植物基因工程载体及其构建.ppt
《植物基因工程载体及其构建.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《植物基因工程载体及其构建.ppt(97页珍藏版)》请在三一办公上搜索。
1、第三章 植物基因工程载体及其构建,第一节 载体概述,1.载体概念,载体(vector):能够承载外源基因,并将其转入受体细胞进行扩增和表达的DNA分子。,运送外源基因高效转入受体细胞;为外源基因提供复制能力和整合能力;为外源基因的扩增或表达提供必要的条件;,功能,所以,目的基因能否有效转入受体细胞,并在其中维持高效表达,很大程度上取决于载体。,具备复制原点,在宿主细胞内能够自主复制;具备合适的酶切位点,供外源片段插入;含有供选择转化子的标记基因;适当的拷贝数:较高的拷贝数,便于回收、制备;载体的安全性:对受体细胞无毒害,不能随便转移;载体大小:原则上要求载体越小越好;如果需要外源基因的表达:启
2、动子。,载体应具备的条件,2.载体的种类,人工染色体载体、线粒体载体、叶绿体载体等,按功能分:,克隆载体:主要用来克隆和扩增DNA片段,能带动外源基因在宿主细胞中复制扩增。表达载体:除具有克隆载体的基本元件外,还具有转录、翻译所必需的DNA元件,使外源基因在宿主细胞中有效表达。整合载体:将目的基因插入到受体染色体中。,目的基因克隆载体,中间载体,卸甲载体,转化载体,其功能是保存和克隆目的基因。与微生物基因工程相似,通常是由多拷贝的E.Coli小质粒为载体。,切除致瘤基因的Ti质粒或Ri质粒,是构建转化载体的受体质粒。,中间克隆载体,中间表达载体,大肠杆菌质粒插入T-DNA片段及目的基因、标记基
3、因等。是构建中间表达载体的基础质粒。,含有植物特异启动子的中间载体。作为构建转化载体的质粒。,最后用于目的基因导入植物细胞的载体,工程载体。由中间表达载体和卸甲载体构建。,第二节 质粒载体,质粒(plasmid):存在于细菌或真菌染色体外的小型环状(线型质粒DNA分子线虫、衣藻等)双链DNA分子(酵母的“杀伤质粒”是RNA),可自身复制和表达。,不是寄主生长所必需的,但可以赋予寄主某些抵御外界环境因素不利影响的能力(带有抗性基因等)。分子量在1-200 kb之间。,1、质粒(plasmid)概念,质粒空间构型,超螺旋:共价闭合环状DNA,开环DNA:1条链上有一至数个缺口,线型DNA:,最快的
4、是超螺旋,其次是线性DNA,最慢的是开环DNA。,2、质粒(plasmid)构象,3、质粒的自主复制性,质粒能利用寄主细胞的DNA复制系统进行自主复制质粒。DNA上的复制子结构决定了质粒与寄主的对应关系根据在每个细胞中的分子数(拷贝数)多寡,质粒可分为两大复制类型:,4、质粒的不相容性,同种的或亲缘关系相近的两种质粒,含有相似复制子结构,不能同时稳定地保持在一个细胞内的现象,称为质粒不相容性。不相容性的质粒组成不相容性群。,在第二个质粒导入后,在不涉及DNA限制系统时,不相容的质粒一般为利用同一复制系统,质粒分配到子细胞时会发生竞争,随机挑选,最终放大。,5、质粒的可转移性,接合型质粒:能在天
5、然条件下自发地从一个细胞转移到另一个细胞(接合作用)。甚至能使寄主染色体上的基因随其一道转移到受体菌种。非接合型质粒:不能再天然条件下独立地发生接合作用。某些非接合型质粒在接合型质粒的存在和协助,也能发生DNA转移。由mob、tra基因顺式因子bom及其内部的转移缺口位点nic决定。,6、携带特殊的遗传标记,物质抗性:抗生素、重金属离子、毒性阴离子、有机物物质合成:抗生素、细菌毒素、有机碱,对重组DNA分子的筛选十分重要!,选择标记:用于转化子的挑选;筛选标记:用于重组子的挑选;转化子:成功转化了载体的宿主细胞;重组子:真正含有重组DNA的转化子。,按用途可分为选择标记基因和筛选标记基因。,筛
6、选标记基因,插入失活法,互补筛选法,lacZ编码-半乳糖苷酶,乳糖及其衍生物可诱导其表达(乳糖既是诱导物,也是底物);IPTG:乳糖衍生物,可作为lac操纵子的诱导物,但不能作为反应底物;X-gal:可作 lac操纵子的底物,不能作为诱导物。还可作为生色剂,被-半乳糖苷酶分解后产生兰色物质,使菌落呈现兰色。,lac Z M15 放在F质粒上,随宿主传代;lac Z 放在载体上,作为筛选标记;受体菌有JM系列、TG1和XL1-Blue等。,lac Z M15:缺失-半乳糖苷酶第11-41个aa;lac Z:只编码N端140个aa;,lac Z M15+lac Z=功能互补,在lac Z 编码区上
7、游插入一小片段DNA(如51bp的MCS),不影响-半乳糖苷酶的功能互补。但在该小片段DNA中再插入一个片段,将导致产生无互补能力的-半乳糖苷酶片段;,7、天然质粒载体的局限性,(1)分子量大,拷贝数低,第一个用于基因克隆的天然质粒pSC101,分子长 9.1 kb。,但只有一个EcoR I切点充当克隆位点,Tetr 作为筛选标志。,(2)筛选标志不理想,合适的单一酶切位点少,ColE1质粒的筛选标志是大肠杆菌素E1(colicin E1)。杀死不含ColE1 质粒的菌,形成“噬菌斑”。唯一的克隆位点 EcoR I 正好位于这个基因的内部。,改造策略:去掉多余片段:缩小质粒分子量,提高外源DN
8、A片段的装载量;减少限制性酶切位点:缺失突变,限制性酶、核酸外切酶和连接酶.;提供多克隆位点易识别的选择标记:通过质粒之间的重组导入;安全性改造:质粒载体不能在细菌间随便转移;增加辅助功能:表达载体。,8、常用的质粒载体,(1)pBR322质粒载体,F.Bolivar和R.L.Rodriguez人工构建载体。,复制起点:pMB1系列(来源于ColE1)的高拷贝型复制起点,高达1000-3000个拷贝;Ampr基因:pSP2124质粒的Ampr基因;Tetr基因:pSC101的Tetr 基因;长度:4361 bp;选择标记:氨苄青霉素和四环素抗性;多克隆位点:24个克隆位点;,其中9个会导致Te
9、tr基因失活(如BamH I、Hind、Sal I);3个会导致Ampr基因失活(Sca I、PvuI、Pst I)。,衍生质粒:pBR325、pBR327及pAT153等。,(2)pUC质粒载体,University of California的J.Messing和J.Vieria于1978年,在pBR322的基础上改造而成。属正选择载体。,复制起点:pBR322的 oriAmpr基因:pBR322Ampr基因,不含原有酶切位点;lacZ启动子:大肠杆菌;lacZ基因:大肠杆菌lacZ的氨基酸片段;长度:约2.7 kb;克隆位点:10个连续的单一酶切位点,位于lacZ基因5端。选择标记:氨苄
10、青霉素和蓝白斑筛选;,pUC7、pUC8、pUC9、pUC10、pUC11、pUC18、pUC19,更小的分子量;选择方便:正向选择,可显色和抗菌素双重直接选择;克隆便利:具有多克隆位点,外源DNA方便插入;测序方便:pUC的MCS与M13噬菌体载体的MCS完全相同,便于把外源DNA转移到M13载体上测序。,(3)pGEM系列载体,由pUC派生而来。与pUC的主要区别是在MCS的两侧分别加了一个噬菌体启动子T7和SP6。可对插入片段进行转录。还加入了丝状噬菌体f1的复制起点。,(3)pBluescript II KS()系列载体,在MCS的两侧分别加了一个噬菌体启动子T7和T3。可对插入片段进
11、行转录。还加入了丝状噬菌体f1的复制起点。,9、PCR产物克隆载体,(1)T载体,PCR产物往往在3端突出一个或多个A,将T-载体的MCS中部已经切开,各有一个3端突出的T。所以能与这个载体直接连接,这种克隆称为T-A克隆。,目前,目的基因的获得几乎都是用PCR的方法,如何将PCR产物连接到载体上?,克隆载体线性化;克隆载体末端补平;克隆载体末端加T。,商业化T载体一般来说,商业化的T载体多是先使用平端限制性内切酶(如EcoRV)将克隆载体进行线性化,然后再单独加入dTTP和Taq酶7275反应,进行末端的加T。自制T载体一种常见的自制方法是利用限制性内切酶制造出具有单个T末端突出的片段,最常
12、用的内切酶为XcmI,其识别和切割特点如下:,TOPO技术,拓扑异构酶I在位点CCCTT切断并松弛超螺旋DNA,然后重新连接末端。这样,其同时作为限制酶和连接酶。,TOPO克隆是一种将拓扑异构酶与 T-载体相结合的 PCR 产物快速克隆系统 pCR-TOPO,无需 DNA 连接酶做连接。,3末端的突出 T 上共价结合了一个拓扑异构酶,当带 3 末端的突出 A 的 PCR 产物与该 T 载体互补配对时,拓扑异构酶 就将该缺口连接起来。,因为越来越多高确限度热稳定酶如Pfx、Pfu被用于PCR扩增,使到PCR后都只是平端产物。这种平端克隆往往效率低,并且有非特异性背景菌落产生,造成筛选困难。,(2
13、)平末端PCR产物载体,TOPO-Blunt载体,在 lacZ基因的下游融合了一个 ccdB(Control of cell death)基因,该基因对大肠杆菌是致死的。载体切成线状,再与目标 DNA 连接,转化大肠杆菌。,外源 DNA 片段与载体连接后,ccdB 基因的表达受到阻断,重组质粒才能在大肠杆菌中存在下来。如果没有DNA片断插入,ccdB基因则会表达,造成细菌染色体的降解导致细菌死亡。,TOPO克隆高效性原理Topo连接反应有两个分子参与,而传统的连接反应有三个分子参与,其热力学上的优势导致5分钟的快速连接。,10、质粒提取,细菌培养和富集,细胞悬浮,细胞破碎,细胞碎片基因组去除,
14、蛋白去除,质粒收集,溶液1:50 mM葡萄糖,25 mM Tris-Cl,10 mM EDTA,pH 8.0,溶液2:0.2 N NaOH,1%SDS;,溶液3:3 M 醋酸钾,2 M 醋酸,苯酚、氯仿抽提,异丙醇/乙醇沉淀,70%乙醇清洗,具备复制原点,在宿主细胞内能够自主复制;具备合适的酶切位点,供外源片段插入;含有供选择转化子的标记基因;适当的拷贝数:较高的拷贝数,便于回收、制备;载体的安全性:对受体细胞无毒害,不能随便转移;载体大小:原则上要求载体越小越好;如果需要外源基因的表达:启动子。,载体应具备的条件,11、大肠杆菌感受态制备及转化,(1)热激法,挑选单菌落,过夜振荡培养,取1m
15、l菌液+50ml培养基2-3h,OD600=0.6,取1ml菌液+50ml培养基2-3h,OD600=0.6,低温低速离心收集细胞,0.1MCaCl2悬浮处理细胞,2ml0.1MCaCl2悬浮细胞,分装,-80保存。,感受态细胞制备,转化,取出感受态,冰浴解冻,加入连接产物/质粒,冰浴30 min,42热激90 S,冰浴1 min,加入1 ml LB培养基培养45 min复苏,产物体系不超过1/10,收集菌体,涂板筛选,过夜培养,(2)电击法,当细菌长到对数中期;冷却,离心;然后用冷却的去离子水反复清洗;最后用10%甘油重悬;超低温保存。,感受态细胞制备,转化,受电场强度、电脉冲长度和DNA浓
16、度等参数的影响。电压和电脉冲长度增高,转化的细胞数量也有所提高,但存活率下降。电压:2.5 kv,电阻:300欧;电容:2.5 uF,12、大肠杆菌重组子筛选和检测,思考题,BamH Xba,EcoR I,BamH I,Xba I,PCR检测正确,片段已经整合进载体;用BamH和Xba切不出目的片段;,载体酶切位点在大肠杆菌中被甲基化;载体构建过程中出现星活性;,第三节 工程载体,植物基因转化载体必须具备的功能,能作为媒介将外源基因导入到植物细胞中,并整合到宿主细胞的基因组DNA上;能提供被寄主细胞的复制和转录系统识别的DNA序列,即启动子和复制子,以保证转化的外源基因能在植物细胞中进行复制和
17、表达。,一、根瘤农杆菌Ti质粒载体,1、Ti质粒的遗传特性及类型,Ti质粒是根癌农杆菌染色体外的遗传物质,为双股共价闭合的环状DNA分子,约有200kb组成。,章鱼碱型(octopine);胭脂碱型(nopaline);农杆碱型(agropine);农杆菌素碱型(agrocinoine)或称琥珀碱型。,根据其诱导的植物冠瘿瘤中合成的冠瘿碱种类的不同,Ti质粒可分成四种类型:,Agrobacterium tumefaciens,章鱼碱型(octopine),2.Ti质粒的功能区域,T-DNA区(transferred-DNA regions):T-DNA是农杆菌侵染植物细胞时,从Ti质粒上切割下
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 植物 基因工程 载体 及其 构建

链接地址:https://www.31ppt.com/p-5360401.html