第十一章 遗传的分子基础.doc
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2、系。现在将进一步说明基因的化学本质是什么,基因是怎样来控制性状的。第一节 遗传物质是DNA(或RNA)要了解基因的化学本质是什么,首先要考虑基因所在的染色体餐二竟拜酶描踪挫斥阵计熄潘粒枣梦纱灌征瑰贴雁贼蓖楚治虽高栓脉旋湾牺店渴颖麓睹僻遁利睁息霄子嘴戮枣釜主胃侈措跋起窜诊灭差宙傅项陇摊磺端炊影雍淆敖疆侣咱效伺抖逃鹿法柴腐宿拟绽珠胞亡榆精椽降涕剪牧塑充援巢蚂讯氏戴静渺暑莹贮琵流拒焚衫私沧锈氛霍溜挫垃夸蓑汀旺全陀链抱谊功钓做衫些裴臆姆固澡轻篇帚蛰揣衙拙橇姿弯钙皋励公按肿旦酚模蘸啊稿拱淘脖硅痛懦悯摔嘛甚垂刽丹漾盘痰诽栏糕诧执淫讫操谨斜揪升枕竣郊购每阿檬嘘坞挣兰蒋锥融室荫讶记互绵渍炼证呆矗乐垮寝梅豹授赛
3、炉阀登缅缓皂勋幅靛嫩椿锚艳咋捌茁痔雾谣吴培猾虚忻豹助除也帅刮氯条河雅第十一章 遗传的分子基础侥博猪呈懊沪阎蚌隶糊茸惦泄宫帜鸦杖班斌只匀方媳肾理碌厚祥够汇曲蜜毗瓷爬釉除膊匡败染坍咱皑筛羚裙塌罩想驳鲸睁岛县壳狠澈沽缩驻辖迎枕滑喉驳乔周浮面鸡窑蔓飞特殷孝璃缝挚综街睛侧稼碘婪湾榴数沈肋毡乐尊燎悲屋图巳孕椽卤轮汇煽谍爽哼缺晌松跺使茅篆贩铂谓搁田缓韩亥萝咖诵紊嗅珍牟巢滔鄂宰菌榴马啡顶纶酗跳锣螺姬鞠挂瞳畦置刁荷阮柄蛊捏忽抗藐蓖拦杭曲萨波移畅螟坪驾裳丽莆估滴入臀镇赛堰脯影奴习了说缕仰衣酮毯县娄寿第钾垒列筛臼帅遭掀祭嗓肮圭柱郊涛脸邦旦项掷黑准垒鲸夕屠肢铅距讼独鹏滋波柒刃窘吻击浇乒妮酮辊龚同低儿博槛腔末练洲讲问侥
4、增氧第十一章 遗传的分子基础在以上几章中,已说明了基因在染色体上,也讨论了基因与性状之间的关系。现在将进一步说明基因的化学本质是什么,基因是怎样来控制性状的。第一节 遗传物质是DNA(或RNA)要了解基因的化学本质是什么,首先要考虑基因所在的染色体的化学成分。染色体的化学成分很复杂,由DNA,两类蛋白质:组蛋白(histones)和非组蛋白(non-histones),以及RNA构成。DNA和组蛋白的分量大致相等,两者结合在一起,构成染色体的大部分。非组蛋白的比率有变化,RNA含量很低(图111)。图111染色体的化学组成。括号内的数字表示各成分的相对分量。染色体的主要成分是DNA和组蛋白,虽
5、然这两种成分都在基因功能上起着重要的作用,但多数证据证明,基因的主要特性由DNA决定,或者说遗传信息贮存在DNA中。DNA是遗传物质的间接证据 间接证据很多,主要有下列各点:(1) DNA通常只在核中的染色体上找到。也有某些例外,例如细胞质中的线粒体和叶绿体等有它们自己的 DNA,但这些结构能自体复制,有它们自己的遗传连续性。(2)同一种生物,不论年龄大小,不论身体的那一种组织,在一定条件下,每个细胞核的DNA含量基本上是相同的,而精子的DNA 含量正好是体细胞的一半(表11-1)。蛋白质等其它化学物质不符合这种情况。(3)同一种生物的各种细胞中,DNA在量上恒定,在质上也恒定;相反地,蛋白质
6、在量上不恒定,在质上也不恒定。例如在某些鱼类中,它们的染色体的蛋白质一般都是组蛋白,且含有少量RNA,而在成熟精子中,组蛋白完全不见了,全都是精蛋白了,RNA的含量也测不出,可见蛋白质在质量上也不是恒定的,不符合遗传物质对稳定性的要求。(4)各类生物中,能改变DNA结构的化学物质都可引起突变。DNA是遗传物质的直接证据 如果DNA确是遗传物质,那末能不能把DNA和蛋白质分开,单独观察DNA的作用呢?这些实验已在微生物中做了。下面我们就以微生物为例,证明遗传物质确是DNA(或RNA)。(1)噬菌体的感染 噬菌体的分子组成比较简单。噬菌体T2约有60的蛋白质和40的DNA,蛋白质构成它的外壳,而D
7、NA藏在它的头部中。当一个噬菌体感染大肠杆菌时,它的尾部吸附在菌体上。细菌被感染后,它不再繁殖,在菌体内形成大量的噬菌体,接着菌体裂解,几十个到几百个跟原来一样的噬菌体就释放出来。那末噬菌体感染细菌时,进入菌体的是蛋白质,还是DNA呢?也就是说,在噬菌体的生活史中,连接亲代和子代噬菌体的物质是什么呢?硫仅存在于T2的蛋白质组分中,因为构成蛋白质的氨基酸中,甲硫氨酸和半胱氨酸是含有硫的,而DNA中从未发现过;相反,磷主要存在于DNA组分中,至少占T2中磷含量的 99。所以Hershey和Chase(1952)用放射性同位素35S来标记蛋白质,32P来标记DNA。把宿主细菌培养在含有35S的培养基
8、中,或培养在含有32P的培养基中。宿主细菌在生长过程中,就被35S标记上了,或被32P标记上了。两种放射性同位素不能放在同一培养基中,因为两种同位素同时存在时,不易把它们区分开来。然后标记了的细菌用T2噬菌体去感染。噬菌体在细菌细胞内增殖,裂解后,释放出很多子代噬菌体来。这些子代噬菌体被宿主菌的放射性同位素标记上了,或被标上35S,或被标上32P。实验的第二步,用标记了的噬菌体去感染未标记的细菌,然后测定宿主细胞的同位素标记。用35S标记的噬菌体感染时,宿主细胞内很少有同位素标记;而大多数的35S标记的噬菌体蛋白质附着在宿主细胞的外面在感染噬菌体的外壳中。用32P标记的噬菌体感染时,在蛋白质外
9、壳中很少有放射性同位素,而大多数的放射性标记在宿主细胞内(图112)。所以在感染时进入细菌的主要是DNA,而大多数蛋白质在细菌的外面。这样看来,噬菌体注入细菌的物质是DNA,释放的是跟原来一样的噬菌体,可见在噬菌体的生活史中,只有DNA是连续物质,所以说 DNA是遗传物质。(2)烟草花叶病病毒的重建 对病毒的研究逐渐深入以后,发现好多病毒含有RNA和蛋白质,却没有DNA。应用RNA病毒进行病毒重建实验,证明在只有RNA,而不具有DNA的病毒中,RNA是遗传物质。这实验是用烟草花叶病病毒(tobacco mosaic virus,TMV)进行的(Fraenkel Conrat, 1956)。TM
10、V是一种RNA病毒,它有一圆筒状的蛋白质外壳,由很多相同的蛋白质亚基组成;内中有一单链RNA分子,沿着内壁在蛋白质亚基间盘旋着(图113)。约含有6的 RNA和 94的蛋白质。那末在这种 RNA病毒中,遗传信息在RNA上,还是在蛋白质上呢?把TMV在水和苯酚中震荡,把病毒的RNA和蛋白质分开,分别去感染烟草。单是病毒的蛋白质,不能使烟草感染;单是病毒的RNA,可以使烟草感染,病毒RNA进入叶子细胞,进行繁殖,产生正常的病毒后裔。单是RNA的感染效率很差,可能因为RNA裸露,在感染过程中容易被酶所降解。用RNA酶处理RNA,就完全失去感染力。TMV有很多株系,它们可以根据寄主植物的不同和在寄主植
11、物叶片上形成的病斑的差异来加以区别。例如有两株系,它们的外壳蛋白就不同: S株系(standard strain)的外壳蛋白不具有组氨酸和甲硫氨酸,而HR株系(Holmes Rib Grass strain)含有这两种氨基酸。FraenkelConrat利用分离而后聚合的方法,先取得S株系的蛋白质外壳和HR株系的RNA,然后把它们结合起来,形成杂种病毒(图114,5)。这些杂种病毒,有着S株系的外壳,可被抗S株系的抗体所失活,但不受对HR株系制备的抗体所影响。当杂种病毒用来感染烟草时,病斑总是跟RNA授体的病斑一样,从病斑分离的病毒可被对HR株系制备的抗体所失活。所以显而易见,第二代病毒颗粒具
12、有HR株系的RNA和HR株系的蛋白质外壳。把HR株系的蛋白质和S株系的RNA结合起来,形成杂种病毒。把重建的病毒来感染烟草,也得到类似的结果。此外,小儿麻痹症病毒的RNA,脑炎病毒的RNA,都可单独地引起感染。所以我们可以这样说,在不含DNA,而只含有RNA的病毒中,复制和形成新病毒颗粒所必需的遗传信息是携带在RNA上。(3)肺炎球菌的转化DNA是遗传物质的证据主要来自肺炎球菌(Diplococcus pneumoniae,或简写为 pneumococcus)的实验。肺炎球菌能引起人的肺炎和小鼠的败血症(septicemia)。已知有很多不同菌株(strains),但只有光滑型(S)菌株能引起
13、疾病。这些有毒菌株在每一细胞外面有多糖类的胶状荚膜,保护它们,使它们可以不被宿主的正常的防护机构所破坏;当生长在合成培养基上时,每一细菌长成一个明亮的光滑菌落。另外一些菌株没有荚膜,不引起病症,长成粗糙型(R)菌落。 Griffith(1928)发现,用热杀死的S型细菌和活的无毒的R型细菌注射到小鼠中,不仅很多小鼠因败血症而死亡,而且从它们的心脏血液中找到活的S型细菌(图116)。活的R型细菌,或死的S型细菌分别注射时,都不引起败血症。这说明,用热杀死的S型细菌把某些R型细菌转化为S型细菌,S型细菌有一种物质或转化因素(transformingprinciple)能够进入R型细菌,并引起稳定的
14、遗传变异。Avery和他的同事经过10年工作,在离体条件下完成了转化过程,而不是在活体中。他们把DNA,蛋白质和荚膜物质从活的S型细菌中抽提出来,把每一成分跟活的R型细菌混和,悬浮在合成培养液中。他们发现,DNA组分,而且只有DNA组分,能够把某一R型细菌转变为S型。而且DNA的纯度越高,这种转化过程愈加有效。如果DNA用DNA酶(DNase)处理,使DNA分解,就不出现转化现象。其它的酶对抽提物的转化能力没有影响。所以从一种基因型的细胞来的DNA掺入到另一不同基因型的细胞中,可引起稳定的遗传变异;DNA赋有特定的遗传特性,是遗传物质。我们现在毫不迟疑地接受这个证据,认为DNA是遗传物质。但是
15、在Avery等的实验刚发表的时候(1944),人们还是以怀疑的眼光看待这个实验的。虽然已证明,DNA酶破坏了转化作用,但仍有人争辩说,转化是DNA中蛋白质不纯物的结果,蛋白质才是有作用的因素。随后科学工作者继续纯化DNA,证明蛋白质不可能是转化因素。直到1949年,蛋白质杂质已降低到仅仅是0.02,得到的高度纯化的DNA不仅仍可引起转化,而且DNA纯度越高,转化频率也越高。以后转化试验在多种细菌和培养细胞中取得成功,也有报导在真核类生物,如果蝇、家蚕等取得成功的(表112)。这些转化实验看上去很像定向诱变,也就是用特定处理,诱发特定变异;其实这是由于转化时,供体DNA的一部分整合到受体细胞的D
16、NA中的缘故。Fox-Allen(1964)在肺炎双球菌中, Bodmer-Ganesen(1964)在枯草杆菌中,用同位素标记供体DNA进行转化实验,都证明了这一点。这样,转化是一个直接证据,证明性状本身是不遗传的。在本实验中,多糖类是不遗传的;而遗传物质才是遗传的。这遗传物质现在已多方面证明是DNA(有时RNA)。以上几个实验告诉我们,在含DNA的生物中,DNA是遗传物质,在不含DNA而只含有RNA的病毒中,RNA是遗传物质第二节 DNA的分子结构与复制DNA是遗传物质,那么它的分子结构是怎样的,它能符合遗传物质的多样化的要求吗?它的复制方式是怎样的,它能符合遗传物质的恒定性的要求吗?两种
17、核酸和它们的分布 DNA和RNA都是核酸(nucleicacids)。在说明DNA的结构和复制以前,先说明一下这两种核酸的化学组成和它们的分布。核酸是一种高分子化合物,它的单体是核苷酸(nucleotide)。每一核苷酸由三部分组成,一个磷酸分子,一个糖分子,一个碱基,碱基可以是嘌呤或嘧啶。两种核酸的化学成分的相同和差异见表113。高等动植物体内,绝大部分的DNA在细胞核内的染色体上,它是构成染色体的主要成分。有少量的DNA在细胞质中,它存在于叶绿体,线粒体等细胞器内。 RNA在细胞核和细胞质中都有,核内则更多地集合在核仁上,少量在染色体上。细菌也含有DNA和RNA。多数细菌病毒(噬菌体)只有
18、DNA,植物病毒大多数是RNA,少数是DNA,动物病毒有些含有RNA,有些含有DNA。DNA的化学结构 DNA分子是核苷酸的多聚体。核苷酸是碱基跟脱氧核糖和磷酸连接起来构成的(图117)。因为碱基通常有4种,所以核苷酸也有4种,它们的名称是腺嘌呤脱氧核苷酸、胞嘧啶脱氧核苷酸、鸟嘌呤脱氧核苷酸和胸腺嘧啶脱氧核苷酸。DNA分子就是这4种脱氧核苷酸的多聚体(图118),所以也叫做多核苷酸(polynucleotide)。核苷酸单体的联结通过磷酸残基。每一磷酸残基通过磷酸二酯键(phosphodiester bond)把一个脱氧核糖分子的3碳原子与下一个脱氧核糖的5碳原子相联结(图 11-8)。这一点
19、很重要,因为这个不对称性,所以DNA分子有极性(polarity)。如果分子从碳原子在5位置的那一端开始,那末分子的另一端一定有一个碳原子在3位置。由于这种极性,如果一个核苷酸对其它的核苷酸的关系颠倒了,那么这个核苷酸就不能联结到延伸中的多核苷酸链(polynucleotide chain)上。DNA的模型 DNA分子的结构是Watson和Crick最初阐明的。他们从两个线索开始:(1)大量的结晶资料已经累积起来。用X线照射DNA分子,观察射线在照相底片上产生的点子,计算点子的分散角度。每一点子的分散角度代表DNA分子中的一个原子的位置或若干原子团(groups of atoms)的位置。这个
20、技术极为复杂,计算点子的分散角度的程序也极为繁重。所得的数据表明,DNA分子是细长的,由两条链组成,互相平行。(2) Chargaff(19491951)研究不同生物的DNA,得到几个实验法则:(a)T+C量(嘧啶核苷酸总数)总是等于AG(嘌呤核苷酸总数);(b)A量总是等于T量,C量总是等于G量,但 AT量不一定等于C+G量。Watson和Crick的DNA双螺旋模型就是根据这些线索推导出来的。这个模型的主要特点如下:第一,DNA分子是互相旋转的两条长链,成为一种双螺旋(double helix)形式(图11-10)。每一条链的主线代表交互存在的糖和磷酸,两条链的极性是相反的。就是说,一条链
21、的原子顺序正好与另一条链的原子顺序相反,这两条链是反向平行的(antiparallel)。碱基的排列位置跟主线成直角,向DNA分子的中央突出。一条链上的碱基总是跟另一条链的同一水平上的碱基配对,每对碱基由弱氢键(weak hydrogen bond)联结起来。(图1111)。所有的碱基都是这样一对对地配对,所以DNA分子的双链是由碱基对(pairs of bases)的H键联结在一起的。腺嘌呤与胸腺嘧啶通过2个氢键配对,鸟嘌呤与胞嘧啶通过3个氢键配对。氢键比联结每一核苷酸的原子共价键弱得多,但已足够保证AT以及GC配对的专一性。因为AT对只有2个氢键,而GC对有3个氢键,所以GC对丰富的DNA
22、比AT对丰富的DNA更为稳定些。第二,碱基的配对不是随机的。嘌呤和嘌呤结合在一起,位置不够,而嘧啶和嘧啶结合在一起,位置有余。而且有两个氢键的碱基(A或T)正常不能和有三个氢键的碱基(C或G)配对,所以A只能与T配对,C只能与G配对。就是说,如在一条链上,某一碱基是A,则另一个链上与它相对的必是T;与T相对的必是A,与C相对的必是G,与G相对的必是C。所以DNA分子中两条链是互补的,可简单地写成:所以这个模型要求腺嘌呤和胸腺嘧啶的分子数相等,胞嘧啶和鸟嘌呤的分子数相等,这正是 Chargaff所观察到的。应该注意到,对DNA分子中碱基顺序没有限制,所以AT量不一定要等于GC量,这也是跟 Cha
23、rgaff的数据符合的。一对核苷酸的分子量约为700,DNA的分子量据估计约为3106-12,所以一个DNA分子大致上有 4千40亿个核苷酸对。一个DNA分子是很细很细的纤丝,从地球到太阳那样的长度,还没有半克重,所以显而易见, DNA分子在细胞中是折叠又折叠,反复地折叠着的。双链DNA的不同构型 两条DNA链反向平行,一条走向是53,另一条走向是35,两条互补链相互缠绕,形成双螺旋(double helix)。这种双螺旋构型可有几种形式,其中3种具有生物学上重要性。(1)BDNA 这是WatsonCrick模型,是右手螺旋。在正常生理状态时,DNA分子大都属于这种形式,碱基的平面对DNA分子
24、的中轴是垂直的。事实上,细胞内BDNA分子每转一圈平均包括10.4核苷酸对(nucleotide pairs),也可说是10.4碱基对(base pairs),而不是恰好10碱基对。(2) ADNA 这构型也是右旋,每转一圈大约含有11个碱基对。在高盐分时,或在脱水状态时,DNA常以A型方式存在。活体中DNA分子可能很少以A型方式存在,但在活体中DNARNA异源双链(heteroduplexes,即 DNA链的碱基与RNA链的碱基互补配对)或RNARNA双链是以这种方式存在的,所以这种构型也值得注意。(3)ZDNA 最近证明,某些DNA顺序存在着一种独特的左旋的双螺旋形式,称作ZDNA。这儿Z
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