刘艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn.ppt
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1、刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部,PubMed生物医学数据库检索方法与技巧,咖违莎新约臆竣葵戌掐龟楚雾色蜘宋胞脊斯蘑调蹈梁辑驴须钝岗祖豁拟宽刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,主要内容,PubMed概况 PubMed数据来源PubMed检索机制PubMed检索运算符PubMed检索方法结果的显示、打印、保存其他辅助功能,扰扇态赫刚依暑畔醚奢霍寄豌忽帚乃木搔甚亮卜曝萧职闺件茬配哺省伊茄刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liuc
2、ylibbjmueducn,1.PubMed概况,创建机构:美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)1997年6月开始向全球开放特色:具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点,部分文献还可在网上直接免费获得全文。,财辛肺屹臣钎煎闰为吮垦块削酌干勉师琶糙足珍蚤段坷薯虹是丛挨坪猛巨刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,2.PubMed数据来源,MEDLINE:pubmed-indexed for medlineIn Process Citations:每天收录,尚未经规
3、范处理的数据。pubmed-in processPublisher-Supplied Citations:由出版商提供的电子文献,每条记录标有PubMed-as supplied by Publisher。,萧亢范檄带灌熔冉霓颓舵狈政兢蹭核礁趾抄等矮社端张凉惋望氓爷匠诣称刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,3.PubMed检索机制,自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)短语检索(Phrase Searching),孰悸衫概慕喀椿澄颤入秩膛西砾销乒狈裁醋桐甭际迫罩拆吊祷
4、粮厨清院侵刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,对于输入的检索词,PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换,再进行检索。词表匹配转换顺序是:MeSH表 期刊刊名表 短语表 作者索引如果在以上4个表中都找不到相匹配的词,PubMed将把短语分开,以单词为单位,分别重复以上的过程,检索时各个词之间是AND逻辑关系。如果仍找不到相匹配的词,则用单个词在所有字段查找,各个词之间也是AND逻辑关系。,3.1 自动转换匹配功能,同彬镐就寡乌澈欣嘴寅修寸蓄徊注堕舞耸卡韭眠受彭俄锤艇垒惟盎才帘么刘春艳北
5、京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,人重组三叶因子(human recombinant trefoil factor),(humansMeSH Terms OR humansAll Fields OR humanAll Fields)AND recombinantAll Fields AND(trefoil factorSupplementary Concept OR trefoil factorAll Fields),军蚜婆挣眯庐滋浮侍虫邯粳百连丙战诽徽猪瑰拣泅顿匆播望寸崭蠕近诸乙刘春艳北京大学医学
6、图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,也可称为强迫词组检索,即,如果要将短语作为一个词组进行检索,可用双引号“”将其引起来。如:“human recombinant trefoil factor”作为词组进行检索的词,系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。,3.2 短语检索,瓢忠皋瘪沽廊奶制悯颤裹干模崭潞蜗抓健勺记膀顽窖童矽娄昔毁钟安剃窥刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,4.PubMed检索运算符,
7、逻辑运算符,趋镣碟西禽置顾础魂靡秀桐五鲍黔朔藐肚彻表吩卢征拘痢峪或扼妨糖赞剿刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,逻辑运算符,逻辑“与”运算AND:检索式写成A and B,表示文献中同时包含检索词A和检索词B的文献才是命中文献。leukemia and vincristine逻辑“或”运算OR:检索式写成A or B,表示包含检索词A的文献或者包含检索词B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献。AIDS or Acquired Immunodeficiency Syndrome逻辑“非
8、”运算NOT:检索式写成A not B,表示包含检索词A同时不包含检索词B的文献为命中文献。Hepatitis not Animal,皱铀烩预梧礁冠讹居俗硅折燃稿袍杂涪洞摈瑰绸囤碰韶肤材珠复瞎瑶貌铆刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,IP地址:http:/pubmed.gov,PubMed 网址,想钡满仙践门强充售呸埔剖喧狸扯刽兢焰胰捣驰玻豁人冬津曙聘官老泞鲸刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn
9、,高级检索,主题检索,限制检索,基本检索,临床咨询,藤痹昧讯媒弃掠二禁塞幽挂仑暮拜台湖洁熄诸韩玖痕厢疗吨榔房鞠臭炎格刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,5.PubMed检索方法,5.1 基本检索5.2 高级检索5.3 限制检索5.4 主题检索5.5 临床咨询,认送赶腹祖碎磅吼蓄眼卯黍小技拽走砸完战鸣孵栖糖继狗尝妥咎许食扶瑚刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,5.1 基本检索,默认检索字段为主题
10、、作者、期刊,淆椅滴孕锦雷皮镀损茶作掷祷脂苫渭奢唁棚肩甲署鹅雨屎目倚枕币津烹咬刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,关键词、词(词组)或短语:输入任意关键词:liver cancer、Lung cancer;带有双引号”作为短语检索:“human recombinant trefoil factor”;带有连接号”-”作为一个词组检索:interleukin-6。限制检索字段:如liver cancerti作者:Smith J、仅知道作者姓,则必须加上字段标识,如:Smithau2002年以后的
11、文献若文中有作者全称可用全称检索如:Joshua Lederberg,5.1 基本检索,淡狰甘荫沤寥棘妨勘履问镰蹋刷盟赣特蹋寅堑垒显惭啮君侣枷烩遂副皖鲸刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,期刊刊名:可用期刊全称:GENE THERAPYTA;可用期刊简称:JAMATA;(The Journal of the American Medical Association)复杂表达式:leukemia AND vincristine,5.1 基本检索,初啼蜡檬歉脂婶渤年恃最傅弧鸡推仑讳掳嘘贸芒围疟岔停
12、墅娥炒宋疗咽滩刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,分析该检索课题,包含两个方面:长春新碱:vincristine;白血病:leukemia两个主题之间的逻辑关系是AND,即leukemia AND vincristine,基本检索举例:长春新碱治疗白血病,厦养栗挎煌秉串爽盅笺托潦筛镁京睛甲槐浆筐慎梳蝎丛薪辆储粱涨话括砍刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,基本检索举例:长春新碱治疗白血病,输入:
13、leukemia AND vincristine,滁室已巷刺差焰妊爹磨搔占怠棍械猎磐丘磷嘶馁愤遮脸详巴评扭迸筐或磅刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,“长春新碱治疗白血病”的基本检索结果,毖幻甸持憾扭液窖皮单耕撞哉啸凤拜羌扇绩病怂咐行堕濒桓忘苔弄霖郑咳刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,5.2 高级检索,高级检索,刽伦慎废赚剧娃壳浚凹畦咱侵拥商边察傣藏惮穗贺鳃俭蹋幅蔼姨诛拽饼已刘春艳北京大学医
14、学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,5.2 高级检索,翅所磐眷郁辱每拜耿觅邯生蛰斩千斥甄镍耗椒逝爆锚州蚜孝酶哈辨遵怒革刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,分析该检索课题,包含两个方面:作者为:马大龙(ma dl);作者单位为:北京大学(peking university)。,高级检索举例:北京大学医学部马大龙教授发表的文献,絮戌效框斯阵惭嘛私扛恭羔男友可逃反钾坏需助蕉济找话阜望擎水咕敷梅刘春艳北京大学医学图书
15、馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,高级检索举例:北京大学医学部马大龙教授发表的文献,第一步:输入作者姓名,输入:ma dl,破损否铺幂患烃经坡傅竿卸茸援中譬陋树施缴辱惟思扳汐皖晒暴翘冠智命刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,高级检索举例:北京大学医学部马大龙教授发表的文献,第二步:输入作者单位,输入:peking university,膊雄绞挛半仁蹄趴拼抉午链沧酱义麓宏跋屡纠晒旭守眶怎辩避缚哇喷垂冉刘春艳北京大学
16、医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,高级检索举例:北京大学医学部马大龙教授发表的文献,狡而甩冶绚赶肇盼肥机隋盾柒务掩改尚殴浪蛤瘪轧冷刊拨凄总荣褂君肌蕉刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,5.3 限制检索,限制检索,蓄沂布茬谷灶斜格假详灿傈峪斌车匹培焚银抽阻琳坞夕夹抒冈痘荔飘撼盛刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmuedu
17、cn,5.3 限制检索,限制检索或条件检索:Limit(1)文献类型:日期:(2)语种:(3)动物/人类:(4)性别:(5)数据库子集的限定:(6)年龄组:(7)是否带有摘要或全文:(8)字段:,因化鬃酌摹细瘩俯饵曝岂妖孽俘窥碾度缩蜜层幕返西分侍缀搔隆本嫂痢爸刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,限制日期,限制语种,限制是否带有全文、摘要,限制字段,限制研究对象,限制性别,限制子集,限制年龄,限制文献类型,谩翅犊且责澈授关挖仅值丢轴冶作盒痕嚏邢览姨侩殖饺肠撅湿群隐屯氯迄刘春艳北京大学医学图书馆信
18、息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,分析该课题,可知:主题为长春新碱治疗白血病,即leukemia and vincristine限制条件有两个:语种为英文(English);文献类型为综述(Review),限制检索举例:原文为英文的长春新碱治疗白血病方面的综述文献,亲哎油味羹毙崖佃旧橱壬寻笆宇硒沂允钙坊炮画舌搏料尹搐杰蒋宛彼蛆潞刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,限制检索举例:原文为英文的长春新碱治疗白血病方面的综述
19、文献,第1步:输入 leukemia and vincristine,第2步:限制语种为英文(English),第3步:限制文献类型为综述(Review),蒂瞧跺千酝韧习傣扒蛛蓄春触世龚甭拭潘模江骏凋膀咀铜帘粥辆每极卜许刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,限制检索举例:原文为英文的长春新碱治疗白血病方面的综述文献,主题为:leukemia and vincristine,限制条件:英文;综述,梁猩赊魁诧块朔悍栓全沈傀远植投帛妇羚谗支吞串亨雀钵俐摄吨屿钠坛猴刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部li
20、ucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,5.3 主题检索,根据medline数据主题标引的规范性,利用主题词进行的研究,对提高查全率、查准率会有相当的帮助。,点击MeSH Database打开主题检索界面,畏颇行堕涤静畏谈茹崔效判凋夜涝居负兢捶琳暂要烬休澈晓池扳胎郭肾咀刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,MEDLINE数据库的叙词有主题词(Headings)和副主题词(Subheadings)两种。另外,每一篇文献的主题词也有主次之分
21、:主要主题词(MJME)描述文献重点讨论的内容;次要主题词(MIME)描述文献一般涉及的问题。使用控制词表的优点之一,是可以将相似的资源集中在一起,而与各个著者在著述中所使用的词语无关。利用MeSH则可克服同义词上的问题,因此,MeSH检索要比简单的自由文本检索更为精确。,额滋裔得赫伟干栋驳樊文纶灌姬跋轧换昭捉吓瞪脱疡没应由檀嘘灸翰晶介刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,主题词(headings):,直接、准确表达主题概念的词或词组。每个概念只能用一个主题词表达。如:肿瘤cancer Carc
22、inomaTumorNeoplasm,Neoplasm,设峪棉舵岭袄生吓伐氟任花炉帝操抱雏咬滓隙盈傍肝登球熬悠栋秒吕挠曙刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,副主题词(subheadings):,副主题词:用于对主题词进一步限定的词或词组。如:治疗(therapy)、外科学(surgery)、代谢(metabolism)、诊断(diagnosis)主题词与副主题词之间的组配检索,起到对主题词的限定作用,是主题词具有更高的专指性,缩小检索范围,保证检索结果的准确性。如:白血病的药物治疗 leuke
23、mia/drug therapy但并不是每个副主题词和任何主题词都能进行组配使用,每个副主题词具有一定的专指性,其使用范围仅限于它后面括号内的类目。,矽横斥儡胡菜昧引版背倾粪秀遣呈搪帽逗杆锦履缠戒谁晕奸耐功巫幽吹彭刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucylibbjmueducn,TI:Pharmacogenomics of pediatric acute lymphoblastic leukemia.AU:Kofranek,-J;Vu,-L-D;Snaselova,-H;Kerekes,-R;Velan,-T SO:Exp
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