实验三酵母核糖核酸(RNA)的提取.ppt
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1、实验三 酵母菌RNA的提取、鉴定及定量测定,一、实验目的,掌握稀碱(NaOH)法分离酵母RNA的原理与方法了解RNA的组分并掌握定性鉴定的具体方法。,二、实验原理,(一)目前常用的RNA的制备方法浓盐法:是用高浓度盐溶液处理,同时加热,以改变细胞壁的通透性,使核酸从细胞内释放出来。成本低、适于大规模操作。稀碱法:是用氢氧化钠使酵母细胞壁变性、裂解,然后用酸中和,除去蛋白质和菌体后的上清液用乙醇沉淀RNA。提取的RNA有不同程度的降解。稀碱法的提取时间短,提取率高于浓盐法,更利于工业化生产。,(二)实验材料的选择,酵母细胞富含核酸,且核酸主要是RNA,含量为干菌体的2.67%-10.0%,而DN
2、A含量较少,仅为0.03%-0.516%。为此提取RNA多以酵母为原料。,(三)RNA的化学组成的鉴定,(1)嘌呤碱鉴定:与硝酸银作用产生白色的嘌呤银化合物沉淀。(2)核糖的鉴定:地衣酚(3,5二羟甲苯试剂)显色法(3)磷酸的鉴定:与钼酸铵试剂作用产生黄色的磷钼酸铵沉淀(NH4)3PO412MoO3。(4)脱氧核糖的鉴定:与二苯胺试剂反应生成蓝灰色沉淀,如没有沉淀产生,说明没有DNA.,三、试剂,1.干酵母粉。20.04mol氢氧化钠溶液。3乙酸。495乙醇。55硫酸。6.浓氨水。7.50g/L硝酸银溶液。,8地衣酚(3,5二羟甲苯试剂):取比重1.19HCl 100ml,加入FeCl36H2
3、0 100mg及二羟甲苯100mg,混匀溶解后,置于棕色瓶中,此试剂必须在临用前新鲜配制。市售的3,5二羟甲苯不能使用,必须用苯纯化结晶l2次,并用活性炭脱色方可使用。9定磷试剂:2.5钼酸铵溶液:20ml水溶解2.5克钼酸铵,加5molL H2S0430ml,用水稀释至l00ml,此试剂可在冷处保存一月不变质。,10.10抗坏血酸(Vc)溶液:10g抗坏血酸溶于100ml水。贮棕色瓶中。溶液呈淡黄色尚可用,如呈深黄色即失效。11二苯胺试剂:称取1.5g二苯胺(如不纯,须在70乙醇中重结晶2次),溶于100ml冰醋酸(AR)中,再加入浓H2SO41.5ml,摇匀,贮在棕色瓶中放冰箱内保存备用。
4、12沉淀剂(钼酸铵过氯酸试剂):0.25钼酸铵溶于2.5过氯酸中。如配200ml,即在 193ml水中加入7m170过氯酸和0.5g钼酸铵。,四、操作步骤,1.核酸的提取:每二人用大试管取1g干酵母,加入0.05mol NaOH溶液5ml提取,放入试管沸水浴加热30分钟,并经常搅拌。待冷却后加入乙酸58滴,使提取液呈酸性(石蕊试纸),移在离心管里,离心10分钟(3500转分)。将上清液倒入另一离心管中,加入95乙醇2ml,边加边搅。加毕,离心10分钟,即可得到核酸钠的白色沉淀。,2.核酸的水解:在含有核酸钠的离心管中加入5硫酸2ml,用玻棒搅匀,沸水浴煮10分钟。其中1ml水解液放进EP管里,
5、贴好标签冷冻保存(下次试验用),3.核酸的鉴定 取水解液,按下表所列程序分别鉴定核酸的嘌呤碱、磷酸及核糖和脱氧核糖。,1.嘌呤碱的鉴定:取试管两只,分别标明测定管与对照管,依次加入下列各试剂。,注:加浓氨水使呈碱性可用pH 试纸检定。加入AgNO3后,观察有何变化。静置15分钟后,再比较两管中之沉淀。,2.磷酸的鉴定:取试管两只,分别标明测定管与对照管,然后依次加入下列各试剂:,放置数分钟,观察两管颜色有何不同。磷酸+钼酸铵磷钼酸+Vc钼蓝,3.核糖的鉴定:取试管两只,分别标明测定管与对照管,然后依次加入下列各试剂。,将两试管放入沸水浴内加热10分钟,比较两管之颜色。,4.脱氧核糖的鉴定:取两
6、试管分别标明测定管与对照管,然后依次加入下列各试剂。,将两试管同时放入沸水浴内,加热10分钟后,比较两管之颜色。,思考题,1.核酸的溶解性质是什么?常用什么试剂分离沉淀核酸?2.为什么用酵母作为实验原料?如何使RNA从酵母中释放出来?3.破酵母细胞时为什么要在沸水浴中进行?,实验五 RNA的定量测定紫外(UV)吸收法,一、目的要求,1.掌握紫外线(UV)吸收法测定核酸浓度的原理。2.熟悉紫外分光光度计的使用方法。,二、实验原理,核酸及其衍生物,核苷酸、核苷、嘌呤和嘧啶有吸收UV的性质,其吸收高峰在260nm波长处。测得未知浓度核酸溶液的A260nm值,即可以计算出其中RNA或DNA的含量。该法
7、操作简便,迅速,并对被测样品无损,用量也少。,三、试剂,钼酸铵过氯酸沉淀剂:取3.6ml 70%过氯酸和0.25g钼酸铵溶于96.4ml蒸馏水中,即成0.25%钼酸铵2.5%过氯酸溶液。,四、操作步骤,(1)取0.5ml未知浓度的RNA溶液(上次实验提取),用蒸馏水稀释至50ml,此为A液。(2)取A液2ml,再稀释至50ml,为B液。(3)另取4ml A液,加1ml沉淀剂,摇匀后置冰水中20分钟,离心(3500rpm/min,10分钟),取上清液2.5ml,稀释至50ml,此为C液。沉淀剂的作用是,使RNA沉淀析出,得到不含RNA的对照液。(4)分别取B,C液于厚度为1cm的石英比色杯,在2
8、60nm波长处测定A值。,式中A260为B管稀释液在260nm波长处A值减去C管稀释液在260nm波长处A值。N为稀释倍数.0.024(或0.020)表示1mg/ml RNA(或DNA)溶液测定的A260值相当于0.024。此为多次试验验证的数值。,计算,1000,思考题,1.核酸的溶解性质是什么?常用什么试剂分离沉淀核酸?2.为什么用酵母作为实验原料?如何使RNA从酵母中释放出来?3.破酵母细胞时为什么要在沸水浴中进行?,实验六 过氧化氢酶米氏常数(Km)的测定,一、实验目的,学习米氏常数的测定方法。,二、实验原理米氏常数的测定,米氏常数的测定:双倒数作图法(Lineweaver-Burk法
9、),1 Km 1 1=.+v Vmax S Vmax,二、实验原理,本实验测定红细胞中过氧化氢酶的米氏常数。过氧化氢酶(CAT)催化下列反应:2H2O2 CAT 2H2O+O2 H2O2浓度可用KMnO4在硫酸存在下滴定测知。2KMnO45H2O23H2SO4-2MnSO4K2SO45O28H2O 求出反应前后H2O2的浓度差即为反应速度。作图求出过氧化氢酶的米氏常数。,三、试剂,10.05mol/L草酸钠标准液 将草酸钠(AR)于100105烘12h。冷却后,准确称取0.67g,用水溶解倒入100ml量瓶中,加入浓H2SO4 5ml,加蒸馏水至刻度,充分混匀,此液可贮存数周。2约0.02ml
10、 KMnO4储存液 称取KMnO4 3.5g,溶于1000ml蒸馏水中,加热搅拌,待全部溶解后,用表面皿盖住,在低于沸点温度上加热数小时,冷后放置过夜,玻璃丝过滤,棕色瓶内保存。30.004mol/L KMnO4应用液 取0.05mol/L草酸钠标准液20ml,于锥形瓶中,加浓H2SO4 4ml,于70水浴中用KMnO4贮存液滴定至微红色,根据滴定结果算出KMnO4贮存液的标准浓度,稀释成0.004mol/L,每次稀释都必须重新标定储存液。4约0.08mol/L H2O2液 取20%H2O2(AR)40ml于1000.0ml量瓶中,加蒸馏水至刻度,临用时用0.004mol/L KMnO4标定之
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