发酵专业论文.doc
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1、第二章 发酵工业菌种第一节 发酵工业菌种概述1、微生物的特性:有些微生物能在厌氧的条件下生长;有些微生物能够利用简单的有机物和无机物满足自身的生长;有些微生物能进行复杂的代谢;有些微生物能利用较复杂的化合物;有些微生物能在极端的环境下生长2、工业化菌种的要求:能够利用廉价的原料,简单的培养基,大量高效地合成产物有关合成产物的途径尽可能地简单,或者说菌种改造的可操作性要强;遗传性能要相对稳定;不易感染它种微生物或噬菌体;产生菌及其产物的毒性必须考虑(在分类学上最好与致病菌无关);生产特性要符合工艺要求3、抗生素生产有关的微生物放线菌(链霉素四环素;红霉素等) ;真菌(青霉素、头孢等);一些产芽孢
2、的细菌;植物或动物来源4、氨基酸生产有关的微生物代谢控制发酵:用人工诱变的方法,有意识地改变微生物的代谢途径,最大限度地积累产物,这种发酵形象地称为代谢控制发酵,最早在氨基酸发酵中得到成功应用。5、食品酶制剂生产有关的微生物开发一个新酶,都要经过一系列研究的毒理试验。关于食品用酶,美国需要得到FDA的批准。目前已同意使用的仅仅少数微生物能用于生产食品用酶。淀粉酶:黑曲霉、米曲霉、米根霉、枯草芽孢杆菌和地衣芽孢杆菌6、常用的基因表达系统(一)原核生物:大肠杆菌、枯草芽孢杆菌:生长迅速、蛋白产量高;表达蛋白的纯化、分离及分析快速;外源基因的导入相对容易;已建立了整套表达理论及技术。(二) 真核细胞
3、表达系统:酵母(既是微生物又是真核细胞):生长迅速,营养要求不高,易培养;安全性好;比哺乳动物细胞操作简单;具有一定的修饰蛋白的能力。中国仓鼠卵巢细胞(CHO细胞)表达系统:具有准确的转录后修饰功能;具有产物胞外分越功能,便于下游产物分离纯化;具有重组基因的高效扩增和表达能力;具有贴壁生长特性,也可进行悬浮生长;CHO很少分泌自身的内源蛋白。微生物(包括动、植物细胞)几乎可以生产我们所需的一切产品,但是涉及到工业化生产对于某一种特定的产品,只有特定的微生物才具有大量表达的潜力。第二节 发酵工业菌种的分离筛选1、菌种选择的总趋势:野生菌变异菌;自然选育代谢控制育种;诱发基因突变基因重组的定向育种
4、 2、分离筛选原理与技术:(1)筛选的两种指导思想先分离纯化,再结合工艺要求进行筛选;分离纯化同时富于筛选条件,一步得出所需菌株。(2) 分离筛选工作在实际中应用的几个方面:从被污染的生产及科研用菌中分离目的菌;生产中长期使用的菌种的定期分离筛选 ;从各种育种方法处理的微生物材料中分离筛选适于工业目的的优良菌株 ;从已知菌种和大自然中分离新菌株寻找新的发酵产品的产生菌;寻找老产品的新的优良菌株。从保藏机构获取菌种进行分离筛选有两个好处:经济性、指导性(3)新种分离筛选:菌种分离的一般过程:土样的采集 预处理富集培养 菌种分离菌种的初筛与复筛采样时要注意的问题:气候、水分、空气;来源要广;结合产
5、品的特点;标签:地点、时间、气候等富集的目的:让目的微生物在种群中占优势,使筛选变得可能。富集的三种方案:定向培养:采用特定的有利于目的微生物富集的条件,进行培养;当不可能采用定向培养时,则可设计在一个分类学中考虑;不能提供任何有助于筛选产生菌的信息,这时只能通过随机分离的办法定向培养的方法:(1)物理方法:加热、膜过滤等;但主要是通过培养的方法(2)分离方法的选择:根据目的菌有无选择性特征来选择分离方法菌种的营养特征独特或生长特征独特选择性分离 无选择性特征根据产物的特征进行随机分离 (3)选择性分离的关键:生长培养条件的选择与控制,从而实现定向富集筛选。 (4)选择性分离原理和技术:生长条
6、件的选择与控制原理(控制营养成分 、控制培养基酸碱度、添加抑制剂、控制培养温度、控制通气条件)+选择性分离技术(富集液体培养技术、固体培养技术)例如:固体培养技术常用于分离某些酶产生菌;选择压力:在选择培养基中加入所需酶的基质,通过直接平皿反应。如乳酸菌、淀粉酶等。随机分离原理与技术从产物入手,通过设计高产培养基和建立快速灵敏专一的筛选方法,从随机分离的菌落中筛选出所需的目的菌。技术关键:产物合成条件的选择与控制及相应筛选方法的确定。随机分离技术举例:抗生素产生菌的筛选、生长因子产生菌的筛选、多糖产生菌的筛选 第三节 菌种改良1、 目的:提高目标产物的产量、提高目标产物的纯度,减少副产物、改良
7、菌种性状,改善发酵过程、改变生物合成途径,以获得高产的新产品 2、 方法:基因突变(自然选育、诱变育种)、基因重组(杂交、原生质体融合、基因工程)自然突变(菌种的分离纯化):(1)有两种情况:一种表现为菌株的衰退和生产质量的下降,这种突变成为负突变;另一种是对生产有利,这种突变成为正突变。(2)工业生产上的意义:自然选育虽然突变率很低,但却是工厂保证稳产高产的重要措施。(3)回复突变:高产菌株在传代的过程中,由于自然突变导致高产性状的丢失,生产性能下降。(4)步骤:单细胞(孢子)悬液的制备;平板分离;挑选单菌落(注意形态的观察);发酵试验诱变育种:用各种物理、化学的因素人工诱发基因突变进行的筛
8、选(1)诱变剂:能够提高生物体突变频率的物质称为诱变剂(物理:紫外,快中子;化学:硫酸二乙酯,亚硝基胍)(2)诱变剂处理过程中几个有关的问题:化学诱变剂使用过程的安全性;诱变剂量的选择;诱变剂的选择;出发菌株的选择(3)、筛选的方法:随机筛选、形态、理性化筛选(从产物形成的生理生化途径着手,进行有的放矢的筛选。如结构类似物抗性、营养缺陷型等,筛选而产生的这些特性,称为遗传标记。)结构类似物:在化学和空间结构上和代谢的中间物(终产物)相似,因而在代谢调节方面可以代替代谢中间物(终产物)的功能,但细胞不能以其作为自身的营养物质。代谢设计育种(一)代谢设计育种的策划(1) 目的产物代谢途径的组合(五
9、段式)(2)中心代谢流上节点的分析(3) 理想载流途径的推定 (5) 五字策略的应用:进、通、节、堵、出(二)育种方案的实施(1) 出发菌种的选定:调节机制简单、遗传标记可靠、生长情况良好、有目的产物的生产潜力、可以获得、经费方面可行(2) 遗传操作方案的制定:物理诱变、化学诱变、复合诱变、定向诱变、插入基因拷贝、插入途径基因组(3) 遗传操作方案的实施:缺陷型突变株的获得(营养因子、酶和功能性蛋白质、营养缺陷与渗漏营养缺陷突变株、酶缺损突变株、输送体系缺损突变株、条件突变株)、结构类似物抗性突变株的获得、 结构类似物超敏性突变株的获得、分子生物学方法、突变株的获得结构类似物(代谢撷颃物)的选
10、择:一、空间结构类似,二、对微生物有致死性或毒性(抑制生长);绝大多数情况下,结构类似物可被其“真身”解毒。 三、有些抗生素、药物(包括中药)、诱变剂本身就是结构类似物(代谢撷颃物),但需确证。结构类似物抗性突变株的获得:结构类似物的确定;生长抑制试验和敏感性试验;“筛子”的设计;剂量的确定;筛选的具体方法的确定;高产株的检出(4)变异株培养条件的优化:尽量从生物学的角度安排试验;尽量排除培养基消毒、摇瓶培养条件不一致带来的系统误差;每批摇瓶(生物)试验都要做对照;注重产量与菌体量之间的的微妙关系(生物机器的特殊性)代谢工程定义利用多基因重组技术有目的地对细胞代谢途径进行修饰、改造,改变细胞特
11、性,并与细胞基因调控、代谢调控及生化工程相结合,为实现构建新的代谢途径,生产特定目的产物而发展起来的一个新的学科领域。又称作途径工程,是多基因的基因工程。发展基础代谢网络理论:是把细胞的生化反应以网络整体,而不是孤立地来考虑。代谢网络分流处的代谢产物称为节点,其中对终产物合成起决定作用的少数节点称为主节点。根据节点下游分支的可变程度,节点分为:柔性节点: 解除一个分支的反馈抑制可提高该分支下游产物的产量。半柔性节点:须降低主分支的酶活并同时提高次分支的酶活或解除其反馈抑制,才可提高次分支下游产物的产量。刚性节点:其下游各分支的比例不易改变。代谢工程育种思路改变代谢流:改变分支代谢途径的流向,阻
12、断有害代谢产物的合成。(1)加速限速反应(2)改变分支代谢途径流向:提高代谢分支点的某一分支代谢途径酶系的活力,在与另外的分支代谢途径的竞争中占有优势,可以提高目的代谢末端产物的产量。(3)构建代谢旁路(4)改变能量代谢途径扩展代谢途径 (1)在引入外源基因后,使原来的代谢途径向后延伸,产生新的末端代谢产物。 (2)使原来的代谢途径向前延伸,可以利用新的原料生物合成代谢末端产物。转移或构建新的代谢途径 1)转移代谢途径: 为生产某一新的化学结构的代谢产物,将催化某一代谢途径的基因组克隆到另一不具备该种能力的微生物中,达到代谢途径转移的目的,使之具备生产该种新化合物的能力。 2)构建新的代谢途径
13、: 利用基因工程手段,通过克隆少数基因将原来细胞中无关的两条代谢途径桥连在一起,形成新的代谢途径。第四节 菌种保藏与复壮菌种保藏:1、保藏目的:使菌种不死亡,不生长,不污染,不降低或丧失其优良性,以尽量延长使用时间。2、原理:创造不利于菌种生长的一切条件,使其代谢处于休眠状态。(低温、无氧、干燥、缺营养)3、菌种保藏的方法:.斜面低温法斜面菌种置46冰箱中(36个月),简单、保存时间短,易污染及退化;穿刺保藏法1%软琼脂培养基,用接种针将菌种穿刺接入培养基的1/2处,覆盖2-3 mm无菌液体石蜡,冰箱,6-12个月;沙土管干燥保藏法载体:沙、土、沙 + 土、干燥、寡营养,适用于形成芽孢的细菌、
14、产生孢子的丝状真菌和放线菌;液体石蜡保藏法在生长良好的斜面表面覆盖一层无菌液体石蜡,液面高出斜面1 cm,直立放置,延长保藏时间;真空冷冻干燥保藏法各保藏机构广泛采用的主要保藏方法,原理:创造干燥和低温的保藏环境,方法:在较低的温度下,将细胞冻结,并且保持细胞完整;然后在减压情况下使水分升华,获得干燥的菌体样品,特点:保藏期长(5年)、变异小、适用范围广,需要一定的设备,操作相对繁琐,技术要求较高;液氮超低温保藏法保藏效果好,方法简单,适用范围最广,原理:液氮的温度可达-196,此时菌种的代谢活动停止,化学作用亦随之消失,方法:将菌种悬浮液封存于圆底安瓿管或塑料的液氮保藏管内,放到液氮罐内保藏
15、。菌种的复壮1、菌种的衰退:是指由于自发突变的结果,而使某种原有一系列生物学性状发生量变或质变的现象。表现:形态改变,生长慢,抗逆性差,产量及质量下降。根源:内因是菌种的遗传物质发生率负变异,外因是传代过多,条件不适宜2、防衰措施:保证菌种的纯培养;严格控制传代次数;用适宜菌龄的菌种;用适宜培养条件及保藏条件3、狭义复壮:指的是在菌种已在发生衰退的情况下,通过纯种分离和测定典型性状,生产性能等指标,从已衰退的群体中筛迁出少数尚未退化的个体,以达到恢复原菌株固有的性状的相应措施。4、广义的复壮:是一项积极的措施,即在菌种的典型特征或生产性状尚未衰退前,主经常有意识地采服纯种分离和生产性状的测定工
16、作,以期众中选择到自发的正变个体。5、复壮方法:纯种分离,通过寄主体进行复壮,淘汰已衰退的个体纯种分离:即从已衰退的菌种中,通过分离纯化,将尚未退化的个体分离出来,以恢复和建立具有原来生产性状的群体,继续供科研及生产使用。分离方法:一是只要求达到菌落纯化的水平,通过稀释平板法、划线法、表面涂血法等常规操作法,该方法较为粗放,适用于菌退化不太严重的情况。另一类方法,可达到“细胞纯”的水平,采用单胞分离法,也可以二者结合,先用前一种方法获得较纯的菌种后再采用单胞分离法进一步纯化。通过寄主体进行复壮对于寄生性微生物如苏云金杆菌、白僵菌、多角体病毒等,由于长期使用,其毒力会下降,导致杀虫效率降低待衰退
17、现象。这时可以用菌种却感染菜青虫幼虫等,然后从致死的虫体上重新分离,经过几次重复感染与分离,就可以逐步恢复和提高毒力。 淘汰已衰退的个体通过物理、化学的方法处理菌体(或孢子),使大部分死亡(80%以上),存活的菌多为生长健壮者,可从中选出优良菌种来。第三章 发酵工业培养基设计 培养基:广义上讲培养基是指一切可供微生物细胞生长繁殖所需的一组营养物质和原料。同时培养基也为微生物培养提供除营养外的其它所必须的条件。 发酵培养基的作用:满足菌体的生长/促进产物的形成发酵培养基的要求:培养基能够满足产物最经济的合成;发酵后所形成的副产物尽可能的少;培养基的原料应因地制宜,价格低廉;且性能稳定,资源丰富,
18、便于采购运输,适合大规模储藏,能保证生产上的供应;所选用的培养基应能满足总体工艺的要求,如不应该影响通气、提取、纯化及废物处理等。第一节 培养基的类型及功能按纯度:(1)合成培养基 : 原料其化学成分明确、稳定;适合于研究菌种基本代谢和过程的物质变化规律;培养基营养单一,价格较高,不适合用于大规模工业生产 (2)天然培养基: 采用天然原料,原料来源丰富(大多为农副产品)、价格低廉、适于工业 化生产 ;原料质量等方面不加控制会影响生产稳定性 按状态:(1)固体培养基 :适合于菌种和孢子的培养和保存,也广泛应用于有子实体的真菌类;(2)半固体培养基:即在配好的液体培养基中加入少量的琼脂,一般用量为
19、0.5%0.8% ,主要用于微生物的鉴定。(3)液体培养基:80%90%是水,其中配有可溶性的或不溶性的营养成分,是发酵工业大规模使用的培养基。 按用途:孢子(斜面)培养基、种子培养基和发酵培养基三种 第二节 发酵培养基的成分及来源 碳源:作用提供微生物菌种的生长繁殖所需的能源和合成菌体所必需的碳成分;提供合成目的产物所必须的碳成分来源糖类、油脂、有机酸、正烷烃工业上常用的糖类 葡萄糖:所有的微生物都能利用葡萄糖,但是会引起葡萄糖效应 糖蜜:糖蜜是制糖生产时的结晶母液,它是制糖工业的副产物。 糖蜜主要含有蔗糖,总糖可达50%75%。糖蜜使用的注意点:除糖份外,含有较多的杂质,其中有些是有用的,
20、但是许多都会对发酵产生不利的影响,需要进行预处理。氮源氮源主要用于构成菌体细胞物质(氨基酸,蛋白质、核酸等)和含氮代谢物。常用的氮源可分为两大类:有机氮源和无机氮源。 1、无机氮源:氨盐、硝酸盐和氨水特点:微生物对它们的吸收快,所以也称之谓迅速利用的氮源。但无机氮源的迅速利用常会引起pH的变化 无机氮源被菌体作为氮源利用后,培养液中就留下了酸性或碱性物质,这种经微生物生理作用(代谢)后能形成酸性物质的无机氮源叫生理酸性物质,如硫酸铵,若菌体代谢后能产生碱性物质的则此种无机氮源称为生理碱性物质,如硝酸钠。正确使用生理酸碱性物质,对稳定和调节发酵过程的pH有积极作用。 所以选择合适的无机氮源有两层
21、意义:满足菌体生长;稳定和调节发酵过程中的pH2、有机氮源来源:工业上常用的有机氮源都是一些廉价的原料,花生饼粉、黄豆饼粉、棉子饼粉、玉米浆、玉米蛋白粉、蛋白胨、酵母粉、鱼粉、蚕蛹粉、尿素、废菌丝体和酒糟。成分复杂:除提供氮源外,有些有机氮源还提供大量的无机盐及生长因子。有机氮源成分复杂可以从多个方面对发酵过程进行影响,而另一方面有机氮源的来源具有不稳定性。所以在有机氮源选取时和使用过程中,必须考虑原料的波动对发酵的影响3、氮源使用的一些相关问题:有机氮源和无机氮源应当混合使用;有些产物会受氮源的诱导和阻遏;有机氮源选取时也要考虑微生物的同化能力;无机盐及微量元素来源:C、N源,以盐的形式补充
22、使用注意点:对于其它渠道有可能带入的过多的某种无机离子和微量元素在发酵过程中必须加以考虑;使用时注意盐的形式(pH的变化)生长因子、前体和产物促进剂生长因子:从广义上讲,凡是微生物生长不可缺少的微量的有机物质,如氨基酸、嘌呤、嘧啶、维生素等均称生长因子。 前体:某些化合物加入到发酵培养基中,能直接被微生物在生物合成过程中合成到产物物分子中去,而其自身的结构并没有多大变化,但是产物的产量却因加入前体而有较大的提高。用量:前体的用量可以按分子量衡算,具体使用有个转化率的问题例:6000单位/ml的青霉素G-Na(MW356),需要多少苯乙酸(MW136) 1mg=1667u 解:青霉素6000*0
23、.6(微克)36mg/ml 苯乙酸(36*136)/356=13.8mg/ml=1.38%实际使用时的转化率在46-90%之间例某厂单耗为:0.337(kg/10亿青霉素) 转化率为:0.6/(0.337*36/13.8)=68%补充:前体一般都有毒性,浓度过大对菌体的生长不利;前体使用时普遍采用流加的方法,前体相对价格较高,添加过多,容易引起挥发和氧化, 流加也有利于提高前提的转化率苯乙酸,一般基础料中仅仅添加0.07%产物促进剂:指那些非细胞生长所必须的营养物,非前体,但加入后却能提高产量的添加剂。有些促进剂本身是酶的诱导物;有些促进剂是表面活性剂,可改善细胞的透性,改善细胞与氧的接触从而
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