核苷酸代谢和核酸生物合成课件.ppt
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1、核苷酸代谢,第一节 核酸及核苷酸的分解代谢一、核酸酶促降解(一)核酸酶促降解的含义:核酸在核酸酶的催化下,使连接核苷酸之间的磷酸二酯键水解,生成核苷酸的过程为核酸的酶促降解。,(二)、核酸酶的种类,1、根据所作用的底物分(1)核糖核酸酶(RNase):专一性水解RNA(2)脱氧核糖核酸酶(DNase):专一性水解DNA2、根据所作用的部位分(1)核酸内切酶:水解核酸分子内部的磷酸二酯键。(2)核酸外切酶:从核酸分子的一端逐个地水解单核苷酸。(3)限制性内切酶:具高度特异性。只能识别DNA的特定核苷酸序列,并在特定部位切断DNA链,使DNA产生双链裂口。,(三)核酸及核苷酸的降解,核酸,核酸酶,
2、磷酸单脂酶,核苷,嘧啶(嘌呤),核糖(脱氧核糖),核苷酶,核苷磷酸化酶,嘧啶(嘌呤),核糖-1-磷酸,脱氧核糖-1-磷酸,核糖-5-磷酸,磷酸戊糖途径,醛缩酶,乙醛,甘油醛-3-磷酸,单核苷酸,二、嘌呤的分解代谢,(一)、嘌呤的分解 1、嘌呤的分解可在核苷酸水平、核苷水平、碱基水平完成脱氨而达到降解。脱氨 脱氨1、核苷酸水平的降解:腺苷酸 次黄苷酸 黄苷酸 鸟氨酸 脱氨 脱氨2、核苷水平的降解:腺苷 次黄苷 黄苷 鸟苷 脱氨 脱氨3、碱基水平的降解 腺嘌呤 次黄嘌呤 黄嘌呤 鸟嘌呤 尿酸,2、嘌呤分解的终产物不同,(1)人类、灵长类、鸟类、爬虫类及大多数昆虫体内缺乏尿酸氧化酶,不能将尿酸进一步
3、,故其嘌呤的最终产物为尿酸;(2)除人和猿以外的哺乳动物、双翅目昆虫以及腹足类动物体内存在尿酸酶可将尿酸氧化为尿囊素,故其嘌呤的最终产物为尿囊素;(3)某些硬骨鱼类的体内含尿囊素酶能水解尿囊素生成尿囊酸,故其嘌呤的最终产物为尿囊酸;(4)大多数鱼类、两栖类体内含有尿囊酸酶能将尿囊酸水解为尿素.,腺嘌呤 鸟嘌呤 H2O H2O NH3 NH3 次黄嘌呤 黄嘌呤 H2O+O2 H2O2 H2O+O2 H2O2 尿囊素 尿酸 H2O CO2+H2O2 2H2O+O2 尿囊酸 尿素+乙醛酸 H2O 2H2O 4NH3+2CO2,植物,腺嘌呤脱氨酶,鸟嘌呤脱氨酶,黄嘌呤氧化酶,黄嘌呤氧化酶,尿酸氧化酶,
4、尿囊素酶,尿囊酸酶,脲酶,三、嘧啶的分解 胞嘧啶 尿嘧啶 二氢尿嘧啶 H2O NH3 NAD(P)H+H+NAD(P)+H2O-丙氨酸-脲基丙酸 H2O 胸腺嘧啶 二氢胸腺嘧啶 NAD(P)H+H+NAD(P)+H2O-氨基异丁酸-脲基异丁酸 H2O,胞嘧啶脱氨酶,二氢尿嘧啶脱氢酶,二氢嘧啶酶,脲基丙酸酶,二氢尿嘧啶脱氢酶,二氢嘧啶酶,脲基丙酸酶,NH3+CO2+,NH3+CO2+,第二节、核苷酸的合成代谢,一、核苷酸合成的基本途径(一)“从头合成途径”或从“无到有途径”。生物体利用某些氨基酸、磷酸核糖、二氧化碳和氮等较简单的化合物合成各种嘌呤和嘧啶核苷酸的合成过程为“从头合成途径”。这样的合
5、成途径几乎存在于所有的生物体内,它不经过碱基、核苷的中间阶段。主要在肝组织中进行。(二)补救途径:一般将生物体内由碱基或核苷合成核苷酸的途径为补救途径。脑、骨髓只能进行补救合成。,二、嘌呤核苷酸的合成,1、从头合成途径(1)嘌呤环中各个原子的来源,(2)嘌呤核苷酸的合成,或碳酸氢盐,5-磷酸核糖焦磷酸,5-磷酸核糖胺,甘氨酸,甘氨酰胺核苷酸,甲酰甘氨酰胺核苷酸,甲酰甘氨咪唑核苷酸,5-氨基咪唑核苷酸,5-氨基咪唑-4-羧核苷酸,IMP的 生物合成,5-氨基咪唑-4-琥珀基-甲酰胺核苷酸,5-氨基咪唑-4-氨甲酰核苷酸,5-甲酰氨基咪唑-4-氨甲酰核苷酸,次黄嘌呤核苷酸(IMP),甲酰THFA,
6、延胡索酸,第二阶段:生成腺嘌呤核苷酸(AMP)和鸟嘌呤核苷酸(GMP),IMP转变为GMP和AMP,嘌呤核苷酸合成特点,先形成IMP(次黄嘌呤核苷酸),然后在单磷酸的水平上转变成AMP、GMP。IMP合成从5-P-核糖开始的,在ATP参与下先形成PRPP(5-磷酸核糖焦磷酸),催化该反应的酶是PRPP合成酶。PRPP为合成的起始物质。嘌呤的各个原子是在PRPP的C1上逐渐加上去的。由Asp、Gln、Gly、甲酸、CO2 提供N和C,合成时先形成右环(五员环),再形成左环(六员环)。四氢叶酸(FH4)是一碳单位的载体,嘌呤核苷酸合成补救途径(自学),磷酸核糖转移酶,嘌呤+PRPP,A(G)MP+
7、PPi,嘌呤+1-P-核糖,嘌呤核苷,A(G)MP,ATP ADP,嘌呤核苷酸合成补救途径,三、嘧啶核苷酸的合成,嘧啶核苷酸的嘧啶环是由氨甲酰磷酸(由谷氨酰胺和CO2合成)和天冬氨酸合成。,氨甲酰磷酸,天冬氨酸,尿嘧啶核苷酸的合成(三个阶段):,1、以CO2和谷氨酰胺为原料合成氨基甲酰磷酸 2、氨基甲酰磷酸和天门冬氨酸缩合生成氨基甲酰天冬氨酸。3、乳清酸接受PRPP的5磷酸核糖生成乳清酸核苷酸,并进一步脱羧生成尿嘧啶核苷酸。,激酶,天冬氨酸,氨甲酰磷酸,氨甲酰天冬氨酸,二氢乳清酸,转氨甲酰酶,二氢乳清酸酶,二氢乳清酸脱氢酶,乳清酸,乳清苷酸,尿嘧啶核苷酸,谷氨酸,谷氨酰胺,焦磷酸化酶,脱羧酶,
8、激酶,CTP合成酶,嘧啶核苷酸合成特点,其合成与嘌呤核苷酸的合成不同,先由氨甲酰磷酸与天冬氨酸形成嘧啶环,再与核糖磷酸焦磷酸(PRPP)结合形成 UMP,其关键的中间产物是乳清酸。胞苷酸则由尿苷酸在三磷酸的水平上转变而来。,四、核苷酸转化成核苷三磷酸,(脱氧)核苷酸激酶(d)NMP+ATP(d)NDP+ADP 激酶(d)NDP+ATP(d)NTP+ADP,核糖核苷酸的还原反应,核糖核苷酸还原酶,五、脱氧核糖核苷酸的合成,六、脱氧胸腺嘧啶核苷酸的合成,胸腺嘧啶核苷酸合成酶,NADPH+H+Ser(丝氨酸),NADP+Gly,N5、N10CH2 FH4 FH2,二氢叶酸还原酶,Ser羟甲基转移酶,
9、O,N,HN,O,dR-P,CH3,O,N,HN,O,dR-P,ATP+CO2+谷氨酰胺,氨基甲酰磷酸,UMP,氨基甲酸天冬氨酸,UTP,CTP,天冬氨酸,嘌呤核苷酸,ATP+5-磷酸核糖,嘧啶核苷酸,PRPP,七、从头合成的调节,八、核苷酸从头合成的抗代谢物,嘌呤类似物(6-巯基嘌呤):可抑制AMP、GMP的生成 谷胺酰胺类似物(氮杂丝氨酸):可抑制IMP的合成中有谷胺酰胺参与的反应 叶酸类似物(氨基蝶呤、氨甲喋呤):可抑制IMP合成中有四氢叶酸参与的反应,嘧啶类似物,胸腺嘧啶(T),5-氟尿嘧啶(5-FU),第十二章核酸的生物合成,第一节 DNA的生物合成学习三个问题:DNA的复制方式DN
10、A的复制的机制DNA的损伤与修复,一、DNA的复制方式半保留复制,(一)概念:每个子代DNA分子的一条链来自亲代的DNA,另一条链是新合成的,这种复制方式为DNA的半保留复制。半保留复制的假说是1953年沃森和克里克在DNA双螺旋结构的基础上提出的。,(二)DNA半保留复制的证据,1958年Meselson(麦尔逊)和Stahl(斯坦赫)首次用实验成功地证明了DNA的半保留复制,亲代DNA(15N15N),子一代DNA(15N14N),子二代DNA(15N14N,14N14N 1:1),子三代DNA(15N14N,14N14N 1:3),子四代DNA(15N14N,14N14N 1:7),亲代
11、DNA与子二代DNA的混合物,亲代DNA与子四代DNA的混合物,居中,重,轻,0,1,2,3,4,(三)DNA复制的必备条件,底物 dNTP(dATP,dGTP,dCTP,dTTP)聚合酶 DNA聚合酶(DNA依赖的DNA聚合酶)模板单链的DNA母链引物寡核苷酸引物(RNA)其他酶和蛋白质因子 解链酶,解旋酶,单链结合蛋白,连接酶,1、DNA聚合酶 DNA聚合酶是机体内以脱氧核苷三磷酸为底物催化合成DNA的一类酶。,DNA模板,引物 Mg2+,四种脱氧核苷三磷酸,催化作用所需要的条件,原核生物DNA聚合酶,DNA聚合酶:聚合作用:使DNA链按53方向延长。校对作用:具有沿3 5或5 3的外切酶
12、的作用。DNA聚合酶:聚合作用活力较低。仅有35的外切酶的作用。DNA聚合酶:聚合和校对作用是三种聚合酶中活力最高的一种。结论:三种聚合酶均具有聚合和校对的作用。而且具有方向性。,真核细胞DNA聚合酶,在高等真核细胞已分离到的DNA聚合酶有三种、。真核细胞DNA聚合酶与细菌DNA聚合酶的性质相似,聚合反应所需的条件也完全一样,所不同的是在真核细胞中的DNA聚合酶一般都不具有核酸外切酶作用。(只有聚合作用),2、DNA连接酶(1967年发现):若双链DNA中一条链有切口,一端是3-OH,另一端是5-磷酸基,连接酶可催化这两端形成磷酸二酯键,而使切口连接。但是它不能将两条游离的DNA单链连接起来。
13、,3、引发酶,促进引物合成的酶为引发酶。如以RNA片段为引物,则促进RNA片段合成的引发酶为RNA聚合酶。,4、复制中解链必需因子,(1)单链结合蛋白(SSB)作用:与单链结合,保护复制中的DNA单链部分不被核酸酶降解;刺激同源聚合酶的活力。(2)解链酶(解双螺旋酶)解链,为SSB提供可结合的单链区。(3)DNA拓扑异构酶(解旋酶)既能水解,又能连接磷酸二酯键 拓扑酶 切断DNA双链中的一股 拓扑酶 切断DNA双链,(四)DNA复制的起始点和复制方向,1、起始点和复制叉起始点是含有100200个碱基对的一段DNA。为DNA复制的起始部位。复制叉:在DNA复制前,DNA的两条链在起始点分开形成在
14、显微镜下可看到的叉状结构,称为复制叉。随着复制叉的移动完成DNA的复制 2、复制方向:单向复制和双向复制,3、环状DNA(大肠杆菌)的复制方向及复制特点,多以Q式方式复制。单向复制:复制叉从起始点向一个方向移动,随着复制叉的移动完成复制。双向复制:复制时首先在起始点裂开,复制叉从起始点开始向两个相反方向移动直到两个复制叉相遇。复制特点:在迅速生长的原核生物中,第一个染色体DNA分子复制尚未完成,第二个DNA分子就在同一个起始点上开始复制,其复制叉移动的速度是相当快的,每分钟约为105个碱基对。,单向复制,i,双向复制,观察到的放射自显影图象,4、真核生物线状DNA的复制方向及复制特点,特点:染
15、色体不同位置上有多个起始点;从这些起始点开始向相反的方向复制(双向复制),就形成多个复制泡;复制叉移动的速度较慢5x1025x103碱基对,但由于同时起作用的复制叉数目很大,所以真核生物染色体DNA复制的总速度比原核生物还快。,DNA的双向复制,二、DNA复制的机制半不连续复制半不连续复制的发现,1968日本学者冈崎:同位素实验,用含3H的dT标记用T4噬菌体感染的大肠杆菌 短时间内分离的DNA均为DNA小片段一段时间后检测到 DNA大片段。当用DNA连接酶的缺失的变异株时,检测到大量DNA片段的积累。证明DNA复制中有小片段合成。测定DNA小片段,远远大于合成DNA的一半。似乎两条链都是不连
16、续合成的,后发现是由于U替代dT渗入DNA中,而被尿嘧啶-N-糖基酶切除所致。在缺少尿嘧啶-N-糖基酶的突变植株中,DNA的U不再被切除,则检测到一半3H标记出现在小片段(冈崎片段)中。,(二)半不连续复制,1、含义:DNA在复制时,由双链分开的两条模板链上,两条新链是按53方向合成,其中一条链是连续合成的,另一条链则是先合成短的片段(冈崎片段),然后再将片段连接起来形成新链,这个复制过程为半不连续复制。,DNA复制的半不连续性,前导链,滞后链,冈崎片段,前导链:以3 5 方向的亲代链为模板连续合成的子代链。,滞后链:以5 3方向的亲代链为模板的子代链先逆复制叉移动方向合成冈崎片段,再连接成滞
17、后链。,参与DNA复制的酶与蛋白因子总览图,2、DNA 复 制 的 过 程,(1)合成起始 引发,在病毒、细菌、真核细胞中DNA的复制过程大同小异。大致可包括下列几个过程:辨认起始点 即由引发酶(RNA聚合酶)识别DNA模板上复制的起点由此启动开始合成引物。,3,5,5,3,起始点,RNA聚合酶(引发酶),模板DNA局部解曲解链,解曲酶、旋转酶与复制起始部位的模板结合,使这部分DNA发生局部解曲和解链作用,这样一段DNA链上的碱基暴露出来,与此同时SSB结合于已解开的链上。,5,3,3,5,SSB,解曲酶,旋转酶,RNA引物的生成,即分别以两条DNA链作模板,由RNA聚合酶催化合成RNA引物。
18、,引物,5,5,3,3,(2)DNA片段的合成及链的延伸,在RNA引物上由DNA聚合酶(真核生物为)催化,按照模板3 5链上的顺序,在引物3OH端接上相应的核苷酸。新链的合成按53方向进行(即前导链的合成)。与此同时与另一条链53为模板,合成冈崎片段,每一个冈崎片段5末端带一个引物,这条链为滞后链。,5,5,3,3,前导链,滞后链(岗崎片段),(3)合成终止,引物的切除 被特异核酸酶切除空缺部位的填补与连接由DNA聚合酶催化DNA片段合成,以补充核苷酸数,最后由连接酶将片段连接起来,从而形成两条连续的新链。,引物的切除 被特异核酸酶切除,5,5,3,3,前导链,滞后链(岗崎片段),合成终止(一
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