蝗虫精氨酸激酶的活性中心及其抑制剂的研究(可编辑) .doc
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1、 山东农业大学硕士学位论文蝗虫精氨酸激酶的活性中心及其抑制剂研究姓名:朱雯静申请学位级别:硕士专业:生物化学与分子生物学指导教师:王晓云20080525英文缩略表缩略词 中文全称 英文全称二磷酸腺苷精氨酸激酶三磷酸腺苷 肌酸激酶二甲基亚砜二乙氨基.乙基.葡聚糖?,.二硫硝基苯甲酸 ,一二硫苏糖醇乙二胺四乙酸半抑制率常数 %木犀草素聚丙烯酰胺凝胶电泳苯乙二醛十二烷基磺酸钠槲皮素关于学位论文原创性和使用授权的声明本人所呈交的学位论文,是在导师指导下,独立进行科学研究所取得的成果。对在论文研究期间给予指导、帮助和做出重要贡献的个人或集体,均在文中明确说明。本声明的法律责任由本人承担。本人完全了解山东
2、农业大学有关保留和使用学位论文的规定,同意学校保留和按要求向国家有关部门或机构送交论文纸质本和电子版,允许论文被查阅和借阅。本人授权山东农业大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文和汇编本学位论文。保密论文在解密后应遵守此规定。论文作者签名,.蒜重鸯导师签名:碱幺日 期:、.矿山东农业大学硕士学位论文蝗虫精氨酸激酶的活性中心及其抑制剂研究研究生:朱雯静指导教师: 王晓云教授业:专 生物化学与分子生物学摘要精氨酸激酶, .是磷酸原激酶的一种,广泛地存在于无脊椎动物中,是一个与细胞内能量运转、肌肉收缩、再生有直接关系的重要激酶。由于仅存在
3、于无脊椎动物中,与脊椎动物中参与能量代谢的肌酸激酶不同,因此可以作为控制昆虫的一个很好的靶标。本研究以蝗虫精氨酸激酶为研究对象,利用化学修饰法研究活性中心的必需基团,并以黄酮类物质筛选有效的抑制剂。本试验的主要结果如下:.精氨酸激酶活性中心半胱氨酸的研究:使用对精氨酸激酶半胱氨酸进行化学修饰,结果发现随修饰剂浓度增加,精氨酸激酶的活性逐渐丧失,这表明半胱氨酸位于该酶的活性中心部位。采用邹氏作图法求得该酶活性中心必需半胱氨酸残基的数目为。利用还原被修饰的精氨酸激酶推测这个必需半胱氨酸残基的位置及作用,结果显示这个半胱氨酸有可能位于的结合位点附近。.精氨酸激酶活性中心精氨酸的研究:通过测定酶活性解
4、离基团的性质,发现蝗虫精氨酸激酶活性中心标准解离热焓为. /,表明该酶的活性中心的可解离基团是精氨酸的侧链胍基。又以苯乙二醛为专一的修饰剂作用于蝗虫精氨酸激酶的精氨酸残基,根据等的方法求得每个酶分子中仅有一个精氨酸是酶活性所必需的。通过考察底物对苯醛修饰的保护作用,结果发现对苯乙二醛修饰该酶存在保护作用,蝗虫精氨酸激酶的活性中心及其抑制剂研究这表明该精氨酸可能位于的结合位点附近。.精氨酸激酶抑制剂效果的研究:黄酮类物质对体内和体外的精氨酸激酶都有一定的抑制效果。对龄蝗虫喷洒槲皮素和木犀草素六天后,提取精氨酸激酶测活发现酶活力仅为原来的.%和.%;在体外实验中当槲皮素和木犀草素的浓度达到/时,酶
5、活性分别下降了.%和.%。并进一步通过双倒数作图确定了槲皮素和木犀草素对精氨酸激酶的抑制类型和抑制常数。.精氨酸激酶抑制剂机理的研究:利用猝灭对抑制机理进行研究。确定槲皮素和木犀草素与精氨酸激酶发生静态猝灭,说明槲皮素和木犀草素与精氨酸激酶能相互结合并结合在色氨酸周围。利用.法求得其结合常数和结合位点。根据非辐射能量转移机理,分别求算了槲皮素和木犀草素与精氨酸激酶之间的距离,并根据热力学参数推测了槲皮素和木犀草素与精氨酸激酶相互作用力是静电作用力。根据猝灭结果和抑制效果,推测槲皮素和木犀草素对精氨酸激酶的抑制活性的不同很有可能是由于结构上的差异引起的。关键词:蝗虫;精氨酸激酶;活性中心;抑制作
6、用 :?:; .;:?,. 也 ,. ,.:.。.,. , .【. /,.蝗虫精氨酸激酶的活性中心及其抑制剂研究.,: , .,. . :,. .; ;:;山东农业大学硕士学位论文引言.精氨酸激酶的研究背景精氨酸激酶,.是磷酸原激酶的一种,主要存在于无脊椎动物体内,如昆虫、虾、蟹及软体动物中.,;,;,;,。它的作用是催化如下反应:将上的磷酸基团转移到精氨酸上,从而生成和一种具有高能键的储能分子?磷酸精氨酸,该反应需要二价金属离子如矿、参与,反应方程式如下:一:?磷酸原激酶家族是一个保守家族,可逆催化肌酸或精氨酸与之间的转磷酰基反应,反应形成的高能磷酸化的磷酸肌酸或磷酸精氨酸称为磷酸原。高能磷
7、酸原在能量储备方面起关键作用,因为当需要再生时,可以在磷酸原激酶的催化下由磷酸原转化而来。磷酸原不仅是一个能量储备库,同样在不断耗能的体系中它也是一个能量传送体.,。一般认为磷酸原及磷酸原激酶具有方面的生物功能:起能量暂时缓冲作用;起空间能量缓冲作用;提高氧化磷酸化的效率。能量的缓冲指的是当的消耗量超过线粒体产生的量时,由磷酸原激酶催化磷酸原形成;空间能量的缓冲指的是来源于心肌细胞等的一些线粒体磷酸原激酶将转化成磷酸原,这些磷酸原扩散到细胞质中,然后在磷酸原激酶的催化下,重新形成;另外也发现线粒体磷酸原激酶可通过保持低浓度来提高氧化磷酸化的效率。肌肉组织中含有丰富的磷酸原激酶,用以维持肌肉收缩
8、过程中的.,;稳态 .,;。另外,在大量需能的组织如脑、肾中磷酸原激酶也大量表达,用于离子运输、突触传递等 .,; ,。蝗虫精氨酸激酶的活性中心及其抑制剂研究等在蜜蜂的脑、触角和复眼中发现了大量不同形式的精氨酸激酶存在,而且在需能变化较大的视觉系统的能量释放机制中,精氨酸激酶是最重要的一种酶。生殖细胞精子的运动性、肠内上皮细胞绒毛小突的收缩,也受或的调控 。;。在细胞分裂后期,微管蛋白驱动纺锤体移动所需的以乎与磷酸原激酶有关,;,.,;。是节肢动物体内唯一的磷酸原激酶。在昆虫肌肉中,磷酸精氨酸是唯一有效形成的磷酰基供体,能在一定时间内给剧烈运动的肌肉提供能量,同时又维持的恒定水平.,;,; .
9、,;,; .,。等证明:磷酸精氨酸在蝗虫腿肌中起暂时能量缓冲库的作用,在静止不动时,蝗虫腿肌中磷酸精氨酸的浓度是浓度的倍;当蝗虫跳跃时,催化磷酸精氨酸形成所需要的。高活性的也被发现存在于参与离子运输的上皮细胞中,如蝗虫的后肠,及鳞翅目昆虫如烟草天蛾的中肠中,; .,;,。另外有些能与肌动蛋白结合,从而使其与动物的运动有密切关系.,.,。; .,;,;发现已经超过年了,它属于磷酸原胍基化合物激酶家族,现在已经在许多种无脊椎动物中发现。尽管基本功能都是催化高能磷酸键的转移,但是从不同的无脊椎动物分离得到的在结构和分子量大小方面却存在着很大差异。这些不同的结构和大小有以下类别:单亚基,如海湾对虾 的
10、 .,是一种相对分子量约为的单亚基的蛋白质。单亚基的是目前研究最多的一种,本文中用到的即是单亚基。双亚基,如海参.,相对分子量,中分离到的。四亚基,如环节动物中具有相对分子量在.的四亚基,。综上所述,是昆虫生命活动过程中参与能量代谢的关键性酶,而山东农业大学硕士学位论文且仅存在于无脊椎动物中,与脊椎动物中参与能量代谢的肌酸激酶不同,因此可以作为控制昆虫的一个很好的靶标,而且对高等动物安全性好。.蛋白质化学修饰.蛋白质化学修饰概述蛋白质化学修饰是指蛋白质化学结构的改变。蛋白质的化学修饰严格来说包括两个方面:其一指侧链的改变,其二指主链的改变。主链的改变属于定点突变的内容,人们一般认为蛋白质化学修
11、饰指的是改变蛋白的侧链。化学修饰的位点或者氨基酸残基一般都是蛋白质分子活性较高且暴露在外部能够被修饰剂接触到的基团,这些活性基团对蛋白质的性质可能具有很重要的作用,因此蛋白质的化学修饰很多情况下会造成蛋白质性质发生很大的变化,致其空间构象发生变化以及生物活性的降低或者丧失。随着生物技术的发展,很多先进的技术不断涌现,例如定点突变、核磁共振、晶体衍射等。蛋白质的化学修饰被许多人认为是已经落伍并且可以被取代的技术。但是,近年来由于很多专一性很高的化学修饰剂的出现,定量处理方法和不可逆抑制动力学理论方法的发展,蛋白质侧链的化学修饰这个经典的用来研究蛋白质结构和功能关系和定向改变蛋白质功能和性质的工具
12、仍然被广泛采用,并且有了新的发展。.蛋白质侧链基团各种氨基酸残基的修饰反应侧链基团化学修饰一个非常重要的作用是用来探测活性部位的结构。反应试剂与蛋白质分子接触并发生化学反应,与蛋白质分子的侧链氨基酸残基共价连接形成某些可探测的报告基团。从该基团的修饰对蛋白质分子的生物活性所造成的影响,就可以推测出被修饰的残基在该蛋白质分子中的功能。只有具有极性的氨基酸残基的侧链基团才能够进行化学修饰,这些基团的反应性决定于它们的亲核性,并且很多因素都会影响蛋白质的化学修饰反应。因此,通过选择不同的化学修饰剂和控制合适的条件可以专一的修饰不同活性的氨基酸残基。赖氨酸的.氨基是亲核反应性较高的基团,三硝基苯磺酸是
13、修饰赖氨酸非常有效的试剂蝗虫精氨酸激酶的活性中心及其抑制剂研究,。除此之外,氨基的烷基化也是目前非常重要的方法之一,。在蛋白质序列分析中,利用氨基的反应修饰多肽末端的方法也占有极重要的地位,常用的修饰剂有一二硝基氟苯和丹磺酰氯。组氨酸残基位于很多酶的活性中心,所以对其咪唑基的修饰研究较多,焦碳酸二乙酯是最常用的组氨酸修饰剂 ,。酪氨酸残基的修饰最常用的试剂是高,度专一性并且反应温和的四硝基甲烷。色氨酸多位于蛋白质内部,而且色氨酸中的吲哚基很难被修饰,.,以及常用的是.溴代琥珀酰亚胺试剂 ,。丝氨酸和苏氨酸专一性化学修饰试剂研究比较少。而蛋氨酸残基的极性较弱,比较难以进行选择性修饰反应。其中,强
14、极性的巯基具有很强的亲核性,因此化学修饰研究最多最深入的氨基酸是半胱氨酸,它是蛋白质中最为活跃的残基之一。烷基化试剂是一种重要的修饰试剂,例如碘乙酸和碘乙酰胺等 .,。.乙基马来酰亚胺也是一种有效的巯基修饰试剂,。有机汞试剂专一性很强,但是有剧毒,所以现在使用较少 ,。目前最常用的巯基修饰剂是,二硫.硝基苯甲酸,又称试剂,。可以与巯基反应生成二硫键,使蛋白质分子上标记一个.硝基.硫苯甲酸,同时释放一个黄色的阴离子,见图.。椭,小心%髻竺睁咱如优。己扣懒州。图对巯基的修饰反应. .时的释放出的阴离子在媳具有很强的吸收,其中消光系数./ ,.,所以可以很容易通过光吸收的变化来检测反应的程度。由于定
15、点诱变的迅速发山东农业大学硕士学位论文展,在目前蛋白质结构和功能的研究中,特别是半胱氨酸的侧链基团的化学修饰有被取代的趋势。然而,仍然是目前最常用的定量测定蛋白质分子巯基数目的试剂,也可以用来定量检测蛋白质中的可反应基数和总基数,并用以研究毓基改变程度的和巯基所处环境的探测,。用氨基酰化酶后修饰发现有四个可反应巯基,其中两个慢反应巯基是必需基团,它们的破坏将导致酶活性的丧失周海梦,。等采用精氨酸专一性修饰剂苯甲酰甲醛对来源于黑曲霉的植酸酶进行修饰,发现精氨酸残基位于该植酸酶的活性部位。等采用专一的修饰试剂对植酸酶组氨酸残基进行修饰,并进一步研究组氨酸残基在植酸酶催化过程中的作用机理。利用和修饰
16、葡聚糖水解酶的赖氨酸和半胱氨酸,确定这两个残基位于活性中,并确定其个数和作用。.精氨酸激酶的催化机制和活性中心研究早期,人们用化学修饰结合光谱学的方法研究酶活性中心及其催化机制。研究发现中的半胱氨酸,、组氨酸,、赖氨酸 ,和酪氨酸.,是胍基底物及核甘结合所必须的氨基酸残基。其中,赖氨酸残基是核甘与酶结合所必需的,而酪氨酸是核甘和胍基底物与酶结合都必需的 .,。现代定点突变和晶体衍射技术的发展有力地加强了人们对酶催化机制以及活性中心的认识。从解出的鲎单体的晶体结构可以看到图.,它的底物类似物中的磷酸基团定位在一系列带正电的组成的口袋中,?,和一,底物精氨酸的肌基与形成盐桥,羧基与.,.和.主链上
17、的形成氢键,并且通过带负电的.与底物形成氢键来提供精氨酸甲基所需要的催化环境 .,。对来说,催化的关键在于两个结构域的相对旋转以及同时两个高度保守的柔性环环和环.的运动引起了酶分子构象上发生较大的变化。其中两个柔性环蝗虫精氨酸激酶的活性中心及其抑制剂研究分别位于结构域中,催化时向底物塌陷靠近,以排除水分子,为底物反应提供疏水性环境。构象变化诱导双底物的精确定位和以最佳反应的角度对齐是这个催化反应的最主要的机理。?蚤?.。?一妒美二二二二夏芦末:孑;眨.:岫山东农业大学硕士学位论文叶与在底物结合后在晶体结构中的位置并没有发生改变,他们认为半胱氨酸并不参与底物诱导构象变化的过程,而硫醇基对催化起重
18、要作用,半胱氨酸而通过静电作用加快了催化的速率 .,。等用修饰精氨酸激酶的活性半胱氨酸残基,精氨酸激酶失活,再用进行复性处理,结果表明,饱和浓度的二硫苏糖醇可完全使修饰过的精氨酸激酶复性.和过渡态类似物可减小表观失活常数,但精氨酸对表观失活常数无影响。该半胱氨酸可能位于结合位点的附近。等邻苯二醛修饰精氨酸激酶发现荧光光谱在 处有最大吸收峰,表明精氨酸激酶中氨基与半胱氨酸中的巯基相邻,在邻苯二醛作用下形成了吲哚环。根据邹式作图法确定只有一个半胱氨酸是催化酶活性所必须的。当其中任何一个亚基的被修饰时将导致整个酶分子活力丧失,说明双亚基的失活是协同性的,暗示其催化也具有协同性,一个亚基活性位点修饰可
19、能会引起结构上较大的变化,通过亚基之间的作用力传递给另外一个亚基,引起其结构变化,导致酶整体活力丧失。.精氨酸激酶抑制剂的研究进展.。精氨酸激酶抑制剂作为磷酸原激酶家族中的重要一员,在无脊椎动物的能量代谢中起着关键作用。因此通过研究的抑制剂来阻止能量代谢,从而达到杀虫的作用是十分重要的。目前对此的研究仍处于探索阶段。证明对龙虾中的有抑制作用,的抑制作用可能与结合有关。等等从龙虾中提纯到,并证明其活性可被巯基促进,而被巯基试剂抑制,如碘乙酰胺。对的反应机制进行了研究,证明存在一个.复合体.。加入硫氰酸根,硝酸根,硼酸根,亚硝酸根等一价阴离子后对复合体的形成有一定的影响,其中。对有抑制作用,抑制分
20、数能达到%,并求得其抑制常数是. /,属于的非竞争性抑制剂。研究表明精氨酸的类似物:精胺,高精氨酸,刀豆氨酸,硝酸精氨酸对锥形虫中的有抑制作用。其中,刀豆氨酸和高精氨蝗虫精氨酸激酶的活性中心及其抑制剂研究.和./。从锥形虫寻找抑制剂的优点是其磷酸原的生物合成途径与哺乳动物完全不同。等对底物.精氨酸的类似/。物研究表明.精氨酸是的竞争性抑制剂,抑制常数是.刀豆氨酸作为.精氨酸的类似物也会起到抑制作用,而且在.精氨酸和.刀豆氨酸混合时可能会引起酶结构的变化。绿茶中含有大量的化学物质对害虫有杀灭作用。研究了儿茶酚对锥形虫的杀灭作用。经过高效液相色谱分离出儿茶酚的多种成分,其中没食子儿茶酚和表儿茶酚对
21、有%的抑制作用,其他五种对并无影响。虽然国内外学者已经发现.刀豆氨酸对昆虫特别是鳞翅目昆虫的生长发育有影响,具有使幼虫体重减轻且生长发育延缓、造成蛹及成虫畸形并直接杀死幼虫等类似杀虫剂的性能,但对刀豆氨酸的作用机制特别是农业昆虫体内能量代谢影响的研究极少且不深入国内尚未有关于的研究文献,国外文献也极少。从结构上看,刀豆氨酸是底物精氨酸的类似物,理论上可以作为抑制剂,由于是能量代谢中最敏感的酶,那么从抑制剂上来筛选比刀豆氨酸活性更强的天然物质,是否目标及针对性更强呢特别是针对一些飞翔昆虫,如蝗虫、飞蝇、菜蛾等,通过利用抑制剂来控制能量代谢从而控制昆虫的运动,并结合其他防治措施以达到控制害虫的目的
22、。这个问题值得研究探索。.荧光猝灭对小分子物质和蛋白质结合机理的研究.荧光猝灭的原理,荧光猝灭是指物质分子与溶剂分子或溶质分子之间所发生的导致荧光强度下降的物理或化学作用的过程。与荧光物质分子发生相互作用而引起荧光强度下降的物质,称为荧光猝灭剂。荧光猝灭过程可以分为两种:一种是动态猝灭,另一种是静态猝灭。动态猝灭是指猝灭剂和荧光物质的激发态分子之间所发生的相互作用过程,如能量转移或电子转移过程。动态猝灭过程是与自发的发射过程相竞争从而缩短激发态分子寿命的过程。静态猝灭是猝灭剂和荧光物质分子在基态时发生配合反应,所产生的配合物通常是不发光的;即使配合物在激发态时可能离解而产生发光的型体,但激态复
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