生物无机化学.pptx
《生物无机化学.pptx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《生物无机化学.pptx(536页珍藏版)》请在三一办公上搜索。
1、生物无机化学Bioinorganic chemistry,计亮年,莫庭焕;生物无机化学导论,中山大学出版社。杨频,高飞;生物无机化学原理,科学出版社。,3.Lippard,席振峰(译);生物无机化学原理,北京大学出版社。4.郭子建,孙为银;生物无机化学,科学出版社。,What is Bioinorganic Chemistry?Bioinorganic chemistry constitutes the discipline at the interface of the more classical areas of inorganic chemistry and biology.Bioin
2、organic chemistry has two major components:the study of naturally occurring inorganic elements in biology and the introduction of metals into biological systems as probes and drugs.,Bioinorganic Chemistry or Inorganic Biochemistry?,生物化学家、医学家研究无机生物化学和无机化学家研究生物无机化学的角度有些差异。,前者研究金属离子及其化合物对生物体的生理和病理作用。,后
3、者研究金属离子及其化合物与生物体系的相互作用。,J.Inorg.Biochem.(IF=3.287),J.Bio.Inorg.Chem.(IF=3.317),Scientific journals,,,第一章 概述及相关基础知识,一、生物无机化学发展史二、生物无机化学的研究内容三、生命元素四、生命配体,一、生物无机化学发展史,上世纪五十年代,肯德鲁和佩鲁茨解析了肌红蛋白和血红蛋白的结构,两者分享1962年的诺贝尔化学奖。,Kendrew,John Cowdery,MaxFerdinand Perutz,1970年,在美国Virginia州举行了国际生物无机化学讨论会,仅19篇报告,并由R.F.
4、Gould汇编“生物无机化学”。1971年,D.R.Willams出版专著生命金属“The Metal of Life”。1971年,美国著名化学家G.N.Schrazer主编的杂志Bioinorganic Chemistry创刊,1979年更名为Journal of Inorganic BioChemistry。1973年,H.Sigel等主编丛书Metal ions in Biological Systems,系统收集金属离子在生物体中的结构和功能数据。,1977年,G.N.Schrazer发起成立了国际生物无机化学协会.1983年起,由I.Bertini,H.B.Gray,B.Malms
5、trom and H.Sigel 组成生物无机化学国际会议组织委员会,决定每两年召开一次会议.1995年,C.D.Garner和I.Betini再次发起成立国际生物无机化学学会(The Society of Biological Inorganic Chemistry,简称SBIC),并于1996年出版会刊“Journal of Biological Inorganic Chemistry”。,2003年,美国科学家彼得阿格雷和罗德里克麦金农,分别因对细胞膜水通道,离子通道结构和机理研究而获诺贝尔化学奖。,Peter Agre Roderick MacKinnon,诺贝尔奖,生物无机化学发展的
6、推动力,蛋白质和其他生物分子高分辨结构的迅速测定。,用于结构及动力学测定的高效光谱仪器的应用。,生物工程在创造新的生物相关结构中的广泛应用,如基因定点突变技术等。,国际生物无机化学会议(ICBIC)International Conference on Biological Inorganic Chemistry,ICBIC-1 1983年 意大利 ICBIC-2 1985年 葡萄牙ICBIC-3 1987年 荷兰ICBIC-4 1989年 美国ICBIC-5 1991年 英国 金属识别、储存、输送和组装ICBIC-6 1993年 美国 固氮酶的结构及催化及其机理ICBIC-7 1995年 德
7、国 金属离子对基因调节影响ICBIC-8 1997年 日本 丙烯腈水合酶合成丙烯酰胺ICBIC-9 1999年 美国,ICBIC LOGO,ICBIC-10 2001年 意大利 中枢神经系统的生物无机化学ICBIC-11 2003年 澳大利亚 金属离子在细胞的交通图ICBIC-12 2005年 美国ICBIC-13 2007年 奥地利ICBIC-14 2009年 日本ICBIC-15 2011年 加拿大ICBIC-16 2013年 法国ICBIC-17 2015年 中国,国际生物无机化学会议(ICBIC),ICBIC LOGO,http:/,ICBIC LOGO,Session Topics
8、for ICBIC 14,Bioenergetics Small Molecules Activation Traffic and Storage of Metal Ions Metalloproteins Biogenesis of Metalloproteins Molecular Design of Metalloproteins Metal-DNA/RNA Interaction Metal Ions in Drug Design,Neuroscience,and Disease Bioorganometallic Chemistry Bionanomaterials New Tren
9、ds in Bioinorganic Chemistry,国际应用生物无机化学学术讨论会(ISABC)International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry,ISABC-1 1990年 武汉 ISABC-2 1992年 广州 ISABC-3 1994年 澳大利亚 ISABC-4 1997年 南非 ISABC-5 1999年 希腊 ISABC-6 2001年 英国ISABC-7 2003年 墨西哥 ISABC-8 2004年 香港 ISABC-9 2006年 阿根廷 ISABC-10 2009年 匈牙利ISABC-11 2011年 西班
10、牙,亚洲生物无机化学学术会议(AsBic)The Asian Biological Inorganic Chemistry Conference,全国生物无机化学学术会(CBIC),第十一届会议议题(2011年,保定,河北大学)无机物与生物大分子的相互作用无机药物化学及其作用机理 金属蛋白与金属酶、细胞生物无机化学生物矿化与仿生无机材料 纳米材料与生物效应 金属和小分子探针 稀土生物无机化学 环境生物无机化学 生物无机化学研究中新方法、新技术 生物无机化学理论或应用相关的其它研究,王夔,计亮年,倪嘉缵,生物无机化学家,中科院院士,二、生物无机化学的研究内容,金属酶和金属蛋白的结构和功能金属离子
11、及其配合物与生物大分子的相互作用 生物矿化电子传递反应金属离子和细胞的相互作用离子载体探针和金属药物金属酶和模拟酶的应用,金属酶和金属蛋白的结构和功能,(a)金属离子的成键位置(b)活性中心周围微环境(c)蛋白链在保证金属离子正常工作的贡献(d)蛋白链与底物的结合方式,金属离子及其配合物与生物大分子的相互作用,共价结合 非共价结合,生物矿化(biomineralization),生物矿物材料(骨头、牙齿、蛋壳等)是由矿物与基质构成的复合材料,具有高度的装配有序性,又特殊的理化性质、可控的动态性质和特殊的生物功能。,定义:有机物质在微生物作用下分解,释放能量,转化为简单无机物质的过程。,电子传递
12、反应,生命过程的核心是能量传递,而能量传递的中心过程是电子传递。生物体内电子传递与化学反应中的电子传递有着重要的区别。,金属离子和细胞的相互作用,细胞是生命活动的基本单位;金属及其化合物与细胞的相互作用是其表现的生物效应得化学基础;如化合物与细胞相互作用时,细胞化学组成、结构、功能方面的变化和无机物结构变化机理;化合物和自由基对细胞增殖、分化和凋亡过程中的作用位点、干预方式、作用机理与化合物性质的关系;cellular bioinorganic chemistry,离子载体,ionophore,可有选择地结合专一离子,并携带其穿过不透性膜的脂溶性小分子。,探针和金属药物,用一些其他的金属元素替
13、代生物无机化合物中的原有金属元素,从而用各种波谱方法来研究和确定体系的结构和作用。,例如,用半径与锌相近的钴离子作探针,代替羧肽酶中的锌,从而根据含钴酶的光谱推断羧肽酶中锌的配位环境。用锰离子做探针,根据含锰羧肽酶的核磁共振谱确定了羧肽酶中锌和一水分子或羟基相连。,金属酶和模拟酶的应用,研究金属酶的结构与功能合成它们的模拟物,以推动它们在生产中的应用。,探讨常见的疾病的发病与某些金属元素与非金属元素之间的关系,研究调节和控制这些元素来防止病变的发生。,硒:地方性疾病,克山病心脏损伤性疾病,大骨节病慢性对称性畸形骨关节病,三、生命元素,生物体的必须元素存在于正常组织之中。在各物体中有一定的浓度范
14、围。如果从机体排除这种元素将会引起特殊的生物化学变化,重新引入这种元素,上述变态将可以消失。至少有26种生物体的必须元素。,占人体总重量低于0.01的元素,人体中的元素,常量元素,微量元素,C、H、O、N、P、S、Cl、Na、Mg、K和Ca等11种,约占体重的99.25。,Rb、As、B、Ti、Al、Ba、Nb和Zr等8种。,Bi、Sb、Be、Cd、Hg和Sb等6种。,必需微量元素,非必需微量元素,有毒微量元素,占人体总重量高于0.01的元素,铁、锌、铜、铬、锰、硒、镍、钴、氟、碘、钼、钒、锡、硅、溴等15种。,Biological function of selected metal ion
15、s,Non-essential but valuable elements,A few elements have become of marked clinical value.,Clinical value of some elements,最适营养浓度定律,浓度,明显地影响着它对生物体是“必需”、“有益”还是“有害”。法国科学家G.Bertrand 在研究锰对植物生长的影响后,提出了一个最适营养定律:植物缺少某种必需元素时不能成活,当该元素适量时就能茁壮成长,但过量时又转为有害。,表1.常见微量元素对人体健康的影响,表2.微量元素引起的地方病,表2.微量元素引起的地方病(续),微量元素引
16、起的地方病,地方性甲状腺肿,碘缺乏,地方性克汀病,呆小聋哑瘫,侏儒、先天畸形,厌食、生长障碍,骨畸形,锌缺乏,六旬母亲肩背侏儒儿子30载,用坏20个背篼,硒缺乏,克山病,心律不齐,心脏扩大,心率衰竭,休克,大骨节病,肌肉萎缩、发育障碍、行动蹒跚,地方性硒中毒,硒过量,脱发脱甲,皮肤潮红、神经、牙齿损害,微量元素引起的地方病(续),黑皮病,慢性砷中毒,皮肤色素过渡沉着、神经性皮炎,致癌。,水俣病,慢性甲基汞中毒,感觉障碍、共济失调,语言、智力障癌。,元素的中毒,骨痛病,易骨折、骨质疏松、软化变形,疼痛,铝过量引起的脑痴呆,电镀时吸入铬酸雾,产生的六价铬化物,可损害人体皮肤及呼吸道,形成很深的溃疡
17、既铬疮。铬疮出现后,铬毒素进入人体血液沉淀。,女工陈麒穗,在重庆市巴南区渝南鑫光灯具有限公司电镀车间打工四个月,体内铬含量竟然超标一万倍!,鬼剃头,铊中毒,脱发、头晕、乏力、食欲不振,视物模糊。,清华女生“铊”中毒后无望挣扎十多年,四、生命配体,蛋白质:蛋白质是生命体系中最重要的一类生物大分子,是生命活动的主要承载者以及生命现象的主要物质基础。核酸:核酸是生物遗传的物质基础,与生物的生长,发育等呈长生命活动以及癌变等异常生命活动相关。酶:具有生物催化功能的生物大分子,大多数由蛋白质组成(少数为RNA)。,蛋白质可以被酸碱或蛋白酶催化水解完全水解得到各种氨基酸的混合物,部分水解通常得到多肽片段。
18、最后得到各种氨基酸的混合物。所以,氨基酸是蛋白质的基本结构单元。大多数的蛋白质都是由20种氨基酸组成。这20种氨基酸被称为基本氨基酸。,蛋白质,L-氨基酸,UV 特征吸收:260280 nm,构成蛋白质的20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但在远紫外区(220 nm)均有光吸收。在近紫外区(220-300nm)只有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸收光的能力。,氨基酸残基可能的配位方式,重要的不常见氨基酸,在少数蛋白质中分离出一些不常见的氨基酸,通常称为不常见蛋白质氨基酸,这些氨基酸都是由相应的基本氨基酸衍生而来的。,非蛋白氨基酸,除了上述构成蛋白质的氨基酸以外,自然界还存在一些并不是蛋白质组分的氨
19、基酸,这些氨基酸通常被称为非蛋白氨基酸,至今已经发现200多种以上,它们具有不同的功能。,高半胱氨酸:甲硫氨酸生物合成的中间产物,蛋白质的结构,将蛋白质结构层次进一步细分,可在二、三级结构之间增加超二级结构和结构域两个层次。,The Structures of Proteins,蛋白质结构,一级结构,二级结构,三级结构,四级结构,超二级结构,结构域,低,高,蛋白质的一级结构,蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目.多肽链的氨基酸顺序,以及多肽链内或链间二硫键的数目和位置。其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。,牛胰核糖核酸酶的一级
20、结构,蛋白质的一级结构,蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目.多肽链的氨基酸顺序,以及多肽链内或链间二硫键的数目和位置。其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。,牛胰核糖核酸酶的一级结构,蛋白质的二级结构,肽链的主链在空间的排列。它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。,蛋白质中的几种超二级结构,motif,motif,hairpin,相邻的二级结构单元经常按照一定规律、规则地组合在一起,彼此相互作用,形成在空间构象上特征的二级结构组合单位。,结构域(structural domain),对于一些相当大的蛋白质分子,一条长的
21、多肽链,有时要先分别折叠成几个相对独立的区域,再组装成球状或颗粒状的复杂构象(三级结构)。这种在二级结构或超二级结构基础上形成的特定区域称为结构域(structural domain)。每个结构域自身都是紧密装配的,但结构域之间的联系是比较松散的,因此在两个结构域间常常形成空穴。不同的蛋白质,其结构域的数目各不相同。蛋白质分子分成几个结构域的现象,通常与蛋白质的功能有关。,疏水 相互作用,静电相互作用,金属离子配位作用,折叠结构链间氫健,螺旋结构链内氫健,二硫健,侧链之间氫健,稳定蛋白质三级结构的主要作用力,蛋白质的四级结构(Quaternary Structure)是指由多条各自具有一、二、
22、三级结构的肽链通过非共价键连接起来的结构形式;各个亚基在这些蛋白质中的空间排列方式及亚基之间的相互作用关系。,四级结构,核酸(Nucleic acid),核酸分为脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)两种。DNA是染色体的主要成份。DNA是所有生物的遗传物质基础,生物体的遗传信息都贮存在DNA中。RNA主要存在于细胞质中。有三种RNA,即信使核糖核酸(mRNA)核糖体核糖核酸(rRNA)和转运核糖核酸(tRNA)。有一类被称为核糖酶(ribozyme)的RNA分子具有酶学功能,有关核糖酶中金属离子的作用是目前生物无机化学领域的一个热点研究内容。,五种碱基,嘌呤(purine)腺嘌呤(ade
23、nine)鸟嘌呤(guanine)(DNA only,A)(DNA only,G),(1)嘌呤碱,(2)嘧啶碱,嘧啶(pyrimidine),胞嘧啶(cytosine,C),尿嘧啶(uracil,U),胸腺嘧啶(thymine,T),(2)嘧啶碱,嘧啶(pyrimidine),胞嘧啶(cytosine,C),尿嘧啶(uracil,U),胸腺嘧啶(thymine,T),(3)核 苷,腺嘌呤脱氧核苷,(4)胞嘧啶脱氧核苷,(5)5-腺嘌呤核苷酸,磷酸腺苷,The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1962for their discoveries conc
24、erning the molecular structure of nucleic acids and its significance for information transfer in living material,Francis H.C.Crick,Maurice H.F.Wilkins,James D.Watson,两条链以相反方向绕同一轴形成右旋双螺旋,直径2nm,转一周高度3.4nm,含10个核苷酸,大沟槽,小沟槽。内侧base基以H band相连,维持double helix。A=T,G C base complementary base stacking force 碱基
25、堆积力 内疏水,外亲水,静电作用。double-stranded cyclic DNA 双链环型DNA Superhelix 超螺旋 Supercoil 超卷曲,DNA双螺旋结构要点,Helical forms of DNA,1 turn 10b 11b 12b1 rise 3.4 2.3 3.8,Structure of a G-quartet,Different strand orientations for 4-strand intermolecular quadruplexes,International Journal of Mass Spectrometry 253(2006)22
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 生物 无机化学
链接地址:https://www.31ppt.com/p-4540994.html