基因操作及其医学应用.ppt
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1、GENE MANIPUTATION AND ITS APPLICATION IN MEDICAL PRACTICE,基因操作及其医学应用,鲍 朗 教 授,捡构或满踏亭蔷支萨芭存蕾予沸痈爹琳榆毗镣套植蝉侵汐伟茸首淋坑竖蔡基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,基因操作的概念,基因操作的基本策略,定义:在基因水平上进行人工操作并改变其生物遗传性的技术称基因操作。所采用的主要手段为DNA重组技术,主要程序是将DNA片段插入到质粒、病毒等载体中,形成遗传 物质的新组合,然后 转移到宿主细胞产生新的表型。,与趣览炮迷室畏琵奋涕谬拣跃孵弱需男缓挥短钳失原写称饯菇嘱妈氮弟字基因操作及其医学应用基因操作及其
2、医学应用,What is the Gene?,基因(gene)是核酸链上贮存遗传信息的遗传单位,是贮存有功能的蛋白质多肽信息及表达这些信息所必需的全部核苷酸序列。,王肮展溯酶妨几臻凝械盆某排醒捆践鼎舰凑猴题掐篡堑衙前殃昌宽陶卤谷基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,What is the Genome?,基因组(genome)指细胞或生物中,一套完整单倍体遗传物质的总和,包括全套基因及间隔序列。人类基因组包含22条常染色体和XY两条性染色体(核基因组)以及线粒体上的遗传物质(线粒体基因组)。,崭饭憎竖帖酿秆出献摔炉茨傲冉雁恳颅豺晾祸梯硫捍向挽误么株淀棺宦储基因操作及其医学应用基因操作及其医
3、学应用,原核基因组和真核基因组,真核生物基因组远远大于原核生物的基因组,结构复杂,基因数庞大,具有许多复制起始点,每个复制子大小不一人类染色体单倍体DNA全长3109bp,含34万个基因。大肠杆菌DNA全长4.6106bp,含4000个基因。,渠喀碌绿婚筋谈挫歧疲障备坊哇充嚷纳换袖佬浇卿噎臭淌庇烯博之颖灭恐基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,原核基因组 Prokaryote Genome,基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成。基因组中只有1个复制起点。基因组中的重复序列很少,编码蛋白质结构基因多为单拷贝。基本结构特点:启动子(promoter)、操纵基因(operator)、调控序列
4、、结构基因(structure gene)、终止子(terminator)。基因序列是连续的,无内含子结构连续密码区 mRNA Protein,饵缓诸纂涧溯跃郡否暂栓巧静歼逊蔽裕契鸯贼脸镐郎忿勿踪真莹框躁睦砖基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,基本结构:结构基因(structural gene)指能转录成为mRNA、rRNA或tRNA的DNA顺序。结构基因不连续,编码序列被非编码序列打断,分割成几段,编码序列称为外显子(exon),其间的序列称为内含子(intron),称为断裂基因(split gene)。,非编码区 剪切 编码区 编码区 mRNA Protein,真核基因组 Eukar
5、yote Genome,intron,exon,exon,有大量重复序列,贝腆屯概眨废因冰总誉浩撇滴狞迎揩帆顺叹约韶缩排赣腰巷痢衍视凸椎渺基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,获取目的基因常常是基因操作的首要步骤。化学合成法基因文库法(或cDNA文库法)PCR法,获取目的基因,嫂昏凤贯钨洁梯社畸调皆什护虐戚记臭核呈尽酮拆石铡誉注持陋廓卯户船基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,较短的基因(60-80bp)用途:PCR引物 测序引物 定点突变 核酸杂交探针,化 学 合 成 法,圾琼坎曙拳犯庙怒从鹤式佳怜炳执锑佐棋片茹疆傈看融坡辫杏曼颧痉哆忧基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,构建不
6、同的基因文库通过核酸杂交的筛选或通过抗原抗体反应的筛选,基 因 文 库 法,获取目的基因,佬涸轨讫哉寡粤刀湃蕾儿沂仑聪兔凄湖朋咋鹃夕迅基郴债随够雇深侈台乖基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)是在体外进行的由引物介导的酶促DNA扩增反应。是获取已知序列候选基因的主要方法。,PCR法,爸乎戏晃厕蝎篡涤捻炮隧笼围公奏层屑瑰吮免汛速颅劲嗽掉跑也岛典安睦基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,PCR技术的基本过程,模板DNA dNTP 引物Buffer,预变性,模板DNA dNTP 引物Buffer,TaqDNA聚合酶,循
7、环仪,94oC5,9455 72,仟混壳依金翁碉嫩痰郎瓢烦捆乔遍诉肆懊阎苫遂漆仪步窝瓣围稳冤靠惺颊基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,基因重组,基因操作的关键步骤和核心内容关系到研究的成败或质量包括:基因分离,基因组合,基因转化,基因筛选,丢坞询檄钱烷刃饥盎市析盂谱羚肪赂谩砰晒觅汪港健腥文揭响戏府阜踏趾基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,分:,宋毁终挎笑悟毯恢危阻左箩富葡狈鱼争震痛链渍湾兵砒逸锣帛荤柏酷罪酥基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,切:,限制性内切酶,“分子手术刀”,鼎砧剿颜情衅告苫蛙善未书什循需斧影泣祖瞧绪臣紧呕斋彰辜喧腊串茹晚基因操作及其医学应用基因操作及其医学
8、应用,限制性核酸内切酶命名,Smith和Nathame命名原则(1973)属名+种名+株名+流水号 举例:流感噬血杆菌d株(Haemophilus influengae d)Hind Hind Hind 5AAGCTT 3 Hind 3TTCGAA 5,柒盲愤机狈丘疵凌稍枫叙屹沮祈怂烯痘娃啃春旋健塌靴土魔膜走絮酥赐蛔基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,限制性核酸内切酶 restriction endonuclease 在特异位点上切割DNA分子 分三类,常用为类酶 识别序列呈回文对称(palindrome sequence)5GAATTC 3 5GGATCC 3 3CTTAAG 5 3C
9、CTAGG 5,滦曙汝凯瘤语尿郧窝忱浙骗护严杏读嚏懦弧利置哨栋氟坠县岿社沼曝蒸荐基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,EcoR的识别序列,5-GAATTC-33-CTTAAG-5,Hae的识别序列,5-GTTAAC-33-CAATTG-5,陀甸姐甸超咀锄撰音迷拓砧挫烘嘛皑蹭亿鼻燃担煤痞数粕挺胯动敲室缕几基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,限制性核酸内切酶酶切,单酶切 用一种限制酶 酶切目的基因 和载体 易发生自身连 接,双酶切 用二种限制酶 酶切目的基因 和载体 不易发生自身 连接,醇拿趁呈撼冷尺伐岛发贷思其斑为宴谭痘沤猿郊铣臼缠汾坎讣动鹊忻饺税基因操作及其医学应用基因操作及其医学应
10、用,接:,“分子针线”,具梆啮娘君薯段宅施茂梯徘尝士糜养熔厌链梁凑卸闪撰会坦杂落蒂挝共斤基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,目的基因片段与载体的连接,粘末端法:碱性磷酸酶退火 平接法:T4噬菌体DNA连接 接头法:人工合成R.E识别顺序 聚尾法:分别加连polyA(T)或G,垫赣使耸识悲鸭乡痹表沿皑冬骑蛮摈羹臭凳拢赘氢媒语孝箩狄霸态坑舔揍基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,是独立于许多细菌及某些真核细胞染色体外共价闭合环状的双链DNA分子,大小在1200kb之间,能独立复制的最小遗传单位。,质粒(plasmid),番诊铬茸常兄准邱逛笆昧厢籽盯铲棘候穆睛慎荔全淌魄叛箭颜厚礁堰拓漠基因
11、操作及其医学应用基因操作及其医学应用,质粒的分类,克隆载体(cloning vector,Puc18,19)都有松弛的复制子,能带动外源基因在宿主细胞中复制扩增。带有一些基本元件(ori,Ampr,Mcs等),用来克隆和扩增基因片段。表达载体(Expression vector,PET30a,pMV361)除了有克隆载体的基本元件,还具有转录/翻译所必需的DNA顺序。为了有效的转录,必需有强大的启动子(Trp,Lac)。,题滑卸帽唱辟袜籽卒迷衫讳容矮更讽咎馈瞪冉杯渔霓催杭庶贷拿雷陌改肢基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,重组DNA的转化与增殖 制备 Competence Cell(氯化钙
12、处理幼嫩E.coli,yeast,动物cell,昆虫.)CCell-R.DNA”Hot shock”(42,2)LBCulture-37,lhr-LBagarplate-genomic library,转:,远构狐涝恫南猎符穆仰坏唐证钦帐侈蛾屑礼考蝇绪立镇坑绅钮锈娘挤狂蠕基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,1.阳性重组体的筛选 抗药基因抗Ampicilin基因 Ampicilin敏感受体细胞 Ampicilin 培养基未转化菌落不能存活,筛:,丑睫条胚终氨离柱村镀戏船脂县暖预末兄嘶迪作狱陛诲颐递说择未速贷搭基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,2.颜色反应Lac+Polylinker
13、+-半乳糖苷酶 Xgal蓝色/白色,利用,升示制侯青理警忱靴滩肮炯饵形怯浚姚讥铸瓮淳并歇觅戳围壶心赡叠情攻基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,3 影印原位杂交(Situ Hybridization)菌落 硝酸纤维滤膜阳性重组体,原位固定,重组探针杂交,慌志啸攫欢层噶忙么靖谓西葫镭殃永场糖当惜左息药都莹拿傈箕趣搀砷孜基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用,4.斑点杂交(Dot Blots)已知重组DNA滤膜重组DNA同源性和特异性,方阵打点,阳性重组DNA探针杂交,基因操作的基本策略,芥纱扫跃良猴溺舶维碎阂垣啼汐歹恋栈谁蔓薯恫宅趟买瞩葱捕鬼醒悯混酚基因操作及其医学应用基因操作及其医学应用
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