核酸化学与核苷酸代谢ppt课件.ppt
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1、核酸化学与核苷酸代谢,概述核酸与蛋白质一样,是一切生物机体不可缺少的组成部分。核酸是生命遗传信息的携带者和传递者,它不仅对于生命的延续,生物物种遗传特性的保持,生长发育,细胞分化等起着重要的作用,而且与生物变异,如肿瘤、遗传病、代谢病等也密切相关。因此,核酸是现代生物化学、分子生物学和医学的重要基础之一。核酸是由核苷酸组成的具有复杂三维结构的大分子化合物,是遗传的物质基础。,第六节 核酸酶,本章要讲述的主要内容,第一节 核酸的化学组成,第二节 核酸的一级结构,第三节 DNA的空间结构与功能,第五节 核酸的理化性质 及其应用,第四节 RNA的空间结构与功能,第一节 核酸的化学组成,脱氧核糖核酸(
2、deoxyribonucliec acid DNA),磷酸(phosphate),一.核酸的种类,二.核酸的化学组成,碱基(base),戊糖(pentose),核糖核酸(ribonucliec acid,RNA),核酸,核苷酸,核酸酶,核 酸 的 种 类,脱氧核糖核酸(DNA),核糖核酸(RNA),两类核酸的基本化学组成比较,DNA RNA 嘌呤碱 腺嘌呤(A)腺嘌呤(A)(Purine bases)鸟嘌呤(G)鸟嘌呤(G)碱基(Base)嘧啶碱 胞嘧啶(C)胞嘧啶(C)(Pyrimidine bases)胸腺嘧啶(T)尿嘧啶(U)戊糖 D-2-脱氧核糖 D-核糖(Pentose)酸 磷酸 磷
3、酸(Acid),C,N,C,C,C,N,N,N,C,H,H,H,NH2,嘌呤碱,1,2,3,4,5,6,7,8,9,嘌 呤,NH2,O,H2N,腺嘌呤(A),鸟嘌呤(G),6,2,6,HC,HN,HC,CH,CH,N,NH2,O,O,O,O,O,CH3,嘧 啶,胞嘧啶(C),尿嘧啶(U),胸腺嘧啶(T),1,2,3,4,5,6,核糖核酸(RNA),脱氧核糖核酸(DNA),核酸,核苷酸,核苷,磷酸,戊糖,碱基,核 酸 的 组 成,核酸酶水解,由戊糖和碱基以糖苷键连接而成,核 苷,脱氧核糖,核糖,嘌呤碱基,嘧啶碱基,+,腺苷,9,+,脱氧腺苷,9,1,由核苷的戊糖羟基被磷酸酯化而成,5,核苷酸的命
4、名,含一个磷酸基团:核苷一磷酸(NMP),含两个磷酸基团:核苷二磷酸(NDP),含三个磷酸基团:核苷三磷酸(NTP),N 代表各种碱基的名称,环化核苷酸:cNMP,O,第二节 DNA的结构与功能,一、DNA的结构,二、DNA的生物学功能,1.DNA的一级结构,2.DNA的二级结构,3.DNA的三级结构,携带并传递遗传信息,四种脱氧核糖核苷酸通过3、5-磷酸二酯键彼此连接而形成的直线形或环线形分子.,DNA分子中核苷酸的排列顺序.,DNA 的 一 级 结 构,核苷酸链的书写方法,双螺旋结构,即DNA分子的空间结构,1.Chargaff 碱基组成规律,2.DNA晶体的X-射线图谱研究,各原子之间的
5、键长、键角,一、DNA分子模型建立,DNA 的 二 级 结 构,由James Watson和Francis Crick提出,(1)腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩尔数相等.A=T,鸟嘌呤与胞嘧啶的摩尔数相等.G=C,嘌呤总数=嘧啶总数 A+G=C+T,(2)DNA的组成具有种的特异性,(3)DNA的碱基组成没有组织的特异性,且较为稳定,不随年龄、营养状态、环境改变的影响,Chargaff 碱基组成规律,分子双螺旋结构模型要点,1.由两条反向平行的脱氧多核苷酸(两条链的走向为53和35),围绕一中心轴(假想轴)构成右手双螺旋结构。,彼此间以磷酸二酯键相连,构成的骨架。,2.碱基在双螺旋内侧。,双链中相对的碱
6、基按和通过氢键配对连接,形成互补.,磷酸基与脱氧核糖在外侧,,5C,糖环平面与中心轴平行。,3.碱基平面与中心 轴垂直,各相邻 平面部分重叠。,4.双螺旋的直径为2nm,沿轴向,每个碱基平面的距离为0.34nm,每圈螺旋含有10对核苷酸,其轴向距为3.4nm,(3)离子键,5.维持DNA双螺旋稳定的作用力,(1)互补碱基间的氢键,(2)使碱基平面堆积的平面间范德华力,又称碱基堆积力,二、DNA结构的多样性,A-DNA:右手螺旋,B-DNA:Watson-Crick模型,右手螺旋生理条件下DNA最稳定的结构形式,Z-DNA:左手螺旋,DNA 的 三 级 结 构,原核生物,真核生物,没有典型的细胞
7、核结构,,真核生物的三级结构是由分子与组蛋白(histine)和非组蛋白(nonhistineprotein,NHP)结合组成。,被认为是原核生物的三级结构,被认为是真核生物的三级结构,超螺旋结构,核小体结构,DNA 超 螺 旋 结 构,H2A、H2B、H3和H4各两分子,组成组蛋白八聚体,构成核心组蛋白,双螺旋DNA以左手超螺旋的方式绕核心颗粒1.75圈,缠绕在核心组蛋白表面,构成核心颗粒,核心颗粒和 连接区DNA及附着在连接区DNA上的 组蛋白H1构成核小体,一个个核小体连接成串珠状结构,染色单体,折叠,折叠,第三节 RNA的结构和功能,一、RNA的类型,1.核蛋白体RNA(ribosom
8、al RNA,rRNA),3.转运RNA(transfer RNA,tRNA),2.信使RNA(messenger RNA,mRNA),4.不均一核RNA(HnRNA),二、RNA的结构与功能,5.小核RNA(SnRNA),mRNA的结构与功能,一、mRNA的结构特点,(1)3末端有多聚腺嘌呤的结构(polyA),(2)5末端具有帽子结构(m7GpppNm),(3)一种 mRNA只含有一条多肽链的信息,由HnRNA经过剪接而成,半衰期最短,几分钟到数小时,二、mRNA的功能,蛋白质合成的直接模板,把核内DNA的碱基顺序(遗传信息),按照碱基互补的原则,抄袭并转送至胞质,在蛋白质合成中用以翻译成
9、蛋白质中氨基酸的排列顺序。,tRNA 的结构与功能,1.分子量最小一类RNA,占RNA总量10-25%,2.分子中含有10%-20%的稀有碱基,一、tRNA的结构特点,如假尿嘧啶(),二氢尿嘧啶(DHU),甲基化碱基(mG,mA)等,3.3末端有CCA-OH,是携带氨基酸的部位,4.具有识别密码子功能的反密码子,5.二级结构为三叶草形,有三个环状结构(DHU环、T 环、反密码环)三级结构为“倒L”形,二、tRNA的功能,在蛋白质的合成过程中作为各种氨基酸的载体并将其转呈给mRNA,tRNA的三级结构,rRNA的结构与功能,一、rRNA的结构特点,1.含量最丰富,约占总RNA的80%以上,2.与
10、核蛋白体蛋白结合成核蛋白体,rRNA 与蛋白质既可分离,又可结合,3.核蛋白体由大小两个亚基构成,两亚基呈不 规则形状,聚合时中间有裂缝,可通过mRNA,二、rRNA的功能,是细胞内蛋白质合成的场所,其他小分子RNA,小核RNA(SnRNA)、,小核仁RNA(SnoRNA)、,小胞质RNA(scRNA/7SL-RNA),功能:参与HnRNA和rRNA的转运和加工,原核生物核糖体的亚基组成,原核生物核蛋白体,真核生物核蛋白体,核 酶,某些RNA分子本身具有自我催化能力,可以完成rRNA的剪接。这些RNA称为核酶(ribozyme),意义:扩充了酶的范围,使之不再局限于蛋白质。,第四节 核酸的理化
11、性质,一、核酸的粘度,二、核酸的紫外吸收特性,三、核酸的变性、复性及其分子杂交,一、核 酸 的 粘 度,*分子量越大粘度也越大,分子比分子小,粘度也就小,*生物分子的空间结构也影响粘度。,线形分子,无规线团分子,球形分子,二、核酸的紫外吸收特性,嘌呤碱和嘧啶碱有共轭双键,都能强烈吸收紫外光,最大吸收波长为260nm,蛋白质对紫外光的最大吸收波长是280nm,紫外分光光度法检测核酸的纯度,通过测定波长在260nm和280nm处吸光度的比值(A260A280)来估计核酸样品的纯度,DNA溶液:A260A280=1.8,RNA溶液:A260A280=2.0,方法:,在波长260nm紫外线下,吸光度为
12、1.00时,,紫外分光光度法估计核酸的浓度,取5l双链DNA样品,加水稀释至1ml。以1ml纯水作为参照测定波长在260nm处的吸光度值(260),假如测得稀释样品的260值为0.500,,相当于50g/ml的双链DNA,40g/ml的单链DNA或RNA,20g/ml的单链寡核苷酸,问题1,那么原液中DNA的浓度是?g/ml,三、核酸的变性、复性及其分子杂交,(一)变性,(二)复性,(三)分子杂交,(一)核 酸 的 变 性,1.概念,核酸分子的双螺旋结构解开,氢键断裂(不涉及共价键的断裂),使双链分离,这种现象称为核酸的变性,2.引起核酸变性的因素,如乙醇、丙酮、尿素、酰胺等,加热、,介质中的
13、pH过酸或过碱、,有机溶剂、,3.核酸的变性与降解的区别,降解,其过程是不可逆的。,是指多核苷酸链中的磷酸二酯键断裂,,使分子量降低,,不发生分子量的变化。,一般是可逆的,,变性,4.蛋白质和核酸的变性,两者均不涉及共价键的断裂,一级结构不破坏,粘度下降,生物活性丧失,分子的热变性,双螺旋结构即遭破坏,氢键断裂,双链分离。,将的稀盐溶液加热至8095(或以上)数分钟,,d.丧失生物活性,a.260nm处的紫外吸收值升高,b.粘度下降,c.浮力、密度升高,(增色效应),变 性 DNA 的 特 点,DNA解链曲线,拐点所对应的温度,,代表变性50时温度,称为解链温度,通常称为融解温度。,用符号 T
14、m 表示,7085之间,“”形曲线,Tm值的大小主要与下列因素有关,中对的含量,碱基对的比例越高,Tm值越高,pH和离子强度不变,根据百分含量,,则可计算样品的Tm值,Tm69.3+0.41*(),Tm4*(G+C)+2*(A+T),(小于20bp),介质中的离子强度,离子强度低,Tm值低,变性温度范围较宽,离子强度大,Tm值高,变性温度范围较窄,的变性,双链的RNA分子,RNA-DNA 杂化分子,可变 性,中性pH条件下,三者Tm值大小为:,双链RNA分子,RNA-DNA 杂化分子,DNA分子,(二)核酸的复性,DNA热变性后的复性,常常称为退火。,变性的DNA或RNA在去除变性因素,并处于
15、适当的条件下,,又可重新结合成为双螺旋结构,这一过程称为复性。,1.概念,彼此分离的双链,2.复性过程,两种情况,(1)两条完全分开的单链通过随机碰撞形 成互补短片段的双螺旋。,(2)尚未配对的碱基很快地“对齐”。迅速 形成双链直至双螺旋结构。,复性后分子性质,一系列的理化性质随即恢复,d.生物活性部分恢复,a.260nm处的紫外吸收值下降,b.粘度上升,c.浮力、密度降低,(减色效应),(三)核酸分子杂交,在一定条件下(适宜的温度、pH及离子强度),可按碱基互补原则复性形成双链,此过程称为核酸分子杂交。,1.概念,具有一定同源性的两条核酸单链,,变性,复性,不完全同源核酸单链分子杂交,突环,
16、2.可发生杂交的核酸分子,(1)两条同源的DNA链,(2)两条同源的RNA链,(3)一条DNA链一条RNA链,3.核酸杂交的应用,(1)测定核酸分子碱基组成,(2)检测某些因基因突变引起的疾病,核 酸 酶,指所有可以水解核酸的酶。,一、分类,1.按照作用底物的不同分,DNA酶(DNase):,水解DNA,RNA酶(RNase):,水解RNA,2.按照作用的部位分,核酸外切酶:,作用于5或3 末端,核酸内切酶:,作用于链的内部,二、限制性核酸内切酶,作用于链的内部,,具有严格序列依赖性。,切基因工程的手术刀,没有限制性内切酶的发现和应用,就很难有今天分子生物学与基因工程的快速发展。,功能:,根据
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