第十章核苷酸代谢及核酸的生物合成课件.ppt
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1、2023年4月2日星期日,1,第十章 核苷酸代谢及核酸的生物合成,2023年4月2日星期日,2,一、核酸的酶促降解,1、核酸水解:,DNA 稳定,耐酸碱RNA 易水解:碱水解,2、酶促水解:,1)降解方式,2023年4月2日星期日,3,RNA:RNase(稳定、耐高温),DNA:DNase(种类多、工具酶),2)核酸E,(1)底物:,2023年4月2日星期日,4,(2)作用方式:,核酸外切E:核酸链的一端逐个水解下核苷酸的酶(非特异性),3-核酸外切E:蛇毒磷酸二酯E3OH端开始,生成5-核苷酸,5-核酸外切E:牛脾磷酸二酯E5OH端开始,生成3-核苷酸,2023年4月2日星期日,5,特异水解
2、分子内磷酸二酯键的酶(特异性强),核酸内切E,牛胰核糖核酸酶:嘧啶核苷3磷酸与相邻核苷酸的3,5磷酸二酯键,2023年4月2日星期日,6,2023年4月2日星期日,7,限制性核酸内切酶(Restriction endonuclease),识别双链DNA分子中特定核苷酸序列,并由此切割DNA双链的核酸内切酶,能识别水解外源双链DNA的核酸内切酶(细菌),细菌本身DNA,顺序已被甲基化,不被水解仅限于水解外源DNA以保护自身限制性酶,2023年4月2日星期日,8,限制酶:内切方式水解DNA,产物:5为P,3为OH,特点:极高的专一性(对特定核苷酸顺序专一性,非碱基专一)对底物DNA有特异的识别位点
3、 位点一般在48bp,通常具回文结构 切割后形成粘性末端(或平齐末端),2023年4月2日星期日,9,回文结构:DNA局部双螺旋以某一对称轴旋转180后,与另 一侧的互补片段的顺序完全相同的DNA结构,粘性末端:双链DNA分子经限制性E作用后,每条单链的一端 带有识别顺序中几个互补碱基,这样的末端称,2023年4月2日星期日,10,(3)核酸的酶促降解,2023年4月2日星期日,11,核酸,核苷,碱基,降解,核苷酸,Pi,戊糖,2023年4月2日星期日,12,(5)核苷酸生理功能:,1)合成核酸的原料:ATP,GTP,CTP,UTPRNA dATP,dGTP,dCTP,dTTPDNA,2)能量
4、的贮存和供应:ATP,GTP,UTP,CTP等,3)参与代谢、调节生理活动:cAMP、cGMP:激素的第二信使,4)构成酶的辅酶或辅基:NAD+,NADP+,FAD,FMN,CoA:含核苷酸,5)代谢中间物的载体:UDP-糖基,CDP-胆碱、胆胺、甘油二酯,腺苷-蛋氨酸,2023年4月2日星期日,13,二、核苷酸的降解,2023年4月2日星期日,14,1、嘌呤的降解,2023年4月2日星期日,15,次黄嘌呤,尿素,NH3+CO2,G,RNH2,(微生物),黄嘌呤,尿酸,尿囊素,鸟类,2023年4月2日星期日,16,尿酸:人体分解代谢的终产物痛风症:嘌呤核苷酸分解代谢异常 血中尿酸水平升高 尿酸
5、钠晶体沉积,软骨、关节、软组织、肾脏 临床:皮下结节,关节疼痛等,2023年4月2日星期日,17,2、嘧啶的降解,2023年4月2日星期日,18,NH2,二氢尿嘧啶,还原,H2O,(开环),脲基丙酸,H2O,丙AA,2023年4月2日星期日,19,三、核苷酸的合成代谢,原料:氨基酸、甲酸盐和CO2等,从头合成(de vovo synthesis),利用核酸降解的中间产物或外源的核苷,嘌呤碱和嘧啶碱合成新的核苷酸,补救途径(salvage pathway),2023年4月2日星期日,20,嘌呤、嘧啶,基本途径,从头合成肝,半合成(补救合成)脑、骨髓,2023年4月2日星期日,21,核糖核苷酸的合
6、成,2023年4月2日星期日,22,核苷酸合成的两条途径,核糖、氨基酸、CO2、NH3,核糖核苷酸,脱氧核苷酸,辅酶,RNA,核苷,碱基,脱氧核苷,DNA,补救途径 从头合成,肝,半合成,脑、骨髓,2023年4月2日星期日,23,(一)嘌呤核苷酸的从头合成,1、嘌呤核苷酸环上原子来源,CO2,Asp,一碳单位,Gln,甘氨酸,一碳单位,N5,N10-次甲基四氢叶酸,2023年4月2日星期日,24,一碳单位,一碳单位,2023年4月2日星期日,25,2、合成特点,合成部位:胞浆主要器官:肝脏;其次,小肠和胸腺 脑和骨髓不能合成5-磷酸核糖IMP(次黄苷酸)AMP、GMP,2023年4月2日星期日
7、,26,IMP合成:5-P-核糖+ATPPRPP(5-磷酸核糖焦磷酸)逐渐加上嘌呤的各个原子先形成右环,再左环(共11步反应)四氢叶酸(FH4):一碳单位的载体,2023年4月2日星期日,27,2023年4月2日星期日,28,IMP的合成,2023年4月2日星期日,29,3、嘌呤核苷酸的相互转化,黄苷单磷酸,腺苷单磷酸,鸟苷单磷酸,次黄苷酸,2023年4月2日星期日,30,NMP+ATP,NDP+ADP,NDP+ATP,NTP+ADP,磷酸激酶,N:嘌呤或嘧啶碱基,2023年4月2日星期日,31,嘌呤类似物(6-巯基嘌呤):抑制AMP、GMP的生成 谷胺酰胺类似物(氮杂丝氨酸):抑制IMP的合
8、成中有谷胺酰胺参与的反应 叶酸类似物(氨基蝶呤、氨甲喋呤):抑制IMP合成中有四氢叶酸参与的反应,4、临床抗癌药物的作用机理,2023年4月2日星期日,32,氨甲酰磷酸,天冬氨酸,(二)嘧啶类核苷酸的从头合成,1、嘧啶环上原子来源,前体:氨甲酰磷酸和天冬氨酸,2023年4月2日星期日,33,合成场所:胞浆(肝细胞)氨甲酰磷酸+天冬氨酸嘧啶环+PRPPUMP 关键中间产物:乳清酸 胞苷酸:尿苷酸转变,2、合成特点,2023年4月2日星期日,34,2023年4月2日星期日,35,2023年4月2日星期日,36,2023年4月2日星期日,37,3、嘧啶核苷酸的合成与相互转变,2023年4月2日星期日
9、,38,除脱氧胸苷酸,大多数合成是在NDP的基础上进行,(三)脱氧核糖核苷酸的合成,1、核糖核苷酸的还原,2023年4月2日星期日,39,2、dTMP 的合成,2023年4月2日星期日,40,(四)NMPNDP、NTP,生物合成和能量转换中,核苷酸的活泼形式是NDP和NTP,2023年4月2日星期日,41,2023年4月2日星期日,42,脱氧胸苷酸的合成,2023年4月2日星期日,43,氟尿嘧啶(FU),氨基蝶呤氨甲蝶呤,胸苷酸合成的抗代谢物作用机理,2023年4月2日星期日,44,5氟尿嘧啶,氨甲蝶呤,嘧啶类抗代谢物结构,2023年4月2日星期日,45,各种核苷酸合成的相互关系,2023年4
10、月2日星期日,46,磷酸核糖转移酶 途径:主要途径 嘌呤+PRPP 嘌呤核苷酸+PPi,(四)嘌呤核苷酸合成的补救途径,2023年4月2日星期日,47,2023年4月2日星期日,48,磷酸核糖转移酶缺乏与Lesch-Nyhan综合症HGPRT(次黄嘌呤尿嘌呤磷酸核糖转移酶)缺乏23岁,患儿,咬手指和嘴唇,智力缺陷,常痉挛,痛风,活20岁左右不能进行补救途径,从头合成速度加快尿酸积累 结石,痛风 自残(?),2023年4月2日星期日,49,(五)嘧啶核苷酸合成的补救途径,2023年4月2日星期日,50,四.DNA生物合成,(一)分子遗传的中心法则,DNA是遗传信息的储存和发布者,在遗传信息的传递
11、中处于中心地位,1958年,Crick,“中心法则”(Central dogma),2023年4月2日星期日,51,生物的遗传信息以密码的形式贮存在DNA分子上(特定的核苷酸排列顺序)细胞分裂,DNA复制,遗传信息子代细胞。子代细胞生长发育遗传信息(转录)RNA氨基酸顺序(翻译)蛋白质执行多样的生物学功能后代表现出与亲代极为相似的遗传特征,2023年4月2日星期日,52,2023年4月2日星期日,53,复制 Replication:以DNA双链为模板,按照碱基配对原则,合成出与亲代DNA分子相同的两个双链DNA分子的过程,基本概念,转录(Transcription):以DNA为模板,按照碱基配
12、对原则,合成出一条与模板DNA链互补的RNA分子的过程,2023年4月2日星期日,54,逆转录(Reverse Transcription):以mRNA为模板,在逆转录酶的作用下合成DNA的过程,翻译(Translation):以mRNA为模板,合成出具有特定AA顺序的Pr肽链的过程,2023年4月2日星期日,55,中心法则(Central Dogma):说明DNA、RNA和蛋白质之间信息传递关系的法则即:,遗传信息:决定生物结构、性状和代谢类型的特殊的生物指令,2023年4月2日星期日,56,(二)DNA的复制,1、DNA生物合成的机理,2023年4月2日星期日,57,2、DNA复制的基本规
13、律,1)半保留复制(semi-conservative Replication),DNA复制过程中,新形成的DNA分子的一条链来自亲代DNA,另一条链是新合成的,这种复制方式,生物学意义:生物的遗传特性,保持相对稳定性,2023年4月2日星期日,58,2023年4月2日星期日,59,2023年4月2日星期日,60,2)复制的多模式,特定的部位开始,双向或单向进行原核生物(细菌、病毒):一个起点;双向为主,也有单向(某些质粒、病毒)真核生物:多个起点;双向为主,也有单向(细胞器DNA),2023年4月2日星期日,61,开始DNA复制的特定位点原点(origin)。从原点开始同时向DNA链两个方向
14、进行,形成一个分叉,复制叉(replieationfork)。复制叉在电镜下观察犹如一只眼睛复制眼(replication eye)。环形DNA复制时由于复制眼的形成,构成了一个有内圈的闭合环状体Q结构。,2023年4月2日星期日,62,2023年4月2日星期日,63,2023年4月2日星期日,64,Meselson、Stahl 15N标记,15NH4Cl,E.coli培养基,培养12代 15N的标记DNA 14N的普通培养基 四代DNA,氯化铯密度梯度离心,实验依据,2023年4月2日星期日,65,2023年4月2日星期日,66,(二)DNA复制的起点和方向,1、两个起点,两个生长端的相向复
15、制 线性DNA病毒 DNA每条链有1个复制起点,分别合成1条新DNA,两条新链相向合成,每个生长点只有1条链合成2、1个起点,1个复制区的单向复制 环形DNA 两条链的复制起始点在同一位置,复制向一个方向运动,两条DNA链均被复制3、1个起点,两个复制区的双向复制 普遍 复制起始于1个位点,形成两个复制区向相反方向运动,在每个复制区两条DNA链均被复制,2023年4月2日星期日,67,DNA复制的起点和方向示意图,2023年4月2日星期日,68,3)复制需RNA为引物,4)子链DNA延伸方向:,核糖的3-OH能与其它核苷酸的磷酸以3,5-磷酸二酯键相连,2023年4月2日星期日,69,5)半不
16、连续复制(semi-discontinuous replication),冈崎片段原核生物:10002000核苷酸真核生物:100200核苷酸,2023年4月2日星期日,70,前导链(leading strand):以35的亲代链为模板,子代链能连续合成,称。滞后链(lagging strand):以53的亲代链为模板,子代链不能连续合成,称,2023年4月2日星期日,71,冈崎片段(Okazaki fragment):1968年,冈崎 以53的亲代链为模板合成新链时,先形成一些1000核苷酸左右的DNA短片段,然后由连接E连接成完整的子链。在复制过程中形成的DNA片段,称为,2023年4月2
17、日星期日,72,半不连续复制:新生的DNA双链,一条链按53的方向连续合成,另一条则按53的方向不连续合成,2023年4月2日星期日,73,3、DNA复制中所需的酶和辅因子,1)引物酶(Primase),功能:以DNA为模板,以NTP为原料,合成一小段RNA,作为合成DNA 的引物(Primer),DNA聚合酶,按模板链的指令引物3OH端延伸无从头合成的活性。引物E 与有关蛋白质结合成引发体(primosome),2023年4月2日星期日,74,2)DNA聚合酶E.coli:,(1)DNA聚合酶(109kD),1958年,A.Kornberg,E.coli,功能:校读错误,填补空隙,切除引物,
18、2023年4月2日星期日,75,(2)DNA聚合酶和,DNA聚合酶:DNA的损伤修复53聚合活力35外切活力,DNA聚合酶:复制的主要酶53聚合活力35外切活力53外切活力,分子量约140kD,10种亚基组成的不对称二聚体。,2023年4月2日星期日,76,2)DNA聚合酶 E.coli:,2023年4月2日星期日,77,真核细胞的DNA聚合E,、:复制延长:修复(没有其他酶时发挥作用)(线粒体):线粒体DNA的复制?:校读、修复和填补空缺,2023年4月2日星期日,78,功能:双螺旋解链需ATP供能,3)DNA连接E(DNA ligase),功能:缝合缺口不连接单独存在的DNA或RNA单链,
19、4)DNA解螺旋E(helicase),基因工程:工具酶,2023年4月2日星期日,79,功能:稳定解开的DNA单链阻止复性保护单链不被核酸E降解,5)单链结合蛋白(single-strand binding protein,SSB),2023年4月2日星期日,80,6)拓扑异构酶(topoisomerase),转录,复制,2023年4月2日星期日,81,型E:双链DNA的一条链发生断裂和再连接,减少负超螺旋反应不需供能活性转录区,同转录有关,2023年4月2日星期日,82,型E(旋转E,grase):内切E、连接E活力使DNA双链同时发生断裂和再连接连续引入负超螺旋(需ATP供能)同复制有关
20、,2023年4月2日星期日,83,2023年4月2日星期日,84,4、原核生物DNA的复制过程(E,coli),1)DNA复制的起始起始位点识别DNA解链RNA引物合成,2023年4月2日星期日,85,参与复制起始的各种蛋白质,2023年4月2日星期日,86,复制:一个特定位点(oriC)开始另一特定位点(ter)终止能独立进行复制的单位复制子(replicon)原核生物:一个复制子,真核生物:多个复制子,2023年4月2日星期日,87,DNA B蛋白:识别起始位点,ATP供能、组装引发体 与模板起始部位结合解链酶(rep蛋白)、旋转酶共同作用,双链局部解开 暴露出起始位点单链结合蛋白(SSB
21、)与DNA结合:防止H键的形成 电镜观察:”眼睛”复制眼”继续解链形成复制叉引物酶(DnaG)催化下合成一小段RNA,5-3P,3-OH,2023年4月2日星期日,88,2023年4月2日星期日,89,复制叉,2023年4月2日星期日,90,2023年4月2日星期日,91,(前导链),(滞后链),冈崎片断,半不连续复制,DNA双链:反向平行合成方向:53DNA复制:合成方向和复制叉的前进方向相同,可连续复制前导链;另一条链的合成方向和复制叉的前进方向相反,不能连续复制,只能分成几个片段合成滞后链滞后链的片段冈崎片段,合成后再连接,2023年4月2日星期日,92,模板:DNA 引物:RNA 原料
22、、能源:NTP,dNTP 酶:引物酶;DNA聚合酶I、II、III;DNA连接酶;解链酶;单链结合蛋白;拓扑异构酶 合成方向:模板链:35 合成链:53,原核细胞DNA的复制(E.Coli),2023年4月2日星期日,93,大肠杆菌三种DNA聚合酶比较,2023年4月2日星期日,94,DNA聚合酶催化的反应:,2023年4月2日星期日,95,与DNA合成有关的蛋白因子(E.coli),2023年4月2日星期日,96,DNA合成步骤,解旋:拓扑异构酶解链:解链酶,SSB结合单链,防止氢键再形成识别起点:引物酶生成引物:DNA为模板,引物酶催化,DNA转录DNA的生成:RNA引物3末端 碱基互补,
23、DNA,聚合酶催化,2023年4月2日星期日,97,DNA合成的起始与延伸,2023年4月2日星期日,98,拓扑异构酶I的作用,2023年4月2日星期日,99,拓扑异构酶II的作用,2023年4月2日星期日,100,切除引物:DNA聚合酶I,冈崎片段补齐封口:DNA聚合酶I,碱基互补,填补冈崎片段间的缺口 DNA连结酶,连结 模板链新的互补链 NAD+供能,2023年4月2日星期日,101,引物的切除,缺口填补,切口连接,2023年4月2日星期日,102,真核细胞DNA的复制(与原核细胞的区别),2023年4月2日星期日,103,RNA引物、冈崎片段较小 复制速度较慢(组蛋白的存在,DNA双股
24、稳定)多起点 DNA聚合酶,、线粒体聚合酶 催化聚合,无外切酶作用,2023年4月2日星期日,104,DNA聚合酶的功能,2023年4月2日星期日,105,(三)逆转录,(reverse transcription),以RNA为模板合成DNA的过程,逆转录E广泛存在于致癌RNA病毒、正常动物的胚胎细胞,2023年4月2日星期日,106,2023年4月2日星期日,107,因发现逆转录病毒的遗传物质而获1975年诺贝尔奖的三位科学家,2023年4月2日星期日,108,(四)DNA复制的忠实性,高度精确性,错误率约1/1091/1010,1、碱基的配对规律:配错几率 1/1041/105。2、DNA
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