医学文献检索-循证实践的基础-BASIC.ppt

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1、医学文献检索 循证实践的基础,张俊华 商洪才,2008/04/03,天津中医药大学循证医学中心教育部循证医学网上合作研究中心天津分中心天津中医药大学中医药研究院临床疗效评价中心,天津中医药大学循证医学中心,2,主要内容,文献检索的重要性医学文献数据库简介 检索策略的制订循证医学信息检索举例,天津中医药大学循证医学中心,3,文献的重要性,子曰：“夏礼，吾能言之，杞不足征也；殷礼，吾能言之，宋不足征也。文献不足故也。足，则吾能征之矣。”论语八佾,天津中医药大学循证医学中心,4,丰富的医学典籍，是中医学的宝藏,天津中医药大学循证医学中心,5,信息的重要性,您写过综述吗？填过标书吗？做过实验吗？发过文

2、章吗？无论哪一种，都离不开文献/检索,文献资料是科学研究的“成炊之米”，无价之宝；是进行科技决策的依据去重、纠错、指导、预测,天津中医药大学循证医学中心,6,信息资源,文献来源：报纸、教科书、杂志、会议文集、学术论文、网络、专业数据库正是在网络技术，数据库技术广泛应用，成为循证医学快速发展的条件。,天津中医药大学循证医学中心,7,天津中医药大学循证医学中心,9,医学文献数据库简介,天津中医药大学循证医学中心,10,天津中医药大学循证医学中心,11,医学文献数据库简介,印刷版、电子版,天津中医药大学循证医学中心,12,中文数据库简介,中国科技信息所,天津中医药大学循证医学中心,13,英文文献数据

3、库,天津中医药大学循证医学中心,14,CNKI,天津中医药大学循证医学中心,15,CNKI简介,天津中医药大学循证医学中心,16,天津中医药大学循证医学中心,17,天津中医药大学循证医学中心,18,简单检索,天津中医药大学循证医学中心,19,天津中医药大学循证医学中心,20,天津中医药大学循证医学中心,21,天津中医药大学循证医学中心,22,天津中医药大学循证医学中心,23,天津中医药大学循证医学中心,24,CNKI-高级检索,天津中医药大学循证医学中心,25,天津中医药大学循证医学中心,26,天津中医药大学循证医学中心,27,PubMed,天津中医药大学循证医学中心,28,简介,由美国国立医

4、学图书馆（National Library of Medicine-NLM）国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information-NCBI）向因特网用户提供免费MEDLINE检索服务(1997-6-26)检索服务具有收录范围广、内容全、检索途径多、访问速度快等优点。,天津中医药大学循证医学中心,29,二、PubMed收录范围（1）,（一）MEDLINE 全世界70多个国家和地区的4800余种生物医学期刊 自1966年至今数据1400万余条 内容每周更新一次，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和前临床科学等。标识PubMed

5、-indexed for MEDLINE(二)OLDMEDLINE 1950 年到1965年全世界生物医学期刊 目前数据大约200多万条 标识PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966（三）In Process Citations 1996年8月开始增加该数据库，只提供基本的引文信息和文摘，每天更新，经过标引以后进入MEDLINE，并从PreMEDLINE 中删除这些记录。标识MEDLINE in process,天津中医药大学循证医学中心,30,二、PubMed收录范围（2）,（四）Publisher Supplied Citation 接受出版商提供的文献数据，这种数据带有

6、MEDLINE record in process的说明，其标识为Record as supplied by publisher。每天都在不停地向In Process Citations数据库中传送，但其 中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将 永 远不会被In Process Citations或MEDLINE条目所取代(例如 在综合性的科学杂志Science或Nature上发表的地理学 文章)，其标识符有PubMed-as supplied by publisher 或 PubMed。先于印刷版的文献，其标识为Epub ahead of print,天津中医药大学循证医学中

7、心,31,目前每年增加60余万条文献记录,每周更新;英文资料占90，3/4有摘要;在全部记录中有76%的文献为英文；在2000年以来的记录中90%的文献为英文；收录中文刊60余种,概况,天津中医药大学循证医学中心,32,与MEDLINE的区别,收录范围广：收录MEDLINE未收录的部分生命科学相关的非医学专业期刊（物理、天文、化学等）收录记录新：在MEDLINE数据标引前的最新题录文献类型全：提供电子原文链接免费开放,天津中医药大学循证医学中心,33,一个或多个检索词，如自由词、主题词、人名等，系统默认空格为AND检索布尔逻辑运算符（AND，OR或NOT），但布尔逻辑运算符必须大写。字段标识符

8、紧跟所要限制的检索词，其他检索条件放在 后面字段限制检索:在字段标识外加 如 anginati若刊名与MeSH词表中的词相同，则需要用刊名字段标识ta加以限定。如：gene therapy，应输入 gene therapyta单个词的刊名也要用ta加以限定。如：scanningta作者名太简单，如jama，输入时用AU限定,基本检索规则,天津中医药大学循证医学中心,34,（二）截词检索功能 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如：键入“bacter*”，系统会找到那些前一部分是bacter的单词（如bacteria，bacterium，bacteriophage等），并对其分别进行检索。如

9、果这类词少于150个，PubMed会逐词检索，若超过150个，PubMed将显示如下警告信息：“Wildcard search forterm*used only the first 150 variations.Lengthen the root word to search for all endings”。截词功能只限于单词，对词组无效。如：“infection*”包括“infections”，但不包括“infection control”等。使用截词功能时，PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。如：heart attack 将不映射到 MeSH 词 Myocardial Infarc

10、tion（三）强制检索功能 允许使用双引号（“”）来强制系统进行短语检索。例如“Single cell”，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。使用双引号检索，会自动关闭词汇转换功能。,基本检索规则,天津中医药大学循证医学中心,35,字段标识符一览表,天津中医药大学循证医学中心,36,Nucleotide(DNA序列)数据库,Protein氨基酸（蛋白质）序列数据库,Genome(基因组序列)数据库，提供所有基因与染色体纪录与图片的查询服务，这个库中数以百万的基因序列是由庞大的基因排序工作得来的,Structure（分子结构模型）数据库，这个数据库保存的是由X线晶体成像

11、、NMR分光光度法建立的三维分子结构。,OMIM(人类孟德尔遗传学)在线数据库,Books(相关图书)可链接到相关参考书籍的文摘页,Journals(期刊)数据库,选择数据库,输入检索词,点击开始检索,PMC（PubMed Central）,特征栏,主页,天津中医药大学循证医学中心,37,可免费提供全文的生命科学文献,对公众提供临床科研的当前信息,毒理学数据库,连接到NLM提供的其他服务,购买原文（大约$5/篇）,为注册用户（免费注册）提供的检索策略存储空间，可以生成检索历史信息，并可以及时更新,为临床医生准备，关注于四个领域：疗法，诊断，病因，和预后,Citation Matcher-是一个

12、填空式的表格，允许用户通过输入刊物的引文信息来定位特定文章，特定一期内容，或者整个刊物的内容。,通过标题，关键词，标题缩写，或者ISSN号，在PubMed和其他Entrez数据库中检索期刊标题，还可以察看提供全文的刊物的列表。,可以在分层结构中浏览MeSH的词汇表,PubMed数据库的覆盖范围和刊物信息,关于PubMed系统更新和未来发展,天津中医药大学循证医学中心,38,作者AU,题名TI,来源SO,PubMed中文献的类型（状态）,收录情况,天津中医药大学循证医学中心,39,链接图标,天津中医药大学循证医学中心,40,简单检索,天津中医药大学循证医学中心,41,Limits限定检索,作者（

13、Author）：系统有提示期刊（Journal）全文（Full Text 或 Free Full Text）日期（Dates）人类或动物研究（Humans or Animals）文献类型（Type of Article）性别（Gender）、语种（Languages）、年龄（Ages）、文献子集限定（Subsets）自由词可以结合以上各种限定进行。,天津中医药大学循证医学中心,42,天津中医药大学循证医学中心,43,限定检索窗口全貌,天津中医药大学循证医学中心,44,添加作者检索,添加期刊检索,限定记录有全文、免费全文或摘要,天津中医药大学循证医学中心,45,限定记录有全文、免费全文或摘要,文

14、献发表时间限定,记录添加到PubMed时间限定,天津中医药大学循证医学中心,46,人类与动物限定,性别限定,天津中医药大学循证医学中心,47,文献语种限定,文献子集限定,文献类型限定,研究对象年龄组限定,检索字段限定,天津中医药大学循证医学中心,48,天津中医药大学循证医学中心,49,天津中医药大学循证医学中心,50,？,天津中医药大学循证医学中心,51,主题词,那么为什么要使用医学主题词呢？我们先来看个比喻，如果有人问你感冒了吗？你会不会回答“没有啦，我只是有点着凉发烧而已”呢？当然不会，因为你知道感冒就是着凉发烧。但一个检索系统，如果你不告诉它的话，它就有可能不知道这一点。在期刊中，对于同

15、一个概念往往可能有不同的描述形式，如Tumor和cancer都是指肿瘤。当一个查询者希望查阅肿瘤和diet(饮食)相关的文献时，他可能会输入Tumor，也可能输入cancer作为关键字，但其实这两者之间是没有区别的。一个愚蠢的检索系统可能就认识不到这点，而像PubMed这样的“智能化”检索系统就能够准确的意识到这点，从而不会造成检索结果的遗漏。,天津中医药大学循证医学中心,52,主题词,何为MeSH？MeSH其实是Medical Subject Headings的缩略词，即医学主题词，是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。NIH的工作人员按MeSH词表规定，浏览生物医学期刊全文后标引出每篇文

16、献中的MeSH主题词，其中论述文献中心的主题词称主要主题词（major topic headings），论述主题某一方面的内容的词称为副主题词。主题词检索法虽然稍嫌繁琐，但其检索结果的准确性高，遗漏率低，是最佳的检索方法，一旦熟练掌握，将使得我们的检索工作事半功倍。,天津中医药大学循证医学中心,53,天津中医药大学循证医学中心,54,天津中医药大学循证医学中心,55,天津中医药大学循证医学中心,56,天津中医药大学循证医学中心,57,天津中医药大学循证医学中心,58,天津中医药大学循证医学中心,59,天津中医药大学循证医学中心,60,天津中医药大学循证医学中心,61,天津中医药大学循证医学中心

17、,62,天津中医药大学循证医学中心,63,天津中医药大学循证医学中心,64,天津中医药大学循证医学中心,65,天津中医药大学循证医学中心,66,Details：显示计算机响应的本次检索式。,点击“URL”,Details功能介绍,天津中医药大学循证医学中心,67,http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=pubmed&Cmd=DetailsSearch&Term=(%22salvia+miltiorrhiza%22%5BTIAB%5D+NOT+Medline%5BSB%5D)+OR+%22salvia+miltiorrhiza%22%5BMeSH+T

18、erms%5D+OR+danshen%5BText+Word%5D,天津中医药大学循证医学中心,68,保存该检索式至收藏夹,天津中医药大学循证医学中心,69,检索策略的制订,天津中医药大学循证医学中心,70,检索策略制订的目的保证检索的规范、可靠、可重复检索策略制订的原则以问题为基础，以目的为导向；中西有别，病证有异；检索策略制订的内容关键词/主题词的初定；数据库/出版商的选择（如MEDLINE-OVID）；检索时限（包括年份范围和执检时间）检索式的表述和保存,检索策略的制订,天津中医药大学循证医学中心,71,检索策略制订的步骤,拟定检索词,将问题分解为若干要素,选择覆盖问题的数据库,确定拟弄

19、清的问题,制订检索式,修订检索策略,病因/诊断/治疗/预后,MeSH/Text Word,EBM/文摘/全文,AND/OR/NOT,保存检索策略和检索结果,P:问题/对象 I:干预措施C:对照措施 O:结局/结果T:研究类型,天津中医药大学循证医学中心,72,Boolean Operator 布尔逻辑算符,天津中医药大学循证医学中心,73,检索的方向性,临床循证实践,证据生产过程,卫生保健研究证据的结构“5S”模型,天津中医药大学循证医学中心,74,循证医学信息检索实例,查证用证,系统评价,天津中医药大学循证医学中心,75,临床证据的获取FOR EBCP,全世界每年有200多万篇有关生物医学的

20、文章发表在2万多种医学刊物上，一个内科临床医师需要每天阅读19篇本专业的文献才能基本掌握本学科的进展1,1.Davidoff F.Evidence-based medicine:a new journal to help doctors identify the information they need.BMJ 1995,医学文献数量浩若烟海，但其质量良莠不齐有限的时间和无限的医学知识,天津中医药大学循证医学中心,76,临床证据的获取FOR EBCP,有没有一种既实用，又靠谱，还不伤脑筋的证据呢？,天津中医药大学循证医学中心,77,临床证据的获取FOR EBCP,鉴于此，循证医学的倡导者开始

21、联合出版公司研发“循证的专家意见”，推出值得信赖又便于临床医生使用的新型循证医学资源，这类资源具有以下共同特点：1根据PICO原则清楚表述临床问题；2纳入标准明确，文献检索全面；3严格评价临床研究的质量和可靠性；4针对临床问题，分级给出推荐处理意见；5.电子版形式（网络、光盘、PDA）推出，检索方便，层次分明，即时更新。,天津中医药大学循证医学中心,78,综述（系统评价）,计算机辅助决策系统,摘要,原始临床研究,总结（手册/指南）,天津中医药大学循证医学中心,79,天津中医药大学循证医学中心,80,对发展中国家免费,Turning Research Into Practice,天津中医药大学循

22、证医学中心,81,天津中医药大学循证医学中心,82,天津中医药大学循证医学中心,83,天津中医药大学循证医学中心,84,InfoPOEMs,天津中医药大学循证医学中心,85,天津中医药大学循证医学中心,86,天津中医药大学循证医学中心,87,天津中医药大学循证医学中心,88,SR,天津中医药大学循证医学中心,89,循证信息检索 Systematic review,系统评价（Systematic review）是一种按照严格的纳入标准广泛收集关于某一医疗卫生问题的所有研究，对纳入研究进行全面的质量评价，并进行定性分析和/或定量合并，以对该问题进行系统总结的研究方法检索要求：此前所有,天津中医药大

23、学循证医学中心,90,检索方式电子数据库检索手工检索在研、灰色文献检索安全性文献检索,循证信息检索Systematic review,天津中医药大学循证医学中心,91,天津中医药大学循证医学中心,92,天津中医药大学循证医学中心,93,天津中医药大学循证医学中心,94,SR数据库的选择,天津中医药大学循证医学中心,95,例1,问题：复方丹参滴丸对冠心病心绞痛的疗效如何？目的：研究复方丹参滴丸治疗心绞痛的疗效和安全性检索数据库：PUBMED，EMBASE，COCHRANE LIBRARY，CBM，CNKI，VIP其他信息查找：心血管杂志；网络；参考文献；药厂文献类型：RCT检索年限：1993-2

24、008/3/6检索时间：2008/3/6,天津中医药大学循证医学中心,96,关键词,天津中医药大学循证医学中心,97,CBM：,天津中医药大学循证医学中心,98,天津中医药大学循证医学中心,99,天津中医药大学循证医学中心,100,天津中医药大学循证医学中心,101,天津中医药大学循证医学中心,102,CBM,天津中医药大学循证医学中心,103,天津中医药大学循证医学中心,104,天津中医药大学循证医学中心,105,天津中医药大学循证医学中心,106,天津中医药大学循证医学中心,107,天津中医药大学循证医学中心,108,天津中医药大学循证医学中心,109,天津中医药大学循证医学中心,110,天津中医药大学循证医学中心,111,天津中医药大学循证医学中心,112,天津中医药大学循证医学中心,113,天津中医药大学循证医学中心,114,天津中医药大学循证医学中心,115,保存检索策略保存检索结果,天津中医药大学循证医学中心,116,Overall？,Enough？,天津中医药大学循证医学中心,117,谢谢!,