香蕉枯萎病菌GFP标记和β葡萄糖甘酶基因克隆.doc
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1、香蕉枯萎病菌GFP标记和-葡萄糖甘酶基因克隆学 科 门 类:农学一级学科名称:植物保护二级学科名称:植物病理学研 究 方 向:分子植物病理学与植物生理学研 究 生:指 导 教 师:完 成 时 间: M.S. Thesis of Fujian Agriculure and Forestry UniversityCloning Beta-Glucosidase Gene and Transformation of the Green Fluorescent Protein Gene in Fusarium oxysporum f.sp.cubense, Causal Agent of Banana
2、 Fusarium Wilt Discipline: AgronomyFirst Rank Discipline: Plant ProtectionSecond Rank Discipline: Plant Pathology Research Field: Molecular Pathology and Physiology of PlantPostgraduate: Li Yan DanSupervisor: Prof. Xu Wen YaoRes. Dr. Liu BoSubmitted Time: April, 2010独创性声明本人声明,所呈交的学位(毕业)论文,是本人在指导教师的指
3、导下独立完成的研究成果,并且是自己撰写的。尽我所知,除了文中作了标注和致谢中已作了答谢的地方外,论文中不包含其他人发表或撰写过的研究成果。与我一同对本研究做出贡献的同志,都在论文中作了明确的说明并表示了谢意,如被查有侵犯他人知识产权的行为,由本人承担应有的责任。学位(毕业)论文作者亲笔签名:日期:论文使用授权的说明本人完全了解福建农林大学有关保留、使用学位(毕业)论文的规定,即学校有权送交论文的复印件,允许论文被查阅和借阅,学校可以公布论文的全部或部分内容,可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。保密,在年后解密可适用本授权书。不保密,本论文属于不保密。学位(毕业)论文作者亲笔签名:日期:指
4、导教师亲笔签名:日期:目 录目 录i中文摘要IAbstractI第一章 前 言11 香蕉枯萎病重要性12 香蕉枯萎病菌的分子病理研究进展22.1 香蕉枯萎病菌的分子鉴定研究进展22.2 香蕉枯萎病菌的-葡萄糖苷酶研究概况23 丝状真菌的转化33.1 研究概况33.2 真菌DNA转化方法44 绿色荧光蛋白(gfp)基因在丝状真菌研究中的应用55 本研究的目的和意义6第二章 香蕉枯萎病菌的分离与分子鉴定61 材料72 方法72.1 香蕉枯萎病症状观察72.2 真菌的分离72.3 枯萎病原菌的纯化与保存72.4 分子鉴定73结果与分析83.1 香蕉枯萎病菌的分离83.2 香蕉枯萎病菌的鉴定114 讨
5、论13第三章 构建香蕉枯萎病菌遗传转化体系151 材料152 方法162.1 原生质体制备162.2 绿色荧光蛋白的转化162.3 转化子的抗性鉴定172.4 转化子的分子鉴定172.5 转化子荧光检测173 结果与分析173.1 香蕉枯萎病菌原生质体形成173.2 绿色荧光蛋白的转化183.3 转化子的抗性鉴定193.4 转化子的分子鉴定213.5 转化子荧光检测224 讨论234.1 尖孢镰刀菌转gfp基因遗传转化体系的建立与优化23第四章 gfp基因标记香蕉枯萎病菌后的生物学特性241 材料242 方法242.1 转gfp基因尖孢镰刀菌Foc-3076的生长特性242.2 转gfp基因尖
6、孢镰刀菌Foc-3076的侵染特性242.3 转gfp基因尖孢镰刀菌的香蕉植株致病性测定253 结论253.1 转GFP尖孢镰刀菌的生长特性253.2 转gfp基因尖孢镰刀菌的侵染特性263.3 转gfp基因尖孢镰刀菌的香蕉组培苗侵染速度283.4 植株中分离出的转化子荧光稳定性测定283.5 转gfp基因尖孢镰刀菌的香蕉植株致病性测定294 讨论294.1 绿色荧光蛋白基因转化香蕉枯萎病菌30第五章 香蕉枯萎病菌-葡萄糖苷酶cDNA克隆311 材料312 方法312.1 中间序列的引物设计312.2 采用TRIZOL Reagent提取尖孢镰刀菌Foc-3076菌株总RNA322.3 中间序
7、列的序列的扩增322.4 3/RACE332.5 5/RACE342.6 尖孢镰刀菌-葡萄糖苷酶基因的多样性分析362.7 PCR产物的克隆与测序372.8 序列的同源性比较372.9 -葡萄糖苷酶基因的多样性分析373 结果与分析373.1 提取的RNA质量分析373.2 简并引物扩增部分373.3 3/RACE扩增结果393.4 5/RACE扩增结果403.5 -葡萄糖苷酶基因同源性分析403.6 -葡萄糖苷酶基因的多样性分析404 讨论42第六章 总结与展望431总结432 展望43参考文献43个人简历49致 谢50中文摘要尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f.
8、sp.cubense,Foc)引起的香蕉枯萎病是香蕉的毁灭性病害,它能侵染几乎所有的香蕉品种,特别是4号生理小种(Foc4),给我国香蕉的生产带来严重威胁。目前,国内外尚无十分有效的化学防治方法,也未培育出稳定的高抗性品种,主要因为香蕉枯萎病是由维管束侵染的系统性病害,一般的化学药剂不能奏效,且而长期不清楚香蕉枯萎病菌的致病机理造成的抗病育种靶标不明确。建立PEG介导香蕉枯萎病菌遗传转化体系,对于香蕉枯萎病菌研究基因的表达调控机理、基因功能等具有重要意义;将绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,gfp)基因转化入香蕉枯萎病菌,研究转化后菌株的生物学特性以及在香蕉植株
9、体内的侵染特性,为进一步研究香蕉枯萎病菌致病机理和生防提供理论基础;本研究克隆香蕉枯萎病菌的-葡萄糖甘酶基因,为研究此基因功能奠定基础。主要研究结果如下:1. 香蕉枯萎病株采自福建省漳州,经单孢分离及形态学与分子鉴定,获得28个尖孢镰刀菌古巴专化型,其中21个为4号生理小种。2. 建立香蕉枯萎病菌的PEG介导原生质体法遗传转化系统,香蕉枯萎病菌的原生质体的制备是整个转化中最关键的一步,影响原生质体制备因素很多主要包括合适的酶液、菌丝的菌龄、制备原生质体的溶菌温度和溶菌时间。本文转化方法采用的是0.8 molL-1的NaCl溶解的崩溃酶 (Drislase)和溶壁酶(Lysing Enzyme)
10、;菌龄10-14 h的新鲜菌丝;28 ,70 rmin-1消化酶解2-3 h。3. 对尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种Foc-3076菌株进行gfp标记。标记后菌株的菌丝、分生孢子、厚垣孢子的形态与亲本菌株形态基本相同,且在紫外光下都呈现绿色荧光。PCR验证表明,目的基因已转入到Foc-3076菌株。且标记后菌株较之原始菌株的抗潮霉素能力大大增加。在无选择压力条件下继代培养6代,转化子仍然保持强烈的绿色荧光。gfp基因标记前后的菌株在菌落形态、最佳pH值和菌丝生长速度基本一致,菌株致病力未有明显改变,发病率均达到90 以上。4. 利用激光共聚焦显微镜扫描观察结果表明,标记病原菌侵染香蕉是以孢子
11、萌发或菌丝体从根部侵入植株体内,并沿着寄主细胞间隙扩展与蔓延,经植株的维管束组织向上生长至植株的假茎顶部。5.通过GenBank上近缘物种-葡萄糖甘酶基因序列设计简并引物,提取尖孢镰刀菌古巴专化型Foc-3076菌株的RNA,通过RT-PCR扩增中间序列及3RACE-PCR从Foc-3076 菌株cDNA一链中克隆得到一个1473 bp的-葡萄糖甘酶基因序列。关键词:香蕉;尖孢镰刀菌古巴专化型;绿色荧光蛋白基因;-葡萄糖甘酶;生物学特性;侵染AbstractFusarium wilt of banana caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense (
12、Foc), is one of the most serious fungal diseases in banana, and reported to be one of the major limiting factors for banana production worldwide. Especially, Foc race 4 is able to infect almost the banana cultivars and brings great threat to banana production. To date, few effective and economically
13、 safe methods to protect banana from Fusarium wilt disease have been developed. The main reasons are that pathogen infects vascular tissues and leads to typical wilt symptoms, common chemicals do not well work, and pathogenic mechanisms are still unclear for resistance breeding target.The PEG-mediat
14、ed transformation system of Foc was established to study expressing regulation and functions of genes. Transform Foc isolate with the gfp gene, was made a useful tool to study Foc infection. It helps to further study pathogenic mechanisms and biocontrol mechanisms for banana fusarium wilt. Beta-gluc
15、osidase genes coloning for the Foc isolates is the foundation to study the gene function. These major results are as follows:1. Fusarium strains collected from banana wilt disease in Zhangzhou, Fujian Province, by single spore isolation and molecular characteristics, were 28 Foc strains, of which 21
16、 Race 4 strains.2. The PEG-mediated transformation system of Foc was established. Preparation of Fusarium protoplast is the key step during the transformation. Many factors affect the quality and quatity of the protoplast including the appropriate enzymes, mycelium age, the digestion temperature and
17、 time of the cell wall. This transformation was used in 0.8 mol L-1 of NaCl dissolved collapse enzyme (Drislase) and dissolved wall enzymes (Lysing Enzyme); culturing 10-14 h of tender mycelium; digest temperature in 28 then shaking at 70 r min-1 at for 2-3 h. 3Strain Foc-3076 was transformed with g
18、fp gene by protoplast method. The morphology of mycelium, conidia, chlamydospores of labeled-gfp strains were the same as the parent strains, and all transformants appeared green under ultraviolet fluorescence. PCR amplification showed that gfp gene has been transferred into strains Foc-3076. And th
19、e transformants resistance ability to hygromycin B increased greatly than the original strain. Transformants were quite stable and remained strong green fluorescence after six successive subcultures. The morphology,pH value and growth rate of the gfp-tagged transformants are the same as the wild typ
20、e strain. The pathogenicity of the wild type strain and the gfp -tagged strain was over 90 percent.4 Using laser scanning confocal microscope, colonization and infection were visualized: the colonization sites on the root surface by spore germination or mycelium, then along the extension of host cel
21、ls within the gap, and spread upward through the plant vascular tissue growth to the top of pseudo stem.5 A degenerated primer was designed basing on the conserved domains of nucleotide sequence of known fungus beta-glucosidase genes through GenBank. After extracting RNA from strain Foc-3076, beta-g
22、lucosidase gene cDNA was amplified with PCR by using the degenerated primers. And we cloned one cDNA of beta-glucosidase from strain Foc-3076 by 3/RACE ,including 1473 bp nucleic acids.Key words: banana; Fusarium oxysporum f.sp.cubense(Foc); green fluorescent protein(GFP); beta-glucosidase; Biochemi
23、cal characterization; infection第一章 前 言香蕉清甜柔软,口感润滑,天然无籽、食用方便等独特的风昧和营养价值深受人们的喜爱。同时,香蕉因产量高、投产早、供应期长(可全年供应)、效益好而深受生产者的欢迎1。目前共有120个国家和地区生产香蕉,其中大部分属于发展中国家,主要分布在北纬18-30之间2。我国是香蕉原产地之一,分布在广东、广西、海南、福建、云南等热带与亚热带地区,2005年我国香蕉产量为639.00万t,占世界香蕉总产量的8.80 %,居全球第三位,为我国国民经济的发展做出了重要的贡献3,4。但随着种植面积的扩大,香蕉病害问题也日益突出。目前全世界报道的
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