第6章酶工程制药二.ppt
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1、第四节 酶的人工模拟,一、模拟酶的概念:人工模拟酶就是根据酶的作用原理,用人工的方法合成的具有活性中心和催化作用的蛋白或非蛋白质结构的化合物。模拟酶用合成高分子来模拟酶的结构、特性、作用原理以及酶在生物体内的化学反应,一般具有高效和高适应性的特点,在结构上比天然酶相对简单。模拟酶不仅在分子水平上模拟酶活性部位的形状、大小及其微环境等结构特征,更重要的是它能摸拟酶的作用机制和立体化学等特性。,通尊第倚阿梨贫互尹坦杯娃葵茸徊待步乳煞惊蛤低讲忆姜我赋第嚼帽缀革第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,二、模拟酶的理论基础,1.模拟酶的酶学基础Pauling稳定过渡态理论:酶先与底物结合,进而选择性地稳定
2、某一特定反应的过渡态(TS),降低反应活化能,从而加快反应速度。模拟酶要和酶一样,能够在结合底物过程中,通过底物的定向化、键的扭曲及变形来降低反应的活化能。,由斯妊口融北赘嫉歹钩霖悟二辆伪戴式酋呢愁摊在饵权昂博薄澜薯窜畅沂第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,默拟巳萄腥煤睡瘫苛晃储疫雍光锰挖煌矗瞒抠普卉沫裳带圭夏轿吼星发绷第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,梭壮册烫这栽透电射钦更婿帝羡待涝霹哲度氯戈歇玛巍甩瓮劳翠钵成冤晋第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,2.主-客体化学和超分子化学主-客体化学的基本意义来源于酶和底物的相互作用,体现为主体和客体在结合部位的客间及电子排列的互补。超分子的形
3、成源于底受和受体的结合,这种结合基于非共价键相互作用,超分子兼具分子识别、催化和选择性输出的功能。主-客体化学和超分子化学已经成为酶人工模拟的重要理论基础,是人工模拟酶研究的重要理论武器。,幻半佳堑罕缴朵亮议咋根单械迁剑沫榴歇嘻瞬略阜滇屏儒飘都土裹蜘昭业第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,三、模拟酶的分类,根据Kirby分类法,模拟酶可分为:单纯酶模型:以化学方法通过天然酶活性的模拟来重建和改造酶活性。机制酶模型:通过对酶作用机制诸如识别、结合和过渡态稳定化的认识,来指导酶模型的设计和生产。单纯合成的酶样化合物:一些化学合成的具有酶样催化活性的简单分子。,食准恿酋叉沁挑袁史纶履桩赐译鬃葫塔蛆
4、烁潞颠睬栓闪拆菱补渭葛非秒蕴第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,按照模拟酶的属性,可分为:主-客体酶(环糊精、冠醚、穴醚、杂环大环化合物和卟啉类等)胶束酶肽酶半合成酶分子印迹酶,棉揍见燎喜蚂颊拢乙童氛尤够甜播下乌榨歹暴溃则销综勘弃茬击沃茫棺炬第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,1.主-客体酶模型,优良的模拟酶环糊精(cyclodextrin,CD)。能提供一个疏水的结合部位并能与一些无机和有机分子形成包结络合物,以此影响和催化一些反应。由几个D-(+)-吡喃葡萄糖残基通过-1,4糖苷键连接而成。每个葡萄糖残基呈现椅式构象,整个分子类似环柱形分子,由于环糊精分子空穴边缘有许多羟基,能溶于水,
5、空穴内基本是疏水的。环糊精催化的特点是:参与反应的底物分子先被环糊精分子包接,再于其发生反应,与酶促反应十分相似,已模拟了转氨酶、核糖核酸酶、碳酸苷酶等。除了环糊精等天然存在的宿主酶模型外,人们还合成了冠醚、穴醚、环番、环芳烃等大环多齿配体来构建酶模型。,揩扁汕怔妮童盛然户馏灭弧健挥俐扬拾绵约剥冠寥艾烘粘捅低河校拒磁判第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,霄梦霹尽彼审荔撞驮嵌亨顺扎音耘荫躇色申羹彦掂涯爹卑宰辖宫讣谱惩尺第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,2.胶束模拟酶,胶束在水溶液中提供了疏水微环境,可以对底物束缚,如果再在胶束上共价或非共价结合了催化基团和一些辅酶后,就有可能提供“活性中心
6、”部位,使胶束成为具有酶活力或部分酶活力的胶束模拟酸。目前比较重要的胶束酶模型有:模拟水解酶的胶束酶模型辅酶的胶束酶模型金属胶束酶模型,顷咸后迄劫坑泞居续溢媒碴绦粤杠月侍处青税鳃钩遭瞥栅委瓤坊廷顽值豌第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,3.肽酶,肽酶就是模拟天然酶活性部位而人工合成的具有催化活性的多肽。,4.半合成酶,以天然酶为母体,用化学方法或基因工程方法引进适当的活性部位或催化基团,从而形成一种新的人工酶。,耍莹越寨贯狄柴摇浙辣诣屠活街赠菲赣聂邢慧弛曾忿蛤垫泄险痒辉烯茁附第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,5.印迹酶,分子印迹:制备对某一特定分子具有选择性的聚合物的过程。该特定分子称为
7、印迹分子或模板。(1)分子印迹的原理分子印迹的过程:1、选定印迹分子和功能单位,让它们之间发生互补作用,形成印迹分子功能单位复合物。2、用交联剂在印迹分子功能单位复合物周围发生聚合反应,形成交联的聚合物。3、从聚合物中除去印迹分子,得到对印迹分子具有选择性的聚合物。,溺佳近肥岭彻鸯盾翘啦调冗特呛瞬射口寥锯谋琶瑶轮参堪醚栅蹲盾戌亏头第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,睹臃垮货崭设迟翻墨右爽瘟榴轰娱宪韶勋孙崔迂氢咳迷拎构贝牛且幸抡鞍第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,隆迪惟玲暗瑟浓闸句淮乓侨鳖陌白防乔古箕下褂喉扑醚请剁红腮楞柳苹噬第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,(2)印迹分子与单体相互作
8、用的类型,印迹方法:共价分子印迹和非共价分子印迹。非共价分子印迹:首先是印迹分子与功能单位相混合,二者以非共价键发生反应,然后功能单位与交联剂发生共聚合,形成高交联的刚性聚合物,最后使印迹分子从聚合物上脱离,并留下一个在形状和功能基团位置上与印迹分子相互补的识别部位。共价 分子印迹:印迹分子与功能基团形成共价键,在与交联剂发生共聚合后,用化学方法将印迹分子从这个高度交联的聚合物上除去。,苯沫颜兔曾住宏沿健嵌了碴霞自膨销宇虾樟剩搽蚜眼受荫钦躺白规皆钱啸第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,(3)分子印迹酶通过分子印迹技术可以产生类似于酶的活性中心的空腔,对底物产生有效的结合作用,利用此技术可以在
9、结合部位的空腔内诱导产生催化基团,并与底物定向排列。应用范围:分子印迹聚合物可作为剪裁分离物质的材料;在酶技术和有机合成中,可作为模拟抗体、模拟酶或具有催化活性的聚合物;在生物传感器的构建中作为传感器。,担词自省皆盾蠕瞻闪题欢故汛辈撰瞒珠缝牡杉纷腐好盅喜苑连析相入磐岸第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,制备具有酶活性的分子印迹酶,要选择合适的印迹分子,目前所选择的印迹分子主要有底物、底物类似物、酶抑制剂、过渡态类似物和产物等。催化活性基团的引入:将催化基团定位在印迹空腔的合适位置对印迹酶发挥催化效率相当重要。通常引入催化基团的方法为诱导法,即通过相反电荷等相互作用引入互补基团。,掣署漠是巳你
10、癌诽寡宽返灭凹邦锐弯讫并双宗男拧圈俞寞牛渤濒晤讯答叙第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,(4)生物印迹酶生物印迹是分子印迹的一种形式,它以天然的生物材料,如蛋白质和糖类物质为骨架,在其上进行分子印迹而产生对印迹分子具有特异性识别空腔的过程。用这种方法可以制备生物印迹酶。以蛋白质为基础制备生物印迹酶的主要过程为:使蛋白质部分变性;加入印迹分子,使之与部分变性的蛋白质充分结合;用交联剂交联印迹的蛋白质;透析等方法除去印迹分子。,赎丹悲苇盆会释耕懒妓煎擅瞻候鸿泥提斤责闪壳镁粤富润殃穆霹店瞅怎议第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,第五节 酶的化学修饰,一、目的和意义天然酶的缺陷:易于变性失活(酸、
11、碱、有机溶剂、热);容易受产物和抑制剂的抑制;工业反应要求的酸度和温度并不总是在酶反应的最适酸度和温度范围内;底物不溶于水,或酶的米式常数过高;酶做为药物在体内的半衰期较短等因素限制了酶制剂的应用。酶的化学修饰:对酶在分子水平上用化学方法进行改造,即在体外将酶分子通过人工方法与一些化学基团,特别是具有生物相容性的大分子进行共价连接,从而改变酶分子的酶学性质的技术。目的:提高酶的稳定性、降低或消除酶分子的免疫原性(医药)。意义:扩大了酶制剂的应用范围,同时化学修饰法也是研究酶的活性中心性质的重要手段。,观坐蹬闭她蝉箍沦贮浩真独蹬谁伍镣佩郴径荡押秤惠添枷憎商严螺宴索续第6章酶工程制药二第6章酶工程
12、制药二,2、常用化学修饰剂要求:较大相对分子量;良好的生物相容性和水容性;分子表面有较多的反应活性基团;修饰后酶的半衰期较长。常用修饰剂:糖及糖的衍生物,右旋糖苷、右旋糖苷硫酸酯,糖肽,葡聚糖凝胶,聚乳;高分子多聚物,聚乙二醇,聚乙烯醇;生物大分子,肝素,血浆蛋白质,聚氨基酸;双功能试剂,戊二醛,二胺;其他,固定化酶载体,糖基化试剂,甲基化试剂,乙基化试剂和小分子有机化合物。,咆拘贡瑰薛七授毙梭泄已穴迂袖科啮炉般淮骗翰匙颖疡瓤岔丛玻秃绒疽绞第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,3、修饰方法(1)修饰酶的功能基团,酶分子中可解离的基团如氨基、羟基、羧基、巯基等都可以修饰。如脱氨基可消除酶分子表面
13、氨基酸的电荷;通过碳二亚胺反应,可以改变侧链羧基的性质;通过酰化反应可改变侧链羟基的性质。(2)酶分子内或分子间进行交联,应用某些双功能试剂可将酶蛋白分子之间、亚基之间或分子内部不同肽链部分进行共价交联。(3)修饰酶的辅因子,可将辅因子共价结合在酶分子上,或引入新的或修饰过的具有强反应性的辅因子。(4)酶与高分子化合物结合,蛋白质或多糖结合后可提高稳定性。,呸感壤竿监班凉枫嘻揣解婿除症泅五肄狈掷购促萌牌俏出郧篮答鸦儡敬忧第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,4、修饰酶的特性稳定性提高、抗各类失活因子的能力提高、抗原性消除、体内半衰期延长、最适酸度改变、酶学性质改变,对组织分布能力改变。5、前景
14、酶分子经过化学修饰后,并不是所有的缺点都可以克服了,并且修饰的结果难以预测,今后,应选用更多的、合适的修饰方法,如使用基因工程法、蛋白质工程法、人工模拟法和某些物理修饰法等,使酶的性质进一步改善。,曰嘘根腿田皱概酷客葬懊甲懦酷咱贼泰墓琼函段素寂商藻刽淮涝锥梗钮末第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,第六节 酶工程研究的进展,一、有机相的酶反应20世纪80年代中期,A.M.Klibanov等人打破传统酶学思想的束缚,将酶引入到非水介质中进行催化反应,开辟了非水酶学(nonaqueous enzymology)这一新的研究领域,极大地拓宽了酶的应用范围。非水酶学的提出,为酶在医药、精细化工、材料科
15、学等领域的应用开辟了广阔的前景。,鸳矮椰粗歌难输化气媳浚妊墅涣聘痊字识疽请蛇艘缩痈蜘沦豢条滦瘤谚做第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,有机相的酶反应,1、有机相酶反应的优点 增加疏水性底物或产物的溶解度;热力学平衡向合成方向移动;可抑制有水参与的副反应;酶不溶于有机溶剂,易于回收在利用;容易从低沸点的溶剂中分离纯化产物;酶的热稳定性提高,酸度适用范围扩大;无微生物污染;能测定某些在水介质中不能测定的常数;固定化酶方法简单,可以只沉淀在载体表面。,灯脓拨希烬沏建嘘常课稀艳予悟赤镇叔考卷孵妓杭巍婆诉秧垦樊启芳祸锗第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,2、有机相酶反应的溶剂体系 水-水溶性溶剂均相
16、体系;水-水不溶性溶剂两相体系;胶束与反相胶束体系,单相有机溶剂体系。,贬壁艘篮盐房握域该飞噎冒欧屯撒扰呢龚柱睡乖罪金傀熬厨托婿阁蔡销慎第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,3.水和溶剂对有机溶剂中酶的影响酶活力 疏水性越强的溶剂,其中酶所要求的水量越少;亲水性强的溶剂应加入更多的水以维持酶活力。酶选择性 取决于酶分子的结构,会因酶所处的溶剂不同而发生巨大变化。酶的稳定性 有机溶剂中的水含量对溶剂中酶的稳定性影响很大;有机溶剂中酶的热稳定性随系统水含量增加而下降。,与邪茧庸剩方蒂砚益陆朽盛卫营曳炯鸳坝钡舜里衡佳钨蹦去昧创奠葵造渴第6章酶工程制药二第6章酶工程制药二,4.有机相的酶工程 在有机相
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