生物化学7第七章 蛋白质的生物合成 课件.ppt
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1、2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,1,蛋白质的生物合成,欢迎大家学习第七章,张 金 国,Protein biosynthesis,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,2,第七章 蛋白质的生物合成(4学时),第一节 遗传密码第二节 蛋白质的生物合成第三节 多肽链合成后的折叠与加工第四节 蛋白质合成后的运输和降解本章重点:蛋白质生物合成的原料和基本过程,三种RNA(tRNA、rRNA、mRNA)在蛋白质生物合成中的作用,遗传密码的概念;了解蛋白质生物合成后折叠与加工、运输和降解。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,3,从D
2、NA到蛋白质,基因能够自我复制,它的生理功能通过蛋白质的形式表达出来。DNA上的核苷酸序列是遗传信息的储存者,它通过自主复制得以延续,通过转录和翻译才能得到表达。DNA转录生成mRNA,再翻译成蛋白质(具有各种各样的生理功能),体现丰富多彩的生命世界。生物学中心法则图:,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,4,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,5,RNA穿出细胞核,指导蛋白质合成,转录,翻译,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,6,蛋白质生物的合成也称为翻译(Translation),蛋白质生物合成的本质是把mRNA分子
3、中4种核苷酸上所携带的遗传信息(遗传密码)转变为由20种氨基酸组成的多肽的过程。蛋白质生物合成的意义:为什么要合成蛋白质?(1)维持正常生命活动(生长、发育等);(2)适应环境变化;(3)参与组织的更新和修复。等等,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,7,蛋白质生物的合成蛋白质的生物合成机制是最复杂的生物合成机制,至少有300种不同的因子参与,蛋白质合成所需的化学能量约占细胞内全部生物合成的90%。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,8,第一节 遗传密码,一、中心法则二、遗传密码(一)遗传密码 的提出mRNA分子中所存储的蛋白质合成信息,是由组
4、成它的四种碱基(A、G、C、U)以特定顺序排列成三个一组的三联体代表的。即mRNA分子中,每三个相邻碱基代表一种氨基酸或翻译时蛋白质的起始、终止信号,称为遗传密码(codon),三联体密码。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,9,(二)遗传密码的破译 1966年64种密码全部确定。起始密码:AUG氨基酸密码终止密码:UAA,UGA,UAG三联体密码的确定 43=64 AAA AAT AAG AAC ATA ATT ATG ATC AGA AGT AGG AGC.1968年,Holley(霍利)、Nirenberg(尼伦伯格)、Khorana(柯拉纳)获诺贝尔奖。,20
5、23/4/2,ZhangJG-Biochemistry,10,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,11,镰刀形红细胞贫血、分子病、遗传病人的16号染色体上有一段DNA序列(基因),决定血红蛋白的氨基酸组成。当此DNA序列的某一对碱基发生改变(突变),转录的mRNA碱基改变,引起血红蛋白的氨基酸组成发生变化,最终导致镰刀型细胞贫血症。如链第6位应是谷氨酸,其对应的碱基密码是GAA,当颠换成GUA时,表达的氨基酸改为缬氨酸。正常人mRNA GAA患者 mRNA GUA 1 2 3 4 5 6 7 8 Hb-A Val His Leu Thr Pro Glu Glu Lys
6、Hb-S Val His Leu Thr Pro Val Glu Lys,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,12,(三)遗传密码的特性,1)方向性:每个密码子三联体决定一种AA。阅读方向是从mRNA的起始密码 AUG开始,按5 3方向直到终止密码止。2)通用性:所有生物的几乎一样。但现发现线粒体和叶绿体中密码含义与染色质DNA密码含义略有差异。3)不重叠性:mRNA中的每个核苷酸只使用一次,不重叠使用,即密码子三联体不重叠。并且连续性,无标点符号。有少数例外,如大肠杆菌R17噬菌体的RNA基因组中,有部分基因重叠。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemis
7、try,13,基因损伤引起mRNA阅读框架内的碱基发生插入或缺失,可能导致框移突变(frameshift mutation)。置换后果很严重!,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,14,镰刀形红细胞贫血、分子病、遗传病人的16号染色体上有一段DNA序列(基因),决定血红蛋白的氨基酸组成。当此DNA序列的某一对碱基发生改变(突变),转录的mRNA碱基改变,引起血红蛋白的氨基酸组成发生变化,最终导致镰刀型细胞贫血症。如链第6位应是谷氨酸,其对应的碱基密码是GAA,当颠换成GUA时,表达的氨基酸改为缬氨酸。正常人mRNA GAA患者 mRNA GUA 1 2 3 4 5 6
8、7 8 Hb-A Val His Leu Thr Pro Glu Glu Lys Hb-S Val His Leu Thr Pro Val Glu Lys,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,15,4)简并性:2种或2种以上密码子编码一种氨基酸的现象称为密码子的简并性。如GGN(GGA、GGU、GGG、GGC)都编码Gly,那么这4种密码子就称为Gly的简并密码。只有Met和Trp没有简并密码。一般情况下密码子的简并性只涉及第三位碱基。同义密码子,即编码同一种AA的不同密码子。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,16,2023/4/2,Zhan
9、gJG-Biochemistry,17,5)密码子的摇摆性:密码子中第三位碱基与tRNA上的反密码子第一位碱基的配对有时不一定完全遵循A-U、G-C的原则,称为摇摆性。也就是说密码子的碱基配对只有第一、二位是严谨的,第三位严谨度低,Crick把这种情况称为摇摆性,有人也称摆动配对或不稳定配对。显然,密码子的第三位和反密码子的第一位是摇摆位点。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,18,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,19,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,20,6)终止密码、起始密码终止密码有3组:UAA,UAG,U
10、GA其中UGA也代表硒代半胱氨酸(SeC)的遗传密码起始密码:AUGAUG是常用的起始密码,也代表甲硫氨酸的密码。GUG是缬氨酸的密码,偶尔也作为起始密码。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,21,7)线粒体的遗传密码1980年的研究发现,无论动物、植物、酵母,其线粒体的个别遗传密码与标准密码有所不同。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,22,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,23,第二节蛋白质的生物合成,主要由mRNA、tRNA、rRNA以及有关的酶和蛋白质因子共同组成。原核生物与真核生物的蛋白质合成过程中有很大的
11、区别,真核生物此过程更复杂,着重介绍原核生物蛋白质合成的过程,并指出真核生物与其不同这处。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,24,参与蛋白质生物合成的物质1、三种RVAmRNA-模板rRNA-构成核糖体作为蛋白质合成场所tRNA-搬运工具2、三种酶氨基酰-tRNA合成酶:催化氨基酸与tRNA结合转肽酶(肽合成酶):催化氨基酸之间形成肽键,使肽链延长。转位酶:催化肽键从核糖体上A部位P部位。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,25,3、三种蛋白质因子起始因子(initiation factor)IF延伸因子(elongation factor
12、)EF,释放因子(release factor)RF。4、二十种氨基酸-原料5、能源物质ATP、GTP6、无机离子Mg2+、K+参与蛋白质生物合成的成份至少有300种。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,26,一、核糖体的结构和功能(一)rRNA(核糖体)是肽链合成的场所核糖体,又称核蛋白体,是细胞内一种核糖核蛋白颗粒,为椭球形的粒状小体。主要由RNA和蛋白质构成,其功能是按照mRNA的指令将氨基酸合成蛋白质多肽链,所以核糖体是细胞内蛋白质合成的分子机器。核糖体按沉降系数分为两类:原核生物中:70 S,真核细胞中:80 S。,2023/4/2,ZhangJG-Bioc
13、hemistry,27,(二)不同细胞核蛋白体的组成,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,28,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,29,核糖体上的功能部位单个核糖体上有6个活性部位,在蛋白质合成中各有专一的识别作用。三个主要部位:A部位、P部位、E部位。1.A部位:氨基酸部位、接受位,在大亚基上,是结合氨酰基-tRNA的部位。2.P部位:肽基部位,肽酰基结合部位,在小亚基上。3.E部位:出口位,是将已经完成翻译任务的tRNA从核糖体上释放的部位。4.转肽酶部位(肽合成酶),简称T因子:位于大亚基上,催化氨基酸间形成肽键,使肽链延长。5.转位酶,
14、简称G因子,对GTP具有活性,催化肽键从A部位P部位。6.mRNA结合部位,在小亚基上。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,30,核糖体是蛋白质合成的工厂,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,31,大肠杆菌核糖体的结构模型,大肠杆菌70S核糖体为一椭圆形球体,30S亚基比较扁平,分成头部与基部两部分,基部一侧伸出一个平台,平台与头部间有一个裂口。50S亚基象一个半球,平面侧伸出3个突起。当30S亚基与50S亚基结合成70S核糖体时,两个亚基接合面上留有相当大的空隙,蛋白质的合成可能就在这个空隙中进行。,2023/4/2,ZhangJG-Bioc
15、hemistry,32,原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式:,A位:氨基酰位(aminoacyl site),P位:肽酰位(peptidyl site),E位:排出位(exit site),2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,33,二、tRNA转运活化的氨基酸至mRNA模板上,tRNA作用:tRNA的反密码子环与mRNA的密码配对tRNA的3-端CCA-OH是氨基酸的结合位点tRNA起结合体(adaptor适配器)作用,氨基酸运载体tRNA分子上与蛋白质生物合成有关的位点至少有4个:3-CCA-OH,是AA接受位点;识别氨酰-tRNA合成酶的位点;核糖体识别位点,使延长
16、中的肽链附着于核糖体上;反密码子位点,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,34,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,35,mRNA是翻译的直接模板,原核生物与真核生物mRNA的区别原核生物多顺反子(真核)单顺反子(真核)5端帽子结构 3端polyA尾巴 三联体密码-mRNA上每三个相邻的碱基构成一个遗传密码,决定一种氨基酸.蛋白质生物合成的本质是把mRNA分子中四种核苷酸上所携带的遗传信息转变为由二十种氨基酸组成的多肽的过程。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,36,2023/4/2,ZhangJG-Biochemist
17、ry,37,三、氨基酸的活化(氨酰-tRNA的合成),氨酰-tRNA合成酶的特点:(1)高度特异性,双向识别功能,既能识别氨基酸,又能识别tRNA;(2)只作用于L-氨基酸。这种严格的专一性大大减少多肽合成中的差错。注意:每个氨基酸的活化反应,净消耗2个高能键。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,38,四、蛋白质生物合成的过程,蛋白质生物合成可分为三个阶段:1、多肽链合成的起始、2、肽链的延长、3、肽链的终止和释放。多肽链的折叠和翻译后的加工修饰。,2023/4/2,ZhangJG-Biochemistry,39,大肠杆菌蛋白质合成五个主要阶段所需成分,2023/4/
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