高通量测序应用资料课件.ppt

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1、高通量测序 应用,1,2,高通量测序的用途,将miRNA的标记与线性放大相结合，只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。高通量测序在microRNA中的应用高通量测序在mRNA表达谱的应用Illumina公司的Solexa测序仪，ABI公司的SOLiD 测序仪高通量测序在甲基化的应用高通量测序方法原理示意图高通量测序的三大平台：目前，科学家正为1000美元完成一个基因组测序而努力。罗氏公司(Roche)的454 测序仪，将miRNA的标记与线性放大相结合，只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。多家研究单位正在为此展开竞争，而且进展比预期

2、的更快。罗氏公司(Roche)的454 测序仪，ABI公司的SOLiD 测序仪高通量测序方法原理示意图对含有全基因组序列且转录本注释较好的物种开展转录组学研究，解析细胞转录产物的数量变化及其结构信息。高通量测序在基因组上应用,3,高通量测序的用途,基因组序列的物种进行重测序，鉴定SNP，indel及基因组结构变化；对含有全基因组序列且转录本注释较好的物种开展转录组学研究，解析细胞转录产物的数量变化及其结构信息。,4,高通量测序现状,第二代测序技术，又称超高通量测序。目前，科学家正为1000美元完成一个基因组测序而努力。多家研究单位正在为此展开竞争，而且进展比预期的更快。,5,高通量测序原理,高

3、通量测序方法原理示意图,6,高通量测序平台,高通量测序的三大平台：Illumina公司的Solexa测序仪，罗氏公司(Roche)的454 测序仪，ABI公司的SOLiD 测序仪,7,高通量测序特点,速度快通量高结果一致性好简便高效,8,高通量测序在基因组上应用,应用于人基因组重测序动植物、细菌基因组测序,9,高通量测序在mRNA表达谱的应用,将miRNA的标记与线性放大相结合，只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。,10,高通量测序在microRNA中的应用,高通量、低成本易于寻找新片段及作用位点,11,高通量测序在CHIP-CHIP的应用,相对ref seq，

4、染色质免疫沉淀以后的DNA直接进行测序,可以直接获得蛋白与DNA结合的位点信息相对ChIP-chip,ChIP-seq可以检测更小的结合区段、未知的结合位点、结合位点。,12,高通量测序在甲基化的应用,对于DNA甲基化的检测，目前采用：甲基化DNA富集并结合高通量测序，可以检测到全基因组范围内的甲基化现象。特点：高效，准确,13,特异片段测序,血浆DNA测序游离RNA测序,罗氏公司(Roche)的454 测序仪，相对ref seq，染色质免疫沉淀以后的DNA直接进行测序,可以直接获得蛋白与DNA结合的位点信息对含有全基因组序列且转录本注释较好的物种开展转录组学研究，解析细胞转录产物的数量变化及

5、其结构信息。多家研究单位正在为此展开竞争，而且进展比预期的更快。高通量测序在基因组上应用将miRNA的标记与线性放大相结合，只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。对于DNA甲基化的检测，目前采用：甲基化DNA富集并结合高通量测序，可以检测到全基因组范围内的甲基化现象。将miRNA的标记与线性放大相结合，只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。将miRNA的标记与线性放大相结合，只需要几皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA芯片表达谱。高通量测序在microRNA中的应用高通量测序在甲基化的应用高通量测序在基因组上应用高通量测序在microRNA中的应用罗氏公司(Roche)的454 测序仪，高通量测序在mRNA表达谱的应用,14,未来-高通量测序会成为临床辅助工具,致病基因碱基突变,15,Thank you！,