第五章病毒的遗传与变异文档资料.ppt
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1、第五章 病毒的遗传与变异,一、病毒遗传变异的物质基础二、病毒的变异三、病毒变异的研究方法,第五章 病毒的遗传与变异,噬菌体标记试验 植物病毒重建试验甲病毒核酸 杂种病毒 感染细胞 子代病毒 乙病毒衣壳(完全甲病毒)病毒的遗传是相对的,变异是绝对的,一、病毒遗传变异的物质基础,二、病毒的变异,(一)病毒突变体株系strain:同一病毒的不同系或分离物“型”type:同一病毒的不同血清型变种:与原始野生型株系不同的病毒突变体mutant分离物isolate,二、病毒的变异,病毒突变的类型:突变类型是一个多标准、多层次和不同水平的分类。从突变引起的遗传信息的意义改变来看,可分为:synonymous
2、/missense/nonsense mutation从突变效应背离或返回到野生型这2种方向上讲,可分为:正向突变forward 和回复突变reverse mutation从突变带来的表型改变来看,可分为:形态突变体、致死突变体、条件致死突变体和生化突变体(anxotroph/resistance)等从引起突变的原因来看,可分为:spontaneous mutation,induced mutation,二、病毒的变异,病毒突变的类型:spontaneous mutation(自发突变)在没有任何已知诱变剂存在的条件下,一些病毒在子代中产生高比例的突变体在基因组为RNA的病毒中,自发突变率高得
3、多(10-310-6),原因是RNA复制酶中缺少校正阅读活性induced mutation(诱导突变)利用自然界各种物理或化学诱变剂处理野生型病毒能够诱发突变,提高病毒群体中的突变率。体外诱变剂:对病毒的静态核苷酸进行化学修饰,使其在后面的复制中碱基配对发生改变,导致同型碱基置换和异型碱基颠换,如亚硝酸、羟胺、烷化剂等体内诱变剂:作用于代谢活跃的核苷酸,为碱基类似物或插入剂,二、病毒的变异,(一)病毒突变体动物病毒几种突变体:蚀斑突变体plaque mutant寄主范围突变体 host range mutant抗药性突变体 drug resistance mutant抗原突变体 antibo
4、dy resistance mutant回复突变体 revertant 无效突变体null mutant:1个基因完全失活温度敏感突变体temperature-sensitive,无效突变体中病毒的一个基因完全失活,一般来说,核苷酸任何形式的改变都能产生无效突变体表型。不管是大的插入、缺失、无意义读框移位突变必然产生null突变体表型。部分突变体保留完整的功能蛋白片段。作用:确定必需基因,ts突变体是一种条件致死突变体。由误义突变产生,即突变体某个基因的核苷酸序列发生变化,在高温条件下(非允许温度),该基因编码的蛋白质不能形成或不能维持它的功能构型,在允许温度(低温)条件下,这一蛋白质能形成功
5、能构型,允许突变体增殖。允许温度下产生的蛋白质或粒子可能不耐热,ts突变可辅助鉴定突变体蛋白,或显示某一蛋白质是结构蛋白。,二、病毒的变异,(一)突变病毒核酸中基因组(遗传信息)发生遗传变异,而不是由于外来的其它病毒或生物体遗传物质的介入所引起的变异位点突变point mutation 温度敏感变种(temperature sensitive,ts)空斑大小变种、酶缺陷变种、热适应变种等(多效作用pleiotropism)缺失突变deletion mutation 基因组的一部分丢失 有可能失去独立繁殖能力,甚至致死性,突变的结果有时导致病毒不能生存,如ts变种:在较低温度下多肽结构稳定,功能
6、正常,在较高温度时结构变化,易被细胞蛋白酶降解。应用:减毒疫苗,多效作用Pleiotropism:几个明显不相关的表型效应由单个基因所决定。,缺失突变deletion mutation,缺陷性干扰(病毒)颗粒(defective interfering particle,DI particle)在某些条件下,如细胞培养中接种大剂量病毒并连续传代,易感细胞被感染后只产生少量有感染性的病毒粒子,而大量病毒粒子的基因组不完全,成为DI 颗粒。具有普遍性,几乎所有RNA病毒各科和大多数DNA病毒各科都有发现对同源的完全病毒有干扰作用,这种现象在理论和致病作用中都很重要。,DI颗粒产生的一些特征:1、接
7、种量过大,m.o.i 高,DI颗粒增加,完全病毒减少2、DI颗粒的产生受宿主细胞种类控制3、基因组不完全,有片段缺失4、与完全病毒形态无差异,沉降系数相近5、必须在完全病毒存在时才能增殖6、干扰同源病毒完整粒子的生成机理尚不清,核酸链短,复制快,竞争强7、与病毒的持续性感染密切相关,可减轻发病,减少死亡,更可能引起慢性带毒感染m.o.i(multiplicity of infection):每一敏感细胞所能吸附的相应病毒的数量,3、病毒突变的分子机制取代substitution 一个核苷酸被另一个核苷酸所取代增加-缺失addition-deletion 一/几个(或一对)核苷酸增加或缺失重排r
8、earrangement 代表一个或几个基因的多核苷酸片段连接顺序与原来的不同 蛋白质结构变化,(二)病毒之间的遗传互作,重组是混合感染中病毒基因组之间的物理作用根据基因组的结构分为3种:(1)分子内重组 intramolecular recombination通过核酸断裂与重接:(单一分子基因组病毒)(2)重配reassortment多分体病毒在混合感染中,来源于不同亲本病毒的基因组片段可能重新组合:,1、遗传重组,(二)病毒之间的遗传互作,(1)分子内重组 intramolecular recombination(2)重配reassortment(3)拷贝选择重组(copy-choice
9、recombination)在部分具单一分子基因组RNA病毒中,RNA聚合酶选择性地连接到静止模板链上进行RNA子代链的合成。仍属于分子内重组,但不涉及核酸分子的共价断裂,1、遗传重组,基因重组的类型(按重组病毒的种类分),(1)活性病毒间的基因重组(2)灭活病毒间的基因重组(3)活性病毒与灭活病毒间的基因重组(4)病毒与细胞间的基因重组,1、遗传重组,(二)病毒之间的遗传互作,交叉复活cross reactivation:一株活性病毒与另一株相关但具有不同遗传标记的灭活病毒复合感染细胞,由于重组产生具有灭活病毒某些遗传标记的活性病毒重组体,又称标记拯救marker rescue。,2、复感染
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