生物化学实验指导.ppt
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1、生物化学实验指导课件,天水师范学院生物系二OO二年二月,前言,随着生物化学的发展和生物化学教学内容的不断丰富。生物化学实验也在不断更新和提高。1992年,我们编写了一本生物化学实验指导作为专科生实验教材,并在实验教学的过程中不断修改并加以充实。这次编写的生物化学实验指导是在以往工作的基础上,结合生物化学实验教学改革、作为本、专科生物化学实验教改项目的一个重要内容。在这次编写过程中,我们确立了这样一个指导思想去掉了许多定性和验证性实验,加大了定量分析的内容;在同一项目实验中,同时介绍了不止一种方法和技术增加了部分大实验,力求使学生有一个完整的实验训练过程,有利于培养学生实验设计能力、分析问题能力
2、和独立操作能力,以达到知识、能力和素质的全面提高。本实验指导共计十五个实验,分基础实验、提高实验、高级实验三篇,内容覆盖了当今生物化学研究中常用的方法与技术。,生物化学实验指导,实验一 蛋白质的沉淀、变性反应实验二 蛋白质的等电点测定(pH法)实验三 酶的特性实验四 菜花(花椰菜)中核酸的分离 和鉴定,基础实验,实验一 3,5二硝基水杨酸比色定糖法 实验二 Fo1in酚法测定血清蛋白质含量 实验三 血清蛋白醋酸纤维薄膜电泳 实验四 蛋白质分子量测定(葡聚糖凝胶薄 层层析法)实验五 脂肪酸的-氧化 实验六 核酸浓度测定定磷法 实验七 血液中转氨酶活力的测定(分光光 度法)实验八 维生素C的定量测
3、定,提高实验,实验一 酯酶的分离、纯化与活性测定 实验二 酯酶同功酶的垂直板不连续聚 丙烯酰胺凝胶电泳分析 实验三 底物浓度对酶促反应速度的影 响(米氏常数的测定),高级实验,注意事项,返 回,实验器材、药品,实验原理,实验操作,酯酶的分离、纯化与活性测定,酯酶是A酯酶,B酯酶和胆碱酯酶的总称,它与人体有机磷药物中毒机制有关。本实验利用离子交换层析法分离和纯化酯酶,常用的阳离子交换剂有弱酸性的羧甲基纤维素(CM纤维素),阴离子交换剂有弱碱性的二乙氨基乙基纤维素(DEAE纤维素).蛋白质的混合物与纤维素离子交换剂的酸性基团或碱性基团相结合,结合力的大小取决于彼此间相反电荷基团的静电引力,这又与溶
4、液的pH有关,因为pH决定离子交换剂和蛋白质的解离程度。盐类的存在可以降低离子交换剂的解离基团与蛋白质的相反电荷基团之间的静电引力。因此,被吸附的蛋白质的洗脱通过改变pH或离子强度(或二者同时改变)来实现;与离子交换剂结合力小的蛋白质首先从层析柱中被洗脱下来。本实验采用CM纤维素离子交换剂,通过柱层析,经梯度洗脱从鼠肾丙酮粉抽提液中分离、纯化酯酶。梯度洗脱法是在洗脱过程中,使洗脱液的pH或盐浓度(或两者同时)发生连续的梯度变化,从而使吸附在柱上的各组分在不同的梯度下洗脱下来。本实验采用的是盐离子浓度梯度洗脱法,其装置由两个彼此相连的容器组成,在与层析柱相连接的一个容器(混合瓶)中,放入梯度洗脱
5、开始时所需浓度的盐溶液(低浓度),并配有搅拌装置,另一容器(贮液瓶)中放入高浓度的盐溶液,其浓度即梯度洗脱最后所需的浓度。两个容器的底部必须保持水平,液面的高度也应该相同。这样,当两容器之间的通道打开,并使混合瓶溶液流进层析柱时,梯度即开始形成。由于这两个容器是连通的,当混合瓶的溶液开始流入层析柱,它的液面高度就逐渐下降,为了维持两容器的液面高度的一致,高浓度的盐溶液即从导管流入混合瓶,结果混合瓶中溶液的盐浓度呈梯度上升。,原理,返 回,返 回,操作,一 粗酶制剂的制备 二 CM纤维素离子交换剂的处理 三 层析柱的安装和平衡 四 加样和梯度洗脱 五 酯酶活性的测定 六 结果处理,返 回,流程图
6、,结 果 处 理,酯酶活性测定,梯度洗脱,上样,组合层析装置,层析柱安装,层析介质处理,粗酶制剂制备,一、粗酶制剂的制备,杀死大白鼠,迅速剖腹取肾,置于冰浴中剔除脂肪和结缔组织。新鲜肾组织和15丙酮,按10g重量和100m1容积的比例,一同置入Waring捣碎器中捣碎,为避免温度升高,捣碎0.5min后,把匀浆倒入烧杯中,置于冰盐浴冷至15,再捣碎0.5min,反复3次。然后把匀浆倾人布氏漏斗抽滤,用15丙酮洗涤3次,按上述方法再捣碎滤饼,抽滤和洗涤一次。将最后得到的滤饼散置于表面皿,放入真空干燥器干燥数天,即得丙酮粉干品,每10g新鲜肾组织可制得丙酮粉34g。按100mg丙酮粉加入5m1 1
7、102mo1l pH6.0磷酸缓冲液的比例,将二者放入烧杯中,置于冰箱内抽提30min,不时搅拌。抽提液在3000rmin下离心10min,上清液即为粗酶制剂(保存于冰箱待用)。测定此粗酶制剂的蛋白含量(按Fo1in酚试剂法)和酶活性。,返 回,二、CM纤维素离子交换剂的处理,称10g CM纤维素干品置于烧杯中,加入100ml 0.5moll NaOH0.5mol从NaCl溶液,混匀,静置15min后,在布氏漏斗中抽滤,水洗滤饼至中性。此滤饼再悬浮于100m1 1mo1l HCl溶液中,混匀,静置10min后放入布氏漏斗抽滤,水洗滤饼至中性。再将滤饼悬浮于100m1 0.5mo1l NaOH0
8、.5mo1l NaCl溶液中,混匀,静置15min后放入布氏漏斗抽滤,水洗滤饼至中性。最后将滤饼悬浮于所选择的起始洗脱缓冲液中。使用后的回收处理和上述步骤相同,只是省略了将滤饼悬浮于1mo1l HCl溶液这一步。,返 回,三、层析柱的安装和平衡,洗净一支1.540cm的玻璃(管)柱(也可选用规格合适的商品层析柱),准备两个橡皮塞,将其中一个的中央插入一根玻璃细管,上面覆盖一圆形尼龙网片或一块绢布。玻璃细管上连接一根细胶管,与部分收集器相连,将这个橡皮塞安入层析柱的下端,另一橡皮塞中央也插人一根玻璃细管,并接上一根胶管与洗脱液混合瓶下口相连。此橡皮塞塞入层析柱的上端。两端胶管上各备一个螺旋夹。将
9、层析柱架至垂直,夹紧下端胶管,向层析柱内加入蒸馏水(约23柱高),然后将预处理好的离子交换纤维素装入柱内,使其自由沉降至柱的底部,放松柱下端螺旋夹,让柱内液体慢慢流出。待树脂沉降至所需高度(约30cm)后,置一圆形滤纸或尼龙片于胶面,待胶面只剩下一薄层水时,夹紧下端夹子,向柱内加入数ml洗脱起始缓冲液,松开下端夹子,用起始缓冲液渗洗平衡,先是压力较小,后增至洗脱时的压力(平衡10h左右为宜)。若平衡压力过大,柱内树脂被压迫太紧,影响流速。平衡好的柱面应存留一薄层缓冲液,旋紧下端螺旋夹。,返 回,返 回,四、加样和梯度洗脱,用滴管将4m1粗酶制剂溶液(总蛋白含量15mg)沿柱内壁徐徐地加到纤维素
10、柱面,然后慢慢放松下端螺旋夹,使样品液面降至纤维素柱表面,再加入少许洗脱起始缓冲液洗涤柱壁,如上操作,反复进行2次。梯度洗脱采用图39.1的装置实现。A为贮液瓶,B为混合瓶,二者容量相等,且置于同一水平面。C为A,B二瓶连通管的活塞,D为搅拌器,E为混合瓶的通嘴活塞。A盛高浓度洗脱缓冲液,B盛等体积起始洗脱缓冲液。洗脱前先开动搅拌器,后启开活塞C和E,B瓶洗脱液浓度呈直线式递增。关紧活塞C和E,在A瓶中加入110l mo1l pH6.0磷酸缓冲液150 m1,在B瓶中加入5103mol/l pH 6.0磷酸缓冲液150m1,将混合瓶B上的胶管与层析柱连接上之后,开动搅拌器,打开A,B两瓶之间连
11、通管的活塞C,再打开B瓶的通嘴活塞E,控制流速在2ml20min。开动部分收集器,分管收集流出液,每管收集2ml。实验在010的温度范围内进行。测定各管流出液的酶活性,同时用Fo1in酚试剂法测定,每管流出液的蛋白含量。,返 回,五、酯酶活性的测定,底物乙酰2,6二氯酚靛酚被酯酶水解后生成的2,6二氯酚靛酚在pH8.0的条件下显蓝色,底物浓度恒定时,酶促反应速度取决于酶的活性。测定时,取4m1 5102mo1l pH 8.0的磷酸缓冲液,加0.2m1底物(最终浓变为1.25104mo1l),再加适量酶溶液(0.5m1含200g蛋白质)和水,使反应系统的最终容积为6m1,在30下反应5min后立
12、即在600nm波长处测定A值。本实验是各管取0.5m1梯度洗脱液测定酶活性。若光吸收值越大,表示酶活性越高。,返 回,六、结果处理,1.以梯度洗脱流出液的管数为横坐标,以相应流出液的蛋白含量为纵坐标,作出洗脱洗脱曲线图,峰和为两个主要酶蛋白峰。蛋白含量以1m1梯度洗脱液(Fo1in酚试剂法测定)在500nm波长处比色的光吸收值表示。2.以梯度洗脱流出液的管数为横坐标,以相应流出液酶活性(取0.5m1测定,在600nm波长处的A值)为纵坐标,绘制出酶活性曲线图,得到两个主要酶活性峰I和(见图)。3.以梯度洗脱流出液的管数为横坐标,梯度洗脱液浓度为纵坐标,绘制出梯度洗脱液浓度曲线图。4.分别合并峰
13、I和两个组分,测定它们的蛋白含量和酶活性,并计算比活性。比活性的计算方法如下:酯酶比活性=酶作用底物后在600nm波长处的A值/mg蛋白量 最后列出鼠肾粗酶制剂(丙酮粉原抽提液)和层析洗脱液酯酶比活性的比较以及蛋白回收率(见表)。由表列的数据看出,酯酶集中在峰。,返 回,蛋白含量、酶活性和梯度洗脱液浓度曲线,代表蛋白含量曲线,表示酶活性曲线,表示洗脱液浓度曲线。,返 回,粗酶制剂和层析洗脱液酯酶比活性的比较,返 回,试剂与器材,一、试剂1丙酮21102mo1l pH6.0磷酸缓冲液35102mo1l pH8.0磷酸缓冲液43.75103mo1l乙酰2,6-二氯酚靛酚丙酮溶液50.5mo1l N
14、aOH0.5mo1l NaCl溶液61mo1l HCl溶液75103mo1l pH6.0磷酸缓冲液80.1mo1l pH6.0磷酸缓冲液9CM纤维素(0.069m mo1g干粉,PK3.5)。,二、器材1waring捣碎器 2布氏漏斗 3抽滤瓶 4表面皿5离心机 6国产724型分光光度计 7梯度混合器81.540cm玻璃柱9试管 10自动收集器 11移液管12量简 13烧杯 14玻璃漏斗。,返 回,返 回,返 回,返 回,返 回,注意事项,返 回,实验器材、药品,实验原理,实验操作,酯酶同功酶的垂直板不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacryamide gel elec
15、trophoresis简称PAGE)根据其有无浓缩效应,分为连续与不连续系统2大类,前者电泳体系中缓冲液PH值及凝胶浓度相同,带电颗粒在电场作用下,主要靠电荷及分子筛效应;后者电泳体系中由于缓冲液离子成分、pH、凝胶浓度及电位梯度的不连续性,带电颗粒在电场中泳动不仅有电荷效应、分子筛效应、还具有浓缩效应,因而其分离条带清晰度及分辨率均较前者佳。目前常用的多为垂直的圆盘及板状两种。前者凝胶是在玻璃管中聚合,样品分离区带染色后呈圆盘状,因而称为圆盘电泳(disc electrophoresis),其装置如图87;后者,凝胶是在间隔几毫米的平行玻璃板中聚合,故称为板状电泳(slab electrop
16、horesis),其装置图见第二部分实验18。两者电泳原理完全相同。现以等(1964)用高PH不连续圆盘PAGE分离血清蛋白为例,阐明各种效应的原理。不连续体系由电极缓冲液、样品胶、浓缩胶及分离胶组成,它们在直立的玻璃管中(或2层玻璃板中)排例顺序依次为上层样品胶、中间浓缩胶、下层分离胶,如示意图88。样品胶是核黄素催化聚合而成的大孔胶,T=3%,C=2%,其中含有一定的样品及pH6.7 的Tris-HCI,凝胶缓冲液,其作用是防止对流,促使样品浓缩以免被电极缓冲液稀释。目前一般不用样品胶,直接在样品液中加入等体积40%蔗糖,同样有防止对流及样品被稀释的作用。实际上,浓缩胶是样品胶的延续,凝胶
17、浓度及PH值与样品胶完全相同,其作用是使样品进入分离胶前,被浓缩成窄的扁盘,从而提高分离效果。分离胶是由AP催化聚合而成的小孔胶,T=7.07.5%,C=2.5%,凝胶缓冲液为PH8.9Tris-HCI,大部分血清中各种蛋白质在此PH条件下,按各自负电荷量及分子量泳动。此胶主要起分子筛作用。上、下电泳槽是用聚苯乙烯或二甲基丙烯酸(商品名为Lucite)制作的。将带有3层凝胶的玻璃垂直放在电泳槽中,在两个电极槽中倒入足够量PH8.3 Tris-甘氨酸电极缓冲液,接通电源即可进行电泳。在此电泳体系中,有两种孔径的凝胶、2种缓冲体系,3种PH值,因而形成了凝胶孔径、PH值、缓冲液离子成分的不连续性,
18、这是样品浓缩的主要因素。PAGE具有较高的分辨率,就是因为在电泳体系中集样品浓缩效应、分子筛效应及电荷效应为一体。,原理,返 回,操作,一 凝胶贮备液及电极缓冲液的配制 二 电泳槽的安装 三 凝胶的制备 四 样品的制备和点样 五 电泳六 染色,返 回,染 色,电 泳,上 样,注 浓 缩 胶,浓缩胶制备,注分离胶,分离胶制备,电泳槽安装,流程图,一、凝胶贮备液及电极缓冲液的配制,请参见试剂与器材方法所述配置凝胶贮备液及电极缓冲液,返 回,二、电泳槽的安装,本实验使用夹芯式垂直板电泳槽。将胶板嵌入胶膜,后安装于垂直槽间。拧紧螺丝固定,水平放置。,返 回,三、凝胶的制备,1 分离胶:取上述凝胶贮备液
19、(表71)按A:C:G:水1:2:4:1的比例配制,先将贮备液A,C和水放在一小烧杯中另将贮备液G放人另一小烧杯中,一起放在真空干燥器中,用真空泵抽气15min,取出将G并入,混匀,立即将凝胶液缓缓注入已准备好的干洁胶室中。胶室两侧和底部要防止渗漏,注胶过程中要防止气泡产生。胶液加至离玻璃板顶部约3cm处,此时将电泳槽垂直放置;立即用装有6号针头的注射器注入蒸馏水使胶的表面覆盖少量水层。约40min后,胶和水层之间出现清晰的界面,表明聚合完成。2 浓缩胶:取上述凝胶贮备液按B:D:E:F=1:2:1:4的比例同上法配制浓缩胶。用注射器或吸水纸吸去分离胶上面的水层,立即将配好的浓缩胶注入已凝固的
20、分离胶上,胶液加到接近胶室的顶部,插入样品梳,置于日光灯下照约 l h,静止聚合。胶聚合好后,小心地取出梳子,用吸水纸吸去样品室内的水分,加入电极缓冲液。,返 回,四、样品的制备和点样,取2g 5d龄的小麦幼苗,剪碎后 放 人研钵内,在冰浴中匀浆,匀浆过程中加入4m1稀释4倍的浓缩胶缓冲液。匀浆液在5000g下离心10min,取2m1上清液与l mL40蔗糖溶液和半滴01溴酚蓝溶液混合,用微量注射器吸取0.05m1混合液,注入样品槽内。按同样操作提取制备水稻样品溶液,将小麦和水稻样品相间点样,点样量可有所不同。,返 回,五、电泳,加样后,向两个电极液槽内注入电极缓冲液,接通电源,并立即电泳。前
21、槽接入电源的负极,后槽接入正极。电泳开始后,电流控制在1520mA,样品进入分离胶后电流可加大到30mA,这时电压一般在100V左右,此后,维持恒流不变。当指示染料到达离凝胶底部2cm时停止电泳,电泳约需3h。电泳到时后,关闭电源,吸出电极缓冲液,取出夹套和玻璃板。用流水冲洗,借助水的润滑作用将胶平放入15cm的大培养皿中。,返 回,六、染色,将100m1酯酶染色液称取50mg醋酸荼酯,50mg-醋酸茶酯,100mg坚牢蓝RR(或坚牢蓝B),先用约5m1丙酮溶解,再用001mol/LpH50磷酸缓冲液稀释到150mol注入培养皿中,于室温下显色约20min,可看到桃红色的磷酸酯酶同工酶区带。弃
22、去染色液,用蒸馏水冲洗。同工酶带采用薄层扫描仪测定,可用5醋酸固定保存。,返 回,试剂与器材,一、试剂1凝胶贮备液的配制:各贮备液需于4下冷藏,由于过硫酸胺不稳定,因而应在用前制备。2电极缓冲液的配制:Tris 606g,甘氨酸28.52g,加蒸馏水配成1000 m1,pH 8.3,用时稀释10倍。,二、器材1 垂直板电泳槽 2直流稳压或稳流电源3医用注射器 4烧杯5量筒 6真空抽气装置7研钵 8离心机9培养皿 10剪刀11镊子 12滴管,返 回,返 回,A、B、C、D、E、F、G各贮备液的配制,返 回,返 回,注意事项,返 回,实验器材、药品,实验原理,实验操作,Fo1in酚法测定血清蛋白质
23、含量,原理,蛋白质浓度可从它们的物理化学性质,如折射率、比重、紫外吸收等测定而得知;或用化学方法,如定氮、双缩脲反应、Fo1in酚试剂反应等方法来求算。其中双缩脲法和Fo1in 酚法是一般实验室中经常使用的方法。它们操作简便、迅速,不需要复杂而昂贵的设备,又能适合一般实验室的要求,若作一般浓度的测定较为适宜。Fo1in酚法灵敏度高,较双缩脲法灵敏100倍。本实验采用的是Fo1in酚法。Fo1in酚法所用的试剂是由两部分组成的。试剂甲相当于双缩脲试剂,可与蛋白质中的肽键起显色反应。试剂乙(磷钨酸和磷钼酸混合液)在碱性条件下极不稳定,易被酚类化合物还原而呈蓝色反应(钼蓝和钨蓝混合物)。由于蛋白质中
24、含有带酚基的酪氨酸,故有此呈色反应。因此,用Fo1in酚法测定蛋白质含量灵敏度较高。所测蛋白质样品中若含酚类及柠檬酸均有干扰作用。浓度较低的尿素(约0.5左右)、胍(0.5左右)、硫酸钠(1)、硝酸钠(1)、三氯乙酸(0.5)、乙醇(5)、乙醚(5)、丙酮(0.5)等溶液对显色无影响。这些物质浓度高时,必须做校正曲线。含硫酸铵的溶液只需加浓碳酸钠氢氧化钠溶液即可显色测定。若样品酸度较高,显色后色浅,则必须提高碳酸钠氢氧化钠溶液的浓度12倍。另外,此法也适用于酪氨酸和色氨酸的定量测定。本实验以血清为材料,测定血清的蛋白质含量。,返 回,操作,一 标准曲线的制作 二 血清样品的测定 三 计算,返
25、回,流程图,比色测定,加Folin-酚试剂乙,加Folin-酚试剂甲,加标准酪蛋白,试管准备,一、标准曲线的制作,取12支试管(平行两份),分别加入0,0.20,0.40,0.60,0.80,1.00ml标准酪蛋白溶液(500gml),用水补足1.00ml。按顺序向各管加入5mlFo1in酚试剂甲,混匀。室温下放置10min。再依次向各管加入0.5mlFolin酚试剂乙,立即摇匀,在30保温(或室温下放置)30min。然后,在500nm处,在724B型分光光度计上进行比色测定,多测几次,并取其平均值。以光密度(OD)为纵坐标,以酪蛋白溶液浓度为横坐标,在方格坐标纸上作图,绘制出酪蛋白的标准曲线
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