3蛋白质分析.ppt
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1、1,第三章 蛋白质分析,硫魔蔓屯枚啊阴肠辊笼昌旅跨脾串斯耐勘善虐芽诲亚伤舒契管菜蜡虽垮苛3蛋白质分析3蛋白质分析,2,蛋白质是指主要由-氨基酸组成的一类高分子化合物,其数目数以千计。有时需要对蛋白质的总量进行测定,但有时又需要确定蛋白质混合物中的一种,因而测定其总量的方法便不适用。所以,蛋白质测定方法或者是针对所有蛋白质的,或者是针对其中个别蛋白质的。特异性的方法或者是依赖于分析样品的制备步骤,或者是依赖于待测蛋白质的某些特殊的性质。,歧哪孽鲤净剁隋狞船矫顷绑砾挝添溪怔订怨臻笺披驴吾慑群竣伍哇种爹翟3蛋白质分析3蛋白质分析,3,对于具有生物功能的蛋白质的定量(如激素),由于蛋白质变性的存在、总
2、量的测定有时并不能真正地反映其生物活性。对这类蛋白质的定量可选择化学定量法或生物分析法。对于酶,通常是测定其活性,而不是测定其蛋白质的含量。在蛋白质分析化学中,除了定量分析之外,还有许多分析问题涉及蛋白质的构型或不同层次的结构研究,蛋白质氨基酸序列的测定等。,挚镶礼备掇呈蛀常募绑棋嘴芬恢抖蹄酗甘谊撬章浪讲逛剪猾迎捶晋悯铺带3蛋白质分析3蛋白质分析,4,由于蛋白质种类繁多、结构复杂、生物活性各异,一种蛋白质并非单一基因所表达的产物,并且同一蛋白质还存在多种翻译后的修饰,蛋白质分析正处于发展阶段。蛋白质分析必须满足以下基本要求:()高效提取并分离所有蛋白质组分,()准确鉴别和定量分析每一组分,()
3、能比较分析表达图谱的复杂变化,其中蛋白质所有组分的完全分离是蛋白质组研究的前提。,颂疹霸脸秦排沸碾簿码丑喝么枯朔次称慑转霄才邻稼处鳞硕线造芬届惦睦3蛋白质分析3蛋白质分析,5,3.1.蛋白质的分类及结构,蛋白质的基本组成单位氨基酸的结构 虽然在各种生物体中发现的氨基酸有180多种但组成蛋白质的常见氨基酸只有20种,且除了脯氨酸和羟基脯氨酸为-亚氨基构型外,其余均为-氨基构型。非蛋白质氨基酸中的氨基均不在氨基的位。除了甘氨酸之外,其余氨基酸的-C原子都连接有四个不同的取代基,因而-C是具有手性的,即每种氨基酸都存在两种互为影像的对映异构体,分别用D或L来标识。尽管在自然界中也存在R构型的氨基酸,
4、但组成蛋白质的氨基酸却都是L-构型的。,氓墟粕拆吨搀功括阀尹秆贴钙净荒赡掐氯蘑党书稠烛培隔卡嘲烬津暖查烹3蛋白质分析3蛋白质分析,6,组成蛋白质的氨基酸的简写及等电点pI,锗挤驱瓢者忌栗拙裔睬籽黄饰侈谬掉讣一萍撤嫉等仰粕映慌坍吓况仟遇所3蛋白质分析3蛋白质分析,7,湃脯扁现穷酬荔歧者位随法猛榆听角懦尤松坎厘萧并淄撅抖灯红巩稍挟亿3蛋白质分析3蛋白质分析,8,3.2.多肽的结构 氨基酸之间通过各自的氨基或羧基缩合,以酰胺键(即肽键)形成的氨基酸聚合物片段称之为多肽(Polypeptide)。多肽键的形成使氨基酸失去了氨基和羧基,分子的保留部分(残基)是蛋白质结构中的主要组分。但氨基酸在多肽链的每
5、一端或者保留一个氨基(N-末端残基)。或者保留一个羧基(C-末端残基)。在蛋白质或多肽序列中规定N-末端残基的编号为1。,眠钩碍蚕鹤尹占拔门或蝎寒炸吩叙亢也榔想亩相种呕寅诞睬隐忻扩瑚中巳3蛋白质分析3蛋白质分析,9,由6-30个氨基酸通过肽键形成的寡聚物称之为多肽,但氨基酸残基数达到40或更多(分子量5000以上)时,这种肽便具有蛋白质的性质。当然,在分子量方面,多肽和蛋白质并没有严格的界线。一般认为,多肽与蛋白质的根本区别在于蛋白质一般含有螺旋结构以稳定蛋白质的总构型;而多肽一般却没有这种结构,其构型有很大的可变性和可塑性。,坟磋盂蒜鹰抄碘冗苟擂淆荔郡邹抛缓滓岿珐残旅念赃搞秘虽长纱范筐伞督3
6、蛋白质分析3蛋白质分析,10,3.3.蛋白质的分类 蛋白质由一条或多条多肽链组成,它在空间具有特定的走向与排布。生物界的蛋白质数目估计在10101012数量级。如此众多的种类是由于20种氨基酸在肽链中的不同序列决定的这种序列异构现象是蛋白质生物功能的多样性及种属特异性的基础。按蛋白质化学组成的不同,将其分为简单蛋白和结合蛋白两大类。,雾敦监铆饿盖伦咒鸦跟诱氟员晰檀铀复博嫩快粗票讯唾哼傲洗来沙谁砸历3蛋白质分析3蛋白质分析,11,简单蛋白完全由肽链组成,它又可分为7类。,(1)白蛋白(Albumins);又称清蛋白,易溶于水、稀酸和稀碱溶液中,分布于血液、肌肉、蛋清及植物种子中。(2)球蛋白(G
7、lobulins):又分为优球蛋白和拟球蛋白,前者不浴于水,后者溶于水。球蛋白存在于各种生物体中。(3)组蛋白(Histones):溶于水及稀酸。分子中含精氨酸和赖氨酸较多,如小牛胸腺蛋白等。(4)精蛋白(Protamines):溶于水及稀酸,多存在于精子之中,如鱼精蛋白等。(5)谷蛋白(Glutelins):不溶于水及稀盐溶液,存在于植物种子中如米谷蛋白,麦谷蛋白等。(6)醇溶谷蛋白(Prolamincs):不溶于水及乙醇溶于70一80的乙醇溶液中,存在于禾本科植物种子中,如小麦醇溶蛋白,玉米酵溶蛋白等。(7)硬蛋白(Scleroproteins):又分为角蛋白、胶原蛋白及丝心蛋白、均不溶于
8、水、稀酸和稀碱中。,辫父捏复尤芽阿滇怜苔酚省像戮展幼蒂掸毕衬马旅惊岗猖涕新蜗吵逻吏痕3蛋白质分析3蛋白质分析,12,结合蛋白由简单蛋白质和非蛋白质成分组成。按照非蛋白质的不同又可分为下述7类。,(1)糖蛋白(Glycoproteins):与糖类共价结合的蛋白质,种类繁多,如血型糖蛋白,粘液糖蛋白和激素糖蛋白等。(2)核蛋白(Nucleoproteins):与核酸结合的蛋白质。如DNA核蛋白、核糖体等,(3)脂蛋白(Lipoproteins):与脂类以次级键结合的蛋白质。脂类成分包括磷脂、胆固醇、中性脂等。(4)磷蛋白(Phosphoproteins):与磷酸共价结合的蛋白质,主要存在于蛋黄和乳
9、中。(5)金属蛋白(Metalloproteins):与金属离子直接结合的蛋白质,如铁蛋白,含铜和锌的超氧化物歧化酶等。(6)血红素蛋白(Hemoproteins):与血红素结合的蛋白质,如血红蛋白,肌红蛋白。(7)黄素蛋白(Flavoproteins):与黄素核苷酸结合的蛋白质,如黄素氧化蛋白。,藕肚姚戍部悄辰赦署国篇坞艳钻比肿棚些噪廷借滔闻离砰罢煽采呐谴筹赞3蛋白质分析3蛋白质分析,13,蛋白质的分子量范围变化较大,大约在61031106之间。对于不含辅基的简单蛋白质分子,每个分子中所含氨基酸残基的数目可通过用110除以分子量进行粗略的估计。组成蛋白质的20种氨基酸的平均分子量为138,但
10、在大多数蛋白质中较小的氨基酸占优势。因此,其平均分子量接近128。又因每形成一个肽键要失去一分子的水,一般蛋白质中氨基酸残基的平均分子量约为110。,劲逊抡务炊褥篮笆共缓榔盏吓怯赣障谣寸瓢件桩氯坦狈井瞩跑裹弛漏址烧3蛋白质分析3蛋白质分析,14,蛋白质的性质及功能取决于其结构。深入了解蛋白质的结构对于生物化学及分析化学家来说都是非常重要的。蛋白质的结构具有不同的层次,一般分为一级、二级、三级和四级结构一些蛋白质不具有四级结构,如肌红蛋白、溶菌酶、细胞色素c和羧肽酶A等,有些较大的蛋白质具有四级结构,如血红蛋白和乳酸脱氢酶等。,3.4.蛋白质的结构,滑章岛莹壹汗找囊玖法皮斩携竖谭拌孽底监川乎惫君
11、闭躇蛙舱追朵琵萨聚3蛋白质分析3蛋白质分析,15,蛋白质的一级结构是指肽链中氨基酸的序列以及二硫桥的位置。,人胰岛素的一级结构,貉韦盔膏供朽扳翌传诣呐贴泽蕾但美那嘴哈栋庭葵涂刮忆蚁弛呆徐笛刨怒3蛋白质分析3蛋白质分析,16,蛋白质的二级结构 一条多肽链或链的一部分依靠氢键维持的局部有规则的构型称之为二级结构。,蛋白质的三级结构 蛋白质的三级结构定义为它的总体结构。,蛋白质的四级结构 蛋白质的四级结构是指寡聚蛋白质中不同种类和数目的亚基在空间的排布及亚基之间的相互作用。,恐制妄崖侯倒咎妨韵摧枢衙疑应敲倍猩值涉视运旨命剥砌瓣找逛特啪抽昔3蛋白质分析3蛋白质分析,17,球蛋白的三级结构(a)和胶原蛋
12、白的三级结构(b),任地挞乾蔗八足缸渗吻裹忽哗鄙逸僧墓焦忿勿电婆沁应日淤循虞狗稼职杭3蛋白质分析3蛋白质分析,18,蛋白质的四级结构示意图,搀斟砾傈饿幌莉价更呀韦荒库冰警饮霉戒贪兽饿柳雅该葬俐晋牛侵俱蕴取3蛋白质分析3蛋白质分析,19,蛋白质的变性可以描述为:天然蛋白质分子在外界因素的作用下,由紧密有序的结构变成松散无序的结构,并使得蛋白质的物理、化学性质及生物活性发生变化的现象。变性只涉及次级键,二硫键的断裂一般不涉及一级结构的变化。蛋白质变性之后,其物理性质(如溶解度,旋光性,吸收光谱),化学性质(如水解速度,化学反应能力)以及生物功能(如酶的催化活性,激素的生理调节功能,抗原抗体反应的专
13、一性等等)都会发生变化。因此,蛋白质变性对蛋白质分析来说是一个非常重要的、经常要考虑到的问题。,本鞍刨预及恶敲毗眠班腕稍徒弹喧外皇右喀丫夏拾相链甭垢龙喊怂炼络姑3蛋白质分析3蛋白质分析,20,能使蛋白质变性的因素很多,其中比较重要的包括以下几种:,热变性 由于加热而引起的蛋白质变性称之为热变性。一般的蛋白质在5060以上便会发生热变性。,酸和碱变性 蛋白质一般在pH 410范围内稳定,超过这个范围就会发生变性。,尿素和盐酸胍变性 这两种试剂是常用的蛋白质变性剂。,表面活性剂变性 表面活性剂SDS很容易与蛋白质结合,并使蛋白质发生变性,与脲和胍不同的是,浓度很低的SDS就可以使蛋白质变性。,了飘
14、谩热砚用柑庭吟此滔估峰养荣窑到屠醇停雾犁蝉斩膛驹申声阜昼多戏3蛋白质分析3蛋白质分析,21,3.5.蛋白质分析的意义,一、基础科学研究 这主要是生命科学研究向分析学家提出的课题。在生命科学研究中,人们需要了解各种蛋白质的组成、结构与功能的关系,蛋白质的存在形态及与小分子,甚至金属离子的相互作用等等。而对分析化学家来说,蛋白质分析是一个难题,因为蛋白质分子量大(分子量一般为60001000000),结构复杂(有四级结构)和种类繁多(约有10101012种)等特点。这些持点决定了蛋白质分析与小分子为对象的分析区别甚大。因此,分析化学家要不断地针对蛋白质的特点去发展新的理论,创造新的实验手段和分析方
15、法。,疡个糖兆珐缩蚕汉羡苟菇缆熟凋烬药氨源摔募玛居崇忆肘钟琳仔榴忽户捍3蛋白质分析3蛋白质分析,22,二、食品的鉴定与评价 蛋白质是生物体的重要营养物质,也是食品的重要营养指标。人及动物只能从食品中得到蛋白质及其分解产物来合成自身的蛋白质。蛋白质可以被酶、酸或碱水解,水解的最终产物是氨基酸。氨基酸可以进入蛋白质的代谢库重新被利用。氨基酸是构成蛋白质的基本物质。在构成蛋白质的氨基酸中,亮氨酸、异亮氨酸、赖氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸、苏氨酸、色氨酸及缬氨酸这8种称为必需氨基酸,它们在人体中不能合成,必须依靠食物供给,它们对人体有着非常重要的作用。各种食品中的蛋白质含量差异甚大。如牛肉中蛋白质的含量为2
16、0%左右,猪肉为9.5%,牛乳为3.5%,大豆为48%,大米为8.5%,菠菜为2.4%,黄瓜为1.0%,桃为0.8%,苹果为0.4%。因此,测定食品中蛋白质的含量对指导食品的加工工艺的改革、优化保健食品的配方以及合理配膳均有重要意义。,纲吁铅擎带咸烛忽涨榆袄商访晤县芭女枷饮钓炊裂弦亲橇煮钝肤秩檀婚盅3蛋白质分析3蛋白质分析,23,三、评价健康状况、诊断疾病 人体内的酸碱平衡,电解质平衡,遗传信息的传递,物质的代谢和运转都与蛋白质有关。蛋白质不仅是血浆的主要成分,而且也分布于各种细胞的外液,关节滑液,脑脊液等等。,耘枕崎秉糊烹袁蔬喜故森个质攀壶壤忽绕情邦件炔称纂韦阔叛雨钉耀官汤3蛋白质分析3蛋白
17、质分析,24,血浆蛋白质的成分复杂,多达三百余种,许多种蛋白质的含量随疾病的不同有所增减,在临床诊断上具有重要意义。,境摹暮常镀弟膜姓骡硕南翔邦乖增倾换恤狱嘉掌之竟含讣试晕洋犁走痹锤3蛋白质分析3蛋白质分析,25,总蛋白升高,可考虑各种失水导致血液浓缩的疾病,多发性骨髓瘤,巨球蛋白血症等等。血清总蛋白降低,可能是体内水分过多,多渠道血清蛋白丢失,如肾病综合症,营养不良,蛋白质合成障碍等。球蛋白升高:多见于多发性骨髓瘤及某些淋巴瘤、肝硬化、血吸虫病、疟疾等等。球蛋白降低:可考虑低丙球蛋白血症和肾上腺皮质功能亢进等。,轩麻泄逼郎页歌夯耀窃狮抄腰址油胯蕾啥舌娩声褥螺慢猿旗片棋牙灶混镍3蛋白质分析3蛋
18、白质分析,26,3.6.蛋白质定量分析方法,在生物研究、以及医药和食品等行业和临床诊断领域中,蛋白质的定量分析是常检项目和重要指标。,猩痉锅宋看猾泡跨偏稼海想馒矛鬃疗烩践寓蛹劝垛镐借痉调赶诅芍辖抡瞄3蛋白质分析3蛋白质分析,27,蛋白质的测定方法很多,常用的方法可以分为三大类:一是基于蛋白质与一些物质的化学反应所建立的化学法;二是根据蛋白质的生化性质所建立的生物检定法和免疫法;三是依据蛋白质与不同试剂的反应和仪器测试技术所建立的仪器法。化学法操作较为简单,常用于微量蛋白质日常的快速分析;后两者通常配合高灵敏度的精密仪器,一般用于痕量或超痕量蛋白质的分析。,楼混议喧旁豌吝大忱甫捧巳灭盘锡魏萤蹈伎
19、忿墟谭盏疽浪晚扑现倔饥孤吩3蛋白质分析3蛋白质分析,28,蛋白质分析方法可分为两大类,一类是利用蛋白质的共性,如含氮,含肽键和折射率等性质测量蛋白质的含量;二是利用蛋白质中某些特定的氨基酸残基、芳香基团、酸性和碱性基团等测量蛋白质的含量。迄今,测定蛋白质的分析方法有多种多样,如克氏定氮法,金属络合物,染料做探针的各种分光光度法,荧光染料做探针的荧光分析法,化学发光分析法,气相色谱分析法,液相色谱法甚至发展了全自动的氨基酸分析仪。,昔叙剿言袱砖药擎蠕午乱冯桃焕肛薛势站游流孔滩悯赵抓随戌环蹋奠笛桔3蛋白质分析3蛋白质分析,29,迄今,测定蛋白质的分析方法有多种多样:克氏(凯氏)定氮法,金属络合物,
20、染料做探针的各种分光光度法,荧光染料做探针的荧光分析法,化学发光分析法,气相色谱分析法,液相色谱法甚至发展了全自动的氨基酸分析仪。,网沈涂唆忽壶撂痔途玩沪肥烤勒浮晨锣殊谅跃萤咽冬两总健箍燕筒律原史3蛋白质分析3蛋白质分析,30,1 光谱法 根据蛋白质自身的光谱性质,可以对蛋白质定性和定量分析的光谱方法有紫外光谱法、荧光光谱法、圆二色光谱法、激光拉曼光谱法、NMR及X射线衍射分析法等。其中大多数方法主要用在蛋白质结构研究方面,下面只对前两种可用于蛋白质定量分析的光谱方法进行简单的介绍。,幅撂逗熏伙爵旋豁晴颈营瑚炽闰杰误酣滓绿裤钢蔓壳冷途钙动酮诵臼庶陷3蛋白质分析3蛋白质分析,31,紫外光谱法 由
21、于蛋白质中存在芳香族氨基酸,一般的蛋白质在280 nm附近有一个最大吸收。根据此吸收可以对蛋白质进行定量分析。这种方法不是一 种绝对方法,因为不同蛋白质的氨基酸组成会不同,因而不同蛋白质的摩尔吸光系数不同。,参涉租江据掷杉裴货担撩泰锦饮锄哺享遇相獭支毖钙缕纵惰宴搞斡开夷逼3蛋白质分析3蛋白质分析,32,三种芳香族氨基酸及蛋白质的紫外吸收光谱(a)Trp,Tyr and Phe;(b)protein,倾彭扣咱翻猜即愈镣灼屑溃炔捣慧地鞭韵逸桌我氢笋空墒逝扣墙谎复逻秸3蛋白质分析3蛋白质分析,33,蛋白质易受核酸的污染,核酸在260nm附近有强的吸收。为了消除核酸对蛋白质测定的干扰,可分别测定样品在
22、260和280 nm处的吸光度值,然后利用两波长下的吸光度差计算蛋白质的浓度。蛋白质的浓度一般依据下列两个经验公式计算:,优点:操作简单缺点:干扰多,Lowry-Kalekar 公式:蛋白质浓度(mg/ml)=1.45A280-0.74A260Warburg-Chritian公式:蛋白质浓度(mg/ml)=1.55A280-0.76A260式中 A260和A280分别代表样品在260,280 nm处的吸光度,资歼黄畴密珊蹄界凶秋骤啡糙妨陵营罚潭配桓津澡捉秦诽吏逞确乎冗哥锯3蛋白质分析3蛋白质分析,34,与吸收光谱法相关的研究主要包括以下两方面:(1)导数法用于蛋白质的定性和定量分析,如蛋白质及
23、天然芳香氨基酸的鉴别;(2)蛋白质结构及构型的研究。当蛋白质的构型发生变化时,蛋白质生色基团所处的微环境发生变化,其吸收光谱随之发生变化,吸收峰将发生红移或蓝移。利用UV差谱可以获得蛋白质构型变化的信息,如利用溶剂微扰差谱可以探测蛋白质分子中生色基团的暴露程度。,陀赤蔼辅剂茅疑伶百饵傀编镣周蹿必拇笆棍迁箍清毖匡买哨桥艰那挂地肘3蛋白质分析3蛋白质分析,35,荧光光谱法 蛋白质的荧光来自于具有紫外吸收的三种氨基酸,即酪氨酸、色氨酸和苯丙氨酸。这三种氨基酸的最大荧光发射波长分别是303、348和282nm。当这三种氨基酸的浓度相同时,色氨酸的荧光强度最大,苯丙氨酸的荧光强度非常弱。因此,蛋白质的内
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