基因工程大实验报告 .docx
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1、编号:分类号:Q78本科生基因工程实验论文纳豆激酶基因表达载体的构建及在大肠杆菌中的表达指导教师:X X X学 生:X X专 业: 生物科学年 级:20092012年8月24日目录摘要2绪论3材料与方法41材料41.1试剂及仪器41.2菌种51.3质粒51.4常用溶液的配制52方法62.1引物的设计62.2 NK基因的PCR扩增72.3 DH5a和BL21(DE3)感受态的制备72.4 pMD19-T-NK的构建及转化和鉴定82.5 pET-trx、pET-NK、pUC-Nk 的酶切与回收92.6 pET- trx-NK的构建及转化和检测112.7 pET-trx-NK 的诱导表达122.8
2、pET-trx-NK 表达的 SDS-PAGE 检测13结果151. NK基因的PCR扩增152. pMD19-T-trx的构建与鉴定163. pET-trx、pET-NK、pUC-Nk 的酶切与回收164. pET-trx-NK的构建与检测185. pET-trx-NK的诱导表达与SDS-PAGE检测19讨论20参考文献21致谢21感想22纳豆激酶基因表达载体的构建及在大肠杆菌中的表达摘要纳豆激酶是一种枯草杆菌蛋白激酶。经研究发现纳豆激酶具有纤溶活性和溶栓能力, 可治疗和预防血栓病。此外,纳豆激酶还具有降低血液黏度、降血脂、降胆固醇,改善 血液循环状况,维持血细胞的正常形态和功能等作用。本文
3、主要介绍利用基因工程实验 技术操作纳豆激酶基因,将已经连接在PMD18-T载体上的纳豆激酶酶源基因用PCR扩增 出837bp的纳豆激酶的基因片段,与T载体连接后导入感受态的DH5 a菌中筛选鉴定。用 双酶切切下纳豆激酶的成熟基因片段,插入带有6个组氨酸标签的原核表达载体pET-trx, 导入BL(21)DE3感受态菌中诱导表达纳豆激酶蛋白质,用SDS-PAGE鉴定。关键词:纳豆激酶,基因表达,载体,大肠杆菌Constructing Expression Vector and Expressingnattokinase in E.coliABSTRACTNattokinase is a kind
4、 of subtilopeptidase. The study found that Nattokinase has activity of fibrinoltic which can treat and prevent thrombosis. In addition, Nattokinase can also lower blood viscosity, blood fat, cholesterol, improve blood circulation and maintain normal blood cells form and function and so on. Main of t
5、his article describe the gene engineering operation in nottokinase gene which has already connected with pMD-18-T vector amplified by PCR in which can get 837bp nattokinase gene fragments ,then linking with T vector that transform it into DH5a bacteria whiche wereened after identification. The matur
6、e peptide can be cutted by double-digested and insert with six histidine-tagged prokaryotic expression vector pET-trx. At last, induced the protein expression of nattokinase in the expression of E.coli BL (21) DE3. Eventually , identify that by SDS-PAGE.KEY WORDS: nattokinase, gene expression, vecto
7、r, E. coli绪论:纳豆激酶(nattokinase简称NK)是一种枯草杆菌蛋白激酶,是在纳豆发酵过程中由 纳豆枯草杆菌(Bacillus subtilisl natto)产生的一种具有强烈纤溶活性的碱性丝氨酸 蛋白酶1。纳豆激酶是食品纳豆中提取或纳豆菌发酵生产的分子量小的单链蛋白质。由于纳豆激酶具有纤溶作用强,作用迅速,药效时间长;来源于食品,安全性能好, 更易被人体消化吸收。可通过静脉与口服两种途径给药以及不引起出血的副作用等第一 代溶栓药物所不具备的优点,使其具有开发成新一代溶栓药的潜力。纳豆激酶于1987年由日本学者sumi在纳豆中发现。其成熟肽含有275个氨基酸, 分子量约为2
8、8ku,等电点为8.60.3。从纳豆中分离和纯化出一种蛋白激酶L这种酶 具有很好的溶栓作用,是一种枯草杆菌的发酵产物,为丝氨酸蛋白酶类,称其为 (nattokinase) L由275个氨基酸组成分子量为27kD,等电点为8.160.13L这种酶与其 它溶栓药相比,除具有较强的溶栓作用外,还具有体内作用时间长,无毒无副作用等优点。 我们用PCR方法克隆纳豆激酶基因,并重组到表达载体上进行了初步表达及表达产物 的活性测定,为用基因工程菌生产纳豆激酶奠定基础。经研究,纳豆激酶具有水解纤维蛋白的作用,它具有严格的限制性酶切位点,可直 接作用于交联纤维蛋白,使其水解成可溶性的小分子,从而达到直接溶解血栓
9、的作用。 提取纯化纳豆激酶,与交联的纤维蛋白酶解,发现不同时间降解交联纤维蛋白片段大小 不同,出现1413kD、36kD、和41 kD不同大小的片段,从而白哦名纳豆激酶具有直接降 解血栓的作用。纳豆激酶活体内尿激酶原转化为尿激酶,从而增加纤维酶的活性,进一 步加强它的溶栓作用;纳豆激酶刺激血管内皮细胞产生内源t-PA,t-PA催化纤溶酶原转 变纤溶酶,以使积累的纤维蛋白或血栓溶解;纳豆激酶通过降解好识货纤溶酶原激活剂 的抑制剂(PAI-1)调控纤溶作用。4纳豆中含有100种以上的酶,碱性蛋白酶和A-淀粉酶易将纳豆中蛋白质分解便于人 体消化吸收,弹性蛋白酶(Elastase)和植酸酶(Phyta
10、se)目前已被从纳豆中提取生产 应用于食品及其它工业中。纳豆激酶具有防治心脑血管栓塞、抗致病菌、防癌、抗癌、 阻止动脉粥样硬化、抗氧化、延缓衰老等多重作用,因此,纳豆激酶成为现在一项热点 研究项目。据统计,目前美国每年有15万人死于中风,在我国,每年死于冠心病者约60万人, 死于脑梗塞,脑溢血者120万人,约有80%病例是由于血栓引起而导致突发性恶果。而 纳豆激酶因具有特殊的溶血栓活性,既能预防也能治疗血管栓性疾病,与其他溶栓药物 相比,具有安全性能好、无免疫原性、易被人体消化吸收、可静脉注射也可口服、半衰 期长、生产价格低廉等优点,极有可能成为新一代李晓你哥的预防和治疗栓塞的新型药 物,将为
11、解决莫倩血栓溶解药物口服性差、价格昂贵、并发症多等问题带来更多希望。综上所述,我国学者对纳豆激酶基因的克隆、表达及表达产物的活性方面进行了深 入系统的研究,已经初步能够利用基因工程菌生产纳豆激酶样品。但是对于基因工程菌 的发酵工艺、表达产物的分离纯化工艺、表达产物的产量及收率方面仅进行了一些探索 性研究,要想实现利用基因工程菌工业化生产纳豆激酶,还需更加深入的研究。材料与方法1. 材料1.1试剂、仪器及实验用具1.1.1仪器台式离心机,旋涡混合器,微量移液取样器,气浴振荡摇床(不需加水),制冰机 (GRANT),超净工作台(上海智城分析仪器制造有限公司),微波炉和电磁炉,电泳仪 (北京市六一仪
12、器厂,DYY-11型电泳仪)和电泳槽,电子分析天平(德国Sartorius公 司),恒温水浴锅(上海博讯实业有限公司医疗设备厂出品,HSH型),紫外分光光度计, PCR仪(Biometra华粤企业公司),通风橱,三用紫外分析仪,恒温细菌培养箱,凝胶 成像仪,高压蒸汽灭菌锅(日本HIRAYAMAHVE-50高压灭菌锅)。1.1.2实验用具超净工作台,玻璃涂布棒,酒精灯,双面微量离心管架,试管架,记号笔,手表,摇 菌试管,1.5mL离心管,0.5mL微量离心管,枪头(010uL,20200uL,2001000uL), 100mL三角瓶,250mL三角瓶,凝胶成像系统,一次性薄膜手套等,0.2mLP
13、CR微量管,泡 沫塑料保温盒,培养皿,琼脂糖凝胶电泳槽和梳子及其制胶模块,垂直电泳槽及配套的 玻璃板、夹子、密封条、梳子。1.1.3试剂LB培养基,氨苄青霉素储存液,无菌ddwater, 100mg/mL (M/V) IPTG, 20%葡 萄糖,1.0mol/LTrisHCl (pH8.8),0.5mol/L TrisHCK pH6.8),10%SDS,30% Acr/Bis, 10% Aps,2X上样缓冲液,TEMED,低分子量蛋白分子量Marker,考马斯亮蓝染色液, 5 X电泳缓冲液,20% (M/V) IPTG,2% (M/V) X-gal,50 X TAE电泳缓冲液,漠化乙锭 储存液
14、,10X加样缓冲液,6X加样缓冲液,DNA分子量Marker,电泳级琼脂糖粉,3U/ uLTaqDNA 聚合酶,10XPCR 缓冲液(MgCl2free),25mMMgCl2, dNTP 混合液,10mg/mL RNase A,TE缓冲液,95%和70%乙醇,EcoR I和BamH I限制性内切酶,10X内切酶缓 冲液,0.1 mol/L CaCl2溶液,T4 DNA连接酶,连接酶缓冲液。1.2菌种带有pET-trx质粒载体DH5a菌,带有pMD18-T-NK载体的DH5a菌,E.coli DH5a, E.coli BL21 (DE3)。由基因工程实验室提供。1.3质粒1.3. 1目的基因所在
15、质粒:pMD-18T-NK1.3.2 表达载体:pET-trxP3.C o_ll FitzFT; | | TRXgs-8心 | CTC GAJk GTT CTG l -ll CAGCCA OCA GOAUQi JUxe-GiJuPro琏wIWTOC GCA C3AA TTCA.GC LXT AC;C: TAA CJT 援由.侦由此:由.TAA M :丁丁4EcroRisjqx*yiujUXLri1.4 常用溶液的配制 1.4.1氨苄青霉素储存液:无菌水配制100mg/mL,分装后-20 C保存。1.4.2 LB培养基:胰化蛋白胨10g,酵母提取物5g, NaCl 10g,加200mL ddwa
16、ter 搅拌完全溶解,用约NaOH调pH至7.0,加dd water至1L,分装4个200ml 和2个100ml,121C 20min灭菌。使用时可加入氨苄青霉素,终浓度100ug/mL。1.4.3 溶液II(NaOH/SDS 溶液):0.2mol/L NaOH, 1%SDS,现用现配。1.4.4 50 X TAE 电泳缓冲液(pH 约 8.5): Tris 碱 242g,57.1ml 冰乙酸,37.2g Na2EDTA 2H2O, dd water定容至1L。使用时稀释成IX。1.4.5琼脂糖凝胶:称取0.25g琼脂糖粉,放入三角瓶,加入25ml 1XTAE电泳缓冲液 (注意原液是50X,按
17、照1:49的比例稀释),用保鲜膜盖住,放入微波炉里烧开 (30 s),取出观察,若无颗粒则置于桌面上冷却至不烫手即可灌胶,若仍然有颗 粒状物,需要再继续加热,直至无颗粒后冷却灌胶。1.4.6 1.0mol/L Tris HCl pH8.8:称取 12.1g Tris 碱,加 50mL 蒸馏水,缓慢地加浓 盐酸至pH8.8(约加8mL)。让溶液冷却至室温,pH将会升高,然后再调至pH8.8, 加蒸馏水至100mL。高温高压灭菌后4C保存。1.4.7 0.5mol/L Tris HCl pH6.8:称取 6.05g Tris 碱溶于 40mL 蒸馏水中,加约 48mL 1mol/L HCl,让溶液
18、冷却至室温,再用HCl调至pH6.8,加水稀释到100mL终 体积。高温高压灭菌后4C保存。1.4.8 30% Acr (丙烯酰胺)/Bis (N,N -亚甲基双丙烯酰胺):30g Acr+0.8g Bis, 用dd water定容至100mL,4 C棕色瓶避光保存(现用现配)。1.4.9 10% Aps (过硫酸铵):蒸馏水配制,-20C保存。过硫酸铵会缓慢分解,一周内 使用完。1.4.10 上样缓冲液:0.5mol/L Tris HCl pH6.8 2mL,甘油 2mL,20% SDS 2mL,0.1% 漠酚蓝0.5mL,B -2-巯基乙醇1.0mL,dd water 2.5mL,室温存放
19、。1.4.11 电泳缓冲液:Tris 7.5g,甘氨酸 36g,SDS2.5g,加 ddwater 至 500mL。使用 时稀释5倍。1.4.12 考马斯亮蓝染色液:考马斯亮蓝R250 0.25g + 45mL甲醇+10mL冰醋酸,用 ddwater 定容至 100mL。1.4.13 LB平板培养基:LB培养基中含1.2 % (1.2g/100ml)琼脂,高压灭菌后加入 氨苄青霉素至100Ug/mL,每个培养皿中约20mL倒制平板。2. 方法2.1设计引物PCR引物:上游引物(PDU,5端带BamHI酶切位点):5-GGATCC ATG GCC TCC TCC GAG AAC-3下游引物(PD
20、L,5端带EcoRI酶切位点):5-GAATTC TAC AGG AAC AGG TGG TG -32.2 NK基因的PCR扩增2.2.1 由老师提供pMD-18-T-NK质粒进行PCR扩增。2.2.2 在0.2mL PCR微量离心管中按下列剂量配制50uL的PCR反应体系。PCR体系50 UL (总)PCR Supermix45 uL模板质粒1 UL (稀释2050倍)Primerl1 U LPrimer21 U Ldd water2uL2.2.3 设置PCR仪的循环程序:94C5min 94C30s 60C30s 72C1min 72C10minPCR总时间需要1h50min。PCR结束后
21、,取5ul产物进行琼脂糖凝胶泳。观察是否有预计分子量的主要产物带。 注:退火温度NK: 60C 红色荧光蛋白:51C 绿色荧光蛋白:61C2.3 DH5 a和BL21(DE3)感受态的制备2.3.1 取2个1.5mL预冷10 min的无菌微量离心管,做上相应标记。2.3.2 其中一管加入1. 0mLBL21(DE3)菌液,另外一管加1.0mL DH5a菌液,然后在冰 上放置10min,5000r/min 4C 离心10min,弃上清。2.3.3 加入1ml冰冷的0.1 mol/L CaCl2溶液,立即在涡旋混合器上混匀,插入冰中 静置30min。2.3.3 4C,5000r/min 离心 10
22、min。弃上清液后,用 1mL 冰冷的 0.1 mol/L CaCl2 溶液重悬菌体,插入冰中放置30min。2.3.4 4C,5000r/min 离心 10min。弃上清液后,用 200uL 冰冷的 0.1 mol/L CaCl2 溶液重悬菌体。2.3.5 在超净工作台内将两种菌按50ul/管分装在1.5ml管内,放于4C冰箱待用。2.4 pMD19-T-NK的构建及转化和检测2.4.1 PCR 产物(NK)与 pMD-19-T (PCR 2.1)载体直接连接阳性PCR产物与pMD-19-T载体(PCR 2.1)连接。在离心管中加入:pMD-19-T连接反应体系10uL (总)10xlink
23、 buffer1 u LPCR 2.1vector2uLPCR Product2uLT4 DNA Ligase1 u LDd water4uL在干式恒温气浴中14C,连接3 h。2.4.2感受态细菌的转化2.4.2.1 将恒温水浴的温度调节到42C。2.4.2.2 从4C冰箱中取出感受态菌,冰浴7min。2.4.2.3 取5 uL连接好的质粒与感受态细菌DH5a混匀,在冰上放置20min。2.4.2.4 于42C水浴中90S进行热休克,然后在冰中放置4 min,在超净台上加入300uL LB培养基(不含氨苄青霉素),37C振荡培养45 min。2.4.2.5 超净台上取上述转化的混合液150
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