癌细胞边缘检测毕业设计(含外文翻译).doc
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1、癌细胞边缘检测(基于迭代算法和腐蚀算法的轮廓提取)摘 要提起癌症很多人都会感到恐惧,癌症是当今世界上最常见的致命疾病之一,世界上每年都有很多人死于癌症,并且发病率仍在逐年上升。癌症的治疗取决于对他早期的诊断,早期是治疗癌症的最佳时期。现在大多数癌症病例确诊的时候已经属于晚期,失去了治愈的最佳时机,因此进行准确的早期诊断和治疗已成为迫切需要解决的问题。因为癌细胞和非癌细胞对于病理专家在传统的显微镜下观察切片或涂片的方法下很难进行区分,借助现代计算机技术结合病理专家实践经验,采用图像处理技术对医学图像进行处理,可以提高判断的有效性和图像信息的使用效率,从而对癌细胞进行更加准确的识别。这对医学科研与
2、教学,以及临床诊断方面有着现实的意义和广阔的前景。数字图像处理技术已被广泛应用到生物医学领域,运用计算机对图像进行处理和分析,并进一步完成癌细胞的检测与识别,能有效的协助医生对肿瘤癌症做出诊断。在识别癌细胞时,需要做出定量的结果,人眼很难准确的完成这类工作,而利用计算机图像处理完成显微图像的分析和识别已经取得了很大的进展。近年来国内外医学图像研究者对癌细胞的检测识别提出了很多理论和方法,对癌细胞的诊断具有十分重要的意义和实践价值。细胞边缘的检测是进行细胞面积圆度个数和颜色等形态及色度学的计算和分析的基础,其检测结果直接影响病情的分析和诊断结果。经典的边缘检测算子如Sobel算子,Laplaci
3、an算子等利用图像的每个像素邻域内灰度的变化来检测边缘。虽然这些算子计算简单、速度较快,但存在对噪声干扰敏感,得到孤立或分小段连续边缘像素,重叠相邻细胞边缘等缺陷,而利用最佳阀值分割和轮廓提取相结合的方法进行边缘检测,通过迭代算法求得图像分割的最佳阈值,再利用轮廓提取算法,挖去细胞内部像素点,最后剩余部分图像就是细胞的边缘,改变了传统边缘检测算法的处理顺序,通过MATLAB编程实现后,实验结果表明能有效抑制噪声干扰影响,同时能够客观地、正确地选取边缘检测的门限值,从而进行精确的细胞边缘检测。关键词:癌细胞,边缘检测,最佳阈值,轮廓提取,数字图像处理 CANCER CELL EDGE DETEC
4、TION (BASED ON ITERATIVE ALGORITHM AND CORROSION ALGORITHM, CONTOUR EXTRACTION) ABSTRACTMany people will mention cancer fear, cancer is one of the most common fatal diseases in the world today the world every year many people die of cancer, and incidence rate is still increasing every year. The trea
5、tment of cancer depends on the diagnosis of his early, early is the best period of the treatment of cancer. The time of diagnosis of most cases of cancer are now belong to the late, lost the best time to cure, so the accurate early diagnosis and treatment has become an urgent need to address the pro
6、blem.Cancer cells and non-cancer pathology experts in a traditional microscope to observe the biopsy or smear difficult to distinguish, with the help of modern computer technology, combined with practical experience of the pathologist, medical image processing using image processing technology, can
7、improve to judge the effectiveness and efficiency in the use of the image information and thus more accurate identification of cancer cells. This has practical significance and broad prospects for medical research and teaching, and clinical diagnosis.Digital image processing technique has been widel
8、y applied to the biomedical field, the use of computer image processing and analysis, and complete detection and recognition of cancer cells can help doctors make a diagnosis of tumor cancers. Need to be made in the identification of cancer cells, the quantitative results, the human eye is difficult
9、 to accurately complete such work, and the use of computer image processing to complete the analysis and identification of the microscopic images have made great progress. In recent years, domestic and foreign medical images of cancer cells testing to identify the researchers put forward a lot of th
10、eory and method for the diagnosis of cancer cells has very important meaning and practical value.Cell edge detection is the cell area of the number of roundness and color, shape and chromaticity calculation and the basis of the analysis their test results directly affect the analysis and diagnosis o
11、f the disease. Classical edge detection operators such as Sobel operator, Laplacian operator, each pixel neighborhood of the image gray scale changes to detect the edge. Although these operators is simple, fast, but there are sensitive to noise, get isolated or in short sections of a continuous edge
12、 pixels, overlapping the adjacent cell edge defects, while the optimal threshold segmentation and contour extraction method of combining edge detection, obtained by the iterative algorithm for the optimal threshold for image segmentation, contour extraction algorithm, digging inside the cell pixels,
13、 the last remaining part of the image is the edge of the cell, change the processing order of the traditional edge detection algorithm, by MATLAB programming, the experimental results that can effectively suppress the noise impact at the same time be able to objectively and correctly select the edge
14、 detection threshold, precision cell edge detection. KEY WORDS:The cancer cells, edge detection, and optimal threshold, contour extraction, digital image processing目录 前言1第1章 图像处理基础31.1 数字图像处理基本知识31.2 图像灰度化51.3 图像平滑滤波61.3.1 邻域平均滤波61.3.2 中值滤波7第2章 边缘检测92.1 边缘检测概述92.2 经典边缘检测算子92.2.1 Robert算子102.2.2 Sobe
15、l算子和Prewitt算子102.2.3 Krisch算子102.2.4 Laplacian算子112.2.5 Canny 算子112.2.6 LoG( Laplacian of Gaussian)算子11第3章 基于迭代算法和腐蚀算法的轮廓提取133.1 迭代算法概述133.1.1 应用举例133.2 最佳阈值分割迭代法143.3 腐蚀算法153.3.1 集合论方法的理论基础153.3.2 图像的腐蚀163.4 轮廓提取16第4章 程序分析184.1 边缘检测的MATLAB实现184.2 程序及分析184.3 实例结果22结论25参考文献26致谢28前言随着计算机技术的不断发展,对显微镜下细
16、胞形态的自动图像识别、细胞形态的检测及细胞的边缘检测是医学检测中的一个重要部分,很多疾病的诊治主要依靠医学专家观察标本中细胞的形态、色度对细胞进行识别和分类。目前最普遍和主要的方法是使用光学显微镜,观察经过染色的标本,根据每种细胞形态、色度的不同进行分类。这种传统的人工分类的工作重复而简单、效率低下、精确度不高。随着计算机模式识别技术和人工智能研究的不断发展,人们把目光投向了对细胞图像的自动识别上,这样大大的提高了检查的效率和精确度。国内外都有一些利用边缘检测诊断癌细胞如肺中的癌细胞的研究,在肿瘤细胞识别方面较成功的是Autpap和Papnet,但这种技术目前只能局限于宫颈等图片。此外,Thi
17、ran JP等介绍了一种从显微镜图像中识别癌细胞组织的方法,该方法利用数学形态学等理论,基于细胞的形状和大小,提取了恶性肿瘤四个诊断标准的客观数值。对于其它一些可制作病理涂片的肿瘤,国内外都有一些肿瘤细胞检测发现与分析进行了研究。例如,Kraef SK对血液病理图像和骨髓肿瘤病理图像中的癌细胞的发现和检测分析进行了研究。Weyn B采用小波变换描述细胞核结构,对乳腺癌细胞的检测诊断与分级进行了研究。长期以来,图像处理技术已经被广泛应用到各种医学应用领域中,其中许多是应用在微观医学与生物学中。医学癌细胞的智能诊断研究是国际的难题和前沿课题。国内从20世纪50年代起,至少已投入了4000个人/年,
18、其完成的效果为:可以去除样本中50%的涂片、剩余50%还需人工检测。因此研究这样的图像检测系统有着重要的理论和实用价值。目前的图像诊断系统,大多数已使用了边缘检测、形态学、灰度特征和色度学,并结合专家系统,对癌细胞进行分析和诊断。近年来,我国实现了一套肺癌早期识别和分类系统。该系统将人工作智能技术、图像处理技术、形态学和色度学技术、神经网络以及软件技术等高新技术综合应用与肺癌早期细胞病理诊断,解决了肺癌早期细胞病理诊断中的智能化和自动化的若干关键问题,并且进行了创新研究。对于胃肠道肿瘤组织细胞的自动识别也有相关报道。目前,肺癌诊断的手段主要有:X光片、CT、MRT、同位素、纤维支气管镜(BF)
19、、经皮穿刺活检等,临床最可靠的还是病理性诊断,但病理性诊断的先进手段还相当匮乏。由于普查的工作最大,而传统的肺癌诊断手段主要是依靠人工,受到多种因素的制约,影响诊断的准确性与效率。因此,利用计算机图像处理技术,减轻人的工作负担,提高诊断的准确性和效率,研制目标是在癌细胞识别率最高的前提下,假阳性率最小。由于所使用的涂片样本来自被检查者的痰液,然后加以染色,和人体活检涂片相比,痰液中有较多的杂质和菌团,并且肺癌细胞种类不单一。主要有以下三种:磷癌细胞、腺癌细胞和小细胞癌细胞,因而,所处理的问题更加复杂,难度更大。针对这些情况,如果能设计一套切实可行的算法,通过对细胞的边缘检测,这里主要采用基于迭
20、代算法和腐蚀算法的边缘检测,然后把细胞的形态学特征,以及色度特征同时用于癌细胞的识别,提高癌细胞诊断的准确性,将对癌细胞的前期诊断和治疗起到很大的帮助。细胞边缘的检测是进行细胞面积圆度个数和颜色等形态及色度学的计算和分析的基础,其检测结果直接影响病情的分析和诊断结果。经典的边缘检测算子如Sobel算子,Laplacian算子等利用图像的每个像素邻域内灰度的变化来检测边缘。虽然这些算子计算简单、速度较快,但存在对噪声干扰敏感,得到孤立或分小段连续边缘像素,重叠相邻细胞边缘等缺陷,而利用最佳阀值分割和轮廓提取相结合的方法进行边缘检测,通过迭代算法求得图像分割的最佳阈值,再利用轮廓提取算法,挖去细胞
21、内部像素点,最后剩余部分图像就是细胞的边缘,改变了传统边缘检测算法的处理顺序,通过MATLAB编程实现后,实验结果表明能有效抑制噪声干扰影响,同时能够客观地、正确地选取边缘检测的门限值,从而进行精确的细胞边缘检测。第1章 图像处理基础1.1 数字图像处理基本知识数字图像处理又称计算机图像处理,就是用计算机处理数字图像。而在自然情况下,计算机是不能直接处理图像的。因为计算机只能对数字进行处理,所以图像必须先转换为数字形式后才能被计算机处理。任意一幅图像A可以定义为一个二维函数f(x,y),其中x和y是空间坐标,而f在任意一对坐标(x,y)处的幅度称为该点处图像的亮度或灰度。图像A的x和y坐标及幅
22、度均是连续的,为了把它们转换成数字形式,必须对坐标和幅度进行取样。坐标值数字化称为采样,幅度值数字化称为量化。取样后f和x,y的幅值都是有限的离散值,这样图像A则转换为了数字图像,产生的数字坐标有M行N列。我们惯用一个MN的矩阵来表示完整的数字图像A。经过数字化处理后,得到的数字矩阵就作为计算机处理的对象了。广义地讲,数字图像处理主要研究的内容有以下几个方面:图像变换、图像增强、图像复原、图像压缩编码、图像分割、图像识别等内容。(1)图像变换:图像数字化时采样点是很多的,直接影响就是图像矩阵阵列很大,如果直接在空间域中进行处理,计算量十分庞大。因此,往往采用各种图像变换的方法,如傅立叶变换、离
23、散余弦变换、小波变换等。利用这些变换的性质和特点,将图像转换到频域中进行处理。不仅可减少计算量,而且可获得更有效的处理(如傅立叶变换可在频域中进行数字滤波处理)。目前新兴研究的小波变换在时域和频域中都具有良好的局部化特性,它在图像处理中也有着广泛而有效的应用。(2)图像增强和复原:为了提高图像的质量,如去噪,增强图像的清晰度等,就需要进行图像增强和复原。图像增强即突出图像中感兴趣的部分(如强化图像高频分量,可使图像中物体轮廓清晰,细节明显;如强化低频分量可减少图像中噪声影响)。图像复原要求对图像质量降低的原因有一定的了解,一般讲应根据降质过程建立“降质模型”,并采用某种滤波方法,恢复或重建原来
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