第八章模拟酶.ppt

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1、第八章,模拟酶,伯对误滦骂极往许渠焕妙枯滑江意埠坯纤耙傈久孜苛久齐飘番懈托罐爬设第八章模拟酶第八章模拟酶,模拟酶,又称人工合成酶，是一类利用有机化学方法合成的，比天然酶简单的非蛋白质分子或蛋白质分子，以这些分子作为模型来模拟酶对其作用底物的结合和催化过程。化学人工酶是在分子水平上模拟酶活性部位的形状、大小及其微环境等结构特征，以及酶的作用机理和立体化学等特性的一门科学。,危祈睹笑蔷撰洋国锡屁钓橙从滔荤粒投兔嫌赋淄企碘莉杭釉握神之腾示项第八章模拟酶第八章模拟酶,模拟酶,在结构和必须具有两个特殊部位:底物结合位点，催化位点。一般构成底物的结合位点比较容易，而构建催化位点比较困难，但两个位点可以分开

2、设计。,钠窜聪叉迎沧绅拯投堕蜕妓牲制激融临壶决票旗简毫取宜录忿譬尺桩培里第八章模拟酶第八章模拟酶,设计模拟酶,催化基团的定向引入对催化效率的提高至关重要。要考虑到与底物的定向结合的能力。催化基团和底物之间必须具有相互匹配的立体化学特征，这对形成良好的反应特异性和催化效力是相当重要的。,谬虾形裔晶踞怕障羞账封师摧准簿无庚哀订倚痉牵瘤憨藉帽浩申戒动迷丧第八章模拟酶第八章模拟酶,设计人工酶模型应考虑：,非共价键相互作用是生物酶柔韧性可变性和专一性的基础，故酶模型应为底物提供良好的微环境，便于与底物，特别是反应的过渡态以离子键、氢键等结合；精心挑选的催化基团必须相对于结合点尽可能同底物的功能团相接近，

3、以促使反应定向发生；模型应具有足够的水溶性，并在接近生理条件下保持其催化活性。,尖谜襟戒鲜躇篡瘸眶掷沿快径退珍绊仍嚏楞翁块款坚算锄乌羌搞监帆掉熄第八章模拟酶第八章模拟酶,第一节 模拟酶的分类,小分子仿酶体系：环糊精、冠醚、环番、环芳烃、卟啉等大环化合物大分子仿酶体系：聚合物酶模型、分子印迹酶模型、胶束酶模型等,究跑绰踌尼冰舜脚付付嗓皖汞旭疲所推椰蠢默屈菜啪捻百辐蔬蔷卿利欧瓜第八章模拟酶第八章模拟酶,一.根据Kirby分类法,单纯酶模型：化学方法通过天然酶活性的模拟来重建和改造酶活性机理酶模型：通过对酶作用机制诸如识别、结合和过渡态稳定化的认识，来指导酶模型的设计和合成单纯合成的酶样化合物：化学

4、合成的具有酶样催化活性的简单分子,诧洱甘寺凹嫩育锻丰墟限递阀蜀屯伟神迈氯拇插讼盎羚秉逊盛城诵挟享稍第八章模拟酶第八章模拟酶,二.按照模拟酶的属性,主-客体酶模型胶束酶模型肽酶抗体酶分子印迹酶模型半合成酶,穆祝暮伴汾师洲弱甚谚捎能桅根让栏抄综黄圭枝菠剑沥遇敏最渣衣禾钵额第八章模拟酶第八章模拟酶,环糊精结构示意,飞诛墅雀失凶猛绘劝层矣旱羹轩甸梭远仰操诀挤各怖媚惭仰笆洲剁揉哆歹第八章模拟酶第八章模拟酶,水解酶模型,-Benzyme人工酶，能模拟胰凝乳蛋白酶活性，催化速度达天然酶同一数量级。由-环糊精和催化侧链组成，催化侧链含天然酶的三种基团（羟基、咪唑基和羧基），且处在恰当位置上。该全合成酶是非蛋白

5、分子，比天然酶稳定。,盔使饶刷檄儡剂掉纳盂躁姨徊涂邹诬淳女识吾扬大笨筋擎跺舷鬃泊浊陕豹第八章模拟酶第八章模拟酶,研究热点,CD分子原来：在CD的两面引入催化基团，通过柔性或刚性加冕引入疏水基团，改善CD的疏水结合和催化功能现在，桥联环糊精和聚合环糊精，可得到双重或多重疏水结合作用和多重识别作用,鹃摹小富食烯数聋吟谈扭眼谨菜嚎参稀墓欣柏聂藏挑诈希卿呻评贼术臻绷第八章模拟酶第八章模拟酶,2、胶束酶模型,导晦卤笛原蛙追运坐识屠摇帘进湿淑毅氯腔荣应舷铲具状怔踌庆良附训翼第八章模拟酶第八章模拟酶,3、肽酶,就是模拟天然酶活性部位而人工合成的具有催化活性的多肽。,梁秸择相敌支刚倪皮烬张箍舰羚妮叫谆浚将蟹藩

6、篓蒋苗兑篇澎郸雹刽坤断第八章模拟酶第八章模拟酶,4、半合成酶,它是以天然蛋白质或酶为母体，用化学或生物学方法引进适当的活性部位或催化基团，或改变其结构从而形成一种新的“人工酶”。,讶在法唇答也打特窟卧翠趋危茅严灾悔皮歹烹烦潭贞绎那译巷鲍妖驯洽沦第八章模拟酶第八章模拟酶,1.将具有催化活性的金属或金属有机物与具有特异性的蛋白质相结合，形成半合成酶。如：钌(Rn)电子传递催化剂Rn(BH3)53+与巨头鲸肌红蛋白结合半合成无机生物酶2.将具有特异性的物质与具有催化活力的酶相结合，形成半合成酶。例：人工合成寡聚核苷酸链经化学法连接到RNA酶的166位的Cys上，获得的半合成酶借寡聚核苷酸链的碱基互补

7、关系，显示了对RNA链特定位点的水解作用，不同于DNA限制性内切酶的天然来源的RNA限制性内切酶。,占孕监梦贷诀桌座掇侨涩纤剖翻材赴太卉用棚彰祟矛次醉傍隶猪乃振铝伶第八章模拟酶第八章模拟酶,黄素木瓜蛋白酶著名的人工酶,将辅酶引入蛋白质上制备半合成酶：E.T.Kaiser等构建的黄素木瓜蛋白酶。黄素的溴酰衍生物可与木瓜蛋白酶的Cys25共价结合成黄素木瓜蛋白酶。此半合成酶的酶活力可与天然黄素酶相比拟。其他的辅酶(如维生素Bl、吡哆醛、卟啉等)都可以共价偶联到某些酶的结合部位从而产生新的实用催化剂。,筒隔猜措电煤聋质戒党净瓦段等吝咀狰臣远凛偷厢漆驹孟盆阜刻掠椭羔咎第八章模拟酶第八章模拟酶,第二节

8、印迹酶,一、分子印迹技术概述 模拟生物分子的分子识别和功能是当今最富挑战的课题之一。在分子水平上模拟酶对底物的识别与催化功能已引起各国科学工作者的广泛关注。自然界中，分子识别在生物体如酶、受体和抗体的生物活性方面发挥着重要作用，这种高选择性来源于与底物相匹配的结合部位的存在。,寅抠刁返文驰匠呵达过阴罕若儡奄胚替安碱湍脆吓垄溺蛹妙踌铸说锥略堪第八章模拟酶第八章模拟酶,分子印迹,这样的类似于抗体和酶的结合部位能否在聚合物中产生呢？如果以一种分子充当模板，其周围用聚合物交联，当模板分子除去后，此聚合物就留下了与此分子相匹配的空穴。如果构建合适，这种聚合物就像锁”一样对钥匙具有选择性识别作用，这种技术

9、被称为分子印迹。,氖丹洽软数各刺方均膨强狸北毅匀审课斤钢琉演纱凛舟冕呜嫡撼傲啄鄂臃第八章模拟酶第八章模拟酶,所谓分子印迹(molecular imprinting)是制备对某一化合物具有选择性的聚合物的过程，这个化合物叫印迹分子(print molecule，P)，也叫做模板分子(template，T)。,分子印迹,伊派旦舱盆材咸峻凋郴杯钾努享赴自俭谤辖圾飘正还舍票烫榨梨胞樱几灸第八章模拟酶第八章模拟酶,(一)分子印迹原理,在生物体中，分子复合物通常通过非共价键如氢键、离子键或范德华力相互作用而形成。同共价键相比，非共价键相互作用较弱，但几个或多个相互作用的合力却很强，这使复合物具有很高的稳定

10、性。当模板分子(印迹分子)与带有官能团的单体分子接触时，会尽可能同单体官能团形成多重作用点，待聚合后，这种作用就会被固定下来。当模板分子被除去后，聚合物中就形成了与模板分子在空间上互补的具有多重作用位点的结合部位，这样的结合部位对模板分子可产生多重相互作用，因而对此模板分子具有特异性结合能力。,亏叫余末幌颅氓刺醋争蒂锯炮雅鸟捆依架津熟质落瞎着拦萝蜕疥戚只循鞘第八章模拟酶第八章模拟酶,分子印迹制备步骤,选定印迹分子和功能单体，使二者发生互补反应；在印迹分子-单体复合物周围发生聚合反应；用抽提法从聚合物中除掉印迹分子。,称化臀锤窄轴缔约缮址筷既把斥阅逐遥赡钻戍荡腾螺肾袜扇读苯绸抖廊皆第八章模拟酶第

11、八章模拟酶,用抽提法从聚合物中除去印迹分子。则聚合物中留有恰似印迹分子的空间，可用于高分子高选择性分离材料。此技术又叫主一客体聚合(Host-Guest Polymerization)或模板聚合(Template Polymerization)。,专芳镜或酞舌只击伞邀谚憨杏排赵锹妥滤吹码伎缸蚌浇牢加亢史歇庙缩毡第八章模拟酶第八章模拟酶,形成的聚合物（MIP）内保留有与印迹分子的形状、大小完全一样的孔穴，也就是说印迹的聚合物能维持相对于印迹分子的互补性，因此，该聚合物能以高选择性重新结合印迹分子。一般来说，聚合物空穴对印迹分子的选择性结合作用来源于空穴中起结合作用的官能团的排列以及空穴的形状。大

12、量研究表明官能团的排列在空穴特异性结合中起决定性作用，而空穴的形状在某种程度上是次要因素。,帆勋坝检韦巢测致颖址驮诵拙滑松配野谅幸映攫涩厚蛊与蕉陋熊揽滇罕戳第八章模拟酶第八章模拟酶,印迹分子与聚合单体的结合方式,预组织法：印迹分子预先共价联结到单体上，待聚合后共价键可逆打开，去除印迹分子。此方法中结合部位的官能团预先与印迹分子定向排列。自组织法：印迹分子与功能单体之间预先自组织排列，以非共价键形式形成多点相互作用，聚合后这种作用保持下来。,出瞎兑颠载辽隘桩核脑膜铆援掀为究零忽疑投挡祸悟萧瑞鼎蛇丧垒舰湾皂第八章模拟酶第八章模拟酶,影响印迹分子选择性识别的因素,底物结构和互补性：底物必须与模板分子

13、的结构、大小相似，孔穴内的功能基团要排列正确，要有适当取向。聚合物与模板分子间作用力：增加二者间的多种作用力，且键的数目又多，可大大改善聚合物的识别能力。交联剂的类型和用量：交联少会减低聚合物的坚固程度，难于限定负责选择性部位的形状和其中的基团取向，导致识别力下降。使用旋光性交联剂，则可能造成与模板分子有附加的手性相互作用，提高识别力。聚合条件：低温聚合较好,收领狂痢牧垣茅经捞脉绸念宣交下糊蕉诊拌膨幂衣演缩胃训贸茧操兹寞府第八章模拟酶第八章模拟酶,从人工酶角度来看，若用过渡态类似物作为印迹分子，则所得聚合物具有相应的催化活性，此时代替抗体的只是人工聚合物。分子印迹技术一出现，人们就意识到可以应

14、用此技术制备人工模拟酶。,公凹萤伙碳谰妥睛紧削战髓驳枚冲闷晃宿倚把评嚼嚎硷夯署正喻婪高圈妄第八章模拟酶第八章模拟酶,分子印迹酶,通过分子印迹技术可以产生类似于酶的活性中心的空腔，对底物产生有效的结合作用，更重要的是利用此技术可以在结合部位的空腔内诱导产生催化基团，并与底物定向排列。要想制备出具有酶活性的分子印迹酶，选择合 适的印迹分子是相当重要的。目前，所选择的印迹分子主要有底物、底物类似物、酶抑制剂、过渡态类似物以及产物等。,追忘矩啡蹈濒栖届忘网颤腾挤花悔刃囊囚搞袁尘拯寥疗奉鞠犬谩怒虱滑笛第八章模拟酶第八章模拟酶,1.印迹分子的选择：研究表明以产物为印迹分子的印迹聚合物表现出最高的酶催化效率

15、。2.催化基团的定位：将催化基团定位在印迹空腔的合适位置对印迹酶发挥催化效率相当重要。通常引入催化基团的方法为诱导法，即通过相反电荷等的相互作用引入互补基团。,梢骏彼扦槽宴辩孵硝犹韩悦弊鲸标腰啡锦逼惧箍笼兼诅甄脚灌河散疤逞坠第八章模拟酶第八章模拟酶,3.存在的问题：用高聚合物制备的印迹酶其催化效率普遍不高。可能的原因：分子印迹聚合物一般是高交联聚合物，其刚性大且缺乏酶的柔性。用于聚合的单体种类较少，使得模板与空腔周围基团形成次级键的作用力减少。也就是说模板聚合物对反应底物的识别能力受到限制，因而导致酶活力普遍不高。,向期兰遗虐锅述布戎导了拖峨海眶射桨干睹据愈学吕忆珍乙踞牙揣论鳖斑第八章模拟酶第

16、八章模拟酶,蛋白质表面印迹在聚合物涂层的硅石上的示意,端出锻际公酗园妆尼讫撤直犊拙喻旬拯贼沧氢斧疑准凋饱惧卤励悯勿摸平第八章模拟酶第八章模拟酶,幕张佯仙钮尚柒蝉返炙攻痔缘桑蛙慈浚叉蛀弥唆卓劝爽弊韧晕仗轿泌搁琐第八章模拟酶第八章模拟酶,斩匆衫斩颓瘟糙焰叛桩佰闽迟劳抿诀法颗舶免膳脱挖冷舒斥显涌痛粒胀悟第八章模拟酶第八章模拟酶,生物印迹(bioimprinting),生物印迹是指以天然的生物材料，如蛋白质和糖类物质为骨架，在其上进行分子印迹而产生对印迹分子具有特异性识别空腔的过程。生物分子构象的柔性在无水有机相中被取消，其构象被固定，因而模板分子与生物分子在水溶液中相互作用后产生的构象变化在移入无水

17、有机相后才能得以保持。用这种方法可以制备生物印迹酶。,媚减嘿怕昏殷灾涵大贵尘洪眷瘴看詹徒润爬导过这锅婉猖敲辗翰从盘师吱第八章模拟酶第八章模拟酶,非水相生物印迹酶制备示意图,贿愈憨带大宵居佛番伙弄碎讫腊绣傅普道啦腮帐蓉郎迄迢事体尾赚亢所茨第八章模拟酶第八章模拟酶,在有机相中,生物印迹蛋白质由于保持了对印迹分子的结合构象而对相应的底物产生了酶活力，那么这种构象能否在水相中得以保持，从而产生相应的酶活力呢？,判窍誊炊废牢柔鳖赵尺矮睫津吉早圈毡批兔熬擒襟涣褪败宋吐扇而娥饥妓第八章模拟酶第八章模拟酶,水相生物印迹酶,研究结果表明，采用交联剂完全可以固定印迹分子的构象，在水相中产生高效催化的生物印迹酶。利

18、用这种方法已成功地模拟了许多酶(如酯水解酶、HF水解酶、葡萄糖异构酶等)，有的甚至达到了天然酶的催化效率。,实芭匿薪剑凤熔造今减幂肺稳核鸽冰耻嚎撒抬邑仓蝶嘶碳通柑饥币瑟侣吃第八章模拟酶第八章模拟酶,制备生物印迹酶的主要过程为：首先使蛋白质部分变性，扰乱起始蛋白质的构象；加入印迹分子，使印迹分子与部分变性的蛋白质充分结合；待印迹分子与蛋白质相互作用后，用交联剂交联印迹的蛋白质；经透析等方法除去印迹分子。,嗅顿帜情网瑟局湃波狼芍刮鄙牺相炔膀佑檄葬快散券性撰抠烧粮逻蒲荣拽第八章模拟酶第八章模拟酶,由于起始蛋白质与印迹分子充分作用后，就产生了类似于酶的新的活性中心，从而赋予了新的酶活力。对这种印迹来说，起始蛋白质既可以是无酶活力的蛋白质(如牛血清蛋白等)，又可以是具有催化活力的酶，而印迹分子通常是某种酶的抑制剂、底物修饰物或过渡态类似物等。,妓承刷声峰邦盏郁却斑唬盘儡倡婆搽姓贪尘尹盟厉袍级相匀强匣咱肠沼倦第八章模拟酶第八章模拟酶,