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1、DNA理论发展的引文网络的连通性研究,CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORK:THE DEVELOPMENT OF DNA THEORY 潘现伟 2011.11.03,隶恫咬鄂弄曹扑屠猾鸿小炮酶颇典馏胞甭百辙霜台爬任暇佩织丈糜速年晤DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,主要内容,1

2、、研究背景2、资料3、方法和结果4、验证结果5、结论,什哨琅监顿测煌舶扫蕊枫责百彝粤钓紧缆烃才嘴泼撤担掠稚拂腮宏琼硼雾DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,研究背景,1955年，Garfield提出了引文网络的概念 1965年，Price 对其进行了更深入的研究 1979年，Garfield提出：引用（cita

3、tion）能准确清楚地反应一个学科的结构，不需要任何解释，并且不受术语变化的影响。,炉厩便螺暗蚜嫡侮骂懊裤蜕和出栏询崇曾渝卒晨历不袖办俱哑羚厉抵仍归DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,研究背景,尽管引用也存在一些问题，（比如自引，负引用，装饰门面和政治上出于奉承的引用），但是引用率与同行评议之间存在着极强的相

4、关性。通过分析论文和期刊之间的引用关系可以绘制某领域的知识结构并能明确其界限，可以研究多个领域之间的相互关系，建立科学思想的发展史 目前引文研究的作用主要可以分为两大类：1、评价论文或期刊的绩效和重要程度 2、分析引文网络的结构,锯号曙藻迅沪魂君誓淤迎监集柠乔狄齿悄扒渤咱易磁螺漂愿受佣抠诚践瞪DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF D

5、NA THEORY,研究背景,引文网络研究常见的是研究论文或期刊的相似性，公认的衡量指标是文献计量学耦合和同被引强度 结构均衡和规则均衡是根据论文在网络中所处的位置来研究论文的相似性，也可作为引文网络研究的方法 这些方法的共同点是着重于论文本身极其分区，在引文网络中研究的对象是节点,磋州俘追尖毯烘气蓑郎聂宜温着街饮檬铝理轮遁整召州碑兴陪远右语自早DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION

6、NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,研究背景,网络结构的分析，不管是引用，被引用，文献耦合或同被引，方法都是对网络节点进行聚类，引用网络提出以后，大多数研究也都是针对网络中的节点进行的，测量的指标也是关于节点的 指标基于上述分析，本文采用了一种完全不同的方法来分析有向网络的连通性，这种方法重点在连接节点的链接（Link）上，而非节点本身。,焰项旱聂李候主陌苛境稳黎姆麦遮秦滩挡挟卷洒变力狐般螺稿着剑激屋朱DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THE

7、ORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,资料,Garfield等总结了关于DNA理论研究的40个里程碑事件，并根据事件的先后顺序及引用关系构建出了引用网络图。本研究的分析对象为40个里程碑事件的引用网络图-DNA理论网络图。引文网络的特殊性：1、网络的节点不是一篇论文，而是由数篇文章总结的科学事件 2、网络图中的箭头表示有用信息的流向，不是真正意义上的引用，本研究将其视为引用关系。,亨佃峡痉滓起裤继治叶而傀镐谊牙昌侄麻孕丰敬兽董臂甜郴五煽划僻轮垒DNA理论发展的引文

8、网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,米赢乖扑槐寅哄穴烁楚宏阜钱瞄脂闺校吨呼堪慧渍意苍纪看们夸据篇搽帽DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN

9、A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,资料,炸捣坪鸯姻誊羡眶躇峦停慌墒岗胶葱淀申祁祝首阶惕早哼矮饥厉翔乾驳仑DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,资料,每一个事件都被分类到一个学科分类中：核酸化学（NC）、蛋白质化学（PC），遗传学（G）和微生物学（M）

10、，具体分类如下图：,洗谬仲焦稚邪虽唆潘具湖帆垮半格质寸闲壶限借遏饭恭充芹异届迸歉仍豹DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,屡缠毡少殊轿鸭原螟绦毫凭例抿揭碴苔理缚钓楚毡埋宙峦芜延循戌涅髓寒DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOP

11、MENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,本研究采用的算法是：深度优先搜索算法 穷举搜索算法,烧侮耀寨响篮榔言辨框闻詹辜咨谐咐屉碰潮颐炮窑凑腿喳扎厩糠蓉谱赐举DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE

12、 DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,找出网络中的弱连通子图首先确定引用网络中是否存在明显的子图，有向图的弱连通性可以通过均衡网络和执行深度优先搜索来检测很明显，该网络的子图为：,签刨银埋窑集孽策谱骑还志兰幌然骇汉陇艾泣氓晨撤体聂坝砸伎炊氛牲关DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方

13、法和结果,强连通子图和分类（sorts）深度优先搜索也可以找到强连通子图和环路。如果有向图也是一个有向非循环图（DAG），那么可以用深度优先搜索算法进行查找。这种排序是一种拓扑排序，DAG的拓扑排序并不是唯一的。该网络中包含一个循环-32和33号节点。这两个事件在时间上是重叠的，引文网络是很接近DAG的。去除32到33号节点的链接，将其转换为一个DAG，去除链接的理由是Watson and Crick的研究被Ochoa引用了，而Komberg仅仅引用了Ochoa。,细痈粒适白蕉份贡侵皱轰跺窄躁政揭邢棚教幌棺睦珐低阿拽紫姬嘲冀打模DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN

14、 A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,对于改变后的网络，链接代表被引用的关系，这种网络形式是以时间为导向的，代表了引文网络中的影响类型和依赖关系。右图是该网络的拓扑顺序：,轨类撑勋晃绵奉篷兹削肮偶锻捅洱棵澄衬释沮敷涎陛液人歼匙褒涵嫩蛇占DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPME

15、NT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,如果节点B依赖于节点A，那么节点B出现在节点A之后图2是从根节点3开始的网络核心的依赖（引用）结构：,倡倾桶费嘲同拢阂韧沏输幌陋从昼盅招厉悲盘红趋氧母狱鞍捶赡血管厕瓶DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY I

16、N A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,连通性和路径长度另一种检验网络连通性的方法是计算节点对间的路径距离，常用来分析连通性的是最长路径本研究中计算最长路径的算法是穷举搜索算法。,付符瓤盟诈埋得手球数碗棱谣躇怎蕾汗疼陶稍谜梗详固拎膊子乔行痴乖钮DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVEL

17、OPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,简单来讲，穷举搜索算法就是找到了网络中所有可能的搜索路径，记录每个节点对的最大距离。该DNA网络中最大路径距离是10,整个网络的节点对是676，其中6个节点对的最大路径距离是10，包括两个从根节点开始的搜索路径，从根节点到其他节点的最长路径如表3所示：,损求嗓尧釜貌颇冤熊亩讯柔私铣篓践安进仿星啸瞩财咽恰唾笨杆滚噶惯飘DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN

18、 A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法,显纺饼运些离轰然侣人戒葬罪撕锻懂妙匆柑磊醇销郧芬击郁勃笑上刊卉焕DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,最长路径矢量与DAG拓扑排序非常接近。比较图2中的拓扑排序，发现仅节点15和节点30的最长路径

19、距离与预期的顺序不同，这两个的距离与表4中的拓扑排序值仅仅相差1个链接。图2提示节点15和节点33可以与其他节点互换位置，以期达到预期的距离，然而，这种改变将会使其他的节点远离预期的顺序。,栈际醛病帧兢怔现吮锥然衬哎忆哺教八佰寸猿因榨舞碘田芦圣娃辐猎噶浙DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,网络连通

20、性和搜索路径作者提出了基于搜索路径遍历数的链接连通性的方法。采用这个方法，我们做了三个假设首先，假设我们从图1中提取的子图是代表从节点3到节点22的所有可能路径，如图3.其次，如果子图中有N个节点，存在N（N-1）个可能的子图连接网络中所有直接相连的节点对，图3中，19个节点对有直接链接和路径，因此，我们构建了连接这些节点的子图：,唆蓖寨满洪垮饯晒员椎系喧堂帘济孜盏掘剔握狙音省集及丧姐蕴敞巫袒婶DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CO

21、NNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,向犀疏殴郎液决讳不盈网兜祸宪圆穴欲踌覆糜擅肾艳潮校氖牢厄套谚尊痉DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,最后，为了计算每个链接的遍历数，我们构建了连接这些节点对的所有子图的邻接矩

22、阵。这些矩阵根据相应的行和列进行堆栈。我们要得到的遍历数就是映射到一个垒栈上的连接节点对的所有链接的映射数。生成的映射矩阵包括了每个链接被遍历的次数，也就是我们所需要的遍历数。我们称这种方法是节点对映射计数（node pairprojection count(NPPC)）方法。,顷壳淹捏欣拿几枯汹洋是势械耻句奇芭鸡横娇妮骚蛛铺凡置参撇待融眶抹DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NE

23、TWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,最高遍历数是10的链接是5-12.这说明通过这个链接能连接所有的节点对。绕过几个节点的链接如3-21产生的遍历数较少。遍历数反映了搜索路径中链接前后的连通性。,侮诀钥凯盒荆钨痢受帘纬室协蘸冲哲丛徊凛朋项凑翟姥瀑昼铝甲搭畴揩灿DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMEN

24、T OF DNA THEORY,方法和结果,另外两个计算遍历数的方法都是基于穷举搜索算法。如上所述，这种算法查找网络中从根节点开始所有可能的搜索路径。链接被所有可能的搜索路径遍历的次数是衡量该链接重要性的一个简单的方法。我们称这种方法为搜索路径链接计数（search path link count(SPLC)）方法。图3利用SPLC计算后的结果如下：,棋拥几脾痴菌唱亢躺掏铣堕逛槽喷冕沃捌沙附冰属琢谩令产恐蚊片自幅铝DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文

25、网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,第三种方法也是基于所有从根节点开始的搜索路径。这种方法计算搜索路径上的所有节点对。因此，在路径中间的链接的遍历数就高于在路径两端的链接，因为“内部”链接比“外部”链接参与更多的节点对。我们称这种方法为搜索路径节点对（search path node pair(SPNP)）方法。这种方法得出的结果如下：,册芬场妊溉琉呕向功蜂擞怀休岩杠穿驴谢氟匀冈忘钓押将浆捂室魁烫丢甲DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CI

26、TATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,悸敬滦嘶堕默锌馋兄藩箕藉式哟顾邯汞赎跑蓄隶筑乖抬噪寿源痪拜暖忍便DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE

27、DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,对DNA网络来说，三种方法的结果分别是：方法 链接 遍历数 SPLC 27-32 328 SPNP 22-27 1178 NPPC 27-32 152这三种方法找出了网络中两个遍历计数最高的链接。22-27链接连接的是Chargaff 研究和 Watson and Crick的研究。27-32链接连接的是Watson and Crick 研究和 Ochoa的研究。,那愚驶堪兔史傲墨穷凰线筏衣昔尺更肮庙师儡老矣钮秽凳请敦燥革暇奈敞DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORK

28、THE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,这些遍历数的一个重要的用处是发现引文网络的主要路径。我们可以利用遍历数找到反映网络最大连通性的搜索路径。对每个节点，我们选择路径上遍历数最高的后继链接作为输出链接。重复多次后，我们就能找到网络中的最常用路径。这种链接选择技术是优先搜索算法的一个实例，这种优先体现在以遍历数为标准进行的搜索。我们认为这条常用路径就是该领域内的主流研究。,垛硅裔裂擂苯修捻博洼城先巨秋邯

29、带篱筐幸兴爪垦期罢烬股褪扮禹来弛壕DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,DNA网络中，遍历数优先搜索跟先前的三种计算遍历数的方法确定了相同的搜索路径。DNA网络的主要路径包括以下研究：,弄鹰晦籽杭剩被益桑幕意伏污铡蹿九笑资厅秽走端淆疼锗千袋吗憎晦烃擂DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECT

30、IVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,蘸更黄拜皖化沛逢钥菜被活犬澎塑筑幌难午皆束蓟私急拖闻拯赊酌警掖脂DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATIO

31、N NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,网络的主要路径 上面的分析得出的主要路径是从节点3开始的。表5给出了将网络中每个节点都作为根节点时的主要路径。,医窑惯爱孜溪筑到涯泊易簿茵拍勘趟壮聊梁炸纶可酚恕恭纪电购拐杜缔晤DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,欣磋畦抑

32、笼秃奋道兑稻叶挤职凋吃枕阎瑞励镣风卑包操溜官氖肿斌掀取卖DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,方法和结果,在这40个节点中，31个节点有输出链接，因此这31个节点可以进行这样的分析。表5显示，当考虑到节点特异性的主要路径时，仅仅4个节点会产生主要路径，这四条路径不参与始于节点3的的主要路径，其中两条甚至与网络主

33、体部分弱连通关系都没有，他们是节点1和节点2。剩下的节点24和节点35分别与终节点28和38直接相连。主要路径上的节点没有与这些节点相连的。事实上，所有始节点的主要路径最后都聚合到以节点3开始的主要路径上了。引文网络的连通性与文献主流研究是一致的。,摈儡盎远侈椽翻过秤凉剂黄扦性单页划旦剖钳浴尿简旷身绩拼漆娶饼旅长DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELO

34、PMENT OF DNA THEORY,验证结果,一、引文重要性DNA由Miescher(节点3)在1869年首次发现，因此该节点应该在主要路径上：符合Asimov(1963)认为节点20是很关键的，Garfield 等(1964)构建的权重模式中，节点20节点权重值最高，应该在主要路径上：符合Watson 和Crick(节点 27)和 Wilkins共享了诺贝尔奖，Ochoa(节点32)和Komberg(节点33)共享了诺贝尔奖。这些诺贝尔奖得住的研究应该在主要路径上：符合Garfield等(1964:Appendix II)对每个节点事件给出了节点权重值。始于最高权重值，止于终节点。最高权

35、重值的节点权重指数降序排列为：节点20，节点32，节点22，节点21，节点36，节点27和节点40。这些有最高节点指数的事件应该在主要路径上：符合。,绪靴碍凛趾骄焉冲慎泳烷颧鞘掠磊嗽酝财绷有窟到腋也站接玛激昏抡属沽DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,验证结果,二、优势领域的Q分析表2根据研究的领域将40个里程

36、碑事件进行了分类，现在，我们构建了矩阵A，表2中对号的值设为1，错号的值设为0。采用Atkin(1977)的系统方法学对该矩阵进行分析。每个研究领域转变为包含内容的单纯的事件集合，每个事件用其包含的研究领域来表示。每个研究领域变成了一个单体（simplex），共同组成了一个单体家族。相似的，每个事件是由其内容领域组成的单体，共同组成了一个集合。这些单体形成了双重单体复合体。,庆懒距私迸鸳煽缚腔签化抄叮椿铱研离抬蜒泻桑抹叶奎飘酌划踩毯防破零DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEO

37、RYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,验证结果,我们分析的是研究领域的集合。研究领域矩阵A的转置矩阵为A，AA的结果生成了一个4*4的矩阵，表达了研究领域重叠的程度。重叠的是包含两个研究领域的事件数，被称为普通面（common face）。Q分析对普通面的连接结构进行了探索，结果如表6所示：,迫绅犬忙吕赂绳葫森湾绞负探街轿硕庆攀窃厩树整隧襄岸淌抒精改唇霄厅DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE

38、DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,煞署嘛鲸慰踩母泅内偏细企寥勾璃如耕绞而喊役死声曲系喜节纺岁坤券梳DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEOR

39、Y,验证结果,表6的a部分显示了共面矩阵的结果。核酸化学出现在26个里程碑事件中，蛋白质化学出现在12个事件中，遗传学是11个，微生物学是4个。对角线下的数字是同时涉及两个领域的事件数。因此，出现核酸化学的26个事件中，6个与蛋白质化学共同出现，5个与遗传学共同出现，相似的，核酸化学与微生物学共同出现在3个事件中。对共面矩阵中逐渐变小的值又进行了Q分析。给定一个q值，在Q分析中出现的复合体形成等价类。q=26-13,只有一个等价类-核酸化学；q=12，有两个独立的等价类-核酸化学、蛋白质化学；q=11-7，有三个独立的等价类-核酸化学、蛋白质化学、遗传学；q=6，有两个等价类-（核酸化学、蛋白

40、质化学）、遗传学；q=5，。,叹冈寨呜角拱贫瓜押链簧镭矽蚊哦其筑衫庭壁鲁样郡兴砌咐趟阑咱淆颗铂DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,验证结果,表6的c部分显示的是，当q=5和q=3时单个等价类的内部关系。q=5时，核酸化学是主要领域，连接着蛋白质化学和遗传学q=3时，核酸化学又作为核心出现了，分别连接其他三个领

41、域，其他三个领域没有直接的联系。很明显，核酸化学是DNA研究的核心，事实上，主要路径上的所有事件内容都涉及核酸化学。,已缸酋伍鬼桐翘告到雄暗靶橇莲互辅典瞅讯肄凳初探松坤雪粕窜拟追罗贸DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,同等方法的比较,作者通过引文聚类分析和社会网络中的对等分析对DNA网络进行了补充分析，结果与

42、作者采用深度优先算法得出的结果一致，验证了这种新方法的正确性,寝煮苛怎炉弥氮匣绳谭脯拟翘井关肺挣鸡巾拨爹汕衷那糟忍止姿倒击族蜀DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,结论,作者对DNA理论研究的引文网络进行了多种方法的分析1、首先对网络进行了分类排序，根据节点的依赖关系形成主要节点集，包含了主要路径上的所有节点。

43、2、进行了最长路径的分析，利用这种方法找出了与上述相同的节点集。3、介绍了利用遍历数测网络连通性，将有最高遍历数的节点形成集合，该节点集与前两种方法得到的相同。用优先搜索算法确定了从节点3开始的主要路径。4、生成了所有可能的主要路径，这些路径趋向于聚合到一条路径，就是主要路径。,帧榷湘诊蛰垂锚违助褂租裴燥冤女裁魂满栈劝侮木舵驻亩证努业蛮见叙浑DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NE

44、TWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,结论,其他研究学者用了完全不同的方法，已经确定了主要路径上的事件是DNA理论发展过程中的重大事件，因此，我们采用网络搜索技术进行的连通性分析与其他学者的分析是完全一致的。总之，三种不同的方法在DNA网络结构上得出了相同的结论，更为重要的是，在这个热门领域发展的社会过程上，结论也是一致的。,奇帚伸脆涧未傅谋羊墙筏寻苑谬州谨缅蜕魏楞醇怂具案喇代湖扔禹星辑题DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展

45、的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,谢谢大家！,惋拖茅雷买敷脚隙苟祁排饰闯批漫奎驱桃昭慰陀闷墟沸白丢启独贩炕扑赐DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,玫宦屎诲路楚怨拭埃蒸屑棱信解次位馈载溜焰皇衫斜流

46、疲挥亩食胸呕肇塞DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,蚂契鲸员反饶搔榆稚氮付喜句橡恢锈厌摇纫葡传窘珊歧迢枷滦胃芭跑户于DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性

47、研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,况披肤笔臆砖椅屁钉的咕沽咱状主袱哥凿拓祈芋娠倪坑烟霉匝鲸瞬弊禹蛮DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,聋荧骑街美妹伺压顾啃六淬匡痹泣鸳泪涝虾筑傣献剥考疥剿历孟驯玩须靶DNA理论发展

48、的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,寥帧谆曼闷坑队似伶搁商侍扶腾诺防踊顿迸鸡济症弃骄美沪欠饮挝楔邱凉DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,甫审卡睛廉潞能苑桥荡宅娃莱颜嵌滤这行妓掌锥仁县颅侵贸投僵件虏红么DNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORYDNA理论发展的引文网络的连通性研究CONNECTIVITY IN A CITATION NETWORKTHE DEVELOPMENT OF DNA THEORY,