备、链接广泛的特点。5000来源期刊,其中英文期刊约占85%2200万条高质量的题录摘要每日完成来自全球的检索200万次医学护理牙科兽医保健临床前生命科学的期刊全文链接超过 3000+种,2023/7/8,7,PubMed系统包含的数据库,（1）MEDLINE(1966-)(2）PreMEDLINE(3）Record s

3、upplied by Publisher(4)OLD MEDLINE(1946-1965)(5)NCBI其它数据库的相关记录,2023/7/8,8,MEDLINE,是美国国立医学图书馆MEDLARS系统中最大的生物医学数据库，收录1966年以来70多个国家近4000多种生物医学期刊的书目信息和著者文摘，每周更新。,2023/7/8,9,MEDLINE的组成,Index Medicus（医学索引）Index to Dental Literature（牙科文献索引）International Nursing Index（国际护理索引）,2023/7/8,10,PreMedline,收集未正式给予M

4、eSH词、出版类型等深度标引信息的一个临时库。NLM每天把最新记录加入到PreMedline库中。工作人员在一周内将这些记录标引，然后转入MEDLINE，同时从PreMedline中删去。,2023/7/8,11,Pre-Medline,Medline,New Data,Collect,PubMed,Process,2023/7/8,12,Record supplied by Publisher,出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分没有被MEDLINE收录，PubMed仍保存。,2023/7/8,13,OLD MEDLINE,1949-1965年间发表的200多万篇文献没有MeSH字段和摘要

5、。,2023/7/8,14,美国国立卫生研究院(National Institutes of Health,NIH)美国国立医学图书馆（National Library of medicine,NLM）美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，ncbi）或,pubmed主页地址,2023/7/8,15,2023/7/8,16,PubMed基本检索,自由词检索 主题词检索布尔逻辑检索字段限制检索 著者检索 刊名检索截词检索强制检索,2023/7/8,17,自由词检索,在检索框中键入一个或多个英文单词（大写或小写均可），点

6、击Search按钮，PubMed系统会自动在主题词表，期刊名表，短语表及作者索引中查询与输入的词相匹配的形式，这就是它特有的“自动词汇匹配功能”。,2023/7/8,18,PubMed对输入检索框中的检索词进行智能化地校对，将其逐步地与其数据库中的各类术语匹配的原则。,MeSH Translation Table主题词注释表,Journals Translation Table期刊注释表,Common Phrase List常用词组表,Author Index作者索引表,No Mapping,检索词拆分AND,自动词汇匹配,上海交通大学医学院医学文献检索教研室,如果在上述4个表或索引中仍找不到

7、相匹配的词时，PubMed就将短语劈开，再重复以上顺序单独分别查找，直到找到相匹配的词。如果仍找不到匹配词，则用AND 将短语中的单个词连接起来在全部字段中查找。例：h1n1 flu转换为h1n1All Fields AND(influenza,humanMeSH Terms OR(influenzaAll Fields AND humanAll Fields)OR human influenzaAll Fields OR fluAll Fields),上海交通大学医学院医学文献检索教研室,强制检索,PubMed允许使用双引号来强制系统进行短语检索。如：在PubMed主页的检索提问框中键入“h

8、eart failure”，并用双引号引起来。点击“GO”按钮，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。如果不使用双引号进行强制检索，系统就会将其分成2个词：heaart和failure检索,并进行自动匹配,2023/7/8,21,自然检索语言,2023/7/8,22,主题检索语言,上海交通大学医学院医学文献检索教研室,主题词检索(MESH DATABASE),主题词(headings)：27000余个直接、准确表达主题概念的词或词组。每个概念只能用一个主题词表达，如：心力衰竭Cardiac FailureMyocardial FailureHeart FailureHe

9、art Decompensation,Heart Failure,主题词检索(MESH DATABASE),副主题词(subheadings)：83个用于对主题词的某一特定方面加以限定，强调主题概念的某些专指方面。如：治疗（therapy）、外科学（surgery）、代谢（metabolism）、诊断（diagnosis）主题词与副主题词之间的组配检索，起到对主题词的限定作用，是主题词具有更高的专指性，缩小检索范围，保证检索结果的准确性。如：心衰的药物治疗heart failure/drug therapy,上海交通大学医学院医学文献检索教研室,2023/7/8,25,举例,检索胃癌(gast

10、ric cancer)的文献,2023/7/8,26,2023/7/8,27,2023/7/8,28,2023/7/8,29,自由词检索优缺点,优点:检索非常简单方便缺点:检索结果不精确建议:如果有主题词的,尽量用主题词检索,2023/7/8,30,主题词检索(MESH DATABASE),采用主题词与副主题词组配的方法,使检索结果更精准.如:胃癌病因的文献.,2023/7/8,31,2023/7/8,32,2023/7/8,33,2023/7/8,34,2023/7/8,35,2023/7/8,36,如检索”乳酸脱氢酶LDH与胃癌关系”的文献,2023/7/8,37,逻辑与（AND）-检出记

11、录中同时含有检索词A和检索词B.如：A AND B,逻辑非（NOT）-在含检索词A的记录中，去掉含检索词B的记录。如：A NOT B,逻辑或（OR）-检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。如：A OR B,布尔逻辑组合检索,2023/7/8,38,2023/7/8,39,2023/7/8,40,2023/7/8,41,2023/7/8,42,2023/7/8,43,2023/7/8,44,2023/7/8,45,过滤器选择,临床试验,综述,全文链接,发表日期,文献语种,年龄,性别,研究对象,期刊类型,学科主题,2023/7/8,46,乳酸脱氢酶与胃癌关系的中英文综述,2

12、023/7/8,47,2023/7/8,48,2023/7/8,49,高级检索,高级检索提供组合检索,检索历史列表。,2023/7/8,50,举例,美托洛尔治疗心力衰竭的文献Heart Failure/drug therapy Metoprolol/therapeutic use,2023/7/8,51,2023/7/8,52,2023/7/8,53,保存检索结果,Send to File默认：把检索到的所有结果保存成.txt文件勾选：只将勾选的记录保存成.txt文件Clipboard(剪贴板，最多保存500)Collections(保存到My NCBI,最多保存1000)E-Mail(检索结

13、果发送到邮箱)Order(订阅全文，全文传递系统),2023/7/8,54,期刊检索,2023/7/8,55,期刊检索,刊名缩写 N Engl J Med刊名全称“The New England Journal of Medicine”ISSN“0028-4793”,2023/7/8,56,作者检索,作者姓在前,名在后,姓全称,名缩写如:alving c*注意与 alving c的区别作者全名如:julia s wong(2002年起增加作者全名字段FAU),2023/7/8,57,2023/7/8,58,2023/7/8,59,使用“*”号作为通配符进行截词检索。如：键入“bacter*”，

14、系 统会找到那些前一部分是bacter的单词（如bacteria,bacterium,bacteriophage等），并对其分别进行检索。但只能查前600个变形 使用截词功能无法进行自由匹配,截词检索功能,2023/7/8,60,字段限制检索,采用字段限制方式进行检索，其规则：使用字段限制无法进行自由匹配 检索词 字段标识如检索 Cell 期刊 cellta如检索 篇名中有Cell的文献 cellti如检索作者姓Cell所发表的文献 cellau如检索地址名为Cell的文献 cellad,2023/7/8,61,Single Citation Matcher,2023/7/8,62,Singl

15、e Citation Matcher,快速找寻一篇特定文章如:Science.2009 Oct 23;326(5952):565-8.Sunshine JM,Farnham TL,Feaga LM,et al.,2023/7/8,63,2023/7/8,64,2023/7/8,65,2023/7/8,66,2023/7/8,67,如PUBMED没有给出全文链接，怎么办？,检索全文 Diabetes.1988Jul;37(7):901-7.Effect of intensive insulin therapy on glycemic thresholds for counterregulator

16、y hormone release.AmielSA,Sherwin RS,Simonson DC,Tamborlane WV.,2023/7/8,68,2023/7/8,69,2023/7/8,70,请用GOOGLE,2023/7/8,71,2023/7/8,72,Clinical Queries,检索临床研究类文献,检索系统评价类文献,检索遗传学类文献,2023/7/8,73,举例,肾炎(Nephritis)病因学的相关文献,2023/7/8,74,2023/7/8,75,2023/7/8,76,2023/7/8,77,2023/7/8,78,Clinical Trials,2023/7/8

17、,79,ClinicalTrials.gov,由美国卫生研究所(NIH)下属国家医学图书馆运作的一个注册库，收录了全球由国家拨款或私募经费资助的各项试验目录。只要能上网，任何人都可以免费使用该注册库。,2023/7/8,80,PMC免费全文,生命科学期刊资源中心免费提供近1000种期刊的200多万篇全文,2023/7/8,81,My NCBI,个性化服务,免费申请帐号,登录用于保存检索式、收藏检索结果、自动更新检索结果、更新结果E-mail提醒等：保存检索策略(Saved Search)：可长期保存检索策略；收藏(Collection)：可保存检索结果，最多保存1000条记录；允许用户每月、每周或每天以Email方式接收系统对这些检索策略进行自动更新的结果，从而大大方便了用户对课题进行定期检索的需求；过滤(Search Filters)：按照用户兴趣把检索结果分类。,2023/7/8,82,谢谢！,