七年制医学ppt课件 生化 蛋白质的生物合成.ppt
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1、蛋白质的生物合成,概 述以RNA中的mRNA为模板,将mRNA的碱基所组成的遗传密码转变为蛋白质分子中氨基酸的排列顺序,称为蛋白质的生物合成,也称为翻译(translation)。生物的遗传信息储存在DNA分子的碱基排列序列中(少数生物是RNA),在转录过程中,将DNA的遗传信息转移至mRNA分子中,mRNA是蛋白质生物合成的直接模板;tRNA分子与氨基酸结合形成氨酰-tRNA,将蛋白质的合成原料氨基酸搬运至蛋白质生物合成的场所核糖体上;rRNA与蛋白质构成的核糖体是蛋白质生物合成的场所。可见,细胞内的主要几种RNA(mRNA、tRNA、rRNA)均直接参与了蛋白质生物合成过程。DNA虽不直接
2、参与了蛋白质生物合成过程,但它却控制着蛋白质生物合成的遗传信息,归根结底来说,蛋白质生物合成的遗传信息最终是由DNA决定的。,参与蛋白质生物合成的物质 生物体内的蛋白质生物合成过程极为复杂,有许多物质参与,包括:mRNA、tRNA、核糖体、20种-氨基酸、氨酰-tRNA合成酶、转肽酶以及多种蛋白质因子等。,mRNA是遗传信息的携带者 mRNA在细胞内含量少,稀有碱基少。mRNA的长度差别较大且寿命短。mRNA的来源是由核内DNA(带有遗传信息),按照碱基配对规则转录而来,因此,将DNA上不同碱基序列所代表的遗传信息抄录至hnRNA分子中,然后,hnRNA分子通过转录后加工、进入胞浆,成为mRN
3、A,再结合于核糖体上,参与蛋白质的生物合成过程。它是蛋白质生物合成过程中遗传信息的携带者,mRNA分子中的碱基排列序列决定了蛋白质分子中的氨基酸排列顺序。,那么,组成mRNA分子的4种碱基(A、C、G和U)怎样代表蛋白质分子中的20种氨基酸呢?人们最初采用简单的数学推测:若mRNA中的1个碱基代表一个氨基酸,则只能代表4种氨基酸,显然不能满足代表20种氨基酸的需要;若mRNA中相邻的2个碱基代表一个氨基酸,则也只能代表16种氨基酸,也不能满足代表20种氨基酸的需要;若mRNA中相邻的3个碱基代表一个氨基酸,则有64种组合,这是代表20种氨基酸的最低组合,其中,三个相邻的碱基称为一组密码(cod
4、en),或称三联体密码。用64组密码来代表20种氨基酸,必然存在一种氨基酸可能有多组不同的密码。上述假设和推论很快即被证明是完全正确的。但是,每一组密码究竟代表何种氨基酸?这就是遗传密码的破译。在20世纪60年代,人们花费了大约5年的时间,破译了生物所有的64组遗传密码。,遗 传 密 码 表,遗传密码具有以下特点:1 密码的连续性(commaless):mRNA分子中,一旦从一个正确的起点(AUG)开始后,必须连续三个碱基一组一组地往下阅读,中间不能有任何核苷酸间隔。mRNA分子中间若有任一个核苷酸的插入或缺少,可造成移码突变(frame shift)突变,使下游的相应的氨基酸序列发生完全改变
5、。2 密码的简并性(degeneracy):在遗传密码表中,共有64组密码(43)。其中,3组作为翻译的终止密码(UAA、UAG和UGA);AUG兼作翻译的起始密码(AUG是亮氨酸的密码),其余61组密码(包括AUG作为亮氨酸的密码)共同编码20种-氨基酸。因此,必然有一种氨基酸由多组密码编码的现象,成为密码的简并性。实际上,除色氨酸与亮氨酸(由一个密码编码)外,其余氨基酸均由两个或两个以上的密码编码。,3 密码的专一性:在组成遗传密码的三个碱基中,代表何种氨基酸主要由密码的第一、二位碱基决定,第三位碱基相对来说,在决定其特异性上要次之。密码的简并性往往也只涉及到第三位碱基的变化。例如,UCU
6、、UCC、UCA、UCG均是丝氨酸的遗传密码(密码的简并性),若遗传密码由UCU变为UCC(第三位碱基由U变为C),其所代表的氨基酸仍是丝氨酸,但若第一、二位密码任一个发生了改变,则其代表的氨基酸往往会发生改变如UCU变为UAU(酪氨酸)或ACU(苏氨酸)。,4 密码的通用性(universal):无论原核生物如病毒、细菌等和真核生物包括人类都共用一套遗传密码即三联体密码。但近年发现,在真核细胞的线粒体、叶绿体中的蛋白质生物合成时,虽然也使用三联体密码,但所代表的氨基酸有少许的差异,主要有(括号内是通用遗传密码所代表的氨基酸):AUA(异亮氨酸):起始密码、蛋氨酸 AUG(蛋氨酸兼起始密码)、
7、AUU(异亮氨酸):起始密码 AGA(精氨酸)、AGG(精氨酸):终止密码 UGA(终止密码):色氨酸,5 密码的方向性:在mRNA中,遗传密码的阅读总是从53,且排列上总是起始密码位于靠近mRNA的5端,而终止密码位于靠近mRNA的3端。在mRNA中遗传密码的这种方向性排列决定了其翻译的方向性。mRNA集中于胞质内,大部分与核糖体结合,可能有少部分与其他蛋白质结合存在。mRNA与蛋白质(包括核糖体)的结合存在可能使其不易被细胞内经常存在的核糖核酸酶(RNase)所降解,因而对mRNA具有保护作用。,在哺乳动物mRNA分子中,除翻译部分(即从起始密码至终止密码之间的mRNA)外,一般还包括靠近
8、5末端的非翻译区(5不翻译部分)和靠近3末端的非翻译区(3不翻译部分)。在5非翻译区中还有5末端的“帽子”结构(7-甲基鸟嘌呤核苷酸残基),3非翻译区有3末端的多聚A“尾巴”。所以,哺乳动物mRNA分子的结构可表示如下:,mRNA分子5非翻译区和3非翻译区虽然不编码蛋白质分子中的氨基酸,但它们可能对控制mRNA的翻译和降解速度、对mRNA从胞核向胞质的输送速度进行调节等方面具有一定意义。此外,5末端的“帽子”结构可保护mRNA免受磷酸酶与某些核酸酶的降解,并使翻译过程易于启动,也有人认为,它是真核生物mRNA与核糖体结合的原始识别信号。而3末端的多聚A“尾巴”可能是mRNA与蛋白质的结合点之一
9、,由此可使mRNA免受某些核酸酶的降解,因此,mRNA 3末端的多聚A“尾巴”对mRNA具有保护作用。同时,mRNA 3末端的多聚A“尾巴”与翻译效率有直接的关系,带polyA的mRNA比无polyA的mRNA的翻译效率要高得多。,近年研究表明,在真核细胞的翻译过程中,mRNA的5非翻译区与polyA间会通过其他一些蛋白质的帮助而头尾结合起来,如哺乳动物中,这些蛋白质主要有:起始因子3、4A、4B、4G、4E(eIF3、4A、4B、4G、4E)、polyA结合蛋白(polyA binding protein,PABP)、PABP作用蛋白(PAIP-1)等。mRNA的5非翻译区与polyA间的相
10、互作用不仅能促进翻译的高效进行,而且在维持mRNA的完整性方面也有重要作用。,tRNA是搬运氨基酸的工具tRNA在蛋白质生物合成过程中的作用是将胞液中的-氨基酸搬运至核糖体上,它包括以下过程:1氨基酸与tRNA分子结合(氨基酸的活化):在生物体内,一种tRNA只能与一种氨基酸结合(即一种tRNA只能搬运一种氨基酸),而一种氨基酸可与一种以上的tRNA分子结合,所以,tRNA的种类比氨基酸(20种)多。氨基酸与tRNA的结合需要氨酰tRNA合成酶催化,并需要消耗ATP。其反应式如下:氨酰tRNA合成酶tRNA+氨基酸+ATP 氨酰-tRNA+AMP+Ppi,在氨酰-tRNA分子中,氨基酰结合在t
11、RNA 3末端腺苷酸残基核糖部分的3位羟基上。此外,由于每种tRNA对一种氨基酸是特异性的,因此,通常将该氨基酸的三字母缩写写在相应tRNA的右上角,如tRNAArg则表示该tRNA是携带精氨酸的tRNA分子。氨酰tRNA合成酶存在于胞液中,是一类具有高度特异性的酶,它既能识别特异的氨基酸,又能辨认携带该种氨基酸的特异tRNA分子,亦即在体内,每种氨酰tRNA合成酶都能从20种氨基酸中选出与之相对应的一种,并选出与此氨基酸对应的特异tRNA分子。但在体内,同一氨基酸常有数种与之相适应的不同的特异tRNA,亦即一种氨基酸可被其相对应的数种tRNA所携带,所以,氨酰tRNA合成酶对tRNA的选择性
12、较对氨基酸的选择性稍低。此外,氨酰tRNA合成酶还具有校正活性,可使误载的氨基酰从氨酰-tRNA分子上水解下来,对于保证翻译的准确性具有重要意义。,真核生物与原核生物的tRNA结构相似,但在翻译过程中行使起始作用的tRNA与其他tRNA分子不同。在真核细胞中,这种具有起始作用的tRNA是甲硫氨酰-tRNA,在原核细胞中,具有起始作用的tRNA是甲酰甲硫氨酰-tRNA。这是原核生物与真核生物tRNA的一个不同之处。起始tRNA能特异地识别作为起始密码的AUG。在原核生物中,仍是先形成甲硫氨酰-tRNA,再由甲硫氨酰-tRNA转甲酰基酶的催化,由甲酰四氢叶酸提供甲酰基而生成甲酰甲硫氨酰-tRNA。
13、另外,在细胞内,还有一类能携带甲硫氨酸的tRNA,它不能识别翻译的起始密码AUG,而只能在肽链合成开始后识别起始密码之后的AUG。,2tRNA对遗传密码的识别作用(遗传密码的解读):携带有氨基酸的氨酰-tRNA,依靠其tRNA分子中反密码环上的反密码(由3个碱基组成)与mRNA上的密码进行配对结合,从而将其所携带的氨基酸带到蛋白质生物合成的场所核糖体上去。tRNA的反密码与mRNA上的遗传密码配对结合时,具有以下特点:1)一对一地配对。即tRNA反密码的3个碱基分别与mRNA上密码的3个碱基按一对一的关系配对结合。2)反密码与密码结合时方向相反。即反密码的第1、2、3位碱基分别与密码的第3、2
14、、1位碱基配对。,1)反密码与密码配对时,反密码的第2、3位碱基分别与密码的第2、1位碱基配对时严格遵循碱基配对规则(即A与U、G与C配对),而反密码的第1位碱基与密码的第3位碱基配对时不严格遵循碱基配对规则,后者成为摆动配对或不稳定配对(wobble base pair)。通过摆动配对,使得携带有同种氨基酸的不同tRNA分子可分别结合在几种同义密码上。如反密码为IGC的丙氨酰-tRNA,可分别结合到同义密码GCU、GCC、GCA上(GCU、GCC、GCA均为编码丙氨酸的密码)。摆动配对的存在对于保持生物物种的稳定具有重要意义。摆动配对情况,3tRNA是氨基酸与遗传密码间的适配器:tRNA在蛋
15、白质生物合成过程中的作用是搬运氨基酸,通过氨酰tRNA合成酶的作用,使特定的氨基酸与其相应的特异tRNA分子结合起来形成氨酰-tRNA,进一步通过tRNA的反密码去识别mRNA上的遗传密码并与之配对结合,从而按照遗传密码的要求将相应氨基酸带至蛋白质生物合成的场所核糖体上,以保证能根据mRNA的遗传信息翻译出正确的多肽链。因此,tRNA在氨基酸与遗传密码间起适配器的作用。,核糖体是蛋白质生物合成的场所核糖体由大、小亚基组成,其组成成份包括rRNA和蛋白质。真核生物的核糖体比原核生物大,成份也远较原核生物复杂。,细胞内的核糖体,有的附着在内质网上,有的游离存在于胞质中。前者主要参与合成分泌性的蛋白
16、质(如胰岛素、白蛋白等)和膜蛋白,后者主要参与合成细胞自身需要的非膜蛋白等固有蛋白质。原核生物核糖体的小亚基的rRNA(16S)的3末端有一富含嘧啶的区段,可与mRNA分子的起始部位的一段富含嘌呤的区段互补结合,使mRNA结合至核糖体上。mRNA分子中的这段富含嘌呤的区段称为S-D序列(Shine-Dalgarno sequence)(通常为GGAGGU)。S-D序列位于mRNA的5端紧接起始信号的上游。但在真核细胞的相应rRNA(18S)中,却并无上述与S-D序列互补的结构存在。,核糖体在蛋白质生物合成过程中起“装配机”的作用。在核糖体上,与蛋白质生物合成有关的主要结构有:1 有容纳mRNA
17、的部位。如原核生物核糖体的小亚基的rRNA(16S)的3末端有一富含嘧啶的区段,是与mRNA结合所必需的结构。2 有结合氨酰-tRNA的部位,称为氨酰基部位,简称A位。3 有结合肽酰-tRNA的部位,称为肽酰基部位,简称P位。4 在大亚基上,尚有转肽基酶(transpeptidase)存在,可催化肽键的形成。A位和P位呈紧密相邻,每个部位的宽度正好相当于mRNA上一个遗传密码的宽度。,蛋白质生物合成过程蛋白质的生物合成过程包括:氨基酸的活化;活化氨基酸的搬运;活化氨基酸在核糖体上形成多肽链。后者是蛋白质生物合成的中心环节,它包括了从核糖体的大、小亚基在mRNA上的聚合开始(形成核糖体)至核糖体
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